BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184H16
Chromosome19 (Build37)
Map Location 21,822,546 - 21,925,747
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmem2
Upstream geneTmc1, LOC100042287, LOC100042294, LOC100041602, LOC100041613, Zfand5, Gda, LOC100041633, 1110059E24Rik, 5730446C15Rik
Downstream geneEG433229, Trpm3, EG433230
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184H16.bB6Ng01-184H16.g
ACCGA009843GA009844
length5761,084
definitionB6Ng01-184H16.b B6Ng01-184H16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(21,822,546 - 21,823,121)(21,924,658 - 21,925,747)
sequence
gaattctcctagtgtgttgatgatgcaaaactcatgacatccaagatatt
ttattggaaatgaacccaagtcattaaataaacctactactttgtgttta
gctaagtagcattaaatgagctcccaaacgcttaccagatagcacatctc
ttaaccctcatccaagaaacttattttttgtggtagatgatgatgagtac
agagctcacaactggtcagtgtgcagacagtagttgactttggagtgctc
tgcctcaaggagacagctgtagtacatgcttggctcccagtgctaaggga
tcatccaggaagaggggacaaaagattgcaagatccaggggcagcagatg
gctagagccaatcagtgatttctggacctgggggagtcacactggctgta
actgcacgtacaaggtgcagctagacgaattctctgcatggatagggagg
tggttaggcaatcccacaaccaacccaggagccaggcaactgatggatgt
tgtgagaagcagagatagttatctgctgagaagtggtccctgagaggcta
tccacgctccagcagatggtcctaca
gaattctcctgaaatagatttctttatggtttgtctgtttgatttgtgta
ggtagtttgcatatttatatccccacatttttataaaaattcctttgcag
aaaggaagctaaggatgggaaaaggttaagaggctctgctggccgatcct
gggcggtggggaagggagtccctgctggccagataacattctctaagcaa
gagagggcagccccctcagcttcgagggtaactcggaagtgtccagatct
cagcatgaacacttaggacatcactgaggtctggaagtcagatctcaggt
gctgccacccaccccacataacccatggaaggccccatcggcatctagtc
cagaagaccaaatccactgaatgcattctttctcctacaaatacaaatgt
ctcttctgacatcaaaacggcaaagtgggacttgtactgatgcttaagct
ctaagctactgcggcaaaaagagaatggcgtggagcagaggaaacacggg
aagagaaagacaccctcacgctggaacctggctgagaagcaagacactgc
aagacaaccgataaatcaaatttgcccactaagacggcacttgtcttcct
taaagatatcttaaagaagttaaaggaaacaagccacaagtacttgtggt
cagaatgtatatggccttgtttaccatgttagcaccctactaacactaaa
tccctaaacatatctcacaaaaccaccttcaggcttacttacaacaagaa
tgctaacttgtctgtttccttccaattttacacttaataagaaatttata
agttagaaagccacagaattgaaaaaaacaaaaacaaaaaaaaacctccc
actgtaggagccaaaacacaactctcttttgtcttgggctgtgcactctc
ttttacagtttgttccctctgccctccagcacacgctctcactctcttgc
cttctttcctgtgctcactctgacatctagacacaaatttccccctccct
tatctccatatggcagttgatgacaggtgcctcgatgatctcatctagtt
gatgctgtcccagtcggccagatctttgataggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_21822546_21823121
seq2: B6Ng01-184H16.b_50_625

seq1  GAATTCTCCTAGTGTGTTGATGATGCAAAACTCATGACATCCAAGATATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTAGTGTGTTGATGATGCAAAACTCATGACATCCAAGATATT  50

seq1  TTATTGGAAATGAACCCAAGTCATTAAATAAACCTACTACTTTGTGTTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGGAAATGAACCCAAGTCATTAAATAAACCTACTACTTTGTGTTTA  100

seq1  GCTAAGTAGCATTAAATGAGCTCCCAAACGCTTACCAGATAGCACATCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGTAGCATTAAATGAGCTCCCAAACGCTTACCAGATAGCACATCTC  150

seq1  TTAACCCTCATCCAAGAAACTTATTTTTTGTGGTAGATGATGATGAGTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACCCTCATCCAAGAAACTTATTTTTTGTGGTAGATGATGATGAGTAC  200

seq1  AGAGCTCACAACTGGTCAGTGTGCAGACAGTAGTTGACTTTGGAGTGCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTCACAACTGGTCAGTGTGCAGACAGTAGTTGACTTTGGAGTGCTC  250

seq1  TGCCTCAAGGAGACAGCTGTAGTACATGCTTGGCTCCCAGTGCTAAGGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCAAGGAGACAGCTGTAGTACATGCTTGGCTCCCAGTGCTAAGGGA  300

seq1  TCATCCAGGAAGAGGGGACAAAAGATTGCAAGATCCAGGGGCAGCAGATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCAGGAAGAGGGGACAAAAGATTGCAAGATCCAGGGGCAGCAGATG  350

seq1  GCTAGAGCCAATCAGTGATTTCTGGACCTGGGGGAGTCACACTGGCTGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGAGCCAATCAGTGATTTCTGGACCTGGGGGAGTCACACTGGCTGTA  400

seq1  ACTGCACGTACAAGGTGCAGCTAGACGAATTCTCTGCATGGATAGGGAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCACGTACAAGGTGCAGCTAGACGAATTCTCTGCATGGATAGGGAGG  450

seq1  TGGTTAGGCAATCCCACAACCAACCCAGGAGCCAGGCAACTGATGGATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTAGGCAATCCCACAACCAACCCAGGAGCCAGGCAACTGATGGATGT  500

seq1  TGTGAGAAGCAGAGATAGTTATCTGCTGAGAAGTGGTCCCTGAGAGGCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGAAGCAGAGATAGTTATCTGCTGAGAAGTGGTCCCTGAGAGGCTA  550

seq1  TCCACGCTCCAGCAGATGGTCCTACA  576
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACGCTCCAGCAGATGGTCCTACA  576

seq1: chr19_21924658_21925747
seq2: B6Ng01-184H16.g_67_1150 (reverse)

seq1  CCCTATCAAAGAATTCT-GCCGACTGGGGACCAAGCATTCAACTAGATGA  49
      ||||||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||
seq2  CCCTATCAAAGA--TCTGGCCGACT-GGGAC--AGCA-TCAACTAGATGA  44

seq1  GACCATCGAGGCCACTGTCAATCAAACTGCCATATGGAGAT-AGGGAGGG  98
      || |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GATCATCGAGGCACCTGTC-ATC-AACTGCCATATGGAGATAAGGGAGGG  92

seq1  GGGAATTTGTGTCTTAGATGTCAGAGTGAGCACAGGAAAGAAGGCAAGAG  148
      || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATTTGTGTC-TAGATGTCAGAGTGAGCACAGGAAAGAAGGCAAGAG  141

seq1  AGTGAGAGCGTGTGCTGGAGGGCAGAGGGAACAAACTGTAAAAGAGAGTG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGAGCGTGTGCTGGAGGGCAGAGGGAACAAACTGTAAAAGAGAGTG  191

seq1  CACAGCCCAAGACAAAAGAGAGTTGTGTTTTGGCTCCTACAGTGGGAGG-  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CACAGCCCAAGACAAAAGAGAGTTGTGTTTTGGCTCCTACAGTGGGAGGT  241

seq1  TTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTCAATTCTGTGGCTTTCTAACTTATAAAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTCAATTCTGTGGCTTTCTAACTTATAAAT  291

seq1  TTCTTATTAAGTGTAAAATTGGAAGGAAACAGACAAGTTAGCATTCTTGT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTATTAAGTGTAAAATTGGAAGGAAACAGACAAGTTAGCATTCTTGT  341

seq1  TGTAAGTAAGCCTGAAGGTGGTTTTGTGAGATATGTTTAGGGATTTAGTG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGTAAGCCTGAAGGTGGTTTTGTGAGATATGTTTAGGGATTTAGTG  391

seq1  TTAGTAGGGTGCTAACATGGTAAACAAGGCCATATACATTCTGACCACAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTAGGGTGCTAACATGGTAAACAAGGCCATATACATTCTGACCACAA  441

seq1  GTACTTGTGGCTTGTTTCCTTTAACTTCTTTAAGATATCTTTAAGGAAGA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTGTGGCTTGTTTCCTTTAACTTCTTTAAGATATCTTTAAGGAAGA  491

seq1  CAAGTGCCGTCTTAGTGGGCAAATTTGATTTATCGGTTGTCTTGCAGTGT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGCCGTCTTAGTGGGCAAATTTGATTTATCGGTTGTCTTGCAGTGT  541

seq1  CTTGCTTCTCAGCCAGGTTCCAGCGTGAGGGTGTCTTTCTCTTCCCGTGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTTCTCAGCCAGGTTCCAGCGTGAGGGTGTCTTTCTCTTCCCGTGT  591

seq1  TTCCTCTGCTCCACGCCATTCTCTTTTTGCCGCAGTAGCTTAGAGCTTAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTGCTCCACGCCATTCTCTTTTTGCCGCAGTAGCTTAGAGCTTAA  641

seq1  GCATCAGTACAAGTCCCACTTTGCCGTTTTGATGTCAGAAGAGACATTTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCAGTACAAGTCCCACTTTGCCGTTTTGATGTCAGAAGAGACATTTG  691

seq1  TATTTGTAGGAGAAAGAATGCATTCAGTGGATTTGGTCTTCTGGACTAGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGTAGGAGAAAGAATGCATTCAGTGGATTTGGTCTTCTGGACTAGA  741

seq1  TGCCGATGGGGCCTTCCATGGGTTATGTGGGGTGGGTGGCAGCACCTGAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCGATGGGGCCTTCCATGGGTTATGTGGGGTGGGTGGCAGCACCTGAG  791

seq1  ATCTGACTTCCAGACCTCAGTGATGTCCTAAGTGTTCATGCTGAGATCTG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGACTTCCAGACCTCAGTGATGTCCTAAGTGTTCATGCTGAGATCTG  841

seq1  GACACTTCCGAGTTACCCTCGAAGCTGAGGGGGCTGCCCTCTCTTGCTTA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTTCCGAGTTACCCTCGAAGCTGAGGGGGCTGCCCTCTCTTGCTTA  891

seq1  GAGAATGTTATCTGGCCAGCAGGGACTCCCTTCCCCACCGCCCAGGATCG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATGTTATCTGGCCAGCAGGGACTCCCTTCCCCACCGCCCAGGATCG  941

seq1  GCCAGCAGAGCCTCTTAACCTTTTCCCATCCTTAGCTTCCTTTCTGCAAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCAGAGCCTCTTAACCTTTTCCCATCCTTAGCTTCCTTTCTGCAAA  991

seq1  GGAATTTTTATAAAAATGTGGGGATATAAATATGCAAACTACCTACACAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTTTTATAAAAATGTGGGGATATAAATATGCAAACTACCTACACAA  1041

seq1  ATCAAACAGACAAACCATAAAGAAATCTATTTCAGGAGAATTC  1090
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAACAGACAAACCATAAAGAAATCTATTTCAGGAGAATTC  1084