BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-254H15
Chromosome19 (Build37)
Map Location 33,436,098 - 33,578,742
singlet/doubletdoublet
Overlap gene6530404N21Rik, LOC638381, EG668095, LOC628236
Upstream gene2700046G09Rik, LOC100042138, LOC672490, LOC100042823, Minpp1, Papss2, Atad1, Pten, B430203M17Rik
Downstream geneAI747699, EG668106, EG668112, EG668114, EG329055, EG433241, LOC668127, Lipf, Lipk, EG383462, Lipn, Ankrd22, Stambpl1, Acta2, Fas, Ch25h, Lipa
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-254H15.bB6Ng01-254H15.g
ACCGA060932GA060933
length1,0941,129
definitionB6Ng01-254H15.b B6Ng01-254H15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,577,652 - 33,578,742)(33,436,098 - 33,437,214)
sequence
gaattcagattagattctctggagatctttaaatttttgaatttcaattc
cttctccttctccttagtgctttgaacttttccaaatcccatttgtctat
aaggattacaaagctgagaattatctttggacaacagatgtgcaatgcaa
cactcacctagttagagtcatatttttcatcttgtactctctcacagcct
gctatgcaattttgataacttgttttgtatgtgttgtatgtgtgtgtgtg
tttcaatatctgacatcactactacatgaagctgctacagtctctttcac
ccagtatcttgaatcacctgtgtgtctactaaaattgtggatcttagttt
tttcatctcaatggaatcatgtgcattggggtcctctgtcttggctatac
cagttagtgtaaatatcattagttcatctatggtgtagcattacaggaac
atcttctgtgaaagaattgtaatctcttgtgtaaatgtaagacattcagt
taatctgtataccaccactgacagagttttcagtggtttttttttttctg
gtttgctaatttgcaagtttttgtatggacatgttttcattttatggtaa
gcatacttcaaaatatagccaattctataaagagtttagttcaacaagtc
tatcagacattaaccctaaataaaccctccccaataaagaaagagaaaga
ttgctctcaccccaaaatgttcatgattctcaaaagtttacattcaattt
aatctgattaaaaatgtttctgtcatatttgggagtgttgtttctcaagt
tagggtactgaatgtcatattcagtgaagtaagccaatccacttcagcag
cacatagtagttttgtcttttgtctcactccgtataaacattatgcttct
atcaggcaaaacactttctcacactaagagctgctcttcacatttgtcaa
tttcaggtcctctttggtgaaaaagaatttttgcctaccgtagtttccag
cgaggtggggtgcatatgtatgcgatattaacttggtcactgctgggtgt
gctgctatgatgggatcgatgggtggatattctccaagaacagt
gaattcttataaagagtaaattactctatttggaataaattatgtttatt
agatttatgctgaaacattttatgatatatatgtacatcaaaacatatta
tacatcttaaataaatataaatactatttttcaaccataccttgattagt
aaagtaaaataaagaacataaatcctaaaattttgattccaaaataaaaa
aatcactatcacagccaaagtatatataggttgagcatggtgacacatgt
ctgtctgctcagcactcaggaggccaaaacagatatattatgaattcaga
gctaccttgtattatattatgagctctatacttccctggccttcatggaa
agatctctcacaaaatatcatgtaagtcatgtgtaacttataacacagtg
gttgtgaggacgcagattcttagacatcaatagtcactattgtgaaaaca
tgtagatatacacgtacctagataaaatagccaactgcacagctaggcca
tgtgataaatgtatatgcaatatacttgtatagatctatacagatacagt
gcactgttcctaggaccttgaaggacaagacaatacaagagaaaaccaag
tctaagagcataaattgcaatcagtagatatagaaaaggctagagatagc
agatgcttgctagtgtgctcagtgctctgagttcaatccccagcaatgca
gtagtactactaataattgaaattcttcaggtgtggtggcaatgcatgcc
ccccccctttaaaaagttattttattttatgtgtatggatgtttttgtct
gcattttatgttttctaagattttatttatatattttataaatatggatg
ttttgtttacataccagatgaggggataagatcccattatggatagttgt
gggcaaccatagaggtcctgggaaatgaactcaggacatctgggaaggac
aaaccaatatgctcttgacccctgagccatctctctggcccacaaaacaa
catcccttttaatggcaacattttcgaggcaaggcaggatggattggcag
ttttacgccatagtggggtatatagccaaacactatcataaaaataccta
gaggagatggtgaagaggagggggaagac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_33577652_33578742
seq2: B6Ng01-254H15.b_46_1139 (reverse)

seq1  ACTGTTC-TGGAGAATATCCACCCATCGATCCAATCATAGCAGCACAACC  49
      ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
seq2  ACTGTTCTTGGAGAATATCCACCCATCGATCCCATCATAGCAGCACACCC  50

seq1  AGCAGTGACCAAGTTAATATCGCATACATATGCA-CCCACCTCGCTGGAA  98
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AGCAGTGACCAAGTTAATATCGCATACATATGCACCCCACCTCGCTGGAA  100

seq1  ACTACGGTAGGCAAAAATTCTTTTTCACCAAAGAGGACCTGAAATTGACA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACGGTAGGCAAAAATTCTTTTTCACCAAAGAGGACCTGAAATTGACA  150

seq1  AATGTGAAGAGCAGCTCTTAGTGTGAGAAAGTGTTTTGCCTGATAGAAGC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGAAGAGCAGCTCTTAGTGTGAGAAAGTGTTTTGCCTGATAGAAGC  200

seq1  ATAATGTTTATACGGAGTGAGACAAAAGACAAAACTACTATGTGCTGCTG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGTTTATACGGAGTGAGACAAAAGACAAAACTACTATGTGCTGCTG  250

seq1  AAGTGGATTGGCTTACTTCACTGAATATGACATTCAGTA-CCTAACTTGA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AAGTGGATTGGCTTACTTCACTGAATATGACATTCAGTACCCTAACTTGA  300

seq1  GAAACAACACTCCCAAATATGACAGAAACATTTTTAATCAGATTAAATTG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAACACTCCCAAATATGACAGAAACATTTTTAATCAGATTAAATTG  350

seq1  AATGTAAACTTTTGAGAATCATGAACATTTTGGGGTGAGAGCAATCTTTC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAAACTTTTGAGAATCATGAACATTTTGGGGTGAGAGCAATCTTTC  400

seq1  TCTTTCTTTATTGGGGAGGGTTTATTTAGGGTTAATGTCTGATAGACTTG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCTTTATTGGGGAGGGTTTATTTAGGGTTAATGTCTGATAGACTTG  450

seq1  TTGAACTAAACTCTTTATAGAATTGGCTATATTTTGAAGTATGCTTACCA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTAAACTCTTTATAGAATTGGCTATATTTTGAAGTATGCTTACCA  500

seq1  TAAAATGAAAACATGTCCATACAAAAACTTGCAAATTAGCAAACCAGAAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGAAAACATGTCCATACAAAAACTTGCAAATTAGCAAACCAGAAA  550

seq1  AAAAAAAACCACTGAAAACTCTGTCAGTGGTGGTATACAGATTAACTGAA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAACCACTGAAAACTCTGTCAGTGGTGGTATACAGATTAACTGAA  600

seq1  TGTCTTACATTTACACAAGAGATTACAATTCTTTCACAGAAGATGTTCCT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTACATTTACACAAGAGATTACAATTCTTTCACAGAAGATGTTCCT  650

seq1  GTAATGCTACACCATAGATGAACTAATGATATTTACACTAACTGGTATAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGCTACACCATAGATGAACTAATGATATTTACACTAACTGGTATAG  700

seq1  CCAAGACAGAGGACCCCAATGCACATGATTCCATTGAGATGAAAAAACTA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGACAGAGGACCCCAATGCACATGATTCCATTGAGATGAAAAAACTA  750

seq1  AGATCCACAATTTTAGTAGACACACAGGTGATTCAAGATACTGGGTGAAA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCACAATTTTAGTAGACACACAGGTGATTCAAGATACTGGGTGAAA  800

seq1  GAGACTGTAGCAGCTTCATGTAGTAGTGATGTCAGATATTGAAACACACA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACTGTAGCAGCTTCATGTAGTAGTGATGTCAGATATTGAAACACACA  850

seq1  CACACATACAACACATACAAAACAAGTTATCAAAATTGCATAGCAGGCTG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACATACAACACATACAAAACAAGTTATCAAAATTGCATAGCAGGCTG  900

seq1  TGAGAGAGTACAAGATGAAAAATATGACTCTAACTAGGTGAGTGTTGCAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGAGTACAAGATGAAAAATATGACTCTAACTAGGTGAGTGTTGCAT  950

seq1  TGCACATCTGTTGTCCAAAGATAATTCTCAGCTTTGTAATCCTTATAGAC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACATCTGTTGTCCAAAGATAATTCTCAGCTTTGTAATCCTTATAGAC  1000

seq1  AAATGGGATTTGGAAAAGTTCAAAGCACTAAGGAGAAGGAGAAGGAATTG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGGATTTGGAAAAGTTCAAAGCACTAAGGAGAAGGAGAAGGAATTG  1050

seq1  AAATTCAAAAATTTAAAGATCTCCAGAGAATCTAATCTGAATTC  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCAAAAATTTAAAGATCTCCAGAGAATCTAATCTGAATTC  1094

seq1: chr19_33436098_33437214
seq2: B6Ng01-254H15.g_66_1194

seq1  GAATTCTTATAAAGAGTAAATTACTCTATTTGGAATAAATTATGTTTATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTATAAAGAGTAAATTACTCTATTTGGAATAAATTATGTTTATT  50

seq1  AGATTTATGCTGAAACATTTTATGATATATATGTACATCAAAACATATTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTATGCTGAAACATTTTATGATATATATGTACATCAAAACATATTA  100

seq1  TACATCTTAAATAAATATAAATACTATTTTTCAACCATACCTTGATTAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCTTAAATAAATATAAATACTATTTTTCAACCATACCTTGATTAGT  150

seq1  AAAGTAAAATAAAGAACATAAATCCTAAAATTTTGATTCCAAAATAAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAAAATAAAGAACATAAATCCTAAAATTTTGATTCCAAAATAAAAA  200

seq1  AATCACTATCACAGCCAAAGTATATATAGGTTGAGCATGGTGACACATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACTATCACAGCCAAAGTATATATAGGTTGAGCATGGTGACACATGT  250

seq1  CTGTCTGCTCAGCACTCAGGAGGCCAAAACAGATATATTATGAATTCAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTGCTCAGCACTCAGGAGGCCAAAACAGATATATTATGAATTCAGA  300

seq1  GCTACCTTGTATTATATTATGAGCTCTATACTTCCCTGGCCTTCATGGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACCTTGTATTATATTATGAGCTCTATACTTCCCTGGCCTTCATGGAA  350

seq1  AGATCTCTCACAAAATATCATGTAAGTCATGTGTAACTTATAACACAGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTCTCACAAAATATCATGTAAGTCATGTGTAACTTATAACACAGTG  400

seq1  GTTGTGAGGACGCAGATTCTTAGACATCAATAGTCACTATTGTGAAAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGAGGACGCAGATTCTTAGACATCAATAGTCACTATTGTGAAAACA  450

seq1  TGTAGATATACACGTACCTAGATAAAATAGCCAACTGCACAGCTAGGCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGATATACACGTACCTAGATAAAATAGCCAACTGCACAGCTAGGCCA  500

seq1  TGTGATAAATGTATATGCAATATACTTGTATAGATCTATACAGATACAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATAAATGTATATGCAATATACTTGTATAGATCTATACAGATACAGT  550

seq1  GCACTGTTCCTAGGACCTTGAAGGACAAGACAATACAAGAGAAAACCAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGTTCCTAGGACCTTGAAGGACAAGACAATACAAGAGAAAACCAAG  600

seq1  TCTAAGAGCATAAATTGCAATCAGTAGATATAGAAAAGGCTAGAGATAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGAGCATAAATTGCAATCAGTAGATATAGAAAAGGCTAGAGATAGC  650

seq1  AGATGCTTGCTAGTGTGCTCAGTGCTCTGAGTTCAATCCCCAGCAATGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCTTGCTAGTGTGCTCAGTGCTCTGAGTTCAATCCCCAGCAATGCA  700

seq1  GTAGTACTACTAATAATTGAAATTCTTCAGGTGTGGTGGCAATGCATGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTACTACTAATAATTGAAATTCTTCAGGTGTGGTGGCAATGCATGCC  750

seq1  CCCCCCCTTTAAAAAGTTA-TTTATTTTATGTGTATGGATG-TTTTGTCT  798
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CCCCCCCTTTAAAAAGTTATTTTATTTTATGTGTATGGATGTTTTTGTCT  800

seq1  GCA-TTTATGTTTTCTAAGA-TTTATTTATATATTTTATAAATATGGATG  846
      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTTATGTTTTCTAAGATTTTATTTATATATTTTATAAATATGGATG  850

seq1  TTTTGTTTACATACCAGATGAGGGGATAAGATCCCATTATGGATAGTTGT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTTTACATACCAGATGAGGGGATAAGATCCCATTATGGATAGTTGT  900

seq1  GGGCAACCATAGAGGTCCTGGGAATTGAACTCAGGACATCT-GGAAGGAC  945
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
seq2  GGGCAACCATAGAGGTCCTGGGAAATGAACTCAGGACATCTGGGAAGGAC  950

seq1  -AACCAATATGCTCTTGACCCCTGAGCCATCTCTCTGGCCCACAAA--CA  992
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |
seq2  AAACCAATATGCTCTTGACCCCTGAGCCATCTCTCTGGCCCACAAAACAA  1000

seq1  CATCCC-TTTAATGCCAACATTTTCGAGGCAAAGGCAGGAT-GATTGGCA  1040
      |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
seq2  CATCCCTTTTAATGGCAACATTTTCGAGGC-AAGGCAGGATGGATTGGCA  1049

seq1  GTTTAAGGCCATAGTGGGTTATATAGCAAAACACTATCATAAAAAATAAC  1090
      |||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |
seq2  GTTTTACGCCATAGTGGGGTATATAGCCAAACACTATCAT-AAAAATACC  1098

seq1  TAGAGGAGATG----TGAGGAGGGGGAGGAC  1117
      |||||||||||     ||||||||||| |||
seq2  TAGAGGAGATGGTGAAGAGGAGGGGGAAGAC  1129