BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-290K05
Chromosome19 (Build37)
Map Location 30,913,108 - 31,050,751
singlet/doubletdoublet
Overlap genePrkg1, LOC625995
Upstream geneIl33, Trpd52l3, Uhrf2, Gldc, EG625917, Mbl2, LOC100042088, LOC668020, EG546723, Dkk1
Downstream geneCstf2t, 8430431K14Rik, 1810073H04Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-290K05.bB6Ng01-290K05.g
ACCGA087730GA087731
length1,0941,074
definitionB6Ng01-290K05.b B6Ng01-290K05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,049,658 - 31,050,751)(30,913,108 - 30,914,184)
sequence
gaattctaccattggagactagtattatctgcttcaagtcaagttaatct
aattgttcagtatgtactgtccctgggtgactttgctcaattttatatct
tgaggagttatctctcttactgagtaaatgcatagctcactttttattat
gttgctgcattccattaagttaagatgtcaacttggatcatccattttcc
taacaacacatgctggcttgtacccagattgggtgttttccagtcttgca
ggtttttataaaatgattggaaatgaccttgagcagtcttttagtgagtt
tctgttttgatttctcttaaatgtacacttcaaaacaagatgtctgggtc
acagtgggggcatacatttagctttttatagatatatcatatcatatttt
ccagtggatgagccagtttatactactaccaaattatgggagagatattt
ttcaaattttcaccaatatttgttactgtgaaacaaatattaattaaaat
atttaagcttattcttaagcttaaatgactgaaacattttaagagaatgc
agttcacaaagcctgaaagtttcctgcaggtaattcattaatatattttt
tgagcaatatgcaaaaaaatgttatatgtaattatcaattacatatatta
actatatattaattttaaaaagaaatatttttcttaattaatgaatccat
agattttttttaaagaaaagacattaaatcaattgagagcccagaagaaa
acccatacatttctgatcttctacaaagcatccaaatgacataaagcgaa
taggagcttatcttcaaacaaatgactgttgaaaaacttaacattcatat
aggtaagaagaaactggaccatcattacatacctcatacaaattacactc
aaaaatgaattaagacttgaaggtaaacctgaaatccataaaacttctag
atgaaaaacataagaaaatgttattcaatattggtgtgtgtatatatata
tatatcaaaagtttcaaatgcaaagcaagatagccatatggcaataagtc
gaagtactacacagcaagatcatagtgtgtgtgttgacagcctc
gaattccaatgcaaaagaaggcaaacaagtcattgatgatgccccaagaa
aagagggattcaccaaagtcctaggttcgaggtcttgagacctttggaaa
taatattaggtgtagaagagggagatgagatgattaacgactacggagat
aaaataactgtaaacccctgtgatgctaggagtctttctgagcaaaagta
agattgcattaggaagctatagactgttaaaaggctatgacaagactgaa
atcaatatgcagatcaaagctaagatccatgggttgaagccatgaaggac
actgggaattactgaaagtctgacagataaacacaatgcggctgagggaa
ggctgaggtagagagagtaaagactcctgaaagagtgggagaggctcaga
ctggtgcttgcagacctgtgaaagcctttaagacaactaggtgagcacag
tcatgagggatttcaaccatcctgggcctctgcccttgcaccattgggta
gaagagacatgtgctcagtcccagtcacaacacaagcaaatcagttcctc
ctcccgtaggcactaaagaaccaaaggaacacaagatgttctgtcttctg
cataaagggcaaatatagagcttacaagtcatgcagctttggggaaggaa
aaatgaaaagggcatctgtagtaggttaaaagaaaaaaaagtaacaaata
tccaactggtgaactcggtatctaagagagttttccacgggccagagaga
aatggattacaaaaggttatgtggatcagaaggcatctcactaagctgct
tatggtaataataagagattacaatgaaccagggattgtgctaaaggctt
tgtgcacggattaacaataaaattgatcaagctaacccagaatgcttgac
gaataccaaagtatgctaaaagtactaattacatccaatcataactatgt
tttgattggtcaagttggacctataaatcattttctgaaaaaaaatgttc
tctgtgtaaaataaatgtagaatgtcatatgtattaaagcatggctctgg
gtggccagtgcacaggactttaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_31049658_31050751
seq2: B6Ng01-290K05.b_58_1137 (reverse)

seq1  GAGGCTG--GTCACACACACTATTGATTCCTTTGCTGTGTAGTACCTTTC  48
      |||||||    ||||||||||| ||||    ||||||||||||||  |||
seq2  GAGGCTGTCAACACACACACTA-TGAT---CTTGCTGTGTAGTAC--TTC  44

seq1  GAACTTTATTCCCATATGGCTAATCTTGCCTTTGCATTTGGAAACTTTTG  98
      ||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||
seq2  GA--CTTATTGCCATATGGCT-ATCTTG-CTTTGCATTT-GAAACTTTTG  89

seq1  ATATATATATATATACACACACCAATATTGAAATAACATTTTCCTTATGT  148
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
seq2  ATATATATATATATACACACACCAATATTG-AATAACATTTT-CTTATGT  137

seq1  TTTTCATCTAGAAGTTTTATGGATTTCAGGTTTTACCTTCAAGTCTTTAA  198
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
seq2  TTTTCATCTAGAAGTTTTATGGATTTCAGG-TTTACCTTCAAGTC-TTAA  185

seq1  TTCATTTTTGAGTGTAATTTGTATGAGGTATGTAATGATGGTCCAGTTTT  248
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTCATTTTTGAGTGTAATTTGTATGAGGTATGTAATGATGGTCCAG-TTT  234

seq1  CTTCTTACCTATATGAATGTTAAGTTTTTCAACAGTCATTTGTTTGAAGA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTACCTATATGAATGTTAAGTTTTTCAACAGTCATTTGTTTGAAGA  284

seq1  TAAGCTCCTATTCGCTTTATGTCATTTGGATGCTTTGTAGAAGATCAGAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCTCCTATTCGCTTTATGTCATTTGGATGCTTTGTAGAAGATCAGAA  334

seq1  ATGTATGGGTTTTCTTCTGGGCTCTCAATTGATTTAATGTCTTTTCTTTA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGGGTTTTCTTCTGGGCTCTCAATTGATTTAATGTCTTTTCTTTA  384

seq1  AAAAAAATCTATGGATTCATTAATTAAGAAAAATATTTCTTTTTAAAATT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATCTATGGATTCATTAATTAAGAAAAATATTTCTTTTTAAAATT  434

seq1  AATATATAGTTAATATATGTAATTGATAATTACATATAACATTTTTTTGC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATATAGTTAATATATGTAATTGATAATTACATATAACATTTTTTTGC  484

seq1  ATATTGCTCAAAAAATATATTAATGAATTACCTGCAGGAAACTTTCAGGC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGCTCAAAAAATATATTAATGAATTACCTGCAGGAAACTTTCAGGC  534

seq1  TTTGTGAACTGCATTCTCTTAAAATGTTTCAGTCATTTAAGCTTAAGAAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGAACTGCATTCTCTTAAAATGTTTCAGTCATTTAAGCTTAAGAAT  584

seq1  AAGCTTAAATATTTTAATTAATATTTGTTTCACAGTAACAAATATTGGTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTAAATATTTTAATTAATATTTGTTTCACAGTAACAAATATTGGTG  634

seq1  AAAATTTGAAAAATATCTCTCCCATAATTTGGTAGTAGTATAAACTGGCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTTGAAAAATATCTCTCCCATAATTTGGTAGTAGTATAAACTGGCT  684

seq1  CATCCACTGGAAAATATGATATGATATATCTATAAAAAGCTAAATGTATG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCACTGGAAAATATGATATGATATATCTATAAAAAGCTAAATGTATG  734

seq1  CCCCCACTGTGACCCAGACATCTTGTTTTGAAGTGTACATTTAAGAGAAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCACTGTGACCCAGACATCTTGTTTTGAAGTGTACATTTAAGAGAAA  784

seq1  TCAAAACAGAAACTCACTAAAAGACTGCTCAAGGTCATTTCCAATCATTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAACAGAAACTCACTAAAAGACTGCTCAAGGTCATTTCCAATCATTT  834

seq1  TATAAAAACCTGCAAGACTGGAAAACACCCAATCTGGGTACAAGCCAGCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAAACCTGCAAGACTGGAAAACACCCAATCTGGGTACAAGCCAGCA  884

seq1  TGTGTTGTTAGGAAAATGGATGATCCAAGTTGACATCTTAACTTAATGGA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTGTTAGGAAAATGGATGATCCAAGTTGACATCTTAACTTAATGGA  934

seq1  ATGCAGCAACATAATAAAAAGTGAGCTATGCATTTACTCAGTAAGAGAGA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGCAACATAATAAAAAGTGAGCTATGCATTTACTCAGTAAGAGAGA  984

seq1  TAACTCCTCAAGATATAAAATTGAGCAAAGTCACCCAGGGACAGTACATA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTCCTCAAGATATAAAATTGAGCAAAGTCACCCAGGGACAGTACATA  1034

seq1  CTGAACAATTAGATTAACTTGACTTGAAGCAGATAATACTAGTCTC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACAATTAGATTAACTTGACTTGAAGCAGATAATACTAGTCTC  1080

seq1: chr19_30913108_30914184
seq2: B6Ng01-290K05.g_66_1139

seq1  GAATTCCAATGCAAAAGAAGGCAAACAAGTCATTGATGATGCCCCAAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAATGCAAAAGAAGGCAAACAAGTCATTGATGATGCCCCAAGAA  50

seq1  AAGAGGGATTCACCAAAGTCCTAGGTTCGAGGTCTTGAGACCTTTGGAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGGATTCACCAAAGTCCTAGGTTCGAGGTCTTGAGACCTTTGGAAA  100

seq1  TAATATTAGGTGTAGAAGAGGGAGATGAGATGATTAACGACTACGGAGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATTAGGTGTAGAAGAGGGAGATGAGATGATTAACGACTACGGAGAT  150

seq1  AAAATAACTGTAAACCCCTGTGATGCTAGGAGTCTTTCTGAGCAAAAGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAACTGTAAACCCCTGTGATGCTAGGAGTCTTTCTGAGCAAAAGTA  200

seq1  AGATTGCATTAGGAAGCTATAGACTGTTAAAAGGCTATGACAAGACTGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTGCATTAGGAAGCTATAGACTGTTAAAAGGCTATGACAAGACTGAA  250

seq1  ATCAATATGCAGATCAAAGCTAAGATCCATGGGTTGAAGCCATGAAGGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATATGCAGATCAAAGCTAAGATCCATGGGTTGAAGCCATGAAGGAC  300

seq1  ACTGGGAATTACTGAAAGTCTGACAGATAAACACAATGCGGCTGAGGGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGAATTACTGAAAGTCTGACAGATAAACACAATGCGGCTGAGGGAA  350

seq1  GGCTGAGGTAGAGAGAGTAAAGACTCCTGAAAGAGTGGGAGAGGCTCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGAGGTAGAGAGAGTAAAGACTCCTGAAAGAGTGGGAGAGGCTCAGA  400

seq1  CTGGTGCTTGCAGACCTGTGAAAGCCTTTAAGACAACTAGGTGAGCACAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGCTTGCAGACCTGTGAAAGCCTTTAAGACAACTAGGTGAGCACAG  450

seq1  TCATGAGGGATTTCAACCATCCTGGGCCTCTGCCCTTGCACCATTGGGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAGGGATTTCAACCATCCTGGGCCTCTGCCCTTGCACCATTGGGTA  500

seq1  GAAGAGACATGTGCTCAGTCCCAGTCACAACACAAGCAAATCAGTTCCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGACATGTGCTCAGTCCCAGTCACAACACAAGCAAATCAGTTCCTC  550

seq1  CTCCCGTAGGCACTAAAGAACCAAAGGAACACAAGATGTTCTGTCTTCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCGTAGGCACTAAAGAACCAAAGGAACACAAGATGTTCTGTCTTCTG  600

seq1  CATAAAGGGCAAATATAGAGCTTACAAGTCATGCAGCTTTGGGGAAGGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAGGGCAAATATAGAGCTTACAAGTCATGCAGCTTTGGGGAAGGAA  650

seq1  AAATGAAAAGGGCATCTGTAGTAGGTTAAAAGAAAAAAAAGTAACAAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAAAAGGGCATCTGTAGTAGGTTAAAAGAAAAAAAAGTAACAAATA  700

seq1  TCCAACTGGTGAACTCGGTATCTAAGAGAGTTTTCCACGGGCCAGAGAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACTGGTGAACTCGGTATCTAAGAGAGTTTTCCACGGGCCAGAGAGA  750

seq1  AATGGATTACAAAAGGTTATGTGGATCAGAAGGCATCTCACTAAGCTGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGATTACAAAAGGTTATGTGGATCAGAAGGCATCTCACTAAGCTGCT  800

seq1  TATGGTAATAATAAGAGATTACAATGAACCAGGGATTGTGCTAAGGGCTT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TATGGTAATAATAAGAGATTACAATGAACCAGGGATTGTGCTAAAGGCTT  850

seq1  TGTGCACGGATTAACAATAAAATTGATCAAGCTAACCCAGAATGCTTGAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCACGGATTAACAATAAAATTGATCAAGCTAACCCAGAATGCTTGAC  900

seq1  GAATACCAAAGTATGCTAAAAGTACTAATTACATCCAATCATAACTATGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATACCAAAGTATGCTAAAAGTACTAATTACATCCAATCATAACTATGT  950

seq1  TTTGATTGGTCAAGTTGGACCTATAAAATCATTTTCTGAAAAAAAATGTT  1000
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATTGGTCAAGTTGGACCTAT-AAATCATTTTCTGAAAAAAAATGTT  999

seq1  CTCTGTGTTAAAATAAATGTAGAATGTCAATATGTATTAAAGCATTGGCT  1050
      ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  CTCTGTG-TAAAATAAATGTAGAATGTC-ATATGTATTAAAGCA-TGGCT  1046

seq1  CT-GGTGG-CAGTGGCACAGACCTTTAAT  1077
      || ||||| |||| ||||||  |||||||
seq2  CTGGGTGGCCAGT-GCACAGGACTTTAAT  1074