BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-327K13
Chromosome19 (Build37)
Map Location 52,898,801 - 52,899,859
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042936, Ins1
Downstream geneLOC100043450, Xpnpep1, LOC668545, LOC674277, Add3, 1700001K23Rik, Mxi1, Smndc1, Dusp5, LOC100043462, Smc3, Rbm20
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-327K13.b
ACCGA115147
length1,055
definitionB6Ng01-327K13.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattctcccatcagcacatggaacacatgctttcaggtagcagtgcagt
gcttggcctcactgcaatacagtcttcaaaagccaacgctttcagctgct
agactcactttctactgtaaatcacaagcaaattctgtacatgctaaatc
tgtcttcatgcaactgccaacccaagatgctatcttcacacatccagttc
taccaaagatgccctttaccatcctgtggtcatcttcaagctgtacaagc
aatgtcgatctgttcacaacactgaaaaggcgacaatgacacatttatct
gttaactgtatgaaaaaagttggtcttgaaatggtttttcactctacgaa
tcagcataagaatattccaggtttaaaaaaatgaatgcagaggccaggaa
gatggccaggtccccagctgcctagcctaatgacctgagtttaatgtctg
ggacccacgtggtagaaggagagactccacacccaggccttggcacacac
tcacccacatacacatgtgcacacaaaataaaatagataaaacataattt
taaaaacccagaatggagtggtgttttatgcccacctcccctctctgtgc
cagaatttgtctgccttaagctcctacaggtcttgtgagtgctgtcacag
cctctggggggtttgtatgtggaatagtcctgctgtatccagaaaacttt
gtttcctggcattcatcctccacctgttttattattattattattattat
tattattattattattattattattcactttatatcctgatcacagccca
cctcttccccctcctcccagttccattctcacatacccttcctaagtctc
ccctccctgtcttctcagagactaggtgccctcccatgggtactaaacca
ctctggcacatcaagtcacgtcaggagtaagctcatcctctctcactgag
gccagactaggcaagggaagggatcataaggcagcaacagagtctgagat
ggcccccgctccaattgttaagggaccacatgaagaccagctgcacatct
tgcta
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_52898801_52899859
seq2: B6Ng01-327K13.b_44_1098

seq1  GAATTCTCCCATCAGCACATGGAACACATGCTTTCAGGTAGCAGTGCAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCCATCAGCACATGGAACACATGCTTTCAGGTAGCAGTGCAGT  50

seq1  GCTTGGCCTCACTGCAATACAGTCTTCAAAAGCCAACGCTTTCAGCTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGCCTCACTGCAATACAGTCTTCAAAAGCCAACGCTTTCAGCTGCT  100

seq1  AGACTCACTTTCTACTGTAAATCACAAGCAAATTCTGTACATGCTAAATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCACTTTCTACTGTAAATCACAAGCAAATTCTGTACATGCTAAATC  150

seq1  TGTCTTCATGCAACTGCCAACCCAAGATGCTATCTTCACACATCCAGTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCATGCAACTGCCAACCCAAGATGCTATCTTCACACATCCAGTTC  200

seq1  TACCAAAGATGCCCTTTACCATCCTGTGGTCATCTTCAAGCTGTACAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAAAGATGCCCTTTACCATCCTGTGGTCATCTTCAAGCTGTACAAGC  250

seq1  AATGTCGATCTGTTCACAACACTGAAAAGGCGACAATGACACATTTATCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCGATCTGTTCACAACACTGAAAAGGCGACAATGACACATTTATCT  300

seq1  GTTAACTGTATGAAAAAAGTTGGTCTTGAAATGGTTTTTCACTCTACGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAACTGTATGAAAAAAGTTGGTCTTGAAATGGTTTTTCACTCTACGAA  350

seq1  TCAGCATAAGAATATTCCAGGTTTAAAAAAATGAATGCAGAGGCCAGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATAAGAATATTCCAGGTTTAAAAAAATGAATGCAGAGGCCAGGAA  400

seq1  GATGGCCAGGTCCCCAGCTGCCTAGCCTAATGACCTGAGTTTAATGTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCCAGGTCCCCAGCTGCCTAGCCTAATGACCTGAGTTTAATGTCTG  450

seq1  GGACCCACGTGGTAGAAGGAGAGACTCCACACCCAGGCCTTGGCACACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCCACGTGGTAGAAGGAGAGACTCCACACCCAGGCCTTGGCACACAC  500

seq1  TCACCCACATACACATGTGCACACAAAATAAAATAGATAAAACATAATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCACATACACATGTGCACACAAAATAAAATAGATAAAACATAATTT  550

seq1  TAAAAACCCAGAATGGAGTGGTGTTTTATGCCCACCTCCCCTCTCTGTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAACCCAGAATGGAGTGGTGTTTTATGCCCACCTCCCCTCTCTGTGC  600

seq1  CAGAATTTGTCTGCCTTAAGCTCCTACAGGTCTTGTGAGTGCTGTCACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATTTGTCTGCCTTAAGCTCCTACAGGTCTTGTGAGTGCTGTCACAG  650

seq1  CCTCTGGGGGGTTTGTATGTGGAATAGTCCTGCTGTATCCAGAAAACTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGGGGGGTTTGTATGTGGAATAGTCCTGCTGTATCCAGAAAACTTT  700

seq1  GTTTCCTGGCATTCATCCTCCACCTGTTTTATTATTATTATTATTATTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCTGGCATTCATCCTCCACCTGTTTTATTATTATTATTATTATTAT  750

seq1  TATTATTATTATTATTATTATTATTCACTTTATATCCTGATCACAGCCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATTATTATTATTATTATTATTCACTTTATATCCTGATCACAGCCCA  800

seq1  CCTCTTCCCCCTCCTCCCAGTTCCATTCTCACATACCCCTTCCCTAAGTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||
seq2  CCTCTTCCCCCTCCTCCCAGTTCCATTCTCACATACCC--TTCCTAAGTC  848

seq1  TCCCCTCCCTGTCTTCTCAGAGACTAGGTGCCCTCCCATGGGTACTAAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCCCTGTCTTCTCAGAGACTAGGTGCCCTCCCATGGGTACTAAAC  898

seq1  CACTCTGGCACATCAAGTCACGTCAGGATTAAGCTCATCCTCTCCCACTG  950
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  CACTCTGGCACATCAAGTCACGTCAGGAGTAAGCTCATCCTCTCTCACTG  948

seq1  AGGCCAGACAAGGCAAGGGAAGGGATCCAAAGGCAGGCAACAGAGTCAGA  1000
      ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||
seq2  AGGCCAGACTAGGCAAGGGAAGGGATCATAAGGCA-GCAACAGAGTCTGA  997

seq1  GATGGCCCCCGCTCCAATTGTTAGGGGACCCACATGAAGACCAAGCTGCA  1050
      ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||
seq2  GATGGCCCCCGCTCCAATTGTTAAGGGA-CCACATGAAGACC-AGCTGCA  1045

seq1  CATC-TGCTA  1059
      |||| |||||
seq2  CATCTTGCTA  1055