| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-049H05.T7 (MSMg01no049_h05.b1) | MSMg01-049H05.TJ (MSMg01no049_h05.g1) |
| ACC | AG278899 | AG278900 |
| length | 1,259 | 1,278 |
length of high quality (start - end) | 554 (74 - 627) | 320 (76 - 395) |
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_h05.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_h05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:29 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_h05.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_h05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:29 2005 |
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | TATGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTCTGGT
CTATGAAATTGCTGTTTCCAGATGTTTGATGACGAGTTTCCTTAACCTTA
CCCTCTTGACGGTCAAACCAAACTTCCTTCATAGTGTTAAAATTGTCCAC
TACCTCAGCCAGACAAGTTAAAACCAATTCTACTACATGGGTCTGAATCT
CCATGGCTTTTCTACCTGGTAAGTTTTGTCATTGGAGCATCTTGAGAGGA
CAGCTTAGCAAGGTTAATATGAAGAGATGTTTTCATTGAACTTGAAATTC
AACTGATTGAAAATATCCCTTGCTTAGCTATCTTCTAATTGAAACTGCTG
TGAGAAAAAGCAAACGGAAGCTGACCCGGTATGCTTTAAAATACTTATTC
CATCTGATAACTGGGATACAAACAAGGTATGCTCTTACAACCTTGCATTC
AAGATAAGGCTGCACAGGTGGTTGTTCCCAGAGACTTCTGGACAACAGCA
TCTCGTCAGCAGGGAACTTATACGGAATGCAATGTCTCAGACAATGCAGT
GGGGAACGGCGGGATGGATTGGCAATAGTCAGTCTCAGACCCTCCAGGTG
ACTCCACTGACAGCTTATGAACCACAGATGCACAGCGAAGCAGGATCCTT
ACTGCTGCAGGTGCAGAGATTGCCTGGAACACCGAGCTCTGCCCCTGCTC
AGTAGGTGACCTTCAGCAAGTTACTTAACACTCATAGGTCTTAATACCCT
CATCCATAAAGTAGCTATGATAATAATGCCTAACTCACTGTAACACTGTT
AATAATCCACTACTTAAGAGAGTTATGCAAAGACTTGGTGTAAAGTGGTG
AAAATCCATTAATGCAGGACATTATTCTCTCTGCTACTAAATGATTACAA
GTTTTGTTCAATTCAAATTGGCATTTGTAATTAATTCCACATCTCCCTAT
ATGTCCATTTATAAAAACCCCCTGGCCATGTCTCACTCTCTTTTAAAATA
AAAGTCTTAACCTCCTTGATGTTGGTCCAATAATTCTTCTAAAATACTAT
TTTTCAAACAATATTTATCCCATGGCTTATAAACATTTGGTTTCTGTTCC
TCCAACTCAACGTATATTAAATTTCTTGTCAAAAATACCTCTTTCTCCTC
AGCTCCGGTATATTCATAATAATAGTACTTCTTCTGCGTTTATCGACTCT
TTTATCAAATAATAACTCCTTAGAGAAATTCTCTATTACTACCAGTTCAT
ATCCTATAT
| ATATGAAGGNAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXCCTCTTTAAAGGTTTATATCTCATGTTTCAATTGGAT
TATTTGCCTTGTTTATGTCCCCCTTTTTTAGTTCTTTATATATTTTGAAT
GTTAGTCCTCTGTCCAATATGGAGTTGGTGAAAATCTTTTCTCATTCTAT
AGGTTGCCATTTTCTCCTATTGGCAGTATCCTTTGCCTTACAGAAACTTT
TCAAGTTCATGAGTTCTATTCAAGAAGTTGTCTCCTGTGCCAATATGTCT
CAAGATATTATTCTCCACTTTCTCTTCTATCAGGTTCAGTGTATCTGATT
TTATGATGAGGTCTTTGATCCACTTAGACTTGAGTCCTGTGTAGAGTGAT
AGACATGGATCTATTTGCCTTCTTCTACATCCTCTTAGACCAGCATTATT
TGCTGAAGATGCTTTTTCCCCCATTGTCTCTTTCTGGGGTTTATTGTTTT
GTTTTGTGCCTTCTTTTATCATAACTTTTATTAATTTTTTATCATTTATT
AATTCTTTTCTTTCTTCTTTCACTTCTATTATTTATTTCTTTATCCTAAT
TTTACATCTCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTCTTCTTATTTTTTTTTATAT
TTCTTTCTTTCTTATCTTATCTTTTTTCATTTTCTCTCTTTTTATTTTTT
TATTCATTTTTTCTCTTTTTTATAATCCTTCATTTTTATATTTAACGTTT
TATAATCTATACTTTTTTATATTATTTTACTTTATAACTATTCATTGTTT
GTTTCCTATTATACATCTCTTTTTTTCTTTAATTCCTTCTTTATTTAAAT
CTTTATCCCTAATCTTCTATTCTCTTATTTTTCATTTTATTCTATTTTTT
ATTTCTCTTTTATCTTACCTTATTTTTTTTTTTTTATATTCTTTCTCCTT
CTTATTATTCTATTATATTATTATATTATATTAATATTTTATTTCTTTAT
TTTCATTATTCCTTTTCTTTACATTTTTTATTTTCCTTATTTAATACTTC
TTTTTTTATTTCTTTTATTTTTATTCTTTATCTATTATTATTTTTCTATT
ACTTTTTTTTTTTTAAATCTTTATTTCTTTCCCTACTTTTCACTCTTTTA
TAATTATCTATTATTCTCCACAAACTTCTTTTTTTTATTCATTATATTAA
TATTTTATTTAAATATGTTTTTTAATTTATATTTTATATTTTTTTTTATA
TNAATTATTTTTATAATATATATTTATA
|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 11 12 17 23 17 13 12 9 9 9 10 13 10 10 10 15 19 26 24 24 35 39 47 47 47 43 43 42 42 42 47 43 57 42 42 47 47 47 57 50 50 50 50 50 50 36
36 33 33 33 33 42 41 25 17 9 11 11 9 9 9 12 11 11 11 13 13 13 18 12 21 29 37 44 53 57 59 57 57 50 50 53 36 36 36 38 36 36 44 41 39 37 37 37 22 22
10 8 8 8 11 19 27 34 39 39 37 30 28 22 22 12 13 14 17 13 15 24 30 41 50 50 50 50 53 50 50 53 53 50 50 43 43 53 53 53 53 59 57 57 57 50 50 50 50 50
50 51 50 68 57 57 57 68 59 59 59 59 59 59 57 68 50 50 50 50 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 57 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 54 54 57 59 59 57 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 52 52 34 38 38 52 52 52 57 57 59 59 59 57 44 43 35 28 28 32 32 42 44 38 41 23 23 20 43 43 57 59 59 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 44 44 31 31 31 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 39 43 43 23 20
14 20 38 23 23 23 38 38 62 68 68 62 62 62 62 62 44 44 35 35 35 43 43 62 62 62 45 45 45 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 47 62 43 43 20 20 18 38 36
52 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 38 38 13 13 13 38 38 52 57 57 59 59 59 37 37 37 52 52 43 43 35 24 24 11
12 12 27 27 52 52 52 52 37 43 32 33 32 24 24 43 43 57 57 38 21 10 9 9 15 27 50 57 50 43 43 43 57 57 50 50 32 32 15 13 13 18 26 41 57 42 42 33 36 28
20 18 18 16 21 15 15 14 23 23 36 36 37 39 42 39 40 57 44 34 27 17 17 22 34 36 37 37 37 44 39 36 36 43 40 40 28 31 23 32 32 43 47 42 43 43 43 40 39 39
37 39 39 39 37 43 23 18 10 10 10 17 12 18 21 36 36 59 32 25 25 32 37 37 23 18 9 9 11 17 16 21 13 10 8 8 8 12 8 9 9 10 17 9 10 16 24 28 24 24
20 22 19 19 19 37 23 23 14 15 15 30 26 24 20 20 18 12 12 17 17 15 9 11 13 13 13 19 28 34 39 39 34 30 19 13 13 11 18 14 25 21 26 28 28 30 27 15 12 14
13 9 9 11 9 10 15 25 18 11 10 10 10 12 11 11 15 21 26 37 39 39 32 32 23 24 20 15 8 8 6 6 8 10 19 19 21 21 11 10 10 25 23 27 15 16 22 22 28 28
17 15 10 19 13 10 10 15 12 12 12 22 11 11 11 15 18 18 26 14 10 8 8 8 8 8 8 8 13 12 16 18 28 21 23 14 14 11 13 21 24 27 26 17 15 13 15 8 8 8
10 10 11 12 10 9 10 10 8 8 8 16 10 10 12 13 10 10 9 10 10 10 8 10 6 6 8 8 8 8 9 10 10 10 10 15 11 12 10 10 9 9 8 8 8 6 7 6 8 8
8 8 8 10 10 8 8 10 8 11 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 11 11 10 10 10 10 10 12 10 9 9 10 8 9 9 11 9 10 10 10 9 10 9 8 8 8 11
11 13 15 8 8 8 8 10 11 14 13 11 10 9 10 10 10 9 9 8 8 8 8 11 12 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 13 9 8 10 8 11 11 11 13 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 10 13 15 12 11 12 10 8 8 10 10 10 11 15 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8 8 10 10 10 15 12 13 11 11 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 12 11 11 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 10 10 10 10 10 8 10 6 6 8 8 9 8 8
15 12 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 10 16 10 8 8 7 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 9 9 9 9 12 10 8 8 8 8 8 8 9
8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 10 15 15 15 10 10 8 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10
8 8 8 11 8 9 9 9 10 10 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 7 7 13 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 6 8 8 10 8 8 8 8 8
8 16 14 10 10 7 7 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 8 6 9 9 9 9 7 8 10 8 8 10 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 9 9 8
8 6 6 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 6 8 6 6 3 6 8 6 3 0 3 6 7 8 8 8 8 8 9 10 13 7 7 9 9 16 11 19 19 22 10 10 12 22 22 29 22 24 25 30 32 35 36 36 37 36 43 39 39 39
50 57 50 50 50 50 50 50 47 37 23 22 9 10 10 12 12 10 10 8 8 8 8 15 19 21 21 29 29 31 31 35 35 50 50 36 36 36 37 42 37 50 50 50 50 53 57 57 53 53
57 57 35 21 8 8 8 10 13 21 17 17 17 22 29 30 28 24 22 13 10 10 10 15 23 59 37 37 37 37 41 33 47 53 38 38 42 42 42 43 43 43 47 53 59 57 57 57 57 57
48 50 51 43 43 43 68 50 50 50 50 48 50 50 50 50 50 50 68 68 54 57 57 57 57 48 43 37 37 44 48 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 68 68 59 59 59 52 52 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 57 57 57
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 68 57 38 38 20 20 20 41 41 44 44 39 35 35 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 52 52 52 57 62 62 33 33 12
12 11 34 34 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 38 38 13 20 20 44 35 31 31 35
43 57 57 57 57 57 39 39 35 44 44 57 35 57 57 57 57 68 57 57 57 68 68 57 57 45 45 45 57 57 57 39 28 19 11 11 11 24 38 38 27 15 11 11 9 12 12 16 15 12
11 11 12 12 32 34 57 57 27 34 12 17 18 41 41 57 57 57 57 57 57 54 54 59 59 59 59 59 59 57 57 32 44 23 16 16 27 27 57 57 57 68 57 57 48 48 34 34 28 28
31 41 41 43 44 44 37 37 37 42 23 40 30 30 18 21 8 8 8 10 19 23 11 11 12 11 11 10 10 21 22 41 48 48 47 41 22 23 11 11 11 23 27 40 37 35 35 40 40 47
40 40 47 47 47 26 17 10 10 10 13 14 20 12 10 12 8 8 8 6 8 8 8 10 12 12 11 11 11 11 10 8 8 6 6 8 10 10 15 9 9 9 8 8 8 12 7 7 10 8
8 6 7 8 8 10 11 11 9 10 9 9 9 9 9 10 8 8 10 8 9 9 10 9 16 16 12 12 16 11 10 8 7 6 6 6 8 8 10 8 10 8 10 6 7 6 6 8 9 9
10 9 10 10 8 6 6 8 8 12 12 14 16 15 24 24 22 16 12 8 8 8 8 8 8 26 23 23 23 24 19 15 11 10 10 8 8 9 9 12 12 12 13 8 11 11 10 10 11 12
12 12 11 7 8 9 9 12 12 14 10 10 6 6 9 10 10 9 8 8 8 9 9 10 10 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 18 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 13 13 9 9 9 11 11 9 9 9 9 9 10 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 15 8 8 8 8 10 8 8 8 6 9 8 10 8 9 9 8 8 12 10 8 8 9 6 8 6 6 8 6 8 8 8 10 9 9 10
7 7 11 13 9 9 9 11 10 6 8 6 6 6 6 9 13 17 12 8 8 8 8 10 10 10 10 11 14 12 11 11 12 13 11 8 8 8 10 8 9 10 10 8 8 9 9 8 8 7
9 9 10 10 10 10 8 7 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 9 12 10 12 7 7 8 8 8 9 7 11 12 19 15 10 10
8 8 10 8 8 9 11 10 13 10 9 9 8 8 8 8 8 6 8 6 8 6 6 8 8 10 10 10 13 14 16 14 16 11 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 10 8
10 10 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 7 9 9 12 8 8 8 8 8 8 13 7 7 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 16 15 15 10 9 9 9 8 10 7 7 6
8 8 9 9 10 13 9 9 9 9 9 9 11 16 10 10 7 6 8 6 6 6 8 10 15 14 12 15 15 16 10 8 8 8 8 8 10 11 10 10 15 13 13 10 10 10 8 10 6 6
8 11 18 16 10 10 10 8 8 10 6 6 8 8 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 12 12 12 10 8 8 8 8 10
8 6 7 8 8 17 15 15 12 17 16 8 8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 9 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8
8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 9 11 13 15 12 10 9 9 10 8 8 9 9 9 12 13 8 8 8 6 6 8
8 6 6 8 8 8 13 11 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 14 15 15 13 9 9 10 8 8 8 9 15 12 11 11 8 10 12 19 8 8
3 0 3 9 8 10 8 8 8 10 10 9 9 10 9 9 13 15 6 6 8 8 8 10 10 8 6 6 |