| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-107K02.T7 (MSMg01no107_k02.b1) | MSMg01-107K02.TJ (MSMg01no107_k02.g1) |
|---|
| ACC | AG321340 | AG321341 |
|---|
| length | 1,325 | 1,335 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 323 (138 - 460) | 274 (130 - 403) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_k02.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_k02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:09:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_k02.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_k02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:09:47 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CAATCCCTTTNTACACATTCGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCC
GCGGAATTCTCGCCTGAGGAATACCCCTTTAAAGACCAGCACCTGAAAAA
ATGTTCAGCATCCTTACCCTTCAGGACCCCGCAAATCAAAACAACCCTGA
GATTCCACCTCACACTAGTCATAATGGCTAAGATAAAAAATTCAGGTGAC
AGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTG
GTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAATCTGGTCGTTCC
TCAAAAAATTGGACATAGTTCTACCAGAGGATCCTGCAATACCTCTCCTG
GGCATATATCCAGAAGATGTTCCAACCGGTAAGAAGGACACATGCTCCAC
TATATTCATATTTTCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCA
GATGTCCCTCTTTTTATGACCGCCCCCAGAAAATGTGCTACCTTTACACA
AAGAAGGACTACCCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAACTTCTTAT
GTAAATAGATGGACCTGCAGGACATTATCCTGACTGAGGTAACCCAACCC
CAAAAGAACTCACATGATATGTACTCACTGCTAAGTGGCTATCTATCCCA
GAAACTTATAATACCCACCACATAATATCCAATTTTTCGAACACTTGATA
TTTCATGAAGACCTATTTACCATAGTGTGGACTCTTTGTACCTCTCTATA
TTTGTCAATTACAACTCCCCTGCTATGGACCTACTTATCCTATGTTCGCA
TCTGCATACGATAGCTCTGTACTCACCCTACAAATTCCTTTCCCCTTGCA
TCCCTCCCCATTAATCCTACCCCTGACCTCCTCTGCTCTCCCCTTATTCT
CTTTTTTTCCTTAATGGTCCCATAAAGCCACCTGTCTCCTTGTTGAAATC
CATTTTCTTTCCCCCCACTCAACCTCTTAAACCTGCTATGTTCCCCTACT
CTCCCCTTTCTCGCTCCTGATTCCTTTTCCCCCTTCTTTTTTTTTTTTTT
TTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGAGTAGTTAAATGCGGTATTCTTTTCT
TTCCCTTTTACCGCTTGTTACTCCTCTTTATTCCAAACCCATTCTCCTTT
CTCCTCTCGAGAAACCCTTCTGCCTCTCTACTCTGCGCTTTCTCTTTCCA
CTAATAAACTCGCCTTCAGCTTCCTGCTCCTTCATCTTGTCTAACCAACA
GTATTCCTTCTGCTCTTCGTGGCTTACACTTCATTTACACTCGCCTCCTC
TTACCCTCTATCCACACTTTCTCTC
| NCGGGTCTTTNNTGAACACGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAGGCCCTTTCTAAGGTAGAA
GGATGACAAGGNATCCCTTTTAAATTTCTCTCTAGAATCCCTTACTTTTA
ACCAGTTGTTCCAGGAGATAGTTACCTCCATTCACGAGTATAAAGGACAG
AACAGCAGATAGCAGTGTCCTAAAAAGTGTGGTGTATAAGCCTTTGTGTT
GCTTTATTTTAGAATGACTGTGTGTCCCTATGGTTGACCTGATTCTTGGT
GCACCTTGAGAAAATAAGTCACTTTTCAGGAGACCTGTTCAGGAGCCTCC
TCTCTCTTGGTGTTCTGCGGTTTTTATTCTTTCCTAACTTAGTTATTTCT
GTAGATTTTTTTTTGCATGGGACAGTACACAGTCAGCTGAGCACTGGGTT
CTATATTTTTTTTCCCCCCCCCCCTGGGACAATCCATTGATGCAAGAAAG
GGGGGGAGTTTATAAGCTCTGATGTCAGGGCAATCTAGATAGAGCCCTGA
GTTGTAAGGTGTTCCTAGTAAACAAACCCAGCTTGCTTGATCTGCAAATC
TGTTGTTCTGTTTGCCAAGTGTCTACTGTTAAATGTATGATATGGAATGT
TAAATGATAATCTTCTTCATTATATGTACTCACCTTGCTTATCCTTATTC
ATAACTCAGTAGACTAAGAGGACTTTCCTCCTTTTATTTCAATAATCGGC
AGTCTTTGTCTTTAAAGTCCGAAGTTTCTTTCAGGCGAATTCTTTGGTTT
ATCGTCTCTTCTCTTATGTTGTTTTTCGTTGTCTCATACTCCCGCTTCTA
CTCTACTTTCACTTATTCTTTCTTGCTCTTTATCTTTCCTTCACTAATTC
TCTCTTCCTGCTCATTCTCCCTCTAATATCTTTTCCCTTTACTCTCTCTT
CTTCTTCCCTTCTTCTCTTTTTCTTCTCACTTCCTTTTCCACTTCCTGCA
CATTAAGTCGTCCACTTGTGTTCTTTCCTTTCATATCCCTTTTTTATATT
TTATATGTTCTTCTTTACTTATTATAATCTTTTACTACATTCACCACCTT
TCTTTATCATTCTTTGTTCCTCCTTATTCTATTTTCTTCACCTTAGTGTT
GTTTTTTTATGACCATCATGTCACTTTGACATCTCTGTATCTATCTTTTC
TTCAGCCTCTTTCCCCCTTCTTATCTCTCTATTTCATACAGTTGCTCTCC
TCGCTATCTTCTTATACTTACTCCATGTTCCTACTCTCTGACTTTTCCTG
CATACTCGTTCGTTCTATCTTTATGTCATCTATTA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 16 17 3 0 3 7 7 6 6 6 7 8 6 8 10 17 12 9 7 6 6 8 15 19 10 8 8 12 12 14 19 19 35 36 36 36 33 36 33 33 33 33 33
37 37 33 33 25 27 32 39 39 39 39 39 37 33 33 33 33 33 33 37 37 37 21 19 10 11 11 10 11 11 11 15 11 12 10 10 10 10 11 11 17 15 22 29 29 36 36 47 57 57
50 50 50 47 47 37 37 28 33 33 31 30 23 23 13 13 11 11 16 16 12 12 11 8 8 8 8 8 8 12 12 11 16 20 30 30 24 17 15 30 30 57 39 39 34 34 42 37 42 43
50 50 43 43 48 48 42 48 48 48 42 42 42 48 48 48 42 42 41 41 41 47 47 42 36 36 22 22 19 30 29 29 37 42 40 41 39 43 44 44 47 44 37 35 35 37 35 35 39 35
35 36 36 41 37 43 44 44 46 43 43 37 37 43 43 50 50 50 57 50 50 41 41 41 43 42 52 52 52 52 52 52 43 43 35 35 37 43 43 57 43 43 32 33 28 41 32 38 38 43
33 33 33 35 35 35 43 43 47 47 35 35 41 43 43 57 45 43 43 39 39 39 43 39 39 33 43 43 43 35 43 43 43 43 43 43 43 52 43 57 43 43 39 43 43 52 52 52 44 43
43 35 26 36 36 43 35 39 35 35 20 20 35 38 43 43 43 33 23 23 43 44 57 43 43 33 35 35 43 43 52 57 57 57 44 43 23 23 23 36 43 43 52 57 57 44 44 18 18 12
24 19 29 32 43 44 42 43 41 43 43 43 42 42 29 29 27 43 32 42 35 43 32 36 36 29 32 28 28 24 32 36 37 32 35 22 30 22 16 16 12 24 24 44 42 47 47 43 42 42
42 37 39 43 42 44 23 23 11 12 12 18 11 14 19 19 27 32 39 43 43 43 36 36 30 28 28 20 15 15 18 15 15 21 18 28 28 32 24 28 25 25 25 33 36 43 39 32 28 20
20 18 26 25 30 29 23 12 10 8 8 8 8 13 9 9 6 8 8 8 8 8 11 12 12 12 11 16 18 25 31 31 36 43 32 25 19 15 15 10 11 10 10 9 9 11 13 11 11 11
21 12 12 12 15 12 12 12 12 15 16 12 12 11 11 11 15 30 30 41 39 30 30 34 32 30 32 32 39 32 33 30 30 21 21 11 11 11 21 14 17 15 18 19 21 20 21 18 11 12
12 12 12 19 26 23 16 11 11 12 13 8 8 8 10 13 16 24 17 15 15 16 21 21 29 25 20 14 8 8 8 8 12 13 12 13 14 15 15 16 19 15 11 8 8 8 10 12 14 11
8 8 8 10 10 13 15 19 16 16 11 11 11 18 17 30 19 19 15 13 16 10 10 10 14 11 11 11 17 11 11 11 16 12 12 11 9 9 9 9 10 12 12 10 9 9 13 11 11 11
10 10 11 11 11 13 16 10 12 12 16 24 24 21 15 12 10 10 14 12 11 11 11 10 9 9 8 10 9 8 8 9 10 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 11 10 10
10 9 8 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 15 11 11 9 10 10 12 12 9 9 10 10 10 8 8 8 7 7 8 8 8 10 10
8 8 8 8 8 8 12 10 10 8 8 6 6 8 6 9 9 9 11 13 14 14 11 8 8 8 8 8 8 10 16 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 10 11 10 10 10
10 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 12 8 8 8 8 8 8 10 13 14 18 17 19 10 8 8 8 8 8 8 12 10 12 11 11 12 17 18 14 12 8 8 10 8 9
8 8 8 8 8 10 12 12 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 13 10 11 11 11 10 9 8 6 6 6 6 8 8 11 11 10 11 11 13 11 13 8 8 7 6 8 8 8 8
8 8 10 9 12 10 10 10 10 10 12 15 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 10 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 9 9 10 8 8 7 7 8 8 9 10 10 10 10 10 10 10
10 10 10 8 8 8 8 10 8 8 10 12 9 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 10 12 12 12 12 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
12 9 11 11 11 11 12 12 12 13 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 15 14 16 18 15 15 20 16 13 8 8 8 9 11 11 15 12 12 16 19 19 17 17 21 18 17
25 24 24 24 29 34 37 47 47 37 37 37 19 19 15 17 21 22 36 30 25 12 8 6 6 8 8 10 9 11 11 11 9 8 8 8 8 8 8 10 15 16 12 12 10 9 9 8 10 8
8 8 8 8 6 6 8 8 9 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 7 7 8 8 8 6 8 10 8 10 10 10 9 8 8 8 10 8 8
10 10 10 11 12 12 10 10 11 11 11 8 8 8 6 6 7 6 8 12 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 11 11 12 7 7 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 10 10 6 6 6 6 8 10 10 12 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 12 13 15 10 8 8
8 8 8 8 11 13 10 8 10 10 8 8 8 10 7 6 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 9 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 6 6 6 6 8 8 10 10
8 6 6 8 8 10 19 12 12 9 9 10 10 11 9 9 8 8 6 6 8 8 12 6 6 | Open.Hide. 0 3 10 10 10 10 9 9 13 3 0 0 3 7 7 7 6 6 6 6 6 10 7 7 8 8 8 9 9 11 19 15 12 9 9 9 10 10 12 12 15 19 8 10 10 13 13 18 19 24
30 30 30 34 28 30 29 33 29 31 31 33 37 34 37 33 28 18 18 9 23 23 9 9 9 16 7 8 6 6 6 6 9 8 10 10 10 9 10 13 23 27 30 30 33 33 33 36 47 48
48 48 48 40 41 41 47 44 27 29 3 0 3 21 18 13 11 12 11 13 12 11 11 11 10 10 15 11 16 13 25 22 33 36 31 32 28 39 34 42 43 43 43 43 43 43 40 47 50 50
50 47 68 48 48 42 42 46 48 54 68 57 54 54 54 48 47 47 41 48 42 42 37 41 41 41 57 57 57 57 57 57 48 48 48 42 30 30 24 24 28 32 35 37 35 43 35 42 42 47
48 48 46 43 43 39 41 43 43 50 47 44 35 35 28 35 35 43 50 57 57 52 52 52 52 52 43 52 43 43 43 33 32 32 43 43 44 43 52 52 52 52 52 59 50 52 52 57 52 52
52 52 47 57 57 57 57 57 57 57 39 39 33 43 43 57 57 43 43 35 35 35 39 44 52 52 52 52 52 52 44 43 35 35 42 43 43 52 52 43 50 43 52 52 52 52 32 36 28 28
35 36 43 52 52 52 57 47 43 35 35 43 43 50 57 44 43 43 43 43 37 37 43 50 42 44 37 35 35 39 42 32 26 13 13 15 30 25 44 44 43 43 46 36 36 23 28 36 42 43
48 48 48 47 47 47 43 44 39 37 37 39 39 37 43 43 43 34 34 28 32 23 32 37 47 48 48 48 48 59 47 47 43 37 33 32 37 37 43 32 31 22 26 19 29 30 43 43 32 32
28 19 18 9 9 12 10 16 14 14 10 11 17 25 21 25 30 32 33 35 37 37 37 23 33 22 22 19 23 19 15 15 12 11 11 11 12 12 17 17 11 11 11 16 16 15 9 9 10 9
15 10 15 16 10 10 9 11 14 17 15 9 9 10 9 9 12 12 11 11 9 26 13 13 15 20 12 11 11 15 15 15 21 15 11 11 11 11 16 11 11 10 9 10 8 8 8 8 8 10
10 12 17 16 16 11 17 11 21 17 19 8 8 8 8 8 11 19 20 19 24 26 18 11 11 11 11 11 10 10 10 12 19 16 15 10 11 11 11 13 18 19 17 20 18 19 23 22 18 10
10 10 15 10 12 13 13 10 10 10 10 10 10 20 28 32 24 20 20 21 21 16 11 11 11 11 11 12 6 6 8 8 9 19 13 15 15 19 19 13 8 8 8 10 10 11 11 13 12 11
11 19 18 15 9 12 12 10 12 10 8 8 8 8 8 10 12 15 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 13 11 11 11 10 10 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 6
8 8 10 12 12 18 15 11 11 11 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 11 13 15 12 12 12 15 15 16 16 13 13 10 8 9 10 12 15 12 8 8
9 12 10 8 11 11 13 11 11 11 11 9 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 11 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 12 8 10 8 8 9 10 8 8 6 6 8 8
8 8 10 10 15 26 12 12 12 11 11 8 8 8 8 8 8 10 12 12 8 8 8 9 12 9 10 9 9 12 12 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 9 10 10 10 10 15
12 11 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 12 12 8 9 9 9 11 11 11 10 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 11 8 8 6 6 8 8 8 9 11 21 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 12 10 8 10 8 8 8 8 8 8 7 6 10 10 10 11
8 8 8 7 7 8 8 8 9 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 12 18 11 11 11 14 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8
8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 10 13 11 12 10 12 12 14 13 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 10 12 10 11 11 9 9
9 8 8 8 8 8 8 10 11 11 8 10 8 8 8 10 11 10 10 10 10 10 10 11 11 11 12 15 12 8 8 6 6 8 6 6 8 8 6 6 7 6 8 8 8 8 10 9 9 9
10 8 10 8 8 6 6 10 10 8 8 9 9 10 10 12 14 14 8 10 8 10 10 8 10 10 10 10 10 10 14 13 10 9 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13
9 10 10 10 12 10 11 9 8 8 10 10 10 10 11 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 9 12 10 12 11 10 10 8 10 9 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 10 10 8
8 8 8 8 11 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 7 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 7 7 6 6 9 9 8 10 11 9 9 9 9 12 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 8 9 10 10 10 10 16 13 8 8 8
8 8 8 10 10 12 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8
9 9 10 10 12 9 9 9 7 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 13 8 |
|---|
