BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-480O03.T7 (MSMg01no480_o03.b1) | MSMg01-480O03.TJ (MSMg01no480_o03.g1) |
ACC | AG561418 | AG561419 |
length | 732 | 740 |
length of high quality (start - end) | 241 (75 - 315) | 243 (75 - 317) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no480_o03.b1 PHD_FILE: MSMg01no480_o03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:01:20 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no480_o03.g1 PHD_FILE: MSMg01no480_o03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:01:20 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCATATAGGGGGCGGAA
TTCTTTGTTTTGCTATAAACCCGATTTTTAATAGGGTTATTTGATTCTCT
GGAATCTAATTTCTTGAGTTCTTTCTATATGTTGAATATTAGCCCTCTAT
TGGAAGTAGGGTTGGTAAAGATCTTTTCCCAATCTGTTGGTTGATGTTTT
GTCTTATTGACAGTGTCCTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAATTTTATGAT
GTCCCATTTGTCTATTGTTGATCCTAAGATCAACAAGGCATTGGTGTTCT
GTTCAGGAAATTTTCTCTTGTGCCCATGTGTTCAAGACTCTTCCCCACTT
TCTCTTCTATTAGTTTCAGTGTCTCTGGCTTTATGTGGAGGTCCTTGATC
CACTTAGACCTGAGCTTTGTACGGGGAGATAAAAATGAATCAGTTTGCAG
TCTTCTACTAGTATACCTCCAGTTGAACCAGCACCATTTTTGAAGATGTC
TTTTTTCCACTGGAGGGTTTTAGCTCCTGTGTCAAAGATCAAGTGACCAT
AGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCATTCTATTCCACTTATCTACCT
GCCTGTCTCAGTACCAATACCATACAGGTTTTATCACTATTGCTCTGTAA
TACAGCTTGAGGTCAGGGATGGTGATTTCCCCAGGTCTTTTATGGTGGAG
AAAGTTTTCGCTATCCTGGGTTTTTTTTTGAC
| CACGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGCTTTTCCTTACAGTTAAGCTGAAT
GAACAAAGGGCCCCAAGGAAGACAAGAGGTTCCAGCTCTGTTTGCCGCCT
GTCTGAGGTTCACCCCATTTTAAAAACCACCTCTTCACCACCCTCTGCTC
ACTGCCATGGTTACCACCGCCCTGTCCTTGAGCGGCACTGGTTGTTCAAA
GGCAGAAACAACAAGGGCATTTTAAGTGTCCTTTTAAATATCCAAAACAC
TGTTGGCATTTAGGAAACTTATAAAGGGAAATAAAAGGTCTGGTTGTTTC
TCGTTTCCTTCCCAGCCCAGGACCCTGAATAAATCCTTTACCCTGGGTGG
CCTCTTAGCCCCCCAAGGAGAGGACGAAGTTTATGAGGCCTCTGGAGTGG
AATTTAGCACCTGTTAGCATTAGTGTTGTTCGCTGTGAGTTGCCTCTTCC
TTTCCCTCCCTCTGCAGCTTTAGACCTTGCCCCCAGGCTAAGCTAGCTCC
ACCCGGCGCCTTGTGAAAGTCTTCTGACTTTCCCTCACCTTCCCGCTCTG
ATAGTCCCACACACTTTAATCCCTAGCCTTCCCTCCCCAGCTGTTAACCC
TGTTTACCGGGGCTAGTATTTTCAGGGAGGCAATATTGGTCCATCTTAAT
ATTCTTCTATCCCTGAAAACACTTTCATTTTTTAATATTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 14 22 39 37 30 28 27 30 28 37 25 21 10 10 10 23 21 37 27 20 20 15 13 6 6 6 7 7 7 6 6 6 9 9 10 9 9 12 11 23 23 30 33 33
33 33 33 59 44 24 9 8 7 7 6 6 6 9 9 9 11 12 12 10 9 9 9 9 9 23 30 39 41 50 39 44 44 53 53 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 53 53 57 57 57
57 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 37 37 28 37 28 30 36 42 43 50 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 44 43 43 43 50 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 34 34 13 20 26 34 34 57 44 44 28 32 42 44 44 24 12 10 10
10 14 23 13 13 13 34 34 68 68 44 44 32 32 41 41 41 68 68 68 68 68 59 44 32 21 12 12 34 34 26 35 35 43 34 34 12 12 12 12 21 34 41 59 59 59 59 59 41 30
17 17 12 27 27 50 50 37 37 37 37 23 19 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 11 20 21 37 41 59 59 50 50 53 53 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 34 34
20 23 23 41 41 46 46 46 46 46 46 46 43 47 47 46 46 46 48 32 34 15 18 20 41 34 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 34 34 12 12 12 24 34 48 68 68 68 68
68 68 68 57 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 21 21 11 11 11 19 12 12 12 24 25 43 57 38 36 23 23 25 44 44 34 34 11 11
12 34 34 68 68 68 68 57 57 57 27 27 11 15 15 32 35 53 53 50 50 50 50 59 50 47 47 47 47 39 48 48 59 59 48 46 47 47 59 59 59 29 23 11 11 13 21 22 47 47
59 59 59 59 59 41 41 41 41 39 34 27 15 14 17 17 26 26 59 59 59 48 48 48 48 27 25 13 11 11 21 19 9 11 11 10 21 23 41 41 37 37 44 44 44 47 47 36 32 23
20 18 27 27 30 33 32 32 35 37 40 36 36 35 37 39 41 59 59 44 37 37 34 38 38 37 37 39 39 37 41 40 39 41 43 37 31 28 30 32 33 37 37 50 50 50 42 41 39 39
39 41 34 40 30 30 18 17 17 13 16 30 34 33 32 29 29 28 28 32 33 33 33 33 28 28 24 24 25 25 34 37 37 37 32 35 36 43 43 43 32 29 17 17 19 23 21 17 17 17
15 18 13 13 15 19 28 27 24 11 8 7 8 7 8 9 19 16 11 10 8 8 8 8 11 11 16 16 13 15 15 20 33 24 19 11 11 13 17 21 14 10 8 10 10 8 10 11 9 9
8 8 12 8 10 15 30 28 20 12 10 12 9 9 9 9 14 12 12 15 14 16 11 12 18 19 27 19 12 10 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 10 10 9 9 20 25 27 15 16 10 9 9 9 19 21 47 47 47 39 37 37 37 25 23 16 9 9 9 9 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 11 27 25 12
12 11 26 23 47 47 27 27 9 9 9 9 9 9 9 14 12 14 10 10 19 16 16 12 15 19 30 41 59 59 59 59 59 57 50 50 50 53 53 53 57 57 57 53 57 57 48 50 48 54
54 50 50 50 68 50 50 68 68 68 59 57 47 34 31 17 17 15 26 15 27 40 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 43 43 43 44 44 57 57 52 52 52 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57
54 54 59 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 50 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 48 44 42 43 37
41 30 34 30 59 48 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 59 48 54 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
50 59 59 48 57 48 48 48 59 59 41 28 20 12 15 12 11 12 12 12 11 11 15 12 17 28 30 37 43 47 48 48 48 48 48 57 48 48 48 48 43 59 43 43 43 43 43 54 43 44
43 43 43 59 43 41 41 43 43 57 46 48 48 43 43 37 40 44 28 28 30 42 43 43 47 48 48 57 57 48 48 48 48 48 48 48 59 57 68 68 68 68 57 59 54 54 54 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 57 48 36 32 24 25 22 29 24 26 13 19 13 13 13 20 32 37 48 44 44 37 37 37 44 44 44 44 41 28 28 23 23 31 30 35
37 42 42 40 32 23 19 17 29 30 42 37 39 28 27 24 25 24 36 36 31 20 20 20 31 32 37 39 28 28 25 34 32 37 31 31 47 37 33 27 25 32 37 39 41 59 37 37 30 30
28 33 27 27 10 10 8 8 8 13 15 20 20 25 22 16 19 20 23 22 15 9 9 9 15 15 17 15 9 9 9 17 19 18 17 17 17 22 30 18 19 23 25 30 24 30 25 26 18 16
15 10 10 10 8 8 8 8 9 9 17 19 16 12 13 10 9 10 8 9 9 12 15 15 16 19 10 10 10 19 11 8 8 8 8 14 14 18 21 24 14 10 8 8 8 8 17 19 12 12
8 8 8 8 8 15 12 8 9 9 9 8 8 8 15 13 8 10 8 8 8 10 8 8 8 12 11 13 18 14 14 14 16 24 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 14 12 20 19 16
16 16 10 11 6 6 6 6 9 10 9 9 11 9 9 9 9 9 9 12 12 10 9 9 8 8 9 9 9 9 8 8 6 7 7 13 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 12 12
11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 10 10 10 12 12 12 11 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 6 6 6 6 6 8 6 |