BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-002A21
Chromosome2 (Build37)
Map Location 117,753,121 - 117,868,815
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043557, LOC241621, Spred1, LOC624574, 2610510H03Rik, Rasgrp1
Downstream geneThbs1, Fsip1, Gpr176, 1700054M17Rik, Eif2ak4, Srp14, LOC668859, Bmf, LOC640461, Bub1b, Pak6, Gm1337, Plcb2, LOC100043272, A430105I19Rik, Disp2, D2Ertd750e, Ivd, Bahd1, Chst14, LOC677379, Ccdc32, Rpusd2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-002A21.bB6Ng01-002A21.g
ACCDH840195DH840196
length1,1171,174
definitionDH840195|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-002A21, 5' end.DH840196|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-002A21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,867,700 - 117,868,815)(117,753,121 - 117,754,322)
sequence
gaattcacctccactatctctggggtgctttctgtctcggagacattatc
cagttcttagcaagtgtcatctaagtatgaattcactcaggaaaacattt
caacactggttaaaaagcagttctaacctggttgttttgtgatgtcaacc
acccctcagggaagagcaaagaaacgggcttttctaagacaaagtaactt
tgtccaccctgagtcacacagtgtacttggattcccttattaaggaaacc
agtttgtttccaaacacttcctctctaagaagtacagtctgccaatattt
gataaaagaattaagatttgagttgctgctgtgccttgtaggattggaag
ttataaagtaactttgggaatttcagacttaagtagaagtggaaagggtg
tgtgaataaactcacacatgtgccagcagctttgaacctcactgagaatc
gagaggactttggcctctctgagaatggagagaaggactttgtccgttta
gtctggcaggagtggcctctgagctatgggacacttactttaatgaagat
tctggcctcctcatctccatgcctcctaggcaatgctgcagtggctccac
catgtgcaccttgctacacccacccacatggaaggaatagcatgattctt
atggaaacacgccaaacacctattccttgtgaagactcagttgatggtat
agagttccccttttcttccttatttatttatttaacattccaatcatagc
ctctccctactctcctcccagttgcacccttgaaaactccttcccccatt
accttttccccttctcttcagagaaggggaagccccaccacagacaccaa
ccctccctggcacatcaagttccaacaggattaagcacatcccatcccca
ctgagacaagacaagacatcccagccaggataaaggatccaagggccagg
caacagagttaggataccacctttgtttcaattgttagagacccacatga
aggtgtgcattgctacaaatgtgtagggggtctaaggtccagctcataca
tgctcttggttgggtggttagtcttggtaagtcccatcagccaaggttaa
gtggactcggtaggtct
gaattcaccatgtgatttgcatgtgaatatctgtctgtggtatagtctca
ctgaggtcaataggctacccttgagcagtagttggtatcaacatagttgc
tccagaggggaaacagaggccatggagtaatatcagatggttaactcctg
ttctaaggtgaattgaatttgtgatctttagtaattacttcttctctgta
atcttaaattccttgctttcgttttatactatgaagcctgaagtgatggc
tgagttcccaccaattgtctttgagaacattgtctaatttatttatttat
tgcaattattttttaaatttctgtagctaatcatctagagcatgcttgtt
tcaatgctagttttctagcacatgcatacacacacacacacacacactgt
ttctaagcagtggcaaggtctctctaagtattattcaaggacccaaagtt
ctaccattattgtgaccatctagtgatgggctttttaaagttgatggcag
actgtaaattacaagccaaataaaccctttcttccttcctcaatttggtt
ttgattagtgtgttatcacaatgacagaaaagcaaagtagaaaagctatg
tattttcatatatgtgtatatatgctagagacataagatcttgtttgctt
taccgtgattcacttgtccatttgcttactttagtgtgagccacggtgta
ggagtttagtaagtagtttagtaagattgggtagaatgcaactgccaagt
cctaaattagcactgctgagagagcaaattgggtagcaagggtcctggcc
ttccttgagctgtatgctaagggcctggcacagtgagctatcaaaatcaa
tcaagcgtataaacaagtctcctggggatgattaatccctgctgagaggt
gccaggaggtaaacgatgtgtcaataaattcttatagtcagctctatagg
ccaggctgagtggggaagtgttggcaaagtgctgggacagccagcgtgtc
tgacgcaacacaacgtgttcccttagcctctatattttttcctggataat
atgaatctgctggagaactctagttctcttcgctgatacaatcaccatta
gttgaaaggagagatcaagcctttaatccttttggaaatacacagtggcc
attgcaatctgactcattccttta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_117867700_117868815
seq2: B6Ng01-002A21.b_46_1162 (reverse)

seq1  AGACCTACGGAGTCAAC-TAACCTGGGCTGATGGGGACTTACAAAGACTA  49
      |||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||| 
seq2  AGACCTACCGAGTCCACTTAACCTTGGCTGAT-GGGACTTACCAAGACT-  48

seq1  AACCACCAACCAAAGAGCATGTATGAGCTGGACC-TAGACCCCCTACACA  98
      ||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AACCACCCAACCAAGAGCATGTATGAGCTGGACCTTAGACCCCCTACACA  98

seq1  TTTGTAGCCAATGCACAACTTCATGTGGGTCTCCTAACAATTGGAACAAA  148
      ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||
seq2  TTTGTAG-CAATGCACACCTTCATGTGGGTCT-CTAACAATTGAAACAAA  146

seq1  GGTTGTAT-CTAACTCTGTTGCCT-GCCCTTGGATCCTTTATCCTGGCTG  196
      ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTATCCTAACTCTGTTGCCTGGCCCTTGGATCCTTTATCCTGGCTG  196

seq1  GGATGTCTTGTCTTGTCTCAGT-GGGATGGGATGTGCTTAATCCTGTTGG  245
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTCTTGTCTTGTCTCAGTGGGGATGGGATGTGCTTAATCCTGTTGG  246

seq1  AACTTGATGTGCCAGGGAGGGTTGGTGTCTGTGGTGGGGCTTCCCCTTCT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGATGTGCCAGGGAGGGTTGGTGTCTGTGGTGGGGCTTCCCCTTCT  296

seq1  CTGAAGAGAAGGGGAAAAGGTAATGGGGGAAGGAGTTTTCAAGGGTGCAA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGAGAAGGGGAAAAGGTAATGGGGGAAGGAGTTTTCAAGGGTGCAA  346

seq1  CTGGGAGGAGAGTAGGGAGAGGCTATGATTGGAATGTTAAATAAATAAAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAGGAGAGTAGGGAGAGGCTATGATTGGAATGTTAAATAAATAAAT  396

seq1  AAGGAAGAAAAGGGGAACTCTATACCATCAACTGAGTCTTCACAAGGAAT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGAAAAGGGGAACTCTATACCATCAACTGAGTCTTCACAAGGAAT  446

seq1  AGGTGTTTGGCGTGTTTCCATAAGAATCATGCTATTCCTTCCATGTGGGT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTTTGGCGTGTTTCCATAAGAATCATGCTATTCCTTCCATGTGGGT  496

seq1  GGGTGTAGCAAGGTGCACATGGTGGAGCCACTGCAGCATTGCCTAGGAGG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTAGCAAGGTGCACATGGTGGAGCCACTGCAGCATTGCCTAGGAGG  546

seq1  CATGGAGATGAGGAGGCCAGAATCTTCATTAAAGTAAGTGTCCCATAGCT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAGATGAGGAGGCCAGAATCTTCATTAAAGTAAGTGTCCCATAGCT  596

seq1  CAGAGGCCACTCCTGCCAGACTAAACGGACAAAGTCCTTCTCTCCATTCT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGCCACTCCTGCCAGACTAAACGGACAAAGTCCTTCTCTCCATTCT  646

seq1  CAGAGAGGCCAAAGTCCTCTCGATTCTCAGTGAGGTTCAAAGCTGCTGGC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGGCCAAAGTCCTCTCGATTCTCAGTGAGGTTCAAAGCTGCTGGC  696

seq1  ACATGTGTGAGTTTATTCACACACCCTTTCCACTTCTACTTAAGTCTGAA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTGTGAGTTTATTCACACACCCTTTCCACTTCTACTTAAGTCTGAA  746

seq1  ATTCCCAAAGTTACTTTATAACTTCCAATCCTACAAGGCACAGCAGCAAC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCAAAGTTACTTTATAACTTCCAATCCTACAAGGCACAGCAGCAAC  796

seq1  TCAAATCTTAATTCTTTTATCAAATATTGGCAGACTGTACTTCTTAGAGA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATCTTAATTCTTTTATCAAATATTGGCAGACTGTACTTCTTAGAGA  846

seq1  GGAAGTGTTTGGAAACAAACTGGTTTCCTTAATAAGGGAATCCAAGTACA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTGTTTGGAAACAAACTGGTTTCCTTAATAAGGGAATCCAAGTACA  896

seq1  CTGTGTGACTCAGGGTGGACAAAGTTACTTTGTCTTAGAAAAGCCCGTTT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGACTCAGGGTGGACAAAGTTACTTTGTCTTAGAAAAGCCCGTTT  946

seq1  CTTTGCTCTTCCCTGAGGGGTGGTTGACATCACAAAACAACCAGGTTAGA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTCTTCCCTGAGGGGTGGTTGACATCACAAAACAACCAGGTTAGA  996

seq1  ACTGCTTTTTAACCAGTGTTGAAATGTTTTCCTGAGTGAATTCATACTTA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTTTTTAACCAGTGTTGAAATGTTTTCCTGAGTGAATTCATACTTA  1046

seq1  GATGACACTTGCTAAGAACTGGATAATGTCTCCGAGACAGAAAGCACCCC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACACTTGCTAAGAACTGGATAATGTCTCCGAGACAGAAAGCACCCC  1096

seq1  AGAGATAGTGGAGGTGAATTC  1116
      |||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATAGTGGAGGTGAATTC  1117

seq1: chr2_117753121_117754322
seq2: B6Ng01-002A21.g_66_1239

seq1  GAATTCACCATGTGATTTGCATGTGAATATCTGTCTGTGGTATAGTCTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCATGTGATTTGCATGTGAATATCTGTCTGTGGTATAGTCTCA  50

seq1  CTGAGGTCAATAGGCTACCCTTGAGCAGTAGTTGGTATCAACATAGTTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGTCAATAGGCTACCCTTGAGCAGTAGTTGGTATCAACATAGTTGC  100

seq1  TCCAGAGGGGAAACAGAGGCCATGGAGTAATATCAGATGGTTAACTCCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAGGGGAAACAGAGGCCATGGAGTAATATCAGATGGTTAACTCCTG  150

seq1  TTCTAAGGTGAATTGAATTTGTGATCTTTAGTAATTACTTCTTCTCTGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAGGTGAATTGAATTTGTGATCTTTAGTAATTACTTCTTCTCTGTA  200

seq1  ATCTTAAATTCCTTGCTTTCGTTTTATACTATGAAGCCTGAAGTGATGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTAAATTCCTTGCTTTCGTTTTATACTATGAAGCCTGAAGTGATGGC  250

seq1  TGAGTTCCCACCAATTGTCTTTGAGAACATTGTCTAATTTATTTATTTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTCCCACCAATTGTCTTTGAGAACATTGTCTAATTTATTTATTTAT  300

seq1  TGCAATTATTTTTTAAATTTCTGTAGCTAATCATCTAGAGCATGCTTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATTATTTTTTAAATTTCTGTAGCTAATCATCTAGAGCATGCTTGTT  350

seq1  TCAATGCTAGTTTTCTAGCACATGCATACACACACACACACACACACTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGCTAGTTTTCTAGCACATGCATACACACACACACACACACACTGT  400

seq1  TTCTAAGCAGTGGCAAGGTCTCTCTAAGTATTATTCAAGGACCCAAAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAGCAGTGGCAAGGTCTCTCTAAGTATTATTCAAGGACCCAAAGTT  450

seq1  CTACCATTATTGTGACCATCTAGTGATGGGCTTTTTAAAGTTGATGGCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCATTATTGTGACCATCTAGTGATGGGCTTTTTAAAGTTGATGGCAG  500

seq1  ACTGTAAATTACAAGCCAAATAAACCCTTTCTTCCTTCCTCAATTTGGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAAATTACAAGCCAAATAAACCCTTTCTTCCTTCCTCAATTTGGTT  550

seq1  TTGATTAGTGTGTTATCACAATGACAGAAAAGCAAAGTAGAAAAGCTATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTAGTGTGTTATCACAATGACAGAAAAGCAAAGTAGAAAAGCTATG  600

seq1  TATTTTCATATATGTGTATATATGCTAGAGACATAAGATCTTGTTTGCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCATATATGTGTATATATGCTAGAGACATAAGATCTTGTTTGCTT  650

seq1  TACCGTGATTCACTTGTCCATTTGCTTACTTTAGTGTGAGCCACGGTGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCGTGATTCACTTGTCCATTTGCTTACTTTAGTGTGAGCCACGGTGTA  700

seq1  GGAGTTTAGTAAGTAGTTTAGTAAGATTGGGTAGAATGCAACTGCCAAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTTTAGTAAGTAGTTTAGTAAGATTGGGTAGAATGCAACTGCCAAGT  750

seq1  CCTAAATTAGCACTGCTGAGAGAGCAAATTGGGTAGCAAGGGTCCTGGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAATTAGCACTGCTGAGAGAGCAAATTGGGTAGCAAGGGTCCTGGCC  800

seq1  TTCCTTGAGCTGTATGCTAAGGGCCTGGCACAGTGAGCTATCAAAATCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTGAGCTGTATGCTAAGGGCCTGGCACAGTGAGCTATCAAAATCAA  850

seq1  TCAAGCGTATAAACAAGTCTCCTGGGGATGATTAATCCTTGCTGAGAAGG  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
seq2  TCAAGCGTATAAACAAGTCTCCTGGGGATGATTAATCCCTGCTGAG-AGG  899

seq1  TGCCAGGAGGTAAACGATGTGTCAAT-AATTC-TATAGTCAGCTCTAATA  948
      |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||
seq2  TGCCAGGAGGTAAACGATGTGTCAATAAATTCTTATAGTCAGCTCT-ATA  948

seq1  GGCCAGGCTGAGT-GGGAAGTGTTGGCAAAGTGCTGGGACAGCCAGGCGT  997
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGCCAGGCTGAGTGGGGAAGTGTTGGCAAAGTGCTGGGACAGCCA-GCGT  997

seq1  GTCTTGACGCAACACAAAGGTGTTCGCTTAGCCTACTAATATTTTTCTTG  1047
      ||| ||||||||||| || |||||| |||||||| |||   |||||| ||
seq2  GTC-TGACGCAACAC-AACGTGTTCCCTTAGCCT-CTATATTTTTTCCTG  1044

seq1  GATAATAATGAAAATCCTGCTGGAAGGACCTTCTAGTTCTCCTTCTGCTG  1097
      |||||| |||||    ||||||||  || | ||||||||| |||| ||||
seq2  GATAAT-ATGAA---TCTGCTGGA--GAAC-TCTAGTTCT-CTTC-GCTG  1085

seq1  ATACCAATCCACACATAAGTTGACAGGGGAAGAGGATCAAAGCTTTTTAC  1147
      ||| |||| ||| ||| |||||| ||| ||    |||| |||| ||| | 
seq2  ATA-CAAT-CAC-CATTAGTTGAAAGGAGA----GATC-AAGCCTTTAA-  1126

seq1  TTTCCTTTTTTGAGAAAAAC-CAGTGGTCATTTTCAAATTCTGACTCATT  1196
        |||||||    |||| || |||||| || || |||  |||||||||||
seq2  --TCCTTTT---GGAAATACACAGTGGCCA-TTGCAA--TCTGACTCATT  1168

seq1  CTTTTA  1202
      | ||||
seq2  CCTTTA  1174