BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-006D13
Chromosome2 (Build37)
Map Location 46,170,569 - 46,171,703
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042661, LOC100041337, LOC666604
Downstream geneLOC383690
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-006D13.bB6Ng01-006D13.g
ACCDH843143DH843144
length1,126132
definitionDH843143|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006D13, 5' end.DH843144|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006D13, 3' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcaaggctgccactgacctcattatgaatgattttgagccctaact
ttcctgcctgtaccttctatgagctgaaattacatgatgacacttggttt
atatgatttaagggactgaattaaagggcctcttgtttgctaggccaaca
ctcttaagaactaagccatttcagtaaattacccgccaaacttgcctttc
caatatctttgagaaatccatatactagaaccctatttacaccacttatt
cccaccccactttcctttccaatgctttcagtgttccctaaatctcctta
acatttagagccacatatataaaccatgttcattaagactgtcaaaacca
aaactaaacacaaaaacaaaacaccaacaccaccatcaacagcaacaaaa
agggaagacaaaatccacagagaatgaaaggacaaggagccagtatgagc
agacatgagttcatttctattgagcccaattatacagctactgtttactt
ccaagatagaatcccactcttgcacagttagggacatttacacagtaagt
ctacttagtgttgctcatacattcagcgatgaccatttgggattgaacaa
actctcagagggttgtcccttgcaaaactgatttctctcagcagtcattg
ccagtagctcttcatctagaggtgggaacttgtgaatattcccctcaacc
acaatagcatgtcaactgatgttcttattcagttcttgtttagtcaacca
tatttttgagaggtcatgagtgcaacttccttattctagctcaatggctc
caagtcctgtgactgaagtatgtagtgtctgcaaaaatatgtttttatat
atacattctaaaagcaagtgtaggagtagaagcgaatacatactcttcaa
aaatgggagaaaggtacagagatacaatcgaggtgccttaggtgataaat
agattcacactgggaagctgggtcctggtctgagatcttgcttgcttgaa
agtctctaaagggatctgccttggggaagcttgctctgagtgtgatatct
gtcacttcttaatacccgaatttcttttatattttcttaactcttctatc
tttgagtactttgctttcttatactt
aagaaggttaagaagcagaagggcccaagtgaggatgcttccatcccact
tgggagtgaaaaggaaataatcatgggaatcagaaggagggaaggacctg
gttgtaagagaggagtgaggtgggggttgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_46170569_46171703
seq2: B6Ng01-006D13.b_46_1171 (reverse)

seq1  AAGTAATAAGAAAGCAAAGTTACTCTAAAGATAGAAGAGTTAAGAAAATA  50
      |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGT-ATAAGAAAGCAAAG-TACTC-AAAGATAGAAGAGTTAAGAAAATA  47

seq1  TAAAAGATATCGGGGTATTAAGAAGTTGACAGATATTCACACTCAGGAGC  100
      ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||
seq2  TAAAAGAAATTCGGGTATTAAGAAG-TGACAGATA-TCACACTCA-GAGC  94

seq1  AAGGCTTCCCCAAGGCAGATCCCTTTAGAGACTTTTCAAGCAAGCAAGAT  150
      || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AA-GCTTCCCCAAGGCAGATCCCTTTAGAGAC-TTTCAAGCAAGCAAGAT  142

seq1  CTCAGACCAGGACCCAGCTTCCCAGTGGTGAATCTATTTATCACCTAAGG  200
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGACCAGGACCCAGCTTCCCAGT-GTGAATCTATTTATCACCTAAGG  191

seq1  CACCTCGATTGTATCTCTGTACCTTTCTCCCATTTTTGAAGAGTATGTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCGATTGTATCTCTGTACCTTTCTCCCATTTTTGAAGAGTATGTAT  241

seq1  TCGCTTCTACTCCTACACTTGCTTTTAGAATGTATATATAAAAACATATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCTTCTACTCCTACACTTGCTTTTAGAATGTATATATAAAAACATATT  291

seq1  TTTGCAGACACTACATACTTCAGTCACAGGACTTGGAGCCATTGAGCTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAGACACTACATACTTCAGTCACAGGACTTGGAGCCATTGAGCTAG  341

seq1  AATAAGGAAGTTGCACTCATGACCTCTCAAAAATATGGTTGACTAAACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGGAAGTTGCACTCATGACCTCTCAAAAATATGGTTGACTAAACAA  391

seq1  GAACTGAATAAGAACATCAGTTGACATGCTATTGTGGTTGAGGGGAATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGAATAAGAACATCAGTTGACATGCTATTGTGGTTGAGGGGAATAT  441

seq1  TCACAAGTTCCCACCTCTAGATGAAGAGCTACTGGCAATGACTGCTGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAAGTTCCCACCTCTAGATGAAGAGCTACTGGCAATGACTGCTGAGA  491

seq1  GAAATCAGTTTTGCAAGGGACAACCCTCTGAGAGTTTGTTCAATCCCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCAGTTTTGCAAGGGACAACCCTCTGAGAGTTTGTTCAATCCCAAA  541

seq1  TGGTCATCGCTGAATGTATGAGCAACACTAAGTAGACTTACTGTGTAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCATCGCTGAATGTATGAGCAACACTAAGTAGACTTACTGTGTAAAT  591

seq1  GTCCCTAACTGTGCAAGAGTGGGATTCTATCTTGGAAGTAAACAGTAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTAACTGTGCAAGAGTGGGATTCTATCTTGGAAGTAAACAGTAGCT  641

seq1  GTATAATTGGGCTCAATAGAAATGAACTCATGTCTGCTCATACTGGCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAATTGGGCTCAATAGAAATGAACTCATGTCTGCTCATACTGGCTCC  691

seq1  TTGTCCTTTCATTCTCTGTGGATTTTGTCTTCCCTTTTTGTTGCTGTTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCTTTCATTCTCTGTGGATTTTGTCTTCCCTTTTTGTTGCTGTTGA  741

seq1  TGGTGGTGTTGGTGTTTTGTTTTTGTGTTTAGTTTTGGTTTTGACAGTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGTGTTGGTGTTTTGTTTTTGTGTTTAGTTTTGGTTTTGACAGTCT  791

seq1  TAATGAACATGGTTTATATATGTGGCTCTAAATGTTAAGGAGATTTAGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGAACATGGTTTATATATGTGGCTCTAAATGTTAAGGAGATTTAGGG  841

seq1  AACACTGAAAGCATTGGAAAGGAAAGTGGGGTGGGAATAAGTGGTGTAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTGAAAGCATTGGAAAGGAAAGTGGGGTGGGAATAAGTGGTGTAAA  891

seq1  TAGGGTTCTAGTATATGGATTTCTCAAAGATATTGGAAAGGCAAGTTTGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGTTCTAGTATATGGATTTCTCAAAGATATTGGAAAGGCAAGTTTGG  941

seq1  CGGGTAATTTACTGAAATGGCTTAGTTCTTAAGAGTGTTGGCCTAGCAAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGTAATTTACTGAAATGGCTTAGTTCTTAAGAGTGTTGGCCTAGCAAA  991

seq1  CAAGAGGCCCTTTAATTCAGTCCCTTAAATCATATAAACCAAGTGTCATC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGGCCCTTTAATTCAGTCCCTTAAATCATATAAACCAAGTGTCATC  1041

seq1  ATGTAATTTCAGCTCATAGAAGGTACAGGCAGGAAAGTTAGGGCTCAAAA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAATTTCAGCTCATAGAAGGTACAGGCAGGAAAGTTAGGGCTCAAAA  1091

seq1  TCATTCATAATGAGGTCAGTGGCAGCCTTGAATTC  1135
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCATAATGAGGTCAGTGGCAGCCTTGAATTC  1126