BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010M20
Chromosome2 (Build37)
Map Location 85,114,922 - 85,300,774
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOlfr987, GA_x5J8B7W531T-1241080-1240524, Olfr988, GA_x5J8B7W531T-1286425-1285652, Olfr990-ps1, Olfr991-ps1, Olfr992, Olfr993, Olfr994, Olfr995
Upstream geneCalcrl, Tfpi, LOC672763, Ctnnd1, 2700094K13Rik, Txndc14, Med19, Zdhhc5, Clp1, Ypel4, Serping1, Ube2l6, Smtnl1, Timm10, Slc43a1, Rtn4rl2, Slc43a3, Prg2, Prg3, P2rx3, Ssrp1, Tnks1bp1, Agtrl1, LOC625033, Lrrc55
Downstream gene4833423E24Rik, Olfr996, Olfr997-ps1, Olfr998, Olfr999-ps1, Olfr1000, Olfr1001-ps1, Olfr1002, GA_x5J8B7W531T-1558688-1559570, Olfr1004-ps1, Olfr154, GA_x5J8B7W531T-1577060-1577325, Olfr1006, GA_x5J8B7W531T-1588603-1588734, Olfr1008, Olfr1009, Olfr1010, Olfr1012, Olfr1013, Olfr1014, Olfr1015, Olfr1016, GA_x5J8B7W3KVV-518538-519236, Olfr1018, Olfr1019, Olfr1020, Olfr1021-ps1, Olfr1022, Olfr1023, Olfr1024, Olfr1025-ps1, Olfr1026, Olfr1027-ps1, Olfr1028, Olfr1029, Olfr1030, Olfr1031, Olfr1032, LOC100042075, Olfr1033, Olfr1034, Olfr1533-ps1, Olfr1035-ps1, Olfr1036, Olfr1037, LOC100041372, Olfr1038, Olfr1039, Olfr1040, GA_x5J8B7W3KVV-170014-170572, Olfr1042, Olfr1043, Olfr1044, Olfr52, Olfr1045, Olfr1046, Olfr1047, Olfr1048, Olfr1049, Olfr1050-ps1, Olfr1051, GA_x5J8B7W3KVV-25848-25992, Olfr1052, Olfr1053-ps1, Olfr1054, Olfr1055, Olfr1056, Olfr1057, GA_x5J8B7TRQ4E-1174-939, Olfr1058, Olfr1059-ps1, Olfr1515, Olfr1062, Olfr1063-ps1, Olfr1064-ps1, Olfr1065, Olfr1066
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010M20.bB6Ng01-010M20.g
ACCDH846366DH846367
length1,107861
definitionDH846366|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010M20, 5' end.DH846367|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010M20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(85,299,650 - 85,300,774)(85,114,922 - 85,115,777)
sequence
gaattcagcatagcaacacactattggcttattcaaacatcagcagaaaa
attacatgtacatgcagggtgtcagagttctgtgagttgttgactcagtt
tagatagccctgttatgtcctcacattcctccttatctcatggtcaacct
gttcccaggaatattttaactacagggcatacccaggtttgtttttcttt
attctcagccccaggcagtctctaggctctcaaacaaccagcaatctctg
agtactttatatgacttacaggtcttgaaatttcatctttctttcaatac
cagtgattatttattctataaaaccatgatgaatttcttacagttcataa
ggactttactttagttgccaatacttttgacattgatgtagttgatctta
attttatatttctcttttcccattctgtattagttttaatgcaattgtca
atcaacctatccaatcaacctatcaatagcagaatgattgcatgcccaca
ctccatgtacctggagtacatattggccaccacataggttcacttcagtg
acttgctagctactattaagttgaacatcaaaagcacagctttaacttct
ataatcttaaatatgcccaagatctttgtccacaaccattttaacctggc
ctgagccaaatcacctttgtagaatactatgagatgcaaatgatggcttg
aaaagggcaaacaaatgcaagaacaaattatcactgagaaaaaaaatttt
tcctttttggcattctgtcaatgaattgatgttcattttccattcttatt
ctcatttatgcacatctatccatccacccatctgtccatccatccatcca
tccatccattctctttcaaagtgctctctggctttctgtgttaaatctat
cctccagtgggatgaggttactatctattcaaatttgctggatattatga
ggaacaaatgatgattataggattatagtagtcatggtgatattaacttt
gtggtcctatgagaaaacaatgaaattgtagtgaaaagtcagaaatttgg
catagtttgatgcttaaaggtatgcccaccaagcctgggtgtctgggaga
gtctagc
gaattctcaccaacatggctgcctaagcatgaactgaccaagaatgacgt
cagtaaacatgctaacagggacgctagggactctcagaagaccacactct
tagacaaagaactataggcaatacagtttccccaagaaactaggtatcca
atgctcagtactgaaaacattatatatacataatatatacatatatgtta
tatatacatatatatgtatatgtatatatgtgtgttggtaattacaatta
aggaaaaagaatccataagttataaattagaataagagcaagaaggtagt
acatgagagggcttgaagggatgaaaggaaagggtgaagtgtaattatat
taacataaaatatttataacttatagttgggacatgtctcagtagtaagg
tgcttatttaacatgtgaggccataggttcaatcctcagcagctcaggaa
agaaaatatcacatatacatattcctaaatgtaacctgctcagtccatgt
aatattactggtttgtatattttcagggttgactatttgtcattggacaa
ccatttggtgtgctcttccccaaggaaaagccatctttctgactctcagc
tttcctagctttactatagttcttggtaagactgagaccttgtaaacctt
tcctgtccattttggaatgtccactggtgtcatccttattcaactcacat
tttggacagtcatgctgatgagactgtatggggaatatatttctgacaca
ctctcacaacaaactccttgatcctttggttctatggatctttctggccc
cctcttccacaatgttttccagatctcttaggtataggactgtttctaag
tgtatctattg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_85299650_85300774
seq2: B6Ng01-010M20.b_48_1154 (reverse)

seq1  GCTAGGACTCTCACCAGACA-CCAAGCTTGTTGGGGCATTACCCTTTAAG  49
      |||| ||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||   ||||||||
seq2  GCTA-GACTCTC-CCAGACACCCAGGCTTGGT-GGGCAT--ACCTTTAAG  45

seq1  CATCTAAAACTATGCAAAATTTCTGACTTTTTTCACTACCAATTTCATTT  99
      ||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||
seq2  CATC--AAACTATGCCAAATTTCTGAC--TTTTCACTA-CAATTTCA-TT  89

seq1  GTTTTCTCATAGGAACACAAAGTTTAATATTCACCATGACTACTTATAAT  149
      |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||
seq2  GTTTTCTCATAGGACCACAAAG-TTAATA-TCACCATGACTAC-TATAAT  136

seq1  TCTATAATCATCATTTTGTTTCCTTCATAATATCCAGCAAAATTTGAATA  199
       |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||
seq2  CCTATAATCATCA-TTTGTT--CCTCATAATATCCAGC-AAATTTGAATA  182

seq1  GATAGTAACCTCATCCCACTGGAGGATAAGATTTAACACAGAAAGCCAGA  249
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGTAACCTCATCCCACTGGAGGAT-AGATTTAACACAGAAAGCCAGA  231

seq1  GAGCACTTTGAAAGAGAATGGATGGATGGATGGATGGATGGACAGATGGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACTTTGAAAGAGAATGGATGGATGGATGGATGGATGGACAGATGGG  281

seq1  TGGATGGATAGATGTGCATAAATGAGAATAAGAATGGAAAATGAACATCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGGATAGATGTGCATAAATGAGAATAAGAATGGAAAATGAACATCA  331

seq1  ATTCATTGACAGAATGCCAAAAAGGAAAAATTTTTTTTCTCAGTGATAAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTGACAGAATGCCAAAAAGGAAAAATTTTTTTTCTCAGTGATAAT  381

seq1  TTGTTCTTGCATTTGTTTGCCCTTTTCAAGCCATCATTTGCATCTCATAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCTTGCATTTGTTTGCCCTTTTCAAGCCATCATTTGCATCTCATAG  431

seq1  TATTCTACAAAGGTGATTTGGCTCAGGCCAGGTTAAAATGGTTGTGGACA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTACAAAGGTGATTTGGCTCAGGCCAGGTTAAAATGGTTGTGGACA  481

seq1  AAGATCTTGGGCATATTTAAGATTATAGAAGTTAAAGCTGTGCTTTTGAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCTTGGGCATATTTAAGATTATAGAAGTTAAAGCTGTGCTTTTGAT  531

seq1  GTTCAACTTAATAGTAGCTAGCAAGTCACTGAAGTGAACCTATGTGGTGG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAACTTAATAGTAGCTAGCAAGTCACTGAAGTGAACCTATGTGGTGG  581

seq1  CCAATATGTACTCCAGGTACATGGAGTGTGGGCATGCAATCATTCTGCTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATATGTACTCCAGGTACATGGAGTGTGGGCATGCAATCATTCTGCTA  631

seq1  TTGATAGGTTGATTGGATAGGTTGATTGACAATTGCATTAAAACTAATAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATAGGTTGATTGGATAGGTTGATTGACAATTGCATTAAAACTAATAC  681

seq1  AGAATGGGAAAAGAGAAATATAAAATTAAGATCAACTACATCAATGTCAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGGAAAAGAGAAATATAAAATTAAGATCAACTACATCAATGTCAA  731

seq1  AAGTATTGGCAACTAAAGTAAAGTCCTTATGAACTGTAAGAAATTCATCA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATTGGCAACTAAAGTAAAGTCCTTATGAACTGTAAGAAATTCATCA  781

seq1  TGGTTTTATAGAATAAATAATCACTGGTATTGAAAGAAAGATGAAATTTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTTATAGAATAAATAATCACTGGTATTGAAAGAAAGATGAAATTTC  831

seq1  AAGACCTGTAAGTCATATAAAGTACTCAGAGATTGCTGGTTGTTTGAGAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCTGTAAGTCATATAAAGTACTCAGAGATTGCTGGTTGTTTGAGAG  881

seq1  CCTAGAGACTGCCTGGGGCTGAGAATAAAGAAAAACAAACCTGGGTATGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGAGACTGCCTGGGGCTGAGAATAAAGAAAAACAAACCTGGGTATGC  931

seq1  CCTGTAGTTAAAATATTCCTGGGAACAGGTTGACCATGAGATAAGGAGGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTAGTTAAAATATTCCTGGGAACAGGTTGACCATGAGATAAGGAGGA  981

seq1  ATGTGAGGACATAACAGGGCTATCTAAACTGAGTCAACAACTCACAGAAC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAGGACATAACAGGGCTATCTAAACTGAGTCAACAACTCACAGAAC  1031

seq1  TCTGACACCCTGCATGTACATGTAATTTTTCTGCTGATGTTTGAATAAGC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACACCCTGCATGTACATGTAATTTTTCTGCTGATGTTTGAATAAGC  1081

seq1  CAATAGTGTGTTGCTATGCTGAATTC  1125
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGTGTGTTGCTATGCTGAATTC  1107

seq1: chr2_85114922_85115777
seq2: B6Ng01-010M20.g_67_927

seq1  GAATTCTCACCAACATGGCTGCCTAAGCATGAACTGACCAAGAATGACGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACCAACATGGCTGCCTAAGCATGAACTGACCAAGAATGACGT  50

seq1  CAGTAAACATGCTAACAGGGACGCTAGGGACTCTCAGAAGACCACACTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAACATGCTAACAGGGACGCTAGGGACTCTCAGAAGACCACACTCT  100

seq1  TAGACAAAGAACTATAGGCAATACAGTTTCCCCAAGAAACTAGGTATCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACAAAGAACTATAGGCAATACAGTTTCCCCAAGAAACTAGGTATCCA  150

seq1  ATGCTCAGTACTGAAAACATTATATATACATAATATATACATATATGTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCAGTACTGAAAACATTATATATACATAATATATACATATATGTTA  200

seq1  TATATACATATATATGTATATGTATATATGTGTGTTGGTAATTACAATTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATACATATATATGTATATGTATATATGTGTGTTGGTAATTACAATTA  250

seq1  AGGAAAAAGAATCCATAAGTTATAAATTAGAATAAGAGCAAGAAGGTAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAAAGAATCCATAAGTTATAAATTAGAATAAGAGCAAGAAGGTAGT  300

seq1  ACATGAGAGGGCTTGAAGGGATGAAAGGAAAGGGTGAAGTGTAATTATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAGAGGGCTTGAAGGGATGAAAGGAAAGGGTGAAGTGTAATTATAT  350

seq1  TAACATAAAATATTTATAACTTATAGTTGGGACATGTCTCAGTAGTAAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATAAAATATTTATAACTTATAGTTGGGACATGTCTCAGTAGTAAGG  400

seq1  TGCTTATTTAACATGTGAGGCCATAGGTTCAATCCTCAGCAGCTCAGGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTATTTAACATGTGAGGCCATAGGTTCAATCCTCAGCAGCTCAGGAA  450

seq1  AGAAAATATCACATATACATATTCCTAAATGTAACCTGCTCAGTCCATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAATATCACATATACATATTCCTAAATGTAACCTGCTCAGTCCATGT  500

seq1  AATATTACTGGTTTGTATATTTTCAGGGTTGACTATTTGTCATTGGACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTACTGGTTTGTATATTTTCAGGGTTGACTATTTGTCATTGGACAA  550

seq1  CCATTTGGTGTGCTCTTCCCCAAGGAAAAGCCATCTTTCTGACTCTCAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTGGTGTGCTCTTCCCCAAGGAAAAGCCATCTTTCTGACTCTCAGC  600

seq1  TTTCCTAGCTTTACTATAGTTCTTGGTAAGACTGAGACCTTGTAAACCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTAGCTTTACTATAGTTCTTGGTAAGACTGAGACCTTGTAAACCTT  650

seq1  TCCTGTCCATTTTGGAATGTCCACTGGTGTCATCCTTATTCAACTCACA-  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TCCTGTCCATTTTGGAATGTCCACTGGTGTCATCCTTATTCAACTCACAT  700

seq1  TTTGGACAGTCATGCTGATGAGACTGTAT-GGGAATATA-TTCTGACACA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  TTTGGACAGTCATGCTGATGAGACTGTATGGGGAATATATTTCTGACACA  750

seq1  CTCTCACAACAAACTCCTTGATCCTTTGGTTCTTATGATCTTTCTGG-CC  796
      |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||
seq2  CTCTCACAACAAACTCCTTGATCCTTTGGTTCTATGGATCTTTCTGGCCC  800

seq1  CCTCTTCCACAATG-TTTCCAGATC-CTTAGGTATTGGACTGTTTCATAG  844
      |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| || 
seq2  CCTCTTCCACAATGTTTTCCAGATCTCTTAGGTATAGGACTGTTTC-TAA  849

seq1  ATGTATCTATTG  856
       |||||||||||
seq2  GTGTATCTATTG  861