BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-032H10
Chromosome2 (Build37)
Map Location 13,690,162 - 13,822,519
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSt8sia6
Upstream geneLOC100040837, Pter, C1ql3, Rsu1, Cubn, Trdmt1, Vim
Downstream genePtpla, Stam, 2010003H20Rik, Mrc1, Slc39a12, Cacnb2, LOC100041164, LOC625335, LOC625342
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-032H10.bB6Ng01-032H10.g
ACCDH861792DH861793
length1,197960
definitionDH861792|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032H10, 5' end.DH861793|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032H10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(13,821,306 - 13,822,519)(13,690,162 - 13,691,129)
sequence
gaattccactggcaagggattggtggagcaatgttctaagctcatagttc
ttggggtctctgcatatctccatggggaagtaggatgctcttgaggtccc
gaaaatctccttcagaccaaagagtaagcccagaactagacaatggagtt
caggtacctcatacaactcaccactgcaggctatgtctacggtggaccca
actgggataaattggagagataggattccaagatgattagtcttggcttc
cattagcaaaggcttccatggggaagcaggctgctcttggggtcccacaa
ggctccttgggactgaagaacaagcccaaagctagacaatggattttctt
caatttctaccaataatattctaagttcccttccaccctctttcttttct
tctttctatttcccttttccctttatgccaaaacaaaacaaacacaacaa
gcatgatgcttaaaacatttgaccagacatatagtgattttagtctattg
ttgctggtataacaaaagtatctcagattctgtcactggaattgatttct
cctggctcaaaagaccagaaagtctaaaggttcttacagatttgatattt
ggtgaatctctctctgctttccaggtaatatgtcatttctgtaaggcaac
tttgtgtccttaaatggtgaaacagatagaaaagcatgaagaagcagcca
gggttcttatggatagggccaagcaagtgcctgtaacctattctctaatg
acgtccaccacatctgtgaggacaaacttaatcacttatcaagatggaat
ctacatgataatttgccaccagggcccctcctttgtaatcttaccaccat
gctgtagttcaagtcctaacatagaaactttgagggagatatagattcta
accacagcaccaagggaacatttatatgtctatgtatatgtctatagcat
gttgtttattcttaaggaccggcatctagtgggagtacacatgcacggaa
agccaggaatgatgagctcatatgggctactatggacgcttctaggccct
gcttccagtagaaaagtgagtttatggcatagtctgggcaggccagagca
ggaaacttggcagatggaagaggctggttggaatcacctactgactgtga
gtaggaaatttggtgggacatgcccattcggactaaaagaggatttt
gaattcaaagatctacaggctgatcagccagcaacagaataatggtatgg
cacccagaccaagtgtcctctcccctgtatctccccaaatcctctgtacc
tgcaaacctgtcatttgtgatcactaatcacctcgagacgccagagatgc
cttgggaaatcaccctgcacgtccacgggacaaacaattcaactgttgtt
tctccaacctgaagcttaaaaacaggagtatagcctctggcattagtagt
accttgttcagctgtgtggccagggccaggttactacaatgtatctgcgt
cttcattttccttactgtaaagtgagtgtttcagtagtcttacataatct
cactgctgaaagagagcatgatcccatgtacataaagctacagaagccca
gtgcatagtaataagacctcagtaattgctagcactccccaattccattg
agctttattcaatgcactgggcatcctgggatatcacatctgaatgacta
gtgtctatcctataagcagcaatttaatcctgacacaaatggcctaaaaa
ccttgggaggaaatataagaaagaatggtaggtgtgctggctagatttat
gaccacttgacacaaactatagccatcctcagtttgaaaatatgcctcca
taagatcaggaggtaggcaagcctgcagagcattttctttaattagtgac
cagtgagtagggcccagttcattgcaagtggtaccatccctggggtgatg
atggtcctgggttctataaggaagcaggctgattaagccagtaagcagca
tctctccaaggtgtctgcattgctccttcctccctgttcctgccctgctt
gagttcctgctctggattcttcagttgtagacatgatagaagaagcataa
gtcaatactcctttcctcccaacttgcttttggtcatggtgttcactggg
cgacgaaacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_13821306_13822519
seq2: B6Ng01-032H10.b_48_1244 (reverse)

seq1  AAAATCCTCATTTTTAGTCCTGAATGGGGAATTTTGTCAGCAAATTTCTT  50
      |||||||||  ||||||||| ||||||| |  | |  || |||||||| |
seq2  AAAATCCTC--TTTTAGTCC-GAATGGGCA--TGTCCCACCAAATTTCCT  45

seq1  GATCTACAGTCAGTAAGGTGATTTCAAACAGCCTCTTCCATCTGGCCAGT  100
        || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  
seq2  ACTC-ACAGTCAGT-AGGTGATTCCAACCAGCCTCTTCCATCT-GCCAAG  92

seq1  TTTCCTGCTCCTGGCCTTGCCAAGACTATGCCATATACTCACCTTTTCTA  150
      ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2  TTTCCTGCT-CTGGCC-TGCCCAGACTATGCCATAAACTCA-CTTTTCTA  139

seq1  CTGGAAGCAGGGCCTAGAAGCGTCCATAGTTAGCCCATATTGAGCTCATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
seq2  CTGGAAGCAGGGCCTAGAAGCGTCCATAG-TAGCCCATA-TGAGCTCA-T  186

seq1  CATTTCTTGGCTTTCCGTGGTATGTTGTACTCCCACTAGATGCCGGTCCT  250
      || ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CA-TTCCTGGCTTTCCGT-GCATG-TGTACTCCCACTAGATGCCGGTCCT  233

seq1  TAAAGAATAAACAACATGCTATAGACATATACATAGACATATACATGTTC  300
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  T-AAGAATAAACAACATGCTATAGACATATACATAGACATATAAATGTTC  282

seq1  CCTTGGTGCTGTGGTTAGAATCTATATCTCCCTCAAAGTTTCTATGTTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGTGCTGTGGTTAGAATCTATATCTCCCTCAAAGTTTCTATGTTAG  332

seq1  GACTTGAACTACAGCATGGTGGTAAGATTACAAAGGAGGGGCCCTGGTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGAACTACAGCATGGTGGTAAGATTACAAAGGAGGGGCCCTGGTGG  382

seq1  C-AATTATCATGTAGATTCCATCTTGATAAGTGATTAAGTTTGTCCTCAC  449
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTATCATGTAGATTCCATCTTGATAAGTGATTAAGTTTGTCCTCAC  432

seq1  AGATGTGGTGGACGTCATTAGAGAATAGGTTACAGGCACTTGCTTGGCCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTGGTGGACGTCATTAGAGAATAGGTTACAGGCACTTGCTTGGCCC  482

seq1  TATCCATAAGAACCCTGGCTGCTTCTTCATGCTTTTCTATCTGTTTCACC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCATAAGAACCCTGGCTGCTTCTTCATGCTTTTCTATCTGTTTCACC  532

seq1  ATTTAAGGACACAAAGTTGCCTTACAGAAATGACATATTACCTGGAAAGC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGGACACAAAGTTGCCTTACAGAAATGACATATTACCTGGAAAGC  582

seq1  AGAGAGAGATTCACCAAATATCAAATCTGTAAGAACCTTTAGACTTTCTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGATTCACCAAATATCAAATCTGTAAGAACCTTTAGACTTTCTG  632

seq1  GTCTTTTGAGCCAGGAGAAATCAATTCCAGTGACAGAATCTGAGATACTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTTGAGCCAGGAGAAATCAATTCCAGTGACAGAATCTGAGATACTT  682

seq1  TTGTTATACCAGCAACAATAGACTAAAATCACTATATGTCTGGTCAAATG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTATACCAGCAACAATAGACTAAAATCACTATATGTCTGGTCAAATG  732

seq1  TTTTAAGCATCATGCTTGTTGTGTTTGTTTTGTTTTGGCATAAAGGGAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGCATCATGCTTGTTGTGTTTGTTTTGTTTTGGCATAAAGGGAAA  782

seq1  AGGGAAATAGAAAGAAGAAAAGAAAGAGGGTGGAAGGGAACTTAGAATAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAATAGAAAGAAGAAAAGAAAGAGGGTGGAAGGGAACTTAGAATAT  832

seq1  TATTGGTAGAAATTGAAGAAAATCCATTGTCTAGCTTTGGGCTTGTTCTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGTAGAAATTGAAGAAAATCCATTGTCTAGCTTTGGGCTTGTTCTT  882

seq1  CAGTCCCAAGGAGCCTTGTGGGACCCCAAGAGCAGCCTGCTTCCCCATGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCCAAGGAGCCTTGTGGGACCCCAAGAGCAGCCTGCTTCCCCATGG  932

seq1  AAGCCTTTGCTAATGGAAGCCAAGACTAATCATCTTGGAATCCTATCTCT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTTTGCTAATGGAAGCCAAGACTAATCATCTTGGAATCCTATCTCT  982

seq1  CCAATTTATCCCAGTTGGGTCCACCGTAGACATAGCCTGCAGTGGTGAGT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTTATCCCAGTTGGGTCCACCGTAGACATAGCCTGCAGTGGTGAGT  1032

seq1  TGTATGAGGTACCTGAACTCCATTGTCTAGTTCTGGGCTTACTCTTTGGT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGAGGTACCTGAACTCCATTGTCTAGTTCTGGGCTTACTCTTTGGT  1082

seq1  CTGAAGGAGATTTTCGGGACCTCAAGAGCATCCTACTTCCCCATGGAGAT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGGAGATTTTCGGGACCTCAAGAGCATCCTACTTCCCCATGGAGAT  1132

seq1  ATGCAGAGACCCCAAGAACTATGAGCTTAGAACATTGCTCCACCAATCCC  1199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGAGACCCCAAGAACTATGAGCTTAGAACATTGCTCCACCAATCCC  1182

seq1  TTGCCAGTGGAATTC  1214
      |||||||||||||||
seq2  TTGCCAGTGGAATTC  1197

seq1: chr2_13690162_13691129
seq2: B6Ng01-032H10.g_72_1031

seq1  GAATTCAAAGATCTACAGGCTGATCAGCCAGCAACAGAATAATGGTATGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGATCTACAGGCTGATCAGCCAGCAACAGAATAATGGTATGG  50

seq1  CACCCAGACCAAGTGTCCTCTCCCCTGTATCTCCCCAAATCCTCTGTACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCAGACCAAGTGTCCTCTCCCCTGTATCTCCCCAAATCCTCTGTACC  100

seq1  TGCAAACCTGTCATTTGTGATCACTAATCACCTCGAGACGCCAGAGATGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAACCTGTCATTTGTGATCACTAATCACCTCGAGACGCCAGAGATGC  150

seq1  CTTGGGAAATCACCCTGCACGTCCACGGGACAAACAATTCAACTGTTGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGAAATCACCCTGCACGTCCACGGGACAAACAATTCAACTGTTGTT  200

seq1  TCTCCAACCTGAAGCTTAAAAACAGGAGTATAGCCTCTGGCATTAGTAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAACCTGAAGCTTAAAAACAGGAGTATAGCCTCTGGCATTAGTAGT  250

seq1  ACCTTGTTCAGCTGTGTGGCCAGGGCCAGGTTACTACAATGTATCTGCGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGTTCAGCTGTGTGGCCAGGGCCAGGTTACTACAATGTATCTGCGT  300

seq1  CTTCATTTTCCTTACTGTAAAGTGAGTGTTTCAGTAGTCTTACATAATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATTTTCCTTACTGTAAAGTGAGTGTTTCAGTAGTCTTACATAATCT  350

seq1  CACTGCTGAAAGAGAGCATGATCCCATGTACATAAAGCTACAGAAGCCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCTGAAAGAGAGCATGATCCCATGTACATAAAGCTACAGAAGCCCA  400

seq1  GTGCATAGTAATAAGACCTCAGTAATTGCTAGCACTCCCCAATTCCATTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATAGTAATAAGACCTCAGTAATTGCTAGCACTCCCCAATTCCATTG  450

seq1  AGCTTTATTCAATGCACTGGGCATCCTGGGATATCACATCTGAATGACTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTATTCAATGCACTGGGCATCCTGGGATATCACATCTGAATGACTA  500

seq1  GTGTCTATCCTATAAGCAGCAATTTAATCCTGACACAAATGGCCTAAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTATCCTATAAGCAGCAATTTAATCCTGACACAAATGGCCTAAAAA  550

seq1  CCTTGGGAGGAAATATAAGAAAGAATGGTAGGTGTGCTGGCTAGATTTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGGAGGAAATATAAGAAAGAATGGTAGGTGTGCTGGCTAGATTTAT  600

seq1  GACCACTTGACACAAACTATAGCCATCCTCAGTTTGAAAATATGCCTCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCACTTGACACAAACTATAGCCATCCTCAGTTTGAAAATATGCCTCCA  650

seq1  TAAGATCAGGAGGTAGGCAAGCCTGCAGAGCATTTTC-TTAATTAGTGAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TAAGATCAGGAGGTAGGCAAGCCTGCAGAGCATTTTCTTTAATTAGTGAC  700

seq1  CAGTGAGTAGGGCCCAGTTCATTGCAAGTGGTACCATCCCTGGGGTGATG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGAGTAGGGCCCAGTTCATTGCAAGTGGTACCATCCCTGGGGTGATG  750

seq1  ATGGTCCTGGGTTCTATAAGGAAGCAGGCTGATTAAGCCAGTAAGCAGCA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTCCTGGGTTCTATAAGGAAGCAGGCTGATTAAGCCAGTAAGCAGCA  800

seq1  TCTCTCCAAGGTGTCTGCATTGCTCCTTCCTCCCTGTTCCTGCCCTGCTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCCAAGGTGTCTGCATTGCTCCTTCCTCCCTGTTCCTGCCCTGCTT  850

seq1  GAGTTCCTGCTCTGGATTCCTTCAGTTGTAGACTATGATAGAGAAGGCAT  899
      |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||
seq2  GAGTTCCTGCTCTGGATT-CTTCAGTTGTAGAC-ATGATAGAAGAAGCAT  898

seq1  AAGTCCAATAACTCCTTTCCTTCCCAACTTGCTTTTTGGTCATGGTGTTT  949
      |||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||
seq2  AAGT-CAAT-ACTCCTTTCC-TCCCAACTTGC-TTTTGGTCATGGTG-TT  943

seq1  CACTGTGGCGACAGAAACC  968
      ||||| |||||| ||||||
seq2  CACTG-GGCGAC-GAAACC  960