BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-035J13
Chromosome2 (Build37)
Map Location 108,137,033 - 108,186,280
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneKcna4
Downstream geneLOC100043078, LOC668790, LOC623003, LOC100043423, LOC623031, Mett5d1, Kif18a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-035J13.bB6Ng01-035J13.g
ACCDH864019DH864020
length901652
definitionDH864019|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-035J13, 5' end.DH864020|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-035J13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(108,185,373 - 108,186,280)(108,137,033 - 108,137,682)
sequence
gaattctgcactgagttagaaagggcaatttgaaaattcatgtggaacaa
caaaaaacctaggatagtaaaaactattctcaacaataaatgaatctctg
tgggaatcatcatgcccgacctcaagctatactaaagagcaattgtgata
aaaactgcatggtactggtataatgacagacaagtagaacaatggaacag
aattgaagacccagagatgaacccacacacctatggtcacttgatctttg
acaagggagctaaaaccatccagtggataaaagacagcattttcaacaaa
tggtgctggcacaactggtggttatcatgtagaagaatgcaaattgatcc
attcttatctccttgtacaaagctcaagtctaagtggatctaagaactcc
acataaaactagagacattgaaatttatagaggagaaagtgcggaaaatc
cttgaagatatgggcacagggggaaaatttctaagtgtttacatgcttat
aagtcatctttgtttcctatctagcaattgcacagcctcatctactctct
ttccactattatttgtttctaaatcatatataagccttcctcctataaaa
taaactcatctatcatttgcttgttcttcctttgtttgtttttatttgtt
tttgtttgtttgtcctatagatttttttcttttcctacccatgcctttta
ttattgagactattttgactccatcctcgatgccctcagatcaacttggc
taattaagcagagttattagatctgatggtacacgtatcttcccataatt
ttaaattcaagacaacaaactattttctacatgtagagtttttatgcctt
tgtagtatgtgtctataccgtgactcttaagctagcagatgcttgttcct
t
gaattctcagctcctcctgcgccatgcctgcctggatactgcaatgctcc
caccttgatgataatggactgaacctctgaacctgtaagccagccccaat
taaatgttgtttttataagacttgccttggtcatggtgtctgttcacagc
agtaaaaccctaagacagatgggtataaaaactatgctgtaaaaaataat
aaagtttaacttttactcaagaagaagaaagaccgacttgtggatacttc
attcctccttagaatagggaacaaaatacccatgggaggagttacagaca
aagtttggagctaagacgaaaggatggaccatccagagactaccccaccc
ggggatccatcccatactcagctaccaaatgcagatactattgcatatgc
cagcaagattttgctgacaggaccctgatatagctgtctcttgtaaggct
aggccagtgcctggcaaatacagaagtggatgctcacagtcatctattgg
atggaacacagggtccccaatgaaggaactagagaaaagtacccaaggag
ctgaaggggtctgcaaccctataggtggaacaactatttgaactatgcca
gtacccccagagctcatgtctttacctgcaaatgtagcaaaagaaggcct
ag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_108185373_108186280
seq2: B6Ng01-035J13.b_45_945 (reverse)

seq1  AAGGAACAAGCCTTCTGCTTAGCTTTTAGAGTCACGGTATAGACAACATA  50
      |||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| 
seq2  AAGGAACAAG-CATCTGC-TAGC-TTAAGAGTCACGGTATAGAC-ACAT-  45

seq1  ACTACAAAGGCCATAAAACTCTACATGTAG-AAATAGTTTGTTGTCTTGA  99
      |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ACTACAAAGGCATAAAAACTCTACATGTAGAAAATAGTTTGTTGTCTTGA  95

seq1  ATTTAGAATTATGGG-AGATACGTGTACCATCAGATCTAATAACTTCTGC  148
      ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| 
seq2  ATTTAAAATTATGGGAAGATACGTGTACCATCAGATCTAATAAC-TCTG-  143

seq1  CTTAATTAGCCAAGTTGATCTTGAGGGCATCGAGGATGGAGTCAAAATAG  198
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAATTAGCCAAGTTGATC-TGAGGGCATCGAGGATGGAGTCAAAATAG  192

seq1  TCTCAATAATAAAAGGCATGGGTAGGAAAAG-AAAAAATCTATAAGACAA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
seq2  TCTCAATAATAAAAGGCATGGGTAGGAAAAGAAAAAAATCTATAGGACAA  242

seq1  ACAAACAAAAACAAATAAAAAACAAAACAAAGGAAGAACAAGCAAATGAT  297
      |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACAAAAACAAATAAAAA--CAAACAAAGGAAGAACAAGCAAATGAT  290

seq1  AGATGAGTTTATTTTATAGGAGGAAGGCTTATATATGATTTAGAAACAAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAGTTTATTTTATAGGAGGAAGGCTTATATATGATTTAGAAACAAA  340

seq1  TAATAGTGGAAAGAGAGTAGATGAGGCTGTGCAATTGCTAGATAGGAAAC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGTGGAAAGAGAGTAGATGAGGCTGTGCAATTGCTAGATAGGAAAC  390

seq1  AAAGATGACTTATAAGCATGTAAACACTTAGAAATTTTCCCCCTGTGCCC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATGACTTATAAGCATGTAAACACTTAGAAATTTTCCCCCTGTGCCC  440

seq1  ATATCTTCAAGGATTTTCCGCACTTTCTCCTCTATAAATTTCAATGTCTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTTCAAGGATTTTCCGCACTTTCTCCTCTATAAATTTCAATGTCTC  490

seq1  TAGTTTTATGTGGAGTTCTTAGATCCACTTAGACTTGAGCTTTGTACAAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTTATGTGGAGTTCTTAGATCCACTTAGACTTGAGCTTTGTACAAG  540

seq1  GAGATAAGAATGGATCAATTTGCATTCTTCTACATGATAACCACCAGTTG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATAAGAATGGATCAATTTGCATTCTTCTACATGATAACCACCAGTTG  590

seq1  TGCCAGCACCATTTGTTGAAAATGCTGTCTTTTATCCACTGGATGGTTTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGCACCATTTGTTGAAAATGCTGTCTTTTATCCACTGGATGGTTTT  640

seq1  AGCTCCCTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCATCTCTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCCTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCATCTCTG  690

seq1  GGTCTTCAATTCTGTTCCATTGTTCTACTTGTCTGTCATTATACCAGTAC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTCAATTCTGTTCCATTGTTCTACTTGTCTGTCATTATACCAGTAC  740

seq1  CATGCAGTTTTTATCACAATTGCTCTTTAGTATAGCTTGAGGTCGGGCAT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAGTTTTTATCACAATTGCTCTTTAGTATAGCTTGAGGTCGGGCAT  790

seq1  GATGATTCCCACAGAGATTCATTTATTGTTGAGAATAGTTTTTACTATCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATTCCCACAGAGATTCATTTATTGTTGAGAATAGTTTTTACTATCC  840

seq1  TAGGTTTTTTGTTGTTCCACATGAATTTTCAAATTGCCCTTTCTAACTCA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTTTTTGTTGTTCCACATGAATTTTCAAATTGCCCTTTCTAACTCA  890

seq1  GTGCAGAATTC  908
      |||||||||||
seq2  GTGCAGAATTC  901

seq1: chr2_108137033_108137682
seq2: B6Ng01-035J13.g_67_718

seq1  GAATTCTCAGCTCCTCCTGCGCCATGCCTGCCTGGATACTGCAATGCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGCTCCTCCTGCGCCATGCCTGCCTGGATACTGCAATGCTCC  50

seq1  CACCTTGATGATAATGGACTGAACCTCTGAACCTGTAAGCCAGCCCCAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTGATGATAATGGACTGAACCTCTGAACCTGTAAGCCAGCCCCAAT  100

seq1  TAAATGTTGTTTTTATAAGACTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCACAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGTTGTTTTTATAAGACTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCACAGC  150

seq1  AGTAAAACCCTAAGACAGATGGGTATAAAAACTATGCTGTAAAAAATAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAAACCCTAAGACAGATGGGTATAAAAACTATGCTGTAAAAAATAAT  200

seq1  AAAGTTTAACTTTTACTCAAGAAGAAGAAAGACCGACTTGTGGATACTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTTAACTTTTACTCAAGAAGAAGAAAGACCGACTTGTGGATACTTC  250

seq1  ATTCCTCCTTAGAATAGGGAACAAAATACCCATGGGAGGAGTTACAGACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTCCTTAGAATAGGGAACAAAATACCCATGGGAGGAGTTACAGACA  300

seq1  AAGTTTGGAGCTAAGACGAAAGGATGGACCATCCAGAGACTACCCCACCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTGGAGCTAAGACGAAAGGATGGACCATCCAGAGACTACCCCACCC  350

seq1  GGGGATCCATCCCATACTCAGCTACCAAATGCAGATACTATTGCATATGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGATCCATCCCATACTCAGCTACCAAATGCAGATACTATTGCATATGC  400

seq1  CAGCAAGATTTTGCTGACAGGACCCTGATATAGCTGTCTCTTGTAAGGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGATTTTGCTGACAGGACCCTGATATAGCTGTCTCTTGTAAGGCT  450

seq1  AGGCCAGTGCCTGGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTATTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCAGTGCCTGGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTATTGG  500

seq1  ATGGAACACAGGGTCCCCAATGAAGGAACTAGAG-AAAGTACCCAAGGAG  549
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ATGGAACACAGGGTCCCCAATGAAGGAACTAGAGAAAAGTACCCAAGGAG  550

seq1  CTGAAGGGGTCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTA-GCCA  598
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||
seq2  CTGAAGGGGTCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACTATTTGAACTATGCCA  600

seq1  GTACCCCCAGAGCTCATGTCTTTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCT  648
      |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||
seq2  GTACCCCCAGAGCTCATGTCTTTACCTGCAAATGTAGCAAAAGAAGGCCT  650

seq1  AG  650
      ||
seq2  AG  652