BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-046C19
Chromosome2 (Build37)
Map Location 22,094,114 - 22,214,243
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyo3a
Upstream gene4933434I06Rik, Thnsl1, Gpr158, LOC637235
Downstream geneLOC100041703, Myo3a, Gad2, Apbb1ip, Pdss1, Abi1, 1200016E24Rik, Acbd5, Mastl, Yme1l1, 4931423N10Rik, LOC664835, Nxph2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-046C19.bB6Ng01-046C19.g
ACCDH871416DH871417
length1,084909
definitionDH871416|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-046C19, 5' end.DH871417|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-046C19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,213,142 - 22,214,243)(22,094,114 - 22,095,023)
sequence
gaattcattgggcttacctcccacctttacctgtcaccatgtcaccatcc
atatatataagaggaatgctctctctcttccccactttctttttgctgcc
accttgaccctccccccccctctctcaataaatctcatagggaactgttt
gaactggtgtattccttctgaagctgcacagtgttcatgatcataacaat
gtgtgtatcttccttagaatccatgggtgaggaaaaattcttatggtctc
taaaaatatcttacttataattaacatggatttttttttcaaatttgaga
cacctagaacttaccaatacatatttaaaagagaaatacatatttagaag
agaaactatccagctgaagtagtgcagttggcaggtaaatattataggta
acatggtcagatggccagttgaagggtaggtaaggctatacacatcctta
aggtgagtgtagtagggtacatctataagcccacaaaggacatgaagcag
gcagatcatcttcaaagtcatcttcggctacttaatgatttcaaggacaa
cttaagttacatggggctttagttttaaaactttctagaacacttctgcc
tatttccatgataagaagtcagtccctagaagggaaaaataggctgctga
tcttggttgcctgaccttggtattttgaagagtgctctcatgggatgcag
ctcagctagtggaggatctccatcaccaagctcaatagccgtgataccca
gggaccatgtgtcacatctagcatcgtaagtggtatctagttgctgttca
caagcaatcacctagaagacaaaagcagcaaaatgctcagagagaaatct
aagtgtttaaccctgataaagttgagagctaaataaagataatgcaggaa
ttagaagaaaaaagatgatacgtgtagtatttttattctaagaacagaca
ataccacagcagattgcagacagagttttgctatgaaacaatagtttaga
actatattgcgagaggaaaaaatgtgccctactggatggatcaatgccca
gtatgccatggtgtattcctcccacagtcatcta
gaattctttagtagtcacctaaaccaaacctcttggattggaggatcctc
tttttgagatgccaggatattgtgggagagagatgcattgttcaaggtca
tgggttagcctaagaaatggtcttcatttgttgttggtgttggctgtgag
tagatatggaggtctagccctcttattaagtgaggaggttggagagagtt
ctaagggtttattctagctcatggctgttttgggataacacagtagcctg
agtttgtacctcaacctttgttcaattgacattggccacattgagtttag
ctgttccttctgccccaacacttcttcgtctatttcctactcttatttat
cctgaaaacatatttcccaacccttctcattgtttttctcaagaagaact
cctctgggctagagatatggctcaatgattaaaagcagggactgctcttc
cagaggactccagttccattcccagcacctacagagtaactgacaatcat
atgcagctccatttacaagggatccagtgctctcttctgccctccttggg
cactttacatagacatatgtgtaaataaaacactcatacacataaaataa
aattaaaattaaaacaccaaaatgaattcctatgggaaaagagtggatag
agtgtctatggcacaattctttctcaggaatgtgttgaagctgatggcaa
attatgctgcccggtctctgcatgatccactgccaaatgtaagcacaatc
cagtatctttctctatgtcagtgtctctccagtacagagaataatgtaag
agggactactcagtaactattaattcatgagactaactgcaataatatac
aaattaacaggatctctcctctctctctctctctctctctctctctctct
ctctctctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_22213142_22214243
seq2: B6Ng01-046C19.b_44_1127 (reverse)

seq1  TAGATGACTGTTGAGAGAATACACCATGGCCATTAACTGTGCATTTGATC  50
      ||||||||||| |   ||||||||||||| |||  |||| ||| ||||| 
seq2  TAGATGACTGTGGGAGGAATACACCATGG-CAT--ACTGGGCA-TTGAT-  45

seq1  CCATTCCAAGTAGGGCAACATTTTTTTTCCCTCTTCGCAATATAGTTTCT  100
      ||||  | |||||||| |||||||||   |||| ||||||||||| ||||
seq2  CCAT--CCAGTAGGGC-ACATTTTTT---CCTC-TCGCAATATAG-TTCT  87

seq1  AAACTATTTGTTTTCATAGCAAAACTTCTGTCTGCAATCCTGCTGTGGTA  150
      ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  AAACTATT--GTTTCATAGCAAAAC-TCTGTCTGCAAT-CTGCTGTGGTA  133

seq1  TTGTCTGTTCTTAGAATAAAAATACTACACGTATCATTCTTTTTTCTTCT  200
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTGTCTGTTCTTAGAATAAAAATACTACACGTATCA-TCTTTTTTCTTCT  182

seq1  AATTCCTGCCTTTATCTTTATTTAGCTCTCAACTTTATCA-GGTTAAACA  249
      |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AATTCCTG-CATTATCTTTATTTAGCTCTCAACTTTATCAGGGTTAAACA  231

seq1  CTTAGATTTCTCTCTGAGCATTTTGCTGCTTTTGTCTTCTAGGTGATTGC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGATTTCTCTCTGAGCATTTTGCTGCTTTTGTCTTCTAGGTGATTGC  281

seq1  TTGTGAACAGCAACTAGATACCACTTACGATGCTAGATGTGACACATGGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAACAGCAACTAGATACCACTTACGATGCTAGATGTGACACATGGT  331

seq1  CCCTGGGTATCACGGCTATTGAGCTTGGTGATGGAGATCCTCCACTAGCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGGTATCACGGCTATTGAGCTTGGTGATGGAGATCCTCCACTAGCT  381

seq1  GAGCTGCATCCCATGAGAGCACTCTTCAAAATACCAAGGTCAGGCAACCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGCATCCCATGAGAGCACTCTTCAAAATACCAAGGTCAGGCAACCA  431

seq1  AGATCAGCAGCCTATTTTTCCCTTCTAGGGACTGACTTCTTATCATGGAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCAGCAGCCTATTTTTCCCTTCTAGGGACTGACTTCTTATCATGGAA  481

seq1  ATAGGCAGAAGTGTTCTAGAAAGTTTTAAAACTAAAGCCCCATGTAACTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGCAGAAGTGTTCTAGAAAGTTTTAAAACTAAAGCCCCATGTAACTT  531

seq1  AAGTTGTCCTTGAAATCATTAAGTAGCCGAAGATGACTTTGAAGATGATC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGTCCTTGAAATCATTAAGTAGCCGAAGATGACTTTGAAGATGATC  581

seq1  TGCCTGCTTCATGTCCTTTGTGGGCTTATAGATGTACCCTACTACACTCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGCTTCATGTCCTTTGTGGGCTTATAGATGTACCCTACTACACTCA  631

seq1  CCTTAAGGATGTGTATAGCCTTACCTACCCTTCAACTGGCCATCTGACCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAAGGATGTGTATAGCCTTACCTACCCTTCAACTGGCCATCTGACCA  681

seq1  TGTTACCTATAATATTTACCTGCCAACTGCACTACTTCAGCTGGATAGTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTACCTATAATATTTACCTGCCAACTGCACTACTTCAGCTGGATAGTT  731

seq1  TCTCTTCTAAATATGTATTTCTCTTTTAAATATGTATTGGTAAGTTCTAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTCTAAATATGTATTTCTCTTTTAAATATGTATTGGTAAGTTCTAG  781

seq1  GTGTCTCAAATTTGAAAAAAAAATCCATGTTAATTATAAGTAAGATATTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTCAAATTTGAAAAAAAAATCCATGTTAATTATAAGTAAGATATTT  831

seq1  TTAGAGACCATAAGAATTTTTCCTCACCCATGGATTCTAAGGAAGATACA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGACCATAAGAATTTTTCCTCACCCATGGATTCTAAGGAAGATACA  881

seq1  CACATTGTTATGATCATGAACACTGTGCAGCTTCAGAAGGAATACACCAG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTGTTATGATCATGAACACTGTGCAGCTTCAGAAGGAATACACCAG  931

seq1  TTCAAACAGTTCCCTATGAGATTTATTGAGAGAGGGGGGGGGAGGGTCAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAACAGTTCCCTATGAGATTTATTGAGAGAGGGGGGGGGAGGGTCAA  981

seq1  GGTGGCAGCAAAAAGAAAGTGGGGAAGAGAGAGAGCATTCCTCTTATATA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCAGCAAAAAGAAAGTGGGGAAGAGAGAGAGCATTCCTCTTATATA  1031

seq1  TATGGATGGTGACATGGTGACAGGTAAAGGTGGGAGGTAAGCCCAATGAA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGATGGTGACATGGTGACAGGTAAAGGTGGGAGGTAAGCCCAATGAA  1081

seq1  TTC  1102
      |||
seq2  TTC  1084

seq1: chr2_22094114_22095023
seq2: B6Ng01-046C19.g_67_975

seq1  GAATTCTTTAGTAGTCACCTAAACCAAACCTCTTGGATTGGAGGATCCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAGTAGTCACCTAAACCAAACCTCTTGGATTGGAGGATCCTC  50

seq1  TTTTTGAGATGCCAGGATATTGTGGGAGAGAGATGCATTGTTCAAGGTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGAGATGCCAGGATATTGTGGGAGAGAGATGCATTGTTCAAGGTCA  100

seq1  TGGGTTAGCCTAAGAAATGGTCTTCATTTGTTGTTGGTGTTGGCTGTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTAGCCTAAGAAATGGTCTTCATTTGTTGTTGGTGTTGGCTGTGAG  150

seq1  TAGATATGGAGGTCTAGCCCTCTTATTAAGTGAGGAGGTTGGAGAGAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATATGGAGGTCTAGCCCTCTTATTAAGTGAGGAGGTTGGAGAGAGTT  200

seq1  CTAAGGGTTTATTCTAGCTCATGGCTGTTTTGGGATAACACAGTAGCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGGTTTATTCTAGCTCATGGCTGTTTTGGGATAACACAGTAGCCTG  250

seq1  AGTTTGTACCTCAACCTTTGTTCAATTGACATTGGCCACATTGAGTTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGTACCTCAACCTTTGTTCAATTGACATTGGCCACATTGAGTTTAG  300

seq1  CTGTTCCTTCTGCCCCAACACTTCTTCGTCTATTTCCTACTCTTATTTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCCTTCTGCCCCAACACTTCTTCGTCTATTTCCTACTCTTATTTAT  350

seq1  CCTGAAAACATATTTCCCAACCCTTCTCATTGTTTTTCTCAAGAAGAACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAAACATATTTCCCAACCCTTCTCATTGTTTTTCTCAAGAAGAACT  400

seq1  CCTCTGGGCTAGAGATATGGCTCAATGATTAAAAGCAGGGACTGCTCTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGGGCTAGAGATATGGCTCAATGATTAAAAGCAGGGACTGCTCTTC  450

seq1  CAGAGGACTCCAGTTCCATTCCCAGCACCTACAGAGTAACTGACAATCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGACTCCAGTTCCATTCCCAGCACCTACAGAGTAACTGACAATCAT  500

seq1  ATGCAGCTCCATTTACAAGGGATCCAGTGCTCTCTTCTGCCCTCCTTGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGCTCCATTTACAAGGGATCCAGTGCTCTCTTCTGCCCTCCTTGGG  550

seq1  CACTTTACATAGACATATGTGTAAATAAAACACTCATACACATAAAATAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTACATAGACATATGTGTAAATAAAACACTCATACACATAAAATAA  600

seq1  AATTAAAATTAAAACACCAAAATGAATTCCTATGGGAAAAGAGTGGATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAATTAAAACACCAAAATGAATTCCTATGGGAAAAGAGTGGATAG  650

seq1  AGTGTCTATGGCACAATTCTTTCTCAGGAATGTGTTGAAGCTGATGGCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCTATGGCACAATTCTTTCTCAGGAATGTGTTGAAGCTGATGGCAA  700

seq1  ATTATGCTGCCCGGTCTCTGCATGATCCACTGCCAAATGTAAGCACAATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGCTGCCCGGTCTCTGCATGATCCACTGCCAAATGTAAGCACAATC  750

seq1  CAGTATCTTTCTCTATGTCAGTGTCTCTCCAGTACAGAGAATAATGTAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATCTTTCTCTATGTCAGTGTCTCTCCAGTACAGAGAATAATGTAAG  800

seq1  AGGGACTACTCAGTAACTATTAATTCATGAGACTAACTGCAAATAATATA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGGGACTACTCAGTAACTATTAATTCATGAGACTAACTGC-AATAATATA  849

seq1  CAAATTAACAGGATCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTAACAGGATCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  899

seq1  TCTCTCTCTC  910
      ||||||||||
seq2  TCTCTCTCTC  909