BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-063B20
Chromosome2 (Build37)
Map Location 166,099,068 - 166,230,597
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC670775
Upstream geneSlc35c2, Elmo2, Gm1008, Zfp334, 4833422F24Rik, Slc13a3, 2810408M09Rik, Slc2a10, Eya2, Prkcbp1, LOC546780, Ncoa3, Sulf2
Downstream genePpia-ps2_2197.1, BC067047, Trp53rk, Arfgef2, LOC670802, Cse1l, Stau1, LOC383774, Ddx27, AI481105, 1500012F01Rik, LOC668950, Kcnb1, Ptgis, LOC668951, B4galt5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-063B20.bB6Ng01-063B20.g
ACCDH883307DH883308
length1,073994
definitionDH883307|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063B20, 5' end.DH883308|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063B20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(166,229,508 - 166,230,597)(166,099,068 - 166,100,066)
sequence
gaattctcactgttatggaatccgttggtcaagggctttgacgcactcct
gacccaattgggtcttacagtagctgcatcaccaccctcccccctttttg
ttattactcatttgctcatgggggaaccgagtcccagcttggtggatctg
ggataaaacctatgggccacggtggtcacccttgctgcacaccatgtgaa
gggcagaggtggattagcctaacacaccctctagcccccccccccagaac
cgccttttaatgtgtggcacttgcctgctgagagggcaggtgtactggct
agttttgtgtcaacttgacacagctggagttatcacagagaaaggagctt
cagttgaggaaatgcctctatgagatccaactgtaaggcattttctcaat
tagtgatcaagggggaaaggccccttgtgggtgggaccatccctgggctg
gtagtcttggttctataagagagcaggctgagcaagccagaggaagcaag
ccagtaaagaacatccctccatggcctctgcatcagctcctgcttcctaa
cctgcttgagttccagtcctgacttccttggtgatgaacagcagtatgga
agtgtaagctgaataaaccctttcctccccaacttgcttcttggtcatga
tgtttgtgcaggaacagaaaccctgactaagatagcaggtaagtcggagg
caggctgctatcctatctggggcttgagttcctacctatttaccctggag
agaaagtgtactttgggctttagcagactgtgcagtggctccaagtcctc
tgagagactctcataggtcaagccagaagacacggttttgacccctgctc
tgtttaccggagctgggcctactgagtctgaacagccacaccccaattct
tctcccaacatctgagatacagagacaggccaggaaggaaacatggacac
tgcaatcccaaaagcacagatacccagctcagcgcccgtcacccctcaaa
agacagtttcaaaggatagcttgtagtacagcatgagaatttgtgagtgt
agcacgaggactggcaggggaga
gaattcatttttcaacagtcaagatttcaagccataaacggctctttatt
atggaaatgccacgggctgcctttagaggagggcaggaacatggggctga
aatggccctggttaatggggaacactttgtaaagagcccgtgcgaggtct
gacatattctcaattttatatgtttgaagtgaggaggagaagagcggatc
acccgcagggaatgcggatatgaattcccagggggtgtttatttaaatgg
agccacttaggagccgtgcagtgggaatccatccaaattctgcctgttgt
ctcagagcctgcgaagcgcagtcaaaggagggcgggtgccacctctgtga
accctgcgtatccaccgctgcttttctcttcatcaagctgcagtgcaaag
tccattccaaagctctggaagattgtgctgtagaagcaaaagcaggcagc
tgctaccgggggagataaatgggacctggaagaccccagcagttctgtgg
aagagagcagtgtgtgctgacatctgagcatgtctctgggggagtgtccc
ttacaaacttccatggtaggtagaacctgttcccattgtgtgtcctgggg
ggctggaagctgaggctgtgccttgtcttggtgtggggtctgccccaagc
acagtccaaactgaggatctgtggtcagagcgatgtgggagtgattctgg
gcacagggagaataaagaagcagagatattcccaggatgcacttggagct
gctgattctgtgggagtcactgaggtctgacaggcctctaacttagacgt
ggaatctgtgtccactccccatccctatgactctgggggcttcagaacat
aactgagtgaggagaggtcttggagttttcatcttgttagagttttgttc
ttaggactctgagccactacagaaggagcctaacaccctgaagtgtccat
gcttgcagagagcctccagctacccgggggtgggggtggggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_166229508_166230597
seq2: B6Ng01-063B20.b_43_1115 (reverse)

seq1  TCTCTCCCTGCCCAGGTCCTCTGTGCTACACTCACAAATTCTCATGCTTG  50
      |||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TCTC-CCCTGCC--AGTCCTC-GTGCTACACTCACAAATTCTCATGC-TG  45

seq1  TACCTACAAGGCTATCCCTTTGAAACCTGTCTTTTGAGGGGTGACGGGCG  100
      || |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TA-CTACAA-GCTAT-CCTTTGAAA-CTGTCTTTTGAGGGGTGACGGGCG  91

seq1  CTGGAGCTGGGTTATCTGTGGCCTTTTTGGGATTTGCAGTGTCCATGTTT  150
      || |||||||| ||||||||    |||||||| |||||||||||||||||
seq2  CT-GAGCTGGG-TATCTGTG---CTTTTGGGA-TTGCAGTGTCCATGTTT  135

seq1  CCTTCCTGGCCTGTCTCTGTATTCTCAGATGTTGGGGAGAAGAATTGGGG  200
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCTTCCTGGCCTGTCTCTGTA-TCTCAGATGTT-GGGAGAAGAATTGGGG  183

seq1  TGTGGCTGTTCAGACTCAGTAGGCCCAGCTCCGGTAAACAGAGCAGGGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCTGTTCAGACTCAGTAGGCCCAGCTCCGGTAAACAGAGCAGGGGT  233

seq1  CAAAACCGTGTCTTCTGGCTTGACCTATGAGAGTCTCTCAGAGGACTTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACCGTGTCTTCTGGCTTGACCTATGAGAGTCTCTCAGAGGACTTGG  283

seq1  AGCCACTGCACAGTCTGCTAAAGCCCAAAGTACACTTTCTCTCCAGGGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACTGCACAGTCTGCTAAAGCCCAAAGTACACTTTCTCTCCAGGGTA  333

seq1  AATAGGTAGGAACTCAAGCCCCAGATAGGATAGCAGCCTGCCTCCGACTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGTAGGAACTCAAGCCCCAGATAGGATAGCAGCCTGCCTCCGACTT  383

seq1  ACCTGCTATCTTAGTCAGGGTTTCTGTTCCTGCACAAACATCATGACCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGCTATCTTAGTCAGGGTTTCTGTTCCTGCACAAACATCATGACCAA  433

seq1  GAAGCAAGTTGGGGAGGAAAGGGTTTATTCAGCTTACACTTCCATACTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCAAGTTGGGGAGGAAAGGGTTTATTCAGCTTACACTTCCATACTGC  483

seq1  TGTTCATCACCAAGGAAGTCAGGACTGGAACTCAAGCAGGTTAGGAAGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCATCACCAAGGAAGTCAGGACTGGAACTCAAGCAGGTTAGGAAGCA  533

seq1  GGAGCTGATGCAGAGGCCATGGAGGGATGTTCTTTACTGGCTTGCTTCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTGATGCAGAGGCCATGGAGGGATGTTCTTTACTGGCTTGCTTCCT  583

seq1  CTGGCTTGCTCAGCCTGCTCTCTTATAGAACCAAGACTACCAGCCCAGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTTGCTCAGCCTGCTCTCTTATAGAACCAAGACTACCAGCCCAGGG  633

seq1  ATGGTCCCACCCACAAGGGGCCTTTCCCCCTTGATCACTAATTGAGAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTCCCACCCACAAGGGGCCTTTCCCCCTTGATCACTAATTGAGAAAA  683

seq1  TGCCTTACAGTTGGATCTCATAGAGGCATTTCCTCAACTGAAGCTCCTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTACAGTTGGATCTCATAGAGGCATTTCCTCAACTGAAGCTCCTTT  733

seq1  CTCTGTGATAACTCCAGCTGTGTCAAGTTGACACAAAACTAGCCAGTACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTGATAACTCCAGCTGTGTCAAGTTGACACAAAACTAGCCAGTACA  783

seq1  CCTGCCCTCTCAGCAGGCAAGTGCCACACATTAAAAGGCGGTTCTGGGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCCTCTCAGCAGGCAAGTGCCACACATTAAAAGGCGGTTCTGGGGG  833

seq1  GGGGGGCTAGAGGGTGTGTTAGGCTAATCCACCTCTGCCCTTCACATGGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGCTAGAGGGTGTGTTAGGCTAATCCACCTCTGCCCTTCACATGGT  883

seq1  GTGCAGCAAGGGTGACCACCGTGGCCCATAGGTTTTATCCCAGATCCACC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGCAAGGGTGACCACCGTGGCCCATAGGTTTTATCCCAGATCCACC  933

seq1  AAGCTGGGACTCGGTTCCCCCATGAGCAAATGAGTAATAACAAAAAGGGG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGGGACTCGGTTCCCCCATGAGCAAATGAGTAATAACAAAAAGGGG  983

seq1  GGAGGGTGGTGATGCAGCTACTGTAAGACCCAATTGGGTCAGGAGTGCGT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGTGGTGATGCAGCTACTGTAAGACCCAATTGGGTCAGGAGTGCGT  1033

seq1  CAAAGCCCTTGACCAACGGATTCCATAACAGTGAGAATTC  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCCCTTGACCAACGGATTCCATAACAGTGAGAATTC  1073

seq1: chr2_166099068_166100066
seq2: B6Ng01-063B20.g_68_1061

seq1  GAATTCATTTTTCAACAGTCAAGATTTCAAGCCATAAACGGCTCTTTATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTTTCAACAGTCAAGATTTCAAGCCATAAACGGCTCTTTATT  50

seq1  ATGGAAATGCCACGGGCTGCCTTTAGAGGAGGGCAGGAACATGGGGCTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAATGCCACGGGCTGCCTTTAGAGGAGGGCAGGAACATGGGGCTGA  100

seq1  AATGGCCCTGGTTAATGGGGAACACTTTGTAAAGAGCCCGTGCGAGGTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGCCCTGGTTAATGGGGAACACTTTGTAAAGAGCCCGTGCGAGGTCT  150

seq1  GACATATTCTCAATTTTATATGTTTGAAGTGAGGAGGAGAAGAGCGGATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATATTCTCAATTTTATATGTTTGAAGTGAGGAGGAGAAGAGCGGATC  200

seq1  ACCCGCAGGGAATGCGGATATGAATTCCCAGGGGGTGTTTATTTAAATGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCGCAGGGAATGCGGATATGAATTCCCAGGGGGTGTTTATTTAAATGG  250

seq1  AGCCACTTAGGAGCCGTGCAGTGGGAATCCATCCAAATTCTGCCTGTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACTTAGGAGCCGTGCAGTGGGAATCCATCCAAATTCTGCCTGTTGT  300

seq1  CTCAGAGCCTGCGAAGCGCAGTCAAAGGAGGGCGGGTGCCACCTCTGTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAGCCTGCGAAGCGCAGTCAAAGGAGGGCGGGTGCCACCTCTGTGA  350

seq1  ACCCTGCGTATCCACCGCTGCTTTTCTCTTCATCAAGCTGCAGTGCAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGCGTATCCACCGCTGCTTTTCTCTTCATCAAGCTGCAGTGCAAAG  400

seq1  TCCATTCCAAAGCTCTGGAAGATTGTGCTGTAGAAGCAAAAGCAGGCAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTCCAAAGCTCTGGAAGATTGTGCTGTAGAAGCAAAAGCAGGCAGC  450

seq1  TGCTACCGGGGGAGATAAATGGGACCTGGAAGACCCCAGCAGTTCTGTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACCGGGGGAGATAAATGGGACCTGGAAGACCCCAGCAGTTCTGTGG  500

seq1  AAGAGAGCAGTGTGTGCTGACATCTGAGCATGTCTCTGGGGGAGTGTCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAGCAGTGTGTGCTGACATCTGAGCATGTCTCTGGGGGAGTGTCCC  550

seq1  TTACAAACTTCCATGGTAGGTAGAACCTGTTCCCATTGTGTGTCCTGGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAACTTCCATGGTAGGTAGAACCTGTTCCCATTGTGTGTCCTGGGG  600

seq1  GGCTGGAAGCTGAGGCTGTGCCTTGTCTTGGTGTGGGGTCTGCCCCAAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGAAGCTGAGGCTGTGCCTTGTCTTGGTGTGGGGTCTGCCCCAAGC  650

seq1  ACAGTCCAAACTGAGGATCTGTGGTCAGAGCGATGTGGGAGTGATTCTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCCAAACTGAGGATCTGTGGTCAGAGCGATGTGGGAGTGATTCTGG  700

seq1  GCACA-GGAGAATAAAGAAGCAGAGATATTCCCAGGATGCACTTGGAGCT  749
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGGGAGAATAAAGAAGCAGAGATATTCCCAGGATGCACTTGGAGCT  750

seq1  GCTGATTCTGTGGGAGTCACTGAGGTCTGACAGGCCTCTAACTTAGACGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATTCTGTGGGAGTCACTGAGGTCTGACAGGCCTCTAACTTAGACGT  800

seq1  GGAATCTGTGTCCACTCCCCATCCCTATGACTCTGGGGCTTCCAGAACAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||
seq2  GGAATCTGTGTCCACTCCCCATCCCTATGACTCTGGGGGCTTCAGAACAT  850

seq1  AAACTGAGTGAGGAGAGGTCTTGGAGTTTTCATCTTGTTAGACGTTTTGT  899
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  -AACTGAGTGAGGAGAGGTCTTGGAGTTTTCATCTTGTTAGA-GTTTTGT  898

seq1  TCTTAGGACTCTGAGCCACTACAGAAGGAGCCTAATCACCCTGAAGTGTC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCTTAGGACTCTGAGCCACTACAGAAGGAGCCTAA-CACCCTGAAGTGTC  947

seq1  CATGCTGGCAGAGAG-CTCCAGCTACACGGGGGTGGGGTGGGGTGGGGGT  998
      |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||||| 
seq2  CATGCTTGCAGAGAGCCTCCAGCTACCCGGGGGTG----GGGGTGGGGGG  993

seq1  G  999
      |
seq2  G  994