BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-071F17
Chromosome2 (Build37)
Map Location 16,434,352 - 16,611,100
singlet/doubletdoublet
Overlap genePlxdc2
Upstream geneLOC625457
Downstream gene4930515L03Rik, LOC383665, Nebl
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-071F17.bB6Ng01-071F17.g
ACCDH889081DH889082
length1,081532
definitionDH889081|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071F17, 5' end.DH889082|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071F17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(16,434,352 - 16,435,449)(16,610,567 - 16,611,100)
sequence
gaattctccttaggatggcagatcagaatgctaacaaagaggcgttgccc
aggagtggttgtttactcaggctcttgatcaattaaagagagttcactta
gttcatatactatcagcaagaaatgagacaagcattcctgctaaaaggaa
ccacttctacaggggatgactatcatcggaactacatagcatgctggcat
cttgcatggttaactaactgttcagtttgaagtttcattttatgtaggct
tttcattcctaataagggtacatttttgaaaaaatggggtgactgaccac
tctttggttttaaatcatcatctgttgtgcttaagatatgaggtaggcga
gaagggtactttagagtgtttgaatgagtgctactttacagggaatatta
gatttcagggttgcttcaaagccccacaagaggtgctagagttctaagag
ccttaaaattatgtcataaaaaaatgatcctgattgtgaaataaatctaa
caaaattgaatgtgaacatctttcagaagaaagcaaggaccatgaagatg
agaacaaactttggtttgccatagaaatggggctggcttcccatctctta
gctttgttaaaaatatgtatgtgaatgagattagtgaacgaaggtaagac
ctctggtagtctttgagtggaggctgttggataggaggttgttgttctaa
ttacaaagagcatgtctgaggtgctaggtacaacgccaagctttatgaac
attatacacggtgtgtacatatgtgcacatactgcttgttattttacttt
tgatttgttatgcacttttaatttttttgtgtttcacaccttaatggagg
caggcagcaaaaggtcagtgttttgagttggtgaaacataaaggagaata
cgggaaacctgctggaaacttgagaattaagatcagtcagatgctcagag
gacataggttcttatggttcttcaagtggctctgtgcgatttgtgtccca
gatgctggataaactcatgactatgaaagtttttttttttcttcacagct
agctagtgctacgatactctagttttagtaa
gaattccactttctaaatgctcctcctacttaagaagaacaagcttgata
accatgttgttgattcttttagacacttcgctcactaattagtataggct
ccttatcattatattttatagagtcattaaatctgttggacaagcaatat
gatctcatttgacttatgatatcagtcagggaaaaagagaaagcaatgga
tgctttctttaggctcctccaagttgttacatgtaaaagcagataatcgt
aaccatgtaaatcataatcattcgaaaattcaaaatcctgtgttggtggg
gcgcccccacagacaaaggcgcttgctccttaagcctgatggtgatttga
gttccaatctgaaacgcagggtggaaggagagaagactcctgaaagttgt
cctgtgacatctactcacttcacatgcacaaagcatgcacacatatagac
agagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagga
gagagagagagaggagagagagagagagacta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_16434352_16435449
seq2: B6Ng01-071F17.b_44_1124

seq1  GAATTCTCCTTAGGATGGCAGATCAGAATGCTAACAAAGAGGCGTTGCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTTAGGATGGCAGATCAGAATGCTAACAAAGAGGCGTTGCCC  50

seq1  AGGAGTGGTTGTTTACTCAGGCTCTTGATCAATTAAAGAGAGTTCACTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTGGTTGTTTACTCAGGCTCTTGATCAATTAAAGAGAGTTCACTTA  100

seq1  GTTCATATACTATCAGCAAGAAATGAGACAAGCATTCCTGCTAAAAGGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATATACTATCAGCAAGAAATGAGACAAGCATTCCTGCTAAAAGGAA  150

seq1  CCACTTCTACAGGGGATGACTATCATCGGAACTACATAGCATGCTGGCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTCTACAGGGGATGACTATCATCGGAACTACATAGCATGCTGGCAT  200

seq1  CTTGCATGGTTAACTAACTGTTCAGTTTGAAGTTTCATTTTATGTAGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCATGGTTAACTAACTGTTCAGTTTGAAGTTTCATTTTATGTAGGCT  250

seq1  TTTCATTCCTAATAAGGGTACATTTTTGAAAAAATGGGGTGACTGACCAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTCCTAATAAGGGTACATTTTTGAAAAAATGGGGTGACTGACCAC  300

seq1  TCTTTGGTTTTAAATCATCATCTGTTGTGCTTAAGATATGAGGTAGGCGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGGTTTTAAATCATCATCTGTTGTGCTTAAGATATGAGGTAGGCGA  350

seq1  GAAGGGTACTTTAGAGTGTTTGAATGAGTGCTACTTTACAGGGAATATTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGTACTTTAGAGTGTTTGAATGAGTGCTACTTTACAGGGAATATTA  400

seq1  GATTTCAGGGTTGCTTCAAAGCCCCACAAGAGGTGCTAGAGTTCTAAGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCAGGGTTGCTTCAAAGCCCCACAAGAGGTGCTAGAGTTCTAAGAG  450

seq1  CCTTAAAATTATGTCATAAAAAAATGATCCTGATTGTGAAATAAATCTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAAAATTATGTCATAAAAAAATGATCCTGATTGTGAAATAAATCTAA  500

seq1  CAAAATTGAATGTGAACATCTTTCAGAAGAAAGCAAGGACCATGAAGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTGAATGTGAACATCTTTCAGAAGAAAGCAAGGACCATGAAGATG  550

seq1  AGAACAAACTTTGGTTTGCCATAGAAATGGGGCTGGCTTCCCATCTCTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAAACTTTGGTTTGCCATAGAAATGGGGCTGGCTTCCCATCTCTTA  600

seq1  GCTTTGTTAAAAATATGTATGTGAATGAGATTAGTGAACGAAGGTAAGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGTTAAAAATATGTATGTGAATGAGATTAGTGAACGAAGGTAAGAC  650

seq1  CTCTGGTAGTCTTTGAGTGGAGGCTGTTGGATAGGAGGTTGTTGTTCTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGTAGTCTTTGAGTGGAGGCTGTTGGATAGGAGGTTGTTGTTCTAA  700

seq1  TTACAAAGAGCATGTCTGAGGTGCTAGGTACAACGCCAAGCTTTATGAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAAGAGCATGTCTGAGGTGCTAGGTACAACGCCAAGCTTTATGAAC  750

seq1  ATTATACACGGTGTGTACATATGTGCACATACTGCTTGTTATTTTACTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATACACGGTGTGTACATATGTGCACATACTGCTTGTTATTTTACTTT  800

seq1  TGATTTGTTATGCACTTTTAATTTTTTTGTGTTTCACACCTTAATGGAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTGTTATGCACTTTTAATTTTTTTGTGTTTCACACCTTAATGGAGG  850

seq1  CAGGCAGCAAAAGGTCAGGTGTTTTGAGTTGGTGAAACATAAAGGAGAAT  900
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCAGCAAAAGGTCA-GTGTTTTGAGTTGGTGAAACATAAAGGAGAAT  899

seq1  ACGGGAAACCTGCTGGAAACTTGAGAATTAAGATCAGTCAGATGCTCAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGGAAACCTGCTGGAAACTTGAGAATTAAGATCAGTCAGATGCTCAGA  949

seq1  GGACATAGGTTCTTATGGTTCTTCAAGTGGCTCTGTGCGATTTGTGTCCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GGACATAGGTTCTTATGGTTCTTCAAGTGGCTCTGTGCGATTTGTGT-CC  998

seq1  CAGATTGCTGGATAAACTCAATGACTATTGAAAGGTTTTTTTTTTTTTCC  1050
      |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||| |
seq2  CAGA-TGCTGGATAAACTC-ATGACTA-TGAAAG----TTTTTTTTTTTC  1041

seq1  TTCACAGCTTAGCTTAGTGCTTACCGAATACTCTAAGTTTTTTAGTAA  1098
      |||||||| |||| |||||| |||   ||||||||    |||||||||
seq2  TTCACAGC-TAGC-TAGTGC-TAC--GATACTCTA---GTTTTAGTAA  1081

seq1: chr2_16610567_16611100
seq2: B6Ng01-071F17.g_65_596 (reverse)

seq1  TAGTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
seq2  TAGTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTC--CTCTCTCTCTCTCT  48

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTATATGTGTGCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTATATGTGTGCAT  98

seq1  GCTTTGTGCATGTGAAGTGAGTAGATGTCACAGGACAACTTTCAGGAGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGTGCATGTGAAGTGAGTAGATGTCACAGGACAACTTTCAGGAGTC  148

seq1  TTCTCTCCTTCCACCCTGCGTTTCAGATTGGAACTCAAATCACCATCAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCCTTCCACCCTGCGTTTCAGATTGGAACTCAAATCACCATCAGG  198

seq1  CTTAAGGAGCAAGCGCCTTTGTCTGTGGGGGCGCCCCACCAACACAGGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGGAGCAAGCGCCTTTGTCTGTGGGGGCGCCCCACCAACACAGGAT  248

seq1  TTTGAATTTTCGAATGATTATGATTTACATGGTTACGATTATCTGCTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATTTTCGAATGATTATGATTTACATGGTTACGATTATCTGCTTTT  298

seq1  ACATGTAACAACTTGGAGGAGCCTAAAGAAAGCATCCATTGCTTTCTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTAACAACTTGGAGGAGCCTAAAGAAAGCATCCATTGCTTTCTCTT  348

seq1  TTTCCCTGACTGATATCATAAGTCAAATGAGATCATATTGCTTGTCCAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTGACTGATATCATAAGTCAAATGAGATCATATTGCTTGTCCAAC  398

seq1  AGATTTAATGACTCTATAAAATATAATGATAAGGAGCCTATACTAATTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTAATGACTCTATAAAATATAATGATAAGGAGCCTATACTAATTAG  448

seq1  TGAGCGAAGTGTCTAAAAGAATCAACAACATGGTTATCAAGCTTGTTCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCGAAGTGTCTAAAAGAATCAACAACATGGTTATCAAGCTTGTTCTT  498

seq1  CTTAAGTAGGAGGAGCATTTAGAAAGTGGAATTC  534
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGTAGGAGGAGCATTTAGAAAGTGGAATTC  532