BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-075J03
Chromosome2 (Build37)
Map Location 3,220,691 - 3,436,586
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNmt2, Rpp38, Acbd7, Olah, Meig1, Dclre1c, Suv39h2, Hspa14, Armetl1
Upstream gene9630050M13Rik
Downstream geneLOC100040219, LOC666495, 3110001A13Rik, LOC100040257, LOC100040163, LOC666944, 1700080N15Rik, Frmd4a, EG634452
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-075J03.bB6Ng01-075J03.g
ACCDH892093DH892094
length7741,152
definitionDH892093|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075J03, 5' end.DH892094|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075J03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(3,220,691 - 3,221,464)(3,435,426 - 3,436,586)
sequence
gaattcagtctgtcaggtacctttacctactaagacaataaaccttggag
ggttttattggttgaggtaaaaaaattttaatcaaaagaaatttcctcct
gtggaaaatgagtttcttttgtttctattgcttcagggtaagtattttga
tggactagtgacataaatcactagcaagtagagtactggtctagtatgtg
caaagccaaataaatgaagatggatagtgtcgtaccaaagaggtatctat
aacacctatttttagtgcatataagtctttttaaaaatatatttcaccca
tggaaggagttacagagacaaagtttggagctgagacaaaaggatggacc
atctagagactgccatatccagggatccatcccataatcagcatccaaac
gctgacaccattgtatacactagcaagattttgctgaaaggaccctgata
tagctatctcttgtgagactatgccggggcctagcaaacacagaagtgga
tgctcacagtcagctattggatggatcacagggcccccaatggaggagct
agagaaagtatccaaggagctaaagagatctgcaaccctgtaggtgcaac
aacattatgaactaaccagtaccccgtagctcttaactctagctgcatat
gtatcaaaagatggcctagtcggccatcactgcaaagagaggcccattgg
acttgaaaactttatatgccccagtacaggggaatgccagggccaaaaag
tgggaatgggtgggtaggggagtg
gaattctttacatactagaaggaagagagagttgagtctgttacacattc
tacctcgaccacatttgtgctcataactcatccaccgagtgaaaaaaata
cagatataattcaggagaggtggctcagcaattaagagcacatgctgctc
ttatagaagacccaggttcagttcccagcacctacaacttacaaagcata
tgtaacttcagctctaaggagctgataccctcttttggcctccgttggca
ccaggcacacttgtggtacaaatgcattacattcaggcaaacacttatat
gcataaaatcagaataaaaatttaaaatatctagatgtgattcaatgcat
tatggccatggattcaaaccctaagcattctttggggttctgttcctaaa
gccatcaattcattagacatttaatatgagcttacagaatccaccggtca
gtctttagaactaagtttcacctgtaatgaaaacctttgtatagacattg
gcaaagcctaaaaggtaagatagcttttttatagaatatggtcttgggta
tagctttgcttcaggcatagagaaaaatctgaataactacaataccttga
atgaagctctttatcatgcacaagtattatgttccaccatcatgagactg
ggtttggtggaaaccttaactgttgggtttttttttttaaaccatacttt
atgcatatcagtagttaaatcctaacttgaagaaccatactcagtcccaa
ttcttttgagctgggagacaggactcaggataggcaaggcatgagcaacc
accatgttaacatttggcaggagctggcaggagctggcaggggctggcta
tgatgcaagcatttcatatattttaactcattcaagtttcacaacaaagc
tatgacatagatactttattatcctctctttacagatagagagactgagc
caagaaacatcacctgacctgcaggtcagcgtagagaatttgatcctcca
ggcgtggccctggtccacgtctccccaacttgtgggaagaagaataaatc
tttcttcttggagtttagtcaggaatttgggtcacagccaatgtgacatc
actaatgcacacatctctctcctgacagaattcatgatggtaagttggag
tt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_3220691_3221464
seq2: B6Ng01-075J03.b_46_819

seq1  GAATTCAGTCTGTCAGGTACCTTTACCTACTAAGACAATAAACCTTGGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTCTGTCAGGTACCTTTACCTACTAAGACAATAAACCTTGGAG  50

seq1  GGTTTTATTGGTTGAGGTAAAAAAATTTTAATCAAAAGAAATTTCCTCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTATTGGTTGAGGTAAAAAAATTTTAATCAAAAGAAATTTCCTCCT  100

seq1  GTGGAAAATGAGTTTCTTTTGTTTCTATTGCTTCAGGGTAAGTATTTTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAAAATGAGTTTCTTTTGTTTCTATTGCTTCAGGGTAAGTATTTTGA  150

seq1  TGGACTAGTGACATAAATCACTAGCAAGTAGAGTACTGGTCTAGTATGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTAGTGACATAAATCACTAGCAAGTAGAGTACTGGTCTAGTATGTG  200

seq1  CAAAGCCAAATAAATGAAGATGGATAGTGTCGTACCAAAGAGGTATCTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCCAAATAAATGAAGATGGATAGTGTCGTACCAAAGAGGTATCTAT  250

seq1  AACACCTATTTTTAGTGCATATAAGTCTTTTTAAAAATATATTTCACCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCTATTTTTAGTGCATATAAGTCTTTTTAAAAATATATTTCACCCA  300

seq1  TGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGACAAAAGGATGGACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGACAAAAGGATGGACC  350

seq1  ATCTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCATCCCATAATCAGCATCCAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCATCCCATAATCAGCATCCAAAC  400

seq1  GCTGACACCATTGTATACACTAGCAAGATTTTGCTGAAAGGACCCTGATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACACCATTGTATACACTAGCAAGATTTTGCTGAAAGGACCCTGATA  450

seq1  TAGCTATCTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTATCTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGA  500

seq1  TGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCCCCCAATGGAGGAGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCCCCCAATGGAGGAGCT  550

seq1  AGAGAAAGTATCCAAGGAGCTAAAGAGATCTGCAACCCTGTAGGTGCAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAGTATCCAAGGAGCTAAAGAGATCTGCAACCCTGTAGGTGCAAC  600

seq1  AACATTATGAACTAACCAGTACCCCGTAGCTCTTAACTCTAGCTGCATAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTATGAACTAACCAGTACCCCGTAGCTCTTAACTCTAGCTGCATAT  650

seq1  GTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGCAAAGAGAGGCCCATTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGCAAAGAGAGGCCCATTGG  700

seq1  ACTTGAAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGCCAAAAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGAAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGCCAAAAAG  750

seq1  TGGGAATGGGTGGGTAGGGGAGTG  774
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAATGGGTGGGTAGGGGAGTG  774

seq1: chr2_3435426_3436586
seq2: B6Ng01-075J03.g_66_1217 (reverse)

seq1  AACTCCAACATACATTCATTGAATTCTAGGTCAGGAGAGAGGATGTGTGC  50
      ||||||||| |||  ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||
seq2  AACTCCAACTTACCATCA-TGAATTCT--GTCAGGAGAGA-GATGTGTGC  46

seq1  ATTAGTGATGTCACATTTGCTGTGA-CCAAATTCCTGACTAAAACTCAAA  99
      ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||
seq2  ATTAGTGATGTCACATTGGCTGTGACCCAAATTCCTGACT-AAACTCCAA  95

seq1  GAAGGAAAGATTTATTCTTCCTCCCAC-AGTTGGGGAGAACGTGGACCAG  148
      ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| 
seq2  GAA-GAAAGATTTATTCTTCTTCCCACAAGTTGGGGAG-ACGTGGACCA-  142

seq1  GGGCCACGCCTGGAGGATCAAATTCTCTACCGCTGACCCTGCAGGTCAGG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
seq2  GGGCCACGCCTGGAGGATCAAATTCTCTA-CGCTGA-CCTGCAGGTCAGG  190

seq1  TGATGTTTCTTTGGCTCAGTCTCTCTATCTGTAAAGAGAGGATAATAAAG  248
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTTTC-TTGGCTCAGTCTCTCTATCTGTAAAGAGAGGATAATAAAG  239

seq1  TATCTATGTCATAGCTTTGTTGTGAAACTTGAATGAGTTAAAATATATGA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATGTCATAGCTTTGTTGTGAAACTTGAATGAGTTAAAATATATGA  289

seq1  AATGCTTGCATCATAGCCAGCCCCTGCCAGCTCCTGCCAGCTCCTGCCAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTTGCATCATAGCCAGCCCCTGCCAGCTCCTGCCAGCTCCTGCCAA  339

seq1  ATGTTAACATGGTGGTTGCTCATGCCTTGCCTATCCTGAGTCCTGTCTCC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAACATGGTGGTTGCTCATGCCTTGCCTATCCTGAGTCCTGTCTCC  389

seq1  CAGCTCAAAAGAATTGGGACTGAGTATGGTTCTTCAAGTTAGGATTTAAC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCAAAAGAATTGGGACTGAGTATGGTTCTTCAAGTTAGGATTTAAC  439

seq1  TACTGATATGCATAAAGTATGGTTTAAAAAAAAAAACCCAACAGTTAAGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGATATGCATAAAGTATGGTTTAAAAAAAAAAACCCAACAGTTAAGG  489

seq1  TTTCCACCAAACCCAGTCTCATGATGGTGGAACATAATACTTGTGCATGA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCACCAAACCCAGTCTCATGATGGTGGAACATAATACTTGTGCATGA  539

seq1  TAAAGAGCTTCATTCAAGGTATTGTAGTTATTCAGATTTTTCTCTATGCC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAGCTTCATTCAAGGTATTGTAGTTATTCAGATTTTTCTCTATGCC  589

seq1  TGAAGCAAAGCTATACCCAAGACCATATTCTATAAAAAAGCTATCTTACC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCAAAGCTATACCCAAGACCATATTCTATAAAAAAGCTATCTTACC  639

seq1  TTTTAGGCTTTGCCAATGTCTATACAAAGGTTTTCATTACAGGTGAAACT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGGCTTTGCCAATGTCTATACAAAGGTTTTCATTACAGGTGAAACT  689

seq1  TAGTTCTAAAGACTGACCGGTGGATTCTGTAAGCTCATATTAAATGTCTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCTAAAGACTGACCGGTGGATTCTGTAAGCTCATATTAAATGTCTA  739

seq1  ATGAATTGATGGCTTTAGGAACAGAACCCCAAAGAATGCTTAGGGTTTGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATTGATGGCTTTAGGAACAGAACCCCAAAGAATGCTTAGGGTTTGA  789

seq1  ATCCATGGCCATAATGCATTGAATCACATCTAGATATTTTAAATTTTTAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATGGCCATAATGCATTGAATCACATCTAGATATTTTAAATTTTTAT  839

seq1  TCTGATTTTATGCATATAAGTGTTTGCCTGAATGTAATGCATTTGTACCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATTTTATGCATATAAGTGTTTGCCTGAATGTAATGCATTTGTACCA  889

seq1  CAAGTGTGCCTGGTGCCAACGGAGGCCAAAAGAGGGTATCAGCTCCTTAG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGTGCCTGGTGCCAACGGAGGCCAAAAGAGGGTATCAGCTCCTTAG  939

seq1  AGCTGAAGTTACATATGCTTTGTAAGTTGTAGGTGCTGGGAACTGAACCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAAGTTACATATGCTTTGTAAGTTGTAGGTGCTGGGAACTGAACCT  989

seq1  GGGTCTTCTATAAGAGCAGCATGTGCTCTTAATTGCTGAGCCACCTCTCC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTTCTATAAGAGCAGCATGTGCTCTTAATTGCTGAGCCACCTCTCC  1039

seq1  TGAATTATATCTGTATTTTTTTCACTCGGTGGATGAGTTATGAGCACAAA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTATATCTGTATTTTTTTCACTCGGTGGATGAGTTATGAGCACAAA  1089

seq1  TGTGGTCGAGGTAGAATGTGTAACAGACTCAACTCTCTCTTCCTTCTAGT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTCGAGGTAGAATGTGTAACAGACTCAACTCTCTCTTCCTTCTAGT  1139

seq1  ATGTAAAGAATTC  1161
      |||||||||||||
seq2  ATGTAAAGAATTC  1152