BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-077E14
Chromosome2 (Build37)
Map Location 46,192,312 - 46,193,414
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042661, LOC100041337, LOC666604
Downstream geneLOC383690
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-077E14.bB6Ng01-077E14.g
ACCDH893304DH893305
length1,095247
definitionDH893304|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-077E14, 5' end.DH893305|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-077E14, 3' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcttggttcactaagctagatgtgagtggatagtgagtgtagtcta
atcttatatgtgggagaaggggatgttcagtcatgtctacccaaaaagta
agaatcacaatatcaattatttgtcaaggttagtttattcatcattgtaa
tgttgtaggacaagaaagaatatggcaattttctatatatctgtttaatt
ttatatgtaacctaaaattgttctaagtttaaaaatctctttcaataata
aaaaagtcgttttgtacttaaggtttaattcaatttctatcattttccaa
accaaaccatgtttagtagacagaagtacttcactgtagttccttttaat
tttgtagagtgaatagtcttctattttgatccattagatgggtgtgtcat
agcttactgtttctattatggaaacataaatatggtgaatgatgttaact
ggcctatgatcttgtaatccccttaggtcatattctatagaaagagatca
ttttagcactgtattaaggagctatagtaataagaatactgtgttgtgtg
caggtgtatgtgcatgtatatatacatacatgtatgtgtgtatgtactca
tgtataggtatctgcatgtaggagtatccatgtacattccacatgtggaa
accaaaacctcaagtcgagtctcttattttagttcactcatattttttgt
gacaatgtctttcatggaatctactaaattgactatactgtcaagcagtg
tattctggcttatcaatcccattcttatgccccaagactgtattttgaga
ttcttgacaacatagccagctcttatgttaaagttaggatccatacatat
tccatcatgctttctaacactggaacagtgtttgaacctaatacatacta
atatgtaaatcaaagccagagtgaggtaacccactaatatgtaaagtcag
agccagagtgagtaacccaatcacaaagagtcatttgatattgcactcac
tgatagtggatataagcccagaaacttagaatacccagattacaatttgc
aaacccaggaaaatcaggaccagaccaacgtgggatacttcattc
ccagggactaaaccaccaaccaaagcatatacatgaaaggacccatgact
tgagctgcatatttagcagaggatggccttatcaggcatcgaagggaggg
gatgcctatgaaagcttcaagccgaagtgtaggggaatgctagggtggtg
gggcaggggtgggtgtgtggctgatggagccccctaatggaggcaggggg
aaggggaatctgatgggggttcctggataggaaactgggaaggggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_46192312_46193414
seq2: B6Ng01-077E14.b_51_1145

seq1  GAATTCTTGGTTCACTAAGCTAGATGTGAGTGGATAGTGAGTGTAGTCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGGTTCACTAAGCTAGATGTGAGTGGATAGTGAGTGTAGTCTA  50

seq1  ATCTTATATGTGGGAGAAGGGGATGTTCAGTCATGTCTACCCAAAAAGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTATATGTGGGAGAAGGGGATGTTCAGTCATGTCTACCCAAAAAGTA  100

seq1  AGAATCACAATATCAATTATTTGTCAAGGTTAGTTTATTCATCATTGTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCACAATATCAATTATTTGTCAAGGTTAGTTTATTCATCATTGTAA  150

seq1  TGTTGTAGGACAAGAAAGAATATGGCAATTTTCTATATATCTGTTTAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTAGGACAAGAAAGAATATGGCAATTTTCTATATATCTGTTTAATT  200

seq1  TTATATGTAACCTAAAATTGTTCTAAGTTTAAAAATCTCTTTCAATAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATGTAACCTAAAATTGTTCTAAGTTTAAAAATCTCTTTCAATAATA  250

seq1  AAAAAGTCGTTTTGTACTTAAGGTTTAATTCAATTTCTATCATTTTCCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGTCGTTTTGTACTTAAGGTTTAATTCAATTTCTATCATTTTCCAA  300

seq1  ACCAAACCATGTTTAGTAGACAGAAGTACTTCACTGTAGTTCCTTTTAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAACCATGTTTAGTAGACAGAAGTACTTCACTGTAGTTCCTTTTAAT  350

seq1  TTTGTAGAGTGAATAGTCTTCTATTTTGATCCATTAGATGGGTGTGTCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAGAGTGAATAGTCTTCTATTTTGATCCATTAGATGGGTGTGTCAT  400

seq1  AGCTTACTGTTTCTATTATGGAAACATAAATATGGTGAATGATGTTAACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTACTGTTTCTATTATGGAAACATAAATATGGTGAATGATGTTAACT  450

seq1  GGCCTATGATCTTGTAATCCCCTTAGGTCATATTCTATAGAAAGAGATCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTATGATCTTGTAATCCCCTTAGGTCATATTCTATAGAAAGAGATCA  500

seq1  TTTTAGCACTGTATTAAGGAGCTATAGTAATAAGAATACTGTGTTGTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGCACTGTATTAAGGAGCTATAGTAATAAGAATACTGTGTTGTGTG  550

seq1  CAGGTGTATGTGCATGTATATATACATACATGTATGTGTGTATGTACTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGTATGTGCATGTATATATACATACATGTATGTGTGTATGTACTCA  600

seq1  TGTATAGGTATCTGCATGTAGGAGTATCCATGTACATTCCACATGTGGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATAGGTATCTGCATGTAGGAGTATCCATGTACATTCCACATGTGGAA  650

seq1  ACCAAAACCTCAAGTCGAGTCTCTTATTTTAGTTCACTCATATTTTTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAAACCTCAAGTCGAGTCTCTTATTTTAGTTCACTCATATTTTTTGT  700

seq1  GACAATGTCTTTCATGGAATCTACTAAATTGACTATACTGTCAAGCAGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATGTCTTTCATGGAATCTACTAAATTGACTATACTGTCAAGCAGTG  750

seq1  TATTCTGGCTTATCAATCCCATTCTTATGCCCCAAGACTGTATTTTGAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTGGCTTATCAATCCCATTCTTATGCCCCAAGACTGTATTTTGAGA  800

seq1  TTCTTGACAACATAGCCAGCTCTTATGTTAAAGTTAGGAATCCATACATA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTCTTGACAACATAGCCAGCTCTTATGTTAAAGTTAGG-ATCCATACATA  849

seq1  TTCCATCATGCTTTCTAACACTGGAACAGTGTTTGAACCTAATACATACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATCATGCTTTCTAACACTGGAACAGTGTTTGAACCTAATACATACT  899

seq1  AATATGTAAATCAAAGCCAGAGTGAGGTAACCCACTAATATGTAAAGTCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGTAAATCAAAGCCAGAGTGAGGTAACCCACTAATATGTAAAGTCA  949

seq1  GAGCCAGAGTGAGGTAACCCAATCACAAAAGAAGTCATTTGATA-TGCAC  999
      |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||
seq2  GAGCCAGAGTGA-GTAACCCAATCACAAA--GAGTCATTTGATATTGCAC  996

seq1  TCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAGAAACTTAGAATACCCAAGATACAA  1049
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||
seq2  TCACTGAT-AGTGGATATAAGCCCAGAAACTTAGAATACCCAGATTACAA  1045

seq1  TTTGCAAAACACAAGAAAATCAAGAACAAAGACCAACATGTGGATACTTC  1099
      ||||| |||| || |||||||| || |  |||||||| || |||||||||
seq2  TTTGC-AAACCCAGGAAAATCAGGACC--AGACCAACGTG-GGATACTTC  1091

seq1  ATTC  1103
      ||||
seq2  ATTC  1095