BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-095K14
Chromosome2 (Build37)
Map Location 35,673,304 - 35,804,402
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTtll11
Upstream geneFbxw2, EG623370, Psmd5, D730039F16Rik, Phf19, Traf1, Hc, AI182371, Rab14, Gsn, Stom, LOC654354, 4930568D16Rik, 4930402F06Rik, Ggta1, LOC666042, LOC100042194, Dab2ip
Downstream geneNdufa8, 1700010A17Rik, Lhx6, Rbm18, LOC100042236, Mrrf, LOC100040493, Ptgs1, Olfr334-ps1, Olfr335, Olfr336-ps1, Olfr337-ps1, Olfr338, LOC675440, Olfr339, Olfr340, Olfr341, Olfr342, Olfr343-ps1, Olfr344, Olfr345, Olfr346, Olfr347, Olfr348, Olfr50, Rpl18p, Olfr3, Olfr349-ps1, Olfr350, Olfr351, Olfr352, Olfr353, Olfr354, Olfr355, Olfr356
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-095K14.bB6Ng01-095K14.g
ACCDH906538DH906539
length1,088933
definitionDH906538|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095K14, 5' end.DH906539|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095K14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(35,803,307 - 35,804,402)(35,673,304 - 35,674,234)
sequence
gaattcagcatttgaataatacaaggataatctttacacagtgcaccata
acatacctacacttttattctcagtcagtaaacgagcttctgtttgcaca
gcagctttgtgaataaaaacattacaaagtgtagaaatgtgaattctgct
ttcaccagcaacagccatgaaatttcattctgtgaatctgtaggaggtgg
agtttaaatctaccttttgggccattaaaagggagaccctggcatcagtt
cctcaaacacaaatatattcagaggacatttaatggctccagctcttggt
taagcctgctttagaactgttttcaggcctctggacaagagaggggaaga
tttggggtccaccctggtgtatcccctgccacagagacttctttgtgtcg
gagctgttatatagatgagggtaggtttgttatgatgctttacgctggtc
tgatacatgactatgatgtgttcagaatgtgctatgtagtggaccattag
ccagtttcatattgctataatgaaatactggagacactttgcttataaaa
gagaaagatttattgaatgcagatgcaggttgtctctgcaaccaccacag
cctgcagagtgatagtccctgagagataacaaggcagctgggtccagcat
gactagtcgacaatgttggttcagacttcaggagtctgacccaagtagtt
tattttaggctcacttaagcacagcacaatttcgtgaaaacttcctggtg
ataatttagtcaattgataaagcatccataaatgtctttgagaaccaaag
aaagctaaataaaataaagtcaaacataactacagcaaaactatctgtaa
aggacatgagacaccttccataaaatgagttttgtagattgactgagcag
aacgagctcatgctaatggtctgaaggaggatccagtgtgagtcccccgc
tgggttgatcttcctcgaggttgttttgccaattagagacgctgtcattc
catttacctataagattatccttttcttttcctacccaaccaagtcatgg
ctgtttggtagagacataaacctatagcttgcttgggt
gaattctgtgttttctgtccatatagatatctggaaagctgaaagcagaa
agcacaaggaactctttttttgcaggctgctttgcatgaggcagttaaag
taagttctacagagatcctgtggagtggctcagaggacatccatggggcc
cagcctgcataggggcccagagggactggggtgggaccttcctgccaaat
gtttgaacagaaccaaaggtactcggtgtctttattacacagtcagagaa
attggtgaggtggcttatgtgacaagtgctgtcacataaggggatacaaa
ataagcatcacagtgtcccttcctaatgggagctcacagtggagcagaaa
gggtctcagaagagctgtaagctctcaccataagctaaggtgcagtcaga
gaggaagcgggggagaggggttaagctcacacactaagaccagagataaa
caaacccctctcaagatcagatctctacaaactgtcccatatgaggatac
aggtgagagaaaagtcacagtcaggatggggaggggccaactgtttaaag
gttttgcttctaactaaagttctatgttcatggaaatacaatcataaaga
caaaggtggaagccaagctgtctcttctctttatctcccatttcttaagt
ttagtagcagtgagctggtgtgcttgctccctcgacagctcttaggctct
tccagacagtaaaggctgtcagaagaaaatgctggaatgtgttttatttc
cctgtagatagtgttcctctaaaacctcactgtgtttgtatatgcatgtg
tatatgtgtttgtgtagaagcctatgggcacatgtacttgtgcttgcatg
tgtgtgtgtgtatgcctgtgtatgtgtgtgaacatatttggctatgtgca
ttatttgtatgggtgtgtgtggatgtggatgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_35803307_35804402
seq2: B6Ng01-095K14.b_49_1136 (reverse)

seq1  ACCCAAAGCAAGCTATAGGTTTTATGTCTCTACCAAAACAGCCATGACTT  50
      |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ACCC-AAGCAAGCTATAGG-TTTATGTCTCTACC-AAACAGCCATGACTT  47

seq1  GGTTTGGGTAAGAAATAGAAAA-GATAATCTTATAGTTAAATGGAATGAC  99
      || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GG-TTGGGTAGGAAA-AGAAAAGGATAATCTTATAGGTAAATGGAATGAC  95

seq1  AAGCGTCTCTAATTGGCCAAAACAACCTCGAGAAAGATCAACCCAGCGGG  149
       ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  -AGCGTCTCTAATTGG-CAAAACAACCTCGAGGAAGATCAACCCAGCGGG  143

seq1  AGACCTCACACTGGATCCTCCTTCAGACCATTAGCATGAGCTCGTTCTGC  199
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGA-CTCACACTGGATCCTCCTTCAGACCATTAGCATGAGCTCGTTCTGC  192

seq1  TCAGTCAATCTACAAAACTCATTTTTATGGAAGGTGTCTCATGTCCTTTA  249
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCAATCTACAAAACTCA-TTTTATGGAAGGTGTCTCATGTCCTTTA  241

seq1  CAGATAGTTTTGCTGTAGTTATGTTTGACTTTATTTTATTTAGCTTTCTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATAGTTTTGCTGTAGTTATGTTTGACTTTATTTTATTTAGCTTTCTT  291

seq1  TGGTTCTCAAAGACATTTATGGATGCTTTATCAATTGACTAAATTATCAC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCTCAAAGACATTTATGGATGCTTTATCAATTGACTAAATTATCAC  341

seq1  CAGGAAGTTTTCACGAAATTGTGCTGTGCTTAAGTGAGCCTAAAATAAAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAGTTTTCACGAAATTGTGCTGTGCTTAAGTGAGCCTAAAATAAAC  391

seq1  TACTTGGGTCAGACTCCTGAAGTCTGAACCAACATTGTCGACTAGTCATG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGGGTCAGACTCCTGAAGTCTGAACCAACATTGTCGACTAGTCATG  441

seq1  CTGGACCCAGCTGCCTTGTTATCTCTCAGGGACTATCACTCTGCAGGCTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACCCAGCTGCCTTGTTATCTCTCAGGGACTATCACTCTGCAGGCTG  491

seq1  TGGTGGTTGCAGAGACAACCTGCATCTGCATTCAATAAATCTTTCTCTTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGTTGCAGAGACAACCTGCATCTGCATTCAATAAATCTTTCTCTTT  541

seq1  TATAAGCAAAGTGTCTCCAGTATTTCATTATAGCAATATGAAACTGGCTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGCAAAGTGTCTCCAGTATTTCATTATAGCAATATGAAACTGGCTA  591

seq1  ATGGTCCACTACATAGCACATTCTGAACACATCATAGTCATGTATCAGAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTCCACTACATAGCACATTCTGAACACATCATAGTCATGTATCAGAC  641

seq1  CAGCGTAAAGCATCATAACAAACCTACCCTCATCTATATAACAGCTCCGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCGTAAAGCATCATAACAAACCTACCCTCATCTATATAACAGCTCCGA  691

seq1  CACAAAGAAGTCTCTGTGGCAGGGGATACACCAGGGTGGACCCCAAATCT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAGAAGTCTCTGTGGCAGGGGATACACCAGGGTGGACCCCAAATCT  741

seq1  TCCCCTCTCTTGTCCAGAGGCCTGAAAACAGTTCTAAAGCAGGCTTAACC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCTCTTGTCCAGAGGCCTGAAAACAGTTCTAAAGCAGGCTTAACC  791

seq1  AAGAGCTGGAGCCATTAAATGTCCTCTGAATATATTTGTGTTTGAGGAAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCTGGAGCCATTAAATGTCCTCTGAATATATTTGTGTTTGAGGAAC  841

seq1  TGATGCCAGGGTCTCCCTTTTAATGGCCCAAAAGGTAGATTTAAACTCCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGCCAGGGTCTCCCTTTTAATGGCCCAAAAGGTAGATTTAAACTCCA  891

seq1  CCTCCTACAGATTCACAGAATGAAATTTCATGGCTGTTGCTGGTGAAAGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTACAGATTCACAGAATGAAATTTCATGGCTGTTGCTGGTGAAAGC  941

seq1  AGAATTCACATTTCTACACTTTGTAATGTTTTTATTCACAAAGCTGCTGT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTCACATTTCTACACTTTGTAATGTTTTTATTCACAAAGCTGCTGT  991

seq1  GCAAACAGAAGCTCGTTTACTGACTGAGAATAAAAGTGTAGGTATGTTAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACAGAAGCTCGTTTACTGACTGAGAATAAAAGTGTAGGTATGTTAT  1041

seq1  GGTGCACTGTGTAAAGATTATCCTTGTATTATTCAAATGCTGAATTC  1096
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCACTGTGTAAAGATTATCCTTGTATTATTCAAATGCTGAATTC  1088

seq1: chr2_35673304_35674234
seq2: B6Ng01-095K14.g_70_1001

seq1  GAATTCTGTGTTTTCTGTCCATATAGATATCTGGAAAGCTGAAAGCAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTGTTTTCTGTCCATATAGATATCTGGAAAGCTGAAAGCAGAA  50

seq1  AGCACAAGGAACTCTTTTTTTGCAGGCTGCTTTGCATGAGGCAGTTAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAAGGAACTCTTTTTTTGCAGGCTGCTTTGCATGAGGCAGTTAAAG  100

seq1  TAAGTTCTACAGAGATCCTGTGGAGTGGCTCAGAGGACATCCATGGGGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTCTACAGAGATCCTGTGGAGTGGCTCAGAGGACATCCATGGGGCC  150

seq1  CAGCCTGCATAGGGGCCCAGAGGGACTGGGGTGGGACCTTCCTGCCAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTGCATAGGGGCCCAGAGGGACTGGGGTGGGACCTTCCTGCCAAAT  200

seq1  GTTTGAACAGAACCAAAGGTACTCGGTGTCTTTATTACACAGTCAGAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGAACAGAACCAAAGGTACTCGGTGTCTTTATTACACAGTCAGAGAA  250

seq1  ATTGGTGAGGTGGCTTATGTGACAAGTGCTGTCACATAAGGGGATACAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTGAGGTGGCTTATGTGACAAGTGCTGTCACATAAGGGGATACAAA  300

seq1  ATAAGCATCACAGTGTCCCTTCCTAATGGGAGCTCACAGTGGAGCAGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCATCACAGTGTCCCTTCCTAATGGGAGCTCACAGTGGAGCAGAAA  350

seq1  GGGTCTCAGAAGAGCTGTAAGCTCTCACCATAAGCTAAGGTGCAGTCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTCAGAAGAGCTGTAAGCTCTCACCATAAGCTAAGGTGCAGTCAGA  400

seq1  GAGGAAGCGGGGGAGAGGGGTTAAGCTCACACACTAAGACCAGAGATAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAGCGGGGGAGAGGGGTTAAGCTCACACACTAAGACCAGAGATAAA  450

seq1  CAAACCCCTCTCAAGATCAGATCTCTACAAACTGTCCCATATGAGGATAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCCCTCTCAAGATCAGATCTCTACAAACTGTCCCATATGAGGATAC  500

seq1  AGGTGAGAGAAAAGTCACAGTCAGGATGGGGAGGGGCCAACTGTTTAAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAGAGAAAAGTCACAGTCAGGATGGGGAGGGGCCAACTGTTTAAAG  550

seq1  GTTTTGCTTCTAACTAAAGTTCTATGTTCATGGAAATACAATCATAAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGCTTCTAACTAAAGTTCTATGTTCATGGAAATACAATCATAAAGA  600

seq1  CAAAGGTGGAAGCCAAGCTGTCTCTTCTCTTTATCTCCCATTTCTTAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGTGGAAGCCAAGCTGTCTCTTCTCTTTATCTCCCATTTCTTAAGT  650

seq1  TTAGTAGCAGTGAGCTGGTGTGCTTGCTCCCTCGACAGCTCTTAGGCTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTAGCAGTGAGCTGGTGTGCTTGCTCCCTCGACAGCTCTTAGGCTCT  700

seq1  TCCAGACAGTAAAGGCTGTCAGAAGAAAATGCTGGAATGTGTTTTATTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGACAGTAAAGGCTGTCAGAAGAAAATGCTGGAATGTGTTTTATTTC  750

seq1  CCTGTAGATAGTGTTCCTCTAAAACCTCACTGTGTTTGTATATGCATGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTAGATAGTGTTCCTCTAAAACCTCACTGTGTTTGTATATGCATGTG  800

seq1  TATATGTGTTTGTGTAGAAGCCTATGGGCACATGTACTTGTGCTTGCATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTGTTTGTGTAGAAGCCTATGGGCACATGTACTTGTGCTTGCATG  850

seq1  TGTGTGTGTGTATGCCTGTGTATGTGTGTGAACATATTTGGCTATGTGCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTATGCCTGTGTATGTGTGTGAACATATTTGGCTATGTGCA  900

seq1  -TATTTGTATGGGTGTGTGTGGATGTGGATGT  931
       |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTGTATGGGTGTGTGTGGATGTGGATGT  932