BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-096G11
Chromosome2 (Build37)X (Build37)
Map Location 142,776,582 - 142,776,89645,738,062 - 45,739,135
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC668913, LOC668914, Kif16b
Downstream geneSnrpb2, Otor, LOC668915, LOC668916, Pcsk2, Bfsp1, LOC100043799, LOC100043534, Dstn, Rrbp1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-096G11.bB6Ng01-096G11.g
ACCDH907065DH907066
length3121,061
definitionDH907065|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096G11, 5' end.DH907066|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096G11, 3' end.
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(142,776,582 - 142,776,896)(45,738,062 - 45,739,135)
sequence
cttgatccacttagatttgaccttagtacaaggagataggaatgtatcaa
ttcacattcttctacattataaccaccagttgtgccagcaacatttgttg
ataatgctgtctttcttccactggatggttttagctcccttgtcaaagat
caagtgaccataggtgtgtgggttcatttctgggtcttcaattctattcc
atttgtctacttgtctgtctctataccagtaccatgcagtttttatcaca
attgctctgtagtaaagctttaggtcaggcatggtgattccaacagaggt
tcttttatcctt
gaattcccaaatgataccagtgagggatagatgcttgtctttgcccacct
cttcctcccccgtgaatccttgttgcagcttagacaagacactcaagtct
atttgctcatctttaaatggagctgatgctccctgccccttctgtctcac
aggagtacttggggggaacaaaagcaatgtctgtgacaggctttgataac
ggaaagtgttctctgagggtcagtatgcatccttgcacttcaggcagaga
caggaatgagagaactagagggaaagccagaccaactgtgatctggcatg
ccagggaatccattatcccaaacccatagactacaggactgataggagcc
actgggagagtacagacacgtgcttggctctggccgcctctttcttcttg
tcactttttatttatttaatgtatgtgcttatattgtgtgtagaggtgag
aggacaagctcgggtgtaggtcccttgtttgagacagtctctctgttttt
ctgctgcatgcactgggtaagcaggaatggatttttttctgtctccacct
cccatcttcccatagagtactgggtttataggcacttgtatcacaagtcc
agcttttatatgggttctggggattcgaactcatatcctcatgcttgtat
ggcaaagttgcttttactccagctctcctgttggtgctcttaattcccaa
gtacttcttagaggtaggcacttatattccagtcattttacagtaaagac
ttatgagaggtgactcagtggtcctccttgccagaatcaggacatgaaac
aaatttgtctgcctgaggaagaggcctaggttgtcatgtgtcttgcagtc
tctgagtaactgctttctgcccgtttctgggcctccctaggaagtaggtt
agtaggcagaaacactaccatctttaaacagttctgagacagtagaggtc
ccgggtctgccctccttccatcttccctggccatccacacaaagggctca
gcagcacactcatgcttctggtgctgctctggctgcaccgggttgctaaa
atgttctcctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_142776582_142776896
seq2: B6Ng01-096G11.b_49_363 (reverse)

seq1  AAGGATAAAAGAACCTCTGGTGGAATCACCATGCCTGACCTAAAGCTTTA  50
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATAAAAGAACCTCTGTTGGAATCACCATGCCTGACCTAAAGCTTTA  50

seq1  CTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTATAGAGACAGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTATAGAGACAGAC  100

seq1  AAGTAGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACACC  150
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGACAAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACACC  150

seq1  TATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCTAAAACCATCCAGAGGAAGAA  200
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TATGGTCACTTGATCTTTGACAAGGGAGCTAAAACCATCCAGTGGAAGAA  200

seq1  AGACAGCATTTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGGTTGTTATCATGTA  250
      |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||
seq2  AGACAGCATTATCAACAAATGTTGCTGGCACAACTGGTGGTTATAATGTA  250

seq1  GAAGAATGGGAATCGATCCATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCT  300
      |||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAATGTGAATTGATACATTCCTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCT  300

seq1  AAGTGGATCAAGGAA  315
      |||||||||||||||
seq2  AAGTGGATCAAGGAA  315

seq1: chrX_45738062_45739135
seq2: B6Ng01-096G11.g_66_1126

seq1  GAATTCCCAAATGATACCAGTGAGGGATAGATGCTTGTCTTTGCCCACCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAAATGATACCAGTGAGGGATAGATGCTTGTCTTTGCCCACCT  50

seq1  CTTCCTCCCCCGTGAATCCTTGTTGCAGCTTAGACAAGACACTCAAGTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTCCCCCGTGAATCCTTGTTGCAGCTTAGACAAGACACTCAAGTCT  100

seq1  ATTTGCTCATCTTTAAATGGAGCTGATGCTCCCTGCCCCTTCTGTCTCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCTCATCTTTAAATGGAGCTGATGCTCCCTGCCCCTTCTGTCTCAC  150

seq1  AGGAGTACTTGGGGGGAACAAAAGCAATGTCTGTGACAGGCTTTGATAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTACTTGGGGGGAACAAAAGCAATGTCTGTGACAGGCTTTGATAAC  200

seq1  GGAAAGTGTTCTCTGAGGGTCAGTATGCATCCTTGCACTTCAGGCAGAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGTGTTCTCTGAGGGTCAGTATGCATCCTTGCACTTCAGGCAGAGA  250

seq1  CAGGAATGAGAGAACTAGAGGGAAAGCCAGACCAACTGTGATCTGGCATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAATGAGAGAACTAGAGGGAAAGCCAGACCAACTGTGATCTGGCATG  300

seq1  CCAGGGAATCCATTATCCCAAACCCATAGACTACAGGACTGATAGGAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGAATCCATTATCCCAAACCCATAGACTACAGGACTGATAGGAGCC  350

seq1  ACTGGGAGAGTACAGACACGTGCTTGGCTCTGGCCGCCTCTTTCTTCTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGAGAGTACAGACACGTGCTTGGCTCTGGCCGCCTCTTTCTTCTTG  400

seq1  TCACTTTTTATTTATTTAATGTATGTGCTTATATTGTGTGTAGAGGTGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTTTTATTTATTTAATGTATGTGCTTATATTGTGTGTAGAGGTGAG  450

seq1  AGGACAAGCTCGGGTGTAGGTCCCTTGTTTGAGACAGTCTCTCTGTTTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAAGCTCGGGTGTAGGTCCCTTGTTTGAGACAGTCTCTCTGTTTTT  500

seq1  CTGCTGCATGCACTGGGTAAGCAGGAATGGATTTTTTTCTGTCTCCACCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGCATGCACTGGGTAAGCAGGAATGGATTTTTTTCTGTCTCCACCT  550

seq1  CCCATCTTCCCATAGAGTACTGGGTTTATAGGCACTTGTATCACAAGTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATCTTCCCATAGAGTACTGGGTTTATAGGCACTTGTATCACAAGTCC  600

seq1  AGCTTTTATATGGGTTCTGGGGATTCGAACTCATATCCTCATGCTTGTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTTATATGGGTTCTGGGGATTCGAACTCATATCCTCATGCTTGTAT  650

seq1  GGCAAAGTTGCTTTTACTCCAGCTCTCCTGTTGGTGCTCTTAATTCCCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAAGTTGCTTTTACTCCAGCTCTCCTGTTGGTGCTCTTAATTCCCAA  700

seq1  GTACTTCTTAGAGGTAGGCACTTATATTCCAGTCATTTTACAGTAAAGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTCTTAGAGGTAGGCACTTATATTCCAGTCATTTTACAGTAAAGAC  750

seq1  TTATGAGAGGTGACTCAGTGGTCCTCCTTGCCAGAATCAGGACATGAAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGAGAGGTGACTCAGTGGTCCTCCTTGCCAGAATCAGGACATGAAAC  800

seq1  AAATTTGTCTGCCTGAGGAAGAGGCCTAGGTTGTCAATGTGTCTTGCAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AAATTTGTCTGCCTGAGGAAGAGGCCTAGGTTGTC-ATGTGTCTTGCAGT  849

seq1  CTCTGAGTAACTGCTTTCTGCCCGTTTCTGGGCCTCCCTAGGAAGTAGGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAGTAACTGCTTTCTGCCCGTTTCTGGGCCTCCCTAGGAAGTAGGT  899

seq1  TAGTAGGCAGAAAACACTACCATCTTTAAACAGTTCTGAGACAGGTAGAG  950
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TAGTAGGCAG-AAACACTACCATCTTTAAACAGTTCTGAGACA-GTAGAG  947

seq1  GTCCCCGGGTCCTGCCCTCCTTCCCATCTTCCCTGGCCCCATCCCACACA  1000
      || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||
seq2  GT-CCCGGGT-CTGCCCTCCTT-CCATCTTCCCTGG--CCAT-CCACACA  991

seq1  AAGGGCTCAGCAGCACACTCATGCTTCTGTGTGCTTGCTCTGGCTGGCAC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||
seq2  AAGGGCTCAGCAGCACACTCATGCTTCTG-GTGC-TGCTCTGGCT-GCAC  1038

seq1  CGGGTCTGCTAAAATGTTCTCCTG  1074
      ||||| ||||||||||||||||||
seq2  CGGGT-TGCTAAAATGTTCTCCTG  1061