BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-134E13
Chromosome2 (Build37)
Map Location 77,455,537 - 77,650,290
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp533
Upstream genePrkra, Dfnb59, Fkbp7, Plekha3, Ttn, 2610301F02Rik, Sestd1, LOC623706, LOC667906
Downstream geneBC003993, LOC667920, OTTMUSG00000016703, LOC383717, LOC100040476
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-134E13.bB6Ng01-134E13.g
ACCDH934622DH934623
length7101,066
definitionDH934622|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134E13, 5' end.DH934623|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134E13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,649,581 - 77,650,290)(77,455,537 - 77,456,607)
sequence
gaattctctctgggtgcctcagctaactctgtacccacccattttttttt
ctaccatgtccagagtttttcagggtgcaggagactcaatctctctttct
acctcggtcactagtatgagacccaagacaaagctgtcatccatcacctg
tcagtagaagatgtgggtggccaagcttcttgggtctccttcaggaccaa
ggcagacaccatgtggtatcttccttcccttggagtggaaggcacctgct
gggctgagcaaggagatgaggcttgctcttctgctcaagctgctgtgtgt
ctctgcctgtggtcttgcaccacggtcctgttccagctaaacagctagag
cttcgattgttggaagcaattcattgctttcttaaaaacctttcttttct
tttgtattgggatctgaatcaggctaagtaagtgctctactgctgagccg
catttaatttttagaatcttgttattatttttattacatttaattaatct
aattgtgtatatgtgtatatacatactcacacatatgcatgtgcatgggc
atgtggaagttagagggcaacttgtagaagtggtttctcttcttccatta
taccacatgggttgcaacgatccaattcagggttccaggtttagcagctc
acaccttttacctatgtatgtgtgtatgtgtgtttgtgtgtatgtgtata
tgtgtatgtg
gaattctaaggatcagacgcagaaccagaagacacgtccagagatcacat
gacatctagagattctgacagcttaattaggtttcttctcctttaggtta
tgtcaataggaatgtatcactggctttacagaatattagaaatatatctt
tcattgcacatagtattaacagtttggaggaatctctgtccttcatgcat
actaatacctttaacttcctgatataatcttcatttctatgggaccttaa
aaacctgtaattgatatgaaacaacacaatacgcaacatttcattccttt
tactaactcacacataggatcgtgcttgattatgccactaactgtatgct
acataaagaagcgttttcagacagatgttattttgatgaatccttataag
ccttggagttagactaaatggacattatgatccccaagtaatcataaccc
aaagaaactgagacccagagaggcaagcgagttgccaacggtcccagaat
gagcacttccctcttctttttcttcactcatatttaaggaagagttaacc
accgacattcagaccttaattaacagaacacacgtgctgatttttacaca
gatttcctaaaccaagcacaaagctgaaggcatttacaaacaacaaggga
aagattcacactctacaggcttacagcctccatcctttcttaccctcatc
tacaacagtctatttgtctttttttgttctgttacacgacctccctccta
aggagccttcttagacacattgtttttcttaagcatctcccatgaaattg
aactgctgcacacacaccacgtgtctgttcttatgcatatttgtacgctt
cacatgcaagattatagatgaggaaagtgagagtttctagaacttcatct
ctaaagtgcatttttgcactgtggtgtgatgtcaacagaacggttctctc
tctgtgtccctctaaccttatacccacctacaggtattgctaataactgt
gggatcatggattaggcttgttggctttcagctcaagttttcagtaagct
taaatgcagatgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_77649581_77650290
seq2: B6Ng01-134E13.b_49_758 (reverse)

seq1  CACATACACATATACACATACACACAAACACACATACACACATACATAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATACACATATACACATACACACAAACACACATACACACATACATAGG  50

seq1  TAAAAGGTGTGAGCTGCTAAACCTGGAACCCTGAATTGGATCGTTGCAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGGTGTGAGCTGCTAAACCTGGAACCCTGAATTGGATCGTTGCAAC  100

seq1  CCATGTGGTATAATGGAAGAAGAGAAACCACTTCTACAAGTTGCCCTCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTGGTATAATGGAAGAAGAGAAACCACTTCTACAAGTTGCCCTCTA  150

seq1  ACTTCCACATGCCCATGCACATGCATATGTGTGAGTATGTATATACACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCACATGCCCATGCACATGCATATGTGTGAGTATGTATATACACAT  200

seq1  ATACACAATTAGATTAATTAAATGTAATAAAAATAATAACAAGATTCTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACAATTAGATTAATTAAATGTAATAAAAATAATAACAAGATTCTAA  250

seq1  AAATTAAATGCGGCTCAGCAGTAGAGCACTTACTTAGCCTGATTCAGATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAAATGCGGCTCAGCAGTAGAGCACTTACTTAGCCTGATTCAGATC  300

seq1  CCAATACAAAAGAAAAGAAAGGTTTTTAAGAAAGCAATGAATTGCTTCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATACAAAAGAAAAGAAAGGTTTTTAAGAAAGCAATGAATTGCTTCCA  350

seq1  ACAATCGAAGCTCTAGCTGTTTAGCTGGAACAGGACCGTGGTGCAAGACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCGAAGCTCTAGCTGTTTAGCTGGAACAGGACCGTGGTGCAAGACC  400

seq1  ACAGGCAGAGACACACAGCAGCTTGAGCAGAAGAGCAAGCCTCATCTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCAGAGACACACAGCAGCTTGAGCAGAAGAGCAAGCCTCATCTCCT  450

seq1  TGCTCAGCCCAGCAGGTGCCTTCCACTCCAAGGGAAGGAAGATACCACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCAGCCCAGCAGGTGCCTTCCACTCCAAGGGAAGGAAGATACCACAT  500

seq1  GGTGTCTGCCTTGGTCCTGAAGGAGACCCAAGAAGCTTGGCCACCCACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCTGCCTTGGTCCTGAAGGAGACCCAAGAAGCTTGGCCACCCACAT  550

seq1  CTTCTACTGACAGGTGATGGATGACAGCTTTGTCTTGGGTCTCATACTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTACTGACAGGTGATGGATGACAGCTTTGTCTTGGGTCTCATACTAG  600

seq1  TGACCGAGGTAGAAAGAGAGATTGAGTCTCCTGCACCCTGAAAAACTCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCGAGGTAGAAAGAGAGATTGAGTCTCCTGCACCCTGAAAAACTCTG  650

seq1  GACATGGTAGAAAAAAAAATGGGTGGGTACAGAGTTAGCTGAGGCACCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGGTAGAAAAAAAAATGGGTGGGTACAGAGTTAGCTGAGGCACCCA  700

seq1  GAGAGAATTC  710
      ||||||||||
seq2  GAGAGAATTC  710

seq1: chr2_77455537_77456607
seq2: B6Ng01-134E13.g_69_1134

seq1  GAATTCTAAGGATCAGACGCAGAACCAGAAGACACGTCCAGAGATCACAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAAGGATCAGACGCAGAACCAGAAGACACGTCCAGAGATCACAT  50

seq1  GACATCTAGAGATTCTGACAGCTTAATTAGGTTTCTTCTCCTTTAGGTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATCTAGAGATTCTGACAGCTTAATTAGGTTTCTTCTCCTTTAGGTTA  100

seq1  TGTCAATAGGAATGTATCACTGGCTTTACAGAATATTAGAAATATATCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAATAGGAATGTATCACTGGCTTTACAGAATATTAGAAATATATCTT  150

seq1  TCATTGCACATAGTATTAACAGTTTGGAGGAATCTCTGTCCTTCATGCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGCACATAGTATTAACAGTTTGGAGGAATCTCTGTCCTTCATGCAT  200

seq1  ACTAATACCTTTAACTTCCTGATATAATCTTCATTTCTATGGGACCTTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATACCTTTAACTTCCTGATATAATCTTCATTTCTATGGGACCTTAA  250

seq1  AAACCTGTAATTGATATGAAACAACACAATACGCAACATTTCATTCCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTGTAATTGATATGAAACAACACAATACGCAACATTTCATTCCTTT  300

seq1  TACTAACTCACACATAGGATCGTGCTTGATTATGCCACTAACTGTATGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAACTCACACATAGGATCGTGCTTGATTATGCCACTAACTGTATGCT  350

seq1  ACATAAAGAAGCGTTTTCAGACAGATGTTATTTTGATGAATCCTTATAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAAGAAGCGTTTTCAGACAGATGTTATTTTGATGAATCCTTATAAG  400

seq1  CCTTGGAGTTAGACTAAATGGACATTATGATCCCCAAGTAATCATAACCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGAGTTAGACTAAATGGACATTATGATCCCCAAGTAATCATAACCC  450

seq1  AAAGAAACTGAGACCCAGAGAGGCAAGCGAGTTGCCAACGGTCCCAGAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAACTGAGACCCAGAGAGGCAAGCGAGTTGCCAACGGTCCCAGAAT  500

seq1  GAGCACTTCCCTCTTCTTTTTCTTCACTCATATTTAAGGAAGAGTTAACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACTTCCCTCTTCTTTTTCTTCACTCATATTTAAGGAAGAGTTAACC  550

seq1  ACCGACATTCAGACCTTAATTAACAGAACACACGTGCTGATTTTTACACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGACATTCAGACCTTAATTAACAGAACACACGTGCTGATTTTTACACA  600

seq1  GATTTCCTAAACCAAGCACAAAGCTGAAGGCATTTACAAACAACAAGGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCCTAAACCAAGCACAAAGCTGAAGGCATTTACAAACAACAAGGGA  650

seq1  AAGATTCACACTCTACAGGCTTACAGCCTCCATCCTTTCTTACCCTCATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTCACACTCTACAGGCTTACAGCCTCCATCCTTTCTTACCCTCATC  700

seq1  TACAACAGTCTATTTGTCTTTTTTTGTTCTGTTACACGACCTCCCTCCTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAACAGTCTATTTGTCTTTTTTTGTTCTGTTACACGACCTCCCTCCTA  750

seq1  AGGAGCCTTCTTAGACACATTGTTTTTCTTAAGCATCTCCCATGAAATTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCCTTCTTAGACACATTGTTTTTCTTAAGCATCTCCCATGAAATTG  800

seq1  AACTGCTGCACACACACCACGTGTCTGTTCTTATGCATATTTGTACGCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCTGCACACACACCACGTGTCTGTTCTTATGCATATTTGTACGCTT  850

seq1  CACATGCAAGATTTATAGATGAGGAAAGTGAGAGTTTCTAGAACTTCATC  900
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGCAAGA-TTATAGATGAGGAAAGTGAGAGTTTCTAGAACTTCATC  899

seq1  TCTAAAGTGCATTTTTGCAACTGTGGTGGTGATGTCAACAGAACGGTTCT  950
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAGTGCATTTTTGC-ACTGTGGT-GTGATGTCAACAGAACGGTTCT  947

seq1  CTCTCTGTGTCCCTCTAAACCTTATACCCACCTACAGGGTATTGCTAATA  1000
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTCTCTGTGTCCCTCT-AACCTTATACCCACCTACA-GGTATTGCTAATA  995

seq1  ACTGTGGGATCATGGATTAGGGCTGTTGGCTTTCAGCTCAAGTTTTCAGT  1050
      |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGGGATCATGGATTAGGCTTGTTGGCTTTCAGCTCAAGTTTTCAGT  1045

seq1  ATGCTTAAATGCAGATGTGTG  1071
      | |||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTAAATGCAGATGTGTG  1066