BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-156B15
Chromosome2 (Build37)
Map Location 133,769,892 - 133,890,565
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene5830467P10Rik, LOC668908, LOC100043785, A430048G15Rik, Bmp2
Downstream geneHao1, Txndc13, LOC627897, LOC433478, Plcb1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-156B15.bB6Ng01-156B15.g
ACCDH950696DH950697
length1,179710
definitionDH950696|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156B15, 5' end.DH950697|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156B15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(133,889,388 - 133,890,565)(133,769,892 - 133,770,600)
sequence
gaattcctgtgtacatatcccctgactatgtctttctataattttccccc
aactaaagtaaaataactgattttccaagcctttggtcctaaatgtggac
ttatggcctgatttaactgataggatagtagcagatagaattcatacaaa
ggcccccttgccttcgtctgttaaatattccatatagctgaccaggaacc
taaagtttgaattctaatcctttctagccctttctctgctatctcatgta
tgtttggccttttctatccaataggacattccattccctggcttatttgg
ctctggtctttaacctgatccttccatgtaataatgaaattgaccctaaa
tcaaacatttcctgattgtcacttcagcctacttttctgagttacttgac
ttgtgtattgctccttgacttttaaaacattcttttcttattttttggca
ataggctgtggtgttgctgagtgtcttctttaatttgcatccagctaaag
ttcagatttgtctaactaaccaagagttactattgtttaagttccccccc
cccaggctctcatattctacattcaaagagaagctatctcacctagtggc
ttcacttattggctcactatgcttgactcaaaaaaaatcagtgtctctgt
cacgaacctcatttctgaactgcaaactcgctcatccatctgcctctctg
atatcttagtttgaataatcctaaggcattacaagtgccagagtttttaa
aataaatcccatgatcctctcatttaagcagttgactttccacttagtat
tatacgatctataacacaacacagttatccatgcatccactggaagccta
tccttcaagcctcatctcaaatatatgggtggcacatcttgtgactgact
catccttatgcacctcatgcaaggatgtcaattctgaacttattccatag
cactgctttcctatctgatctgctgctacactgtaagctcatttgtgctc
aaatccctatggagctcaaatccctttgagtgcccaaatcttcctcctcc
ctcctccttctcctagtcctccttaacaattctttcctctctcttctcca
ctctctcttccccccctcccccacacacttggagtttcttaatgtatcta
aatttcattcaattcatatatctgtcttg
gaattccaagctggccttaactcataattgccctatctccaacctcagtg
ctgaaatcatgagcttacacatttattctgctggcttggctttcattgtt
taggtatttccactctaatgagcagaatccccaaaatgactttacctgta
tgaatcagattcatctgtatgcatatatatgcaataaaaactctccataa
tgaaataggatttatttatcgttgtggagactgtaactagtccacctctt
agggttgagaaaaacatggcagatagggggcagggaaaatgcatgagcat
gaaagcaaaggacacttctaacccaattcggccatttacatgctagatcc
aactgtataattaagtaccagtaaaagtcagtaattatgcatgcatgtat
atggtctgatatgtagtagggaccactaggatatatatatgcattgaaca
agacttaagactagactggaaacacagtgttataatattataaatatcaa
gactcagttttagcttggctttctcatctgtctcccacatgtgagaaagt
ccaggcatttgaatttataagtagtaaaacaagcaaggatactcttgttt
gttggtattgctgagggatgtggttcccagtgctggtcttcccttaaaga
cataacacaaccagcatacacagactaacttacaacatggttgggggttg
ggggttgaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_133889388_133890565
seq2: B6Ng01-156B15.b_45_1223 (reverse)

seq1  CAAGACAG-TATATGAATTTGAATGAAAATTTAGATACATTAAGAAAACT  49
      |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||
seq2  CAAGACAGATATATGAA-TTGAATG-AAATTTAGATACATTAAG-AAACT  47

seq1  CAAGGTGTGTGGGAG-GGGGAGAAAGAGAGAGT-GAG-AGAGAGAGG-AA  95
      | | ||||||||| | |||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||
seq2  CCAAGTGTGTGGGGGAGGGGGGGAAGAGAGAGTGGAGAAGAGAGAGGAAA  97

seq1  GAATGTTTAAGGAGGACTAGGAGAAGGAGGA-GGAGGAGGAAGATTTGGG  144
      ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GAATTGTTAAGGAGGACTAGGAGAAGGAGGAGGGAGGAGGAAGATTTGGG  147

seq1  CACTCCAAAGGGATTTGAGCTCCATAGGGATTTGAGCACAAATGAGCTTA  194
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACT-CAAAGGGATTTGAGCTCCATAGGGATTTGAGCACAAATGAGCTTA  196

seq1  CAGTGTAGCAGCAGATCAAGATAGGAAAGCAGTGCTATGGAATAAGTTCA  244
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTAGCAGCAGATC-AGATAGGAAAGCAGTGCTATGGAATAAGTTCA  245

seq1  GAATTGACATCCTTGCATGAGGTGCATAAGGATGAGTCAGTCACAAGATG  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGACATCCTTGCATGAGGTGCATAAGGATGAGTCAGTCACAAGATG  295

seq1  TGCCACCCATATATTTGAGATGAGGCTTGAAGGATAGGCTTCCAGTGGAT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACCCATATATTTGAGATGAGGCTTGAAGGATAGGCTTCCAGTGGAT  345

seq1  GCATGGATAACTGTGTTGTGTTATAGATCGTATAATACTAAGTGGAAAGT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGATAACTGTGTTGTGTTATAGATCGTATAATACTAAGTGGAAAGT  395

seq1  CAACTGCTTAAATGAGAGGATCATGGGATTTATTTTAAAAACTCTGGCAC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGCTTAAATGAGAGGATCATGGGATTTATTTTAAAAACTCTGGCAC  445

seq1  TTGTAATGCCTTAGGATTATTCAAACTAAGATATCAGAGAGGCAGATGGA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAATGCCTTAGGATTATTCAAACTAAGATATCAGAGAGGCAGATGGA  495

seq1  TGAGCGAGTTTGCAGTTCAGAAATGAGGTTCGTGACAGAGACACTGATTT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCGAGTTTGCAGTTCAGAAATGAGGTTCGTGACAGAGACACTGATTT  545

seq1  TTTTTGAGTCAAGCATAGTGAGCCAATAAGTGAAGCCACTAGGTGAGATA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGAGTCAAGCATAGTGAGCCAATAAGTGAAGCCACTAGGTGAGATA  595

seq1  GCTTCTCTTTGAATGTAGAATATGAGAGCCTGGGGGGGGGGAACTTAAAC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTCTTTGAATGTAGAATATGAGAGCCTGGGGGGGGGGAACTTAAAC  645

seq1  AATAGTAACTCTTGGTTAGTTAGACAAATCTGAACTTTAGCTGGATGCAA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGTAACTCTTGGTTAGTTAGACAAATCTGAACTTTAGCTGGATGCAA  695

seq1  ATTAAAGAAGACACTCAGCAACACCACAGCCTATTGCCAAAAAATAAGAA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAGAAGACACTCAGCAACACCACAGCCTATTGCCAAAAAATAAGAA  745

seq1  AAGAATGTTTTAAAAGTCAAGGAGCAATACACAAGTCAAGTAACTCAGAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATGTTTTAAAAGTCAAGGAGCAATACACAAGTCAAGTAACTCAGAA  795

seq1  AAGTAGGCTGAAGTGACAATCAGGAAATGTTTGATTTAGGGTCAATTTCA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGGCTGAAGTGACAATCAGGAAATGTTTGATTTAGGGTCAATTTCA  845

seq1  TTATTACATGGAAGGATCAGGTTAAAGACCAGAGCCAAATAAGCCAGGGA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTACATGGAAGGATCAGGTTAAAGACCAGAGCCAAATAAGCCAGGGA  895

seq1  ATGGAATGTCCTATTGGATAGAAAAGGCCAAACATACATGAGATAGCAGA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAATGTCCTATTGGATAGAAAAGGCCAAACATACATGAGATAGCAGA  945

seq1  GAAAGGGCTAGAAAGGATTAGAATTCAAACTTTAGGTTCCTGGTCAGCTA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGGCTAGAAAGGATTAGAATTCAAACTTTAGGTTCCTGGTCAGCTA  995

seq1  TATGGAATATTTAACAGACGAAGGCAAGGGGGCCTTTGTATGAATTCTAT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAATATTTAACAGACGAAGGCAAGGGGGCCTTTGTATGAATTCTAT  1045

seq1  CTGCTACTATCCTATCAGTTAAATCAGGCCATAAGTCCACATTTAGGACC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTACTATCCTATCAGTTAAATCAGGCCATAAGTCCACATTTAGGACC  1095

seq1  AAAGGCTTGGAAAATCAGTTATTTTACTTTAGTTGGGGGAAAATTATAGA  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCTTGGAAAATCAGTTATTTTACTTTAGTTGGGGGAAAATTATAGA  1145

seq1  AAGACATAGTCAGGGGATATGTACACAGGAATTC  1178
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACATAGTCAGGGGATATGTACACAGGAATTC  1179

seq1: chr2_133769892_133770600
seq2: B6Ng01-156B15.g_68_777

seq1  GAATTCCAAGCTGGCCTTAACTCATAATTGCCCTATCTCCAACCTCAGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGCTGGCCTTAACTCATAATTGCCCTATCTCCAACCTCAGTG  50

seq1  CTGAAATCATGAGCTTACACATTTATTCTGCTGGCTTGGCTTTCATTGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAATCATGAGCTTACACATTTATTCTGCTGGCTTGGCTTTCATTGTT  100

seq1  TAGGTATTTCCACTCTAATGAGCAGAATCCCCAAAATGACTTTACCTGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTATTTCCACTCTAATGAGCAGAATCCCCAAAATGACTTTACCTGTA  150

seq1  TGAATCAGATTCATCTGTATGCATATATATGCAATAAAAACTCTCCATAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATCAGATTCATCTGTATGCATATATATGCAATAAAAACTCTCCATAA  200

seq1  TGAAATAGGATTTATTTATCGTTGTGGAGACTGTAACTAGTCCACCTCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATAGGATTTATTTATCGTTGTGGAGACTGTAACTAGTCCACCTCTT  250

seq1  AGGGTTGAGAAAAACATGGCAGATAGGGGGCAGGGAAAATGCATGAGCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTGAGAAAAACATGGCAGATAGGGGGCAGGGAAAATGCATGAGCAT  300

seq1  GAAAGCAAAGGACACTTCTAACCCAATTCGGCCATTTACATGCTAGATCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCAAAGGACACTTCTAACCCAATTCGGCCATTTACATGCTAGATCC  350

seq1  AACTGTATAATTAAGTACCAGTAAAAGTCAGTAATTATGCATGCATGTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTATAATTAAGTACCAGTAAAAGTCAGTAATTATGCATGCATGTAT  400

seq1  ATGGTCTGATATGTAGTAGGGACCACTAGGATATATATATGCATTGAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTCTGATATGTAGTAGGGACCACTAGGATATATATATGCATTGAACA  450

seq1  AGACTTAAGACTAGACTGGAAACACAGTGTTATAATATTATAAATATCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTAAGACTAGACTGGAAACACAGTGTTATAATATTATAAATATCAA  500

seq1  GACTCAGTTTTAGCTTGGCTTTCTCATCTGTCTCCCACATGTGAGAAAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCAGTTTTAGCTTGGCTTTCTCATCTGTCTCCCACATGTGAGAAAGT  550

seq1  CCAGGCATTTGAATTTATAAGTAGTAAAACAAGCAAGGATACTCTTGTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCATTTGAATTTATAAGTAGTAAAACAAGCAAGGATACTCTTGTTT  600

seq1  GTTGGTATTGCTGAGGGATGTGGTTCCCAGTGCTGGTCTTCCCTTAAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGTATTGCTGAGGGATGTGGTTCCCAGTGCTGGTCTTCCCTTAAAGA  650

seq1  CATAACACAACCAGCATACACAGACTAACTTACAACATGGTTGGGGGTT-  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CATAACACAACCAGCATACACAGACTAACTTACAACATGGTTGGGGGTTG  700

seq1  GGGGTTGAGA  709
      ||||||||||
seq2  GGGGTTGAGA  710