BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-166M12
Chromosome2 (Build37)
Map Location 19,621,781 - 19,623,047
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneBC061194, LOC667493, LOC100041479, Pip5k2a, 4930426L09Rik, LOC667521, Armc3, Msrb2, LOC100041196, Ptf1a, LOC100041534, 4921504E06Rik, LOC100041244, Otud1, LOC667564
Downstream geneLOC100041302, LOC433406, LOC654360, LOC667609, Etl4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-166M12.b
ACCDH958462
length1,260
definitionDH958462|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166M12, 5' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcacaaccacccatcacatgagtgcctgtttcaggggagactttaa
tcctcaactttcattttcttgactttttcctttttaatgccaaatctcat
aaaaagtgaggcctgaggatgtgactcaatggtagacctcttgtctagta
aacacacggtcctgggctcaatcccagctccacagggaaaatgaaagtga
gtcttcacattgccttgacttcttgtcttacacaggctctgagtttacac
tggtaacttgtcttcctttccatcagcacatcaagttatcactttctgaa
tttttaccttatcttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgttttca
gcatgcaacatgcctgtatgccttctcttctcaaacttatccacacaccc
atagcagactttacaaacaaactttgtagagtctgagctggggcaactac
aaggtgttagagcagctcaattaccctcctgcatgtcagaatctatacat
gtgaggatgccattatctatagcctggagcttgttagagattaatgaaag
aaatcaatgagaaacttcaatccctaggctgtctatcagttgttcatttc
taccatccccacacgttatacagactccgagtgagtagaggtgtataact
tgcacttgccttgagcaaccctccacctggacattctgctcagcttttct
ggggctagccccttcctctcatacctttccttcccacagatgacttgggg
taaatgacatcagcccttttccattgtccagcttccaaaaagcatgaaat
taaatgagactatgaggcctggggttttacaataagaacatgcatgaaag
atcttagtctatcagccacagtaactttctagcactaggaggctctgtga
acaatgtctccctctagacattgagactaatggacaccccagccaagaag
cccctgcacaactaaaggcctgttttaaaggtagagatgggctttctcca
gcctagtgcatcataaatgagggggtctatgctgtctagatagttcagga
accacctgactttagagacctcacaggtttaacacctactatctggacct
taaaagaagaccagatatttttaaaatagtgtataatggagtgttttgta
ttttcatttcaatcattgaaaaaattccaacatgcgattaaaaatgcttg
ccccaatgccagtagagagcgtgacctgggtcatcatgagccagaggagc
tgtgtccctg
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_19621781_19623047
seq2: B6Ng01-166M12.b_45_1304 (reverse)

seq1  CAGGG--ACAGC-CCTCTGGCTC-TGATGACCCCAGGGTCA-GCTCTCCT  45
      |||||  ||||| |||||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||
seq2  CAGGGACACAGCTCCTCTGGCTCATGATGACCC--AGGTCACGCTCT-CT  47

seq1  ACTTGCTATTGGTGGCAAGCCATCTCTCACTCGCCCATGTTGAAAATTTT  95
      ||| || ||||| |||||| ||| | | | |||  ||||||| ||   ||
seq2  ACTGGC-ATTGG-GGCAAG-CAT-TTTTAATCG--CATGTTGGAA---TT  88

seq1  TTTTCAATGATTG-AATGAAATTAC-AAACACTCATTTATACAACTATTT  143
      ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||
seq2  TTTTCAATGATTGAAATGAAAATACAAAACACTCCATTATAC-ACTATTT  137

seq1  ---AAATATCT-GTCTTCTCTTAAGGTCCCAGATAGTAGTTGTTTACACC  189
         |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||
seq2  TAAAAATATCTGGTCTTCTTTTAAGGT-CCAGATAGTAGGTG-TTAAACC  185

seq1  TGTGA-GTCTCTAATGTCAGGGTGTTCCTGAACTATCTAGACAGCATTAG  238
      ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGTGAGGTCTCTAAAGTCAGGTGGTTCCTGAACTATCTAGACAGCA-TAG  234

seq1  ACCCCCTCATTTATGATGCACTAGGCTTGGAGAAAAGCCCATCTCTTACC  288
      |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||
seq2  ACCCCCTCATTTATGATGCACTAGGC-TGGAG-AAAGCCCATCTC-TACC  281

seq1  TTTAAAACAGGCCTTTAGTTGTGCAGGGGCTTCTTGGCTGGGGTGTCCAT  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAACAGGCCTTTAGTTGTGCAGGGGCTTCTTGGCTGGGGTGTCCAT  331

seq1  TAGTCTCAATGTCTAGAGGGAGACATTGTTCACAGAGCCTCCTAGTGCTA  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTCAATGTCTAGAGGGAGACATTGTTCACAGAGCCTCCTAGTGCTA  381

seq1  GAAAGTTACTGTGGCTGATAGACTAAGATCTTTCATGCATGTTCTTATTG  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTTACTGTGGCTGATAGACTAAGATCTTTCATGCATGTTCTTATTG  431

seq1  TAAAACCCCAGGCCTCATAGTCTCATTTAATTTCATGCTTTTTGGAAGCT  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACCCCAGGCCTCATAGTCTCATTTAATTTCATGCTTTTTGGAAGCT  481

seq1  GGACAATGGAAAAGGGCTGATGTCATTTACCCCAAGTCATCTGTGGGAAG  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAATGGAAAAGGGCTGATGTCATTTACCCCAAGTCATCTGTGGGAAG  531

seq1  GAAAGGTATGAGAGGAAGGGGCTAGCCCCAGAAAAGCTGAGCAGAATGTC  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGTATGAGAGGAAGGGGCTAGCCCCAGAAAAGCTGAGCAGAATGTC  581

seq1  CAGGTGGAGGGTTGCTCAAGGCAAGTGCAAGTTATACACCTCTACTCACT  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGGAGGGTTGCTCAAGGCAAGTGCAAGTTATACACCTCTACTCACT  631

seq1  CGGAGTCTGTATAACGTGTGGGGATGGTAGAAATGAACAACTGATAGACA  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGTCTGTATAACGTGTGGGGATGGTAGAAATGAACAACTGATAGACA  681

seq1  GCCTAGGGATTGAAGTTTCTCATTGATTTCTTTCATTAATCTCTAACAAG  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTAGGGATTGAAGTTTCTCATTGATTTCTTTCATTAATCTCTAACAAG  731

seq1  CTCCAGGCTATAGATAATGGCATCCTCACATGTATAGATTCTGACATGCA  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGGCTATAGATAATGGCATCCTCACATGTATAGATTCTGACATGCA  781

seq1  GGAGGGTAATTGAGCTGCTCTAACACCTTGTAGTTGCCCCAGCTCAGACT  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGTAATTGAGCTGCTCTAACACCTTGTAGTTGCCCCAGCTCAGACT  831

seq1  CTACAAAGTTTGTTTGTAAAGTCTGCTATGGGTGTGTGGATAAGTTTGAG  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAAAGTTTGTTTGTAAAGTCTGCTATGGGTGTGTGGATAAGTTTGAG  881

seq1  AAGAGAAGGCATACAGGCATGTTGCATGCTGAAAACAAACAAACAAACAA  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAAGGCATACAGGCATGTTGCATGCTGAAAACAAACAAACAAACAA  931

seq1  ACAAACAAACAAACAAGATAAGGTAAAAATTCAGAAAGTGATAACTTGAT  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACAAACAAACAAGATAAGGTAAAAATTCAGAAAGTGATAACTTGAT  981

seq1  GTGCTGATGGAAAGGAAGACAAGTTACCAGTGTAAACTCAGAGCCTGTGT  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGATGGAAAGGAAGACAAGTTACCAGTGTAAACTCAGAGCCTGTGT  1031

seq1  AAGACAAGAAGTCAAGGCAATGTGAAGACTCACTTTCATTTTCCCTGTGG  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAAGAAGTCAAGGCAATGTGAAGACTCACTTTCATTTTCCCTGTGG  1081

seq1  AGCTGGGATTGAGCCCAGGACCGTGTGTTTACTAGACAAGAGGTCTACCA  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGATTGAGCCCAGGACCGTGTGTTTACTAGACAAGAGGTCTACCA  1131

seq1  TTGAGTCACATCCTCAGGCCTCACTTTTTATGAGATTTGGCATTAAAAAG  1188
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTCACATCCTCAGGCCTCACTTTTTATGAGATTTGGCATTAAAAAG  1181

seq1  GAAAAAGTCAAGAAAATGAAAGTTGAGGATTAAAGTCTCCCCTGAAACAG  1238
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAGTCAAGAAAATGAAAGTTGAGGATTAAAGTCTCCCCTGAAACAG  1231

seq1  GCACTCATGTGATGGGTGGTTGTGAATTC  1267
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCATGTGATGGGTGGTTGTGAATTC  1260