BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-167L02
Chromosome2 (Build37)
Map Location 67,920,141 - 68,091,744
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC227995, B3galt1, Stk39
Upstream geneGm1322, Cmya3, LOC621171
Downstream geneLOC100039683, Gm1323, 4933409G03Rik, 4932414N04Rik, LOC667443, Lass6, Nostrin, Spc25, G6pc2, Abcb11
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-167L02.bB6Ng01-167L02.g
ACCDH959119DH959120
length1,1631,114
definitionDH959119|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167L02, 5' end.DH959120|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167L02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,090,572 - 68,091,744)(67,920,141 - 67,921,265)
sequence
gaattctattaccatttttggacaatgaccttcttgaagactctaggaaa
acctagctcttactcttcaaccacacaggtttaggatccaagaaacagtg
tgtaagaatgctattgcccctgaattcattttaagaaagagagacacttt
cttggtcaccttccaacagattgaccaggcccttttctttagacctatgc
tcttccagttataaaagtcaacattgacacacattgttcagtagcacagg
ctgttatttggtaacctatgttgtccacctcacagggctggtcttcctgt
aggactcttgctcggtgaactacaggaggattcaatgggaaaccatagcc
cagaaaacaacccaagatagacacatagctgcagattcctgggcctggct
gtgaatccgtctgcccagagctcactgcagcaaacagtgaaggagctgtc
tattcatttgacttggaaaacatttttttttccacttaaattcttaacag
taacatgccttcaaccgttagtgagtttatttagccgtgagatacacatt
actgaaaatgaggctatcttatacaaagcattttttcagtaatagactcc
ttggagggctaatttataaccagctcttgagacttcttaccatcttgtat
ttgttggccaaggctctagaaagcactgtatccatggcttaattcttgct
tggtcttcctttgctgtgggggactgttgcttccttacacatcttcctca
cagtttttgttttgttttgttgttttgtagggtctttctttctttctttc
tttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttcctgtct
ttttgtcagtggtcccaagtcataagataatacttacataaaatgataca
ctactttctagaaataaagaatataacctagaagtcatagttttgatgtc
gttgcttttagacatacacaaatgtaataagattatgctggctaatggct
agcccctggcatagcagattacagaagactgtcagacttctttgagggct
aaacaatctatcacccacccacccgtattccagttctgtttctcgaatct
tggcagtcatgatctctaatgtatcctttcactggggcgaaggggcttct
ctgataggacaag
gaattcttcctttgcaaaactacagttttgatggcgtttgctaatggtca
ttctactgggctgattttggacagtggagctacccacaccacttcgattc
cagtccacgatggctatgtccttcaaaaaggcattgtgaaatcccctctt
gctggagtcttcattaccatgcagtacaaagaactcttccaggaaatgaa
catagaactcattcctccttacatgattgcattaaaagaggctgtttgag
taggctctccagccaactggaaaagaaaagagaacctgccccaggttaca
aagtcttggcacaattacatgtgcaacggtgtcactcaggactttcaagc
ttctgtccttcaggtattagactccacctatgacaaacaagtggcttcac
agatgccaactattcactacgaattccccaatggttacagctgtggtttt
ggtgcaaagaggctgaaaattcctgaaggattatttgacccttccaacta
aagggcttgtctgggaacatgatgctgggagtcagtcacatggtcacaac
cagtgtcgggatgtgtgacatcaatatcagaccaagtctctatggcagtg
tgatcatagcaggaggaaacaagctaatacagagtttcactgacaggata
aatagagacctttctcagaaaacttcaccaagtatgtagttgaaactgat
tgcaaagcgcaggttcagctcatggattagtggctccctcctagcatctt
tggataccttccaaacaggaatatgaaggaagaaagcagagtgtagaaag
aaaatgcccttgagggctctatcctgcctacacttcacctcacgtctgta
gcttgagttcactcaagacaatatgaccatcttttgtagaatgttggcac
atgttttgcatatttcaatttctacttaaactttttaagctttaaccagc
tctataattaaatgagttgtgctttccttggatgcacttatccttattag
aggcattttataattgttgaatgtctattttctctaaatttttgcttcag
tagtactttcaggtctcccgttgggttgtggattactttttaattgacac
tagtaaaagtcact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_68090572_68091744
seq2: B6Ng01-167L02.b_45_1207 (reverse)

seq1  CTTGTCCTTAATCAGAGAAGCCCC-TCTGCCCAGTGAAGGGATTACATTT  49
      ||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| ||
seq2  CTTGTCCT--ATCAGAGAAGCCCCTTCGCCCCAGTGAAAGGA-TACA-TT  46

seq1  AGAGATTCTGGACTGCCCAGGGTTCCGAG-AACAGAACTGGGATACGGGT  98
      ||||| ||  ||||||| |  | | |||| ||||||||||| ||||||||
seq2  AGAGA-TCATGACTGCCAA--GATTCGAGAAACAGAACTGGAATACGGGT  93

seq1  GGGTGGGGTGGATAGATGGTTTAGCCCTTCAAAGAAGTCTTGACAGTC-T  147
      |||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |
seq2  GGGTGGG--TGATAGATTGTTTAGCCC-TCAAAGAAGTC-TGACAGTCTT  139

seq1  CTGTAATCCTGCTATGCCAGGGGCTTAGCCCATTAGCCAGCATAATC-TA  196
      ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||
seq2  CTGTAAT-CTGCTATGCCAGGGGC-TAG-CCATTAGCCAGCATAATCTTA  186

seq1  TTACATTTGTGTATGTCTTAAAAGCAACGACATCAAAACTATGACTTCTA  246
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATTTGTGTATGTC-TAAAAGCAACGACATCAAAACTATGACTTCTA  235

seq1  GGTTATATTCTTTATTTCTAG-AAGTAGTGTATCATTTTATGTAAGTATT  295
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTATATTCTTTATTTCTAGAAAGTAGTGTATCATTTTATGTAAGTATT  285

seq1  ATCTTATGACTTGGGACCACTGACAAAAAGACAGGAAAGAAAGAAAGAAA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTATGACTTGGGACCACTGACAAAAAGACAGGAAAGAAAGAAAGAAA  335

seq1  GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGACCCT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGACCCT  385

seq1  ACAAAACAACAAAACAAAACAAAAACTGTGAGGAAGATGTGTAAGGAAGC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACAACAAAACAAAACAAAAACTGTGAGGAAGATGTGTAAGGAAGC  435

seq1  AACAGTCCCCCACAGCAAAGGAAGACCAAGCAAGAATTAAGCCATGGATA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTCCCCCACAGCAAAGGAAGACCAAGCAAGAATTAAGCCATGGATA  485

seq1  CAGTGCTTTCTAGAGCCTTGGCCAACAAATACAAGATGGTAAGAAGTCTC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCTTTCTAGAGCCTTGGCCAACAAATACAAGATGGTAAGAAGTCTC  535

seq1  AAGAGCTGGTTATAAATTAGCCCTCCAAGGAGTCTATTACTGAAAAAATG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCTGGTTATAAATTAGCCCTCCAAGGAGTCTATTACTGAAAAAATG  585

seq1  CTTTGTATAAGATAGCCTCATTTTCAGTAATGTGTATCTCACGGCTAAAT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTATAAGATAGCCTCATTTTCAGTAATGTGTATCTCACGGCTAAAT  635

seq1  AAACTCACTAACGGTTGAAGGCATGTTACTGTTAAGAATTTAAGTGGAAA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCACTAACGGTTGAAGGCATGTTACTGTTAAGAATTTAAGTGGAAA  685

seq1  AAAAAATGTTTTCCAAGTCAAATGAATAGACAGCTCCTTCACTGTTTGCT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATGTTTTCCAAGTCAAATGAATAGACAGCTCCTTCACTGTTTGCT  735

seq1  GCAGTGAGCTCTGGGCAGACGGATTCACAGCCAGGCCCAGGAATCTGCAG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGAGCTCTGGGCAGACGGATTCACAGCCAGGCCCAGGAATCTGCAG  785

seq1  CTATGTGTCTATCTTGGGTTGTTTTCTGGGCTATGGTTTCCCATTGAATC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTGTCTATCTTGGGTTGTTTTCTGGGCTATGGTTTCCCATTGAATC  835

seq1  CTCCTGTAGTTCACCGAGCAAGAGTCCTACAGGAAGACCAGCCCTGTGAG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGTAGTTCACCGAGCAAGAGTCCTACAGGAAGACCAGCCCTGTGAG  885

seq1  GTGGACAACATAGGTTACCAAATAACAGCCTGTGCTACTGAACAATGTGT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGACAACATAGGTTACCAAATAACAGCCTGTGCTACTGAACAATGTGT  935

seq1  GTCAATGTTGACTTTTATAACTGGAAGAGCATAGGTCTAAAGAAAAGGGC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATGTTGACTTTTATAACTGGAAGAGCATAGGTCTAAAGAAAAGGGC  985

seq1  CTGGTCAATCTGTTGGAAGGTGACCAAGAAAGTGTCTCTCTTTCTTAAAA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCAATCTGTTGGAAGGTGACCAAGAAAGTGTCTCTCTTTCTTAAAA  1035

seq1  TGAATTCAGGGGCAATAGCATTCTTACACACTGTTTCTTGGATCCTAAAC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTCAGGGGCAATAGCATTCTTACACACTGTTTCTTGGATCCTAAAC  1085

seq1  CTGTGTGGTTGAAGAGTAAGAGCTAGGTTTTCCTAGAGTCTTCAAGAAGG  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGGTTGAAGAGTAAGAGCTAGGTTTTCCTAGAGTCTTCAAGAAGG  1135

seq1  TCATTGTCCAAAAATGGTAATAGAATTC  1173
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGTCCAAAAATGGTAATAGAATTC  1163

seq1: chr2_67920141_67921265
seq2: B6Ng01-167L02.g_70_1183

seq1  GAATTCTTCCTTTGCAAAACTACAGTTTTGATGGCGTTTGCTAATGGTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCTTTGCAAAACTACAGTTTTGATGGCGTTTGCTAATGGTCA  50

seq1  TTCTACTGGGCTGATTTTGGACAGTGGAGCTACCCACACCACTTCGATTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTACTGGGCTGATTTTGGACAGTGGAGCTACCCACACCACTTCGATTC  100

seq1  CAGTCCACGATGGCTATGTCCTTCAAAAAGGCATTGTGAAATCCCCTCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCACGATGGCTATGTCCTTCAAAAAGGCATTGTGAAATCCCCTCTT  150

seq1  GCTGGAGTCTTCATTACCATGCAGTACAAAGAACTCTTCCAGGAAATGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAGTCTTCATTACCATGCAGTACAAAGAACTCTTCCAGGAAATGAA  200

seq1  CATAGAACTCATTCCTCCTTACATGATTGCATTAAAAGAGGCTGTTTGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGAACTCATTCCTCCTTACATGATTGCATTAAAAGAGGCTGTTTGAG  250

seq1  TAGGCTCTCCAGCCAACTGGAAAAGAAAAGAGAACCTGCCCCAGGTTACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTCTCCAGCCAACTGGAAAAGAAAAGAGAACCTGCCCCAGGTTACA  300

seq1  AAGTCTTGGCACAATTACATGTGCAACGGTGTCACTCAGGACTTTCAAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTTGGCACAATTACATGTGCAACGGTGTCACTCAGGACTTTCAAGC  350

seq1  TTCTGTCCTTCAGGTATTAGACTCCACCTATGACAAACAAGTGGCTTCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTCCTTCAGGTATTAGACTCCACCTATGACAAACAAGTGGCTTCAC  400

seq1  AGATGCCAACTATTCACTACGAATTCCCCAATGGTTACAGCTGTGGTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCCAACTATTCACTACGAATTCCCCAATGGTTACAGCTGTGGTTTT  450

seq1  GGTGCAAAGAGGCTGAAAATTCCTGAAGGATTATTTGACCCTTCCAACTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCAAAGAGGCTGAAAATTCCTGAAGGATTATTTGACCCTTCCAACTA  500

seq1  AAGGGCTTGTCTGGGAACATGATGCTGGGAGTCAGTCACATGGTCACAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCTTGTCTGGGAACATGATGCTGGGAGTCAGTCACATGGTCACAAC  550

seq1  CAGTGTCGGGATGTGTGACATCAATATCAGACCAAGTCTCTATGGCAGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTCGGGATGTGTGACATCAATATCAGACCAAGTCTCTATGGCAGTG  600

seq1  TGATCATAGCAGGAGGAAACAAGCTAATACAGAGTTTCACTGACAGGATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCATAGCAGGAGGAAACAAGCTAATACAGAGTTTCACTGACAGGATA  650

seq1  AATAGAGACCTTTCTCAGAAAACTTCACCAAGTATGTAGTTGAAACTGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGAGACCTTTCTCAGAAAACTTCACCAAGTATGTAGTTGAAACTGAT  700

seq1  TGCAAAGCGCAGGTTCAGCTCATGGATTAGTGGCTCCCTCCTAGCATCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAGCGCAGGTTCAGCTCATGGATTAGTGGCTCCCTCCTAGCATCTT  750

seq1  TGGATACCTTCCAAACAGGAATATGAAGGAAGAAAGCAGAGTGTAGAAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATACCTTCCAAACAGGAATATGAAGGAAGAAAGCAGAGTGTAGAAAG  800

seq1  AAAATGCCCTTGAGGGCTCTATCCTGCCTACACTTCACCTCACGTCTGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGCCCTTGAGGGCTCTATCCTGCCTACACTTCACCTCACGTCTGTA  850

seq1  GCTTGAGTTCACTCAAGACAATATGACCATCTTTTGTAGAATGTTGGCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAGTTCACTCAAGACAATATGACCATCTTTTGTAGAATGTTGGCAC  900

seq1  ATG-TTTGCATATTTCAATTTCTACTTAAACTTTTTAAGGCTTTAACCAG  949
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ATGTTTTGCATATTTCAATTTCTACTTAAACTTTTTAA-GCTTTAACCAG  949

seq1  CTCTATAAATTAAATGAGTTTGTGCTTTCCTTGGAATGCACTTATCCTTA  999
      |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CTCTAT-AATTAAATGAG-TTGTGCTTTCCTTGG-ATGCACTTATCCTTA  996

seq1  TTAGAGGCATTTTATAATTTTGTATGAATGTCTATTTTTCTCTAAATATT  1049
      ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||| ||
seq2  TTAGAGGCATTTTATAATTGT---TGAATGTCTA-TTTTCTCTAAAT-TT  1041

seq1  TTGCTTTCAGTAAGTACTTTCCAGGTCTCCCGTGGGTTGGTGGGATTACT  1099
      |||| |||||| |||||||| |||||||||||| || | || ||||||||
seq2  TTGC-TTCAGT-AGTACTTT-CAGGTCTCCCGTTGGGTTGT-GGATTACT  1087

seq1  TTTT-ATTGACACTAGTAAAAGTCACT  1125
      |||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATTGACACTAGTAAAAGTCACT  1114