BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-207D15
Chromosome2 (Build37)
Map Location 88,167,924 - 88,342,605
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOlfr1176, Olfr1177, Olfr1178, Olfr1179, Olfr1180, Olfr1181, Olfr1182, Olfr1183, Olfr1184, Olfr1185-ps1
Upstream geneOlfr1119-ps1, Olfr1120, Olfr1121, Olfr1122, LOC668432, Olfr1123, Olfr1125, Olfr1126, Pramel7, Pramel6, LOC668439, Olfr1127-ps1, Olfr253-ps1, Olfr1128, LOC100042038, LOC668445, LOC668447, Olfr1129, Olfr1130, Olfr1131, Olfr1132, LOC100042076, Olfr1133, Olfr1134, Olfr1135, Olfr1136, Olfr1137, Olfr1138, GA_x5J8B7W3Y5M-1033291-1033773, Olfr1140, Olfr1141, Olfr152, Olfr1142-ps1, Olfr1143, GA_x5J8B7W3Y5M-1094074-1093275, Olfr1145, Olfr1146-ps1, Olfr1147-ps1, Olfr1148, Olfr1149-ps1, Olfr1150-ps1, Olfr1151, Olfr1152, Olfr1153, Olfr1154, Olfr1155, Olfr1156, Olfr1157, Olfr74, Olfr1158, Olfr1159-ps1, Olfr1160, Olfr1161, Olfr73, Olfr1162, Olfr1163, Olfr1164, Olfr1165, Olfr1166, Olfr1167, Olfr1168, Olfr1169-ps1, Olfr1170, Olfr1171-ps1, Olfr1172-ps1, Olfr1173, Olfr1174, Olfr1175
Downstream geneOlfr1186, Olfr1187-ps1, Olfr1188, LOC668528, Olfr1189, GA_x5J8B7W4NS2-37772-38277, Olfr475-ps1, Olfr526-ps1, Olfr1192-ps1, Olfr1193, Olfr1194-ps1, Olfr1195, Olfr1196, Olfr1197, Olfr1198, Olfr1199, Olfr1200, Olfr1201, Olfr1202, Olfr1203, Olfr1204, Olfr1206, Olfr1208, Olfr1209, Olfr1211, Olfr1212, Olfr1213, Olfr1214, Olfr1215, Olfr1216, Olfr1217, Olfr1218, Olfr1219, Olfr1220, Olfr1221, Olfr1222, Olfr1223, Olfr1224-ps1, Olfr1225, LOC435676, Olfr1226, LOC100042983, GA_x5J8B7TTH1T-1160-261, Olfr1227-ps1, Olfr1228, Olfr1229, Olfr1230, Olfr1231, Olfr1232, Olfr1233, Olfr1234, Olfr1235-ps1, GA_x5J8B7W62NC-668773-668438, Olfr1237-ps1, Olfr1238, Olfr1239, Olfr1240, Olfr1241, Olfr1242
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-207D15.bB6Ng01-207D15.g
ACCGA026439GA026440
length1,168722
definitionB6Ng01-207D15.b B6Ng01-207D15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(88,341,437 - 88,342,605)(88,167,924 - 88,168,645)
sequence
gaattctttatgatgtagcatgtatgggagaatgggccttttaaagaggt
aagaatgggtctttaatgataacaagacagagtttcttcttgtgaaaagg
ataataattagataagacagggcagatatctttgagaaaacatcaacaag
aataagcagaacataccctccatgacataggcaaagtcagtgagtccatt
tataaaacaacaattcaaatcaggtgtttgtgttgtctacatacatcttc
ctcacatgtctcctttgacattatctgtctttctcattttcagcttctag
agtttgactgaagatagaaagtaaattttaacactttaaaaacatcaaag
ttggaataatttatttttaatatttgtatgtttttctacataataattac
aaaaattattgaataaagcataatgttttagcacatatacaacatgtaat
gaccagaatagggaaaaggacatattcttcattgcacacactcataagaa
cttcttgtactggtaacttttctaccagctattctgaaatacctagttat
ttagagaatttcaagattatcgcactacgctgtatgagaatatcaataga
gggcagatgattaattggtttttattggttgtaatccacattattgtgaa
aaacaattatggcaaaataacttcaataaggaatgtcttatttagtttac
caatttgaagatatggctcattatagcaggtgggtcaggatggtaggtat
cctgtgtacctaatctcaatacttccatatctacatgtcttcttagacag
tgtctgtctttttcatttccagatcctcaatattaggttattatagagtg
taatttttcacactttgagaatatcaaccttttggacactttatttttaa
tatttgtatatattttgtcacataataattacaaaattattgaatctgtg
agaaacatgaaatcttcttcctatataattatgtccagaatactgcagtc
tatagagttgtattagcacacttaaaggtgtgtcttcctacttatcaaca
tatgtataagcatccatcacagggatgcctgtgttgattcttagacatgt
catgtattcagcataacatttgcattggggcattcaaattggagcattga
tatgttggaataaaggct
gaattctcctaaagatatacagatattaagacttaacaaatgtcaaattt
taatgacatgatcctacttctttttaaaattttacttattcaaaaatgta
tttaaatatttgtgtgtatgagtattttatctacatatttatttgtgcac
catatgtatgctggtagccactaggattaaatgagagctagatatgcttt
gatactggaattgcaagtgactgtgaactgccacgtgggcactgggaatt
gaacctgaatcctcaacaggagtgactagtgatcttaaccattaagccac
tcctctagccttcctcccactcttttctgcatgtacatatgtgtgtgatg
ggaatatttgatgcatttcagtattgatgccctcagagaccatagtgaac
tagataaaatatttggtattcaaatataagtgaccaagcactggcatttg
tttaggcttatatcatgtgatgtttggtatttagaatatgagaccaaata
ttgtgctaggaattaaatcagggtaaccaattatgtcagaaatatatgtc
ttcaagacatcagggacataacaactaggaaatatcactgaaaattacca
ggaagacgagagtttgaacaactaggaacaatatcttcccatgtgatacc
ttgactatatgttatatttctaaagccctggtgtattttcttccttcctt
ccttccttccttccttccttcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_88341437_88342605
seq2: B6Ng01-207D15.b_31_1198 (reverse)

seq1  AGCCTCTATTCCAA-ACATACATGCT-CAATTTGAATGCCCCAATGCAAA  48
      ||||| |||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTTATTCCAACATATCAATGCTCCAATTTGAATGCCCCAATGCAAA  50

seq1  TGTTATGCTGAATACCATTGAACATGGTCT-AGAATCACCACAGGCATCC  97
      |||||||||||||| |||   |||| |||| ||||||| |||||||||||
seq2  TGTTATGCTGAATA-CAT--GACAT-GTCTAAGAATCAACACAGGCATCC  96

seq1  CTGTGATGGATGCTATAACATATGTTGATTAAGTAGGAAGACACACC-TT  146
      ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||
seq2  CTGTGATGGATGCTTATACATATGTTGA-TAAGTAGGAAGACACACCTTT  145

seq1  AAGTGTGCTAATACAACTCTATAGACTGCAGTATTCTGGACATAATTATA  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTGCTAATACAACTCTATAGACTGCAGTATTCTGGACATAATTATA  195

seq1  TAGGAAGAAGATTTCATGTTTCTCACAGATTCAATAATTTTGTAATTATT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAGAAGATTTCATGTTTCTCACAGATTCAATAATTTTGTAATTATT  245

seq1  ATGTGACAAAATATATACAAATATTAAAAATAAAGTGTCCAAAAGGTTGA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGACAAAATATATACAAATATTAAAAATAAAGTGTCCAAAAGGTTGA  295

seq1  TATTCTCAAAGTGTGAAAAATTACACTCTATAATAACCTAATATTGAGGA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTCAAAGTGTGAAAAATTACACTCTATAATAACCTAATATTGAGGA  345

seq1  TCTGGAAATGAAAAAGACAGACACTGTCTAAGAAGACATGTAGATATGGA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAAATGAAAAAGACAGACACTGTCTAAGAAGACATGTAGATATGGA  395

seq1  AGTATTGAGATTAGGTACACAGGATACCTACCATCCTGACCCACCTGCTA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTGAGATTAGGTACACAGGATACCTACCATCCTGACCCACCTGCTA  445

seq1  TAATGAGCCATATCTTCAAATTGGTAAACTAAATAAGACATTCCTTATTG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGAGCCATATCTTCAAATTGGTAAACTAAATAAGACATTCCTTATTG  495

seq1  AAGTTATTTTGCCATAATTGTTTTTCACAATAATGTGGATTACAACCAAT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTATTTTGCCATAATTGTTTTTCACAATAATGTGGATTACAACCAAT  545

seq1  AAAAACCAATTAATCATCTGCCCTCTATTGATATTCTCATACAGCGTAGT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACCAATTAATCATCTGCCCTCTATTGATATTCTCATACAGCGTAGT  595

seq1  GCGATAATCTTGAAATTCTCTAAATAACTAGGTATTTCAGAATAGCTGGT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGATAATCTTGAAATTCTCTAAATAACTAGGTATTTCAGAATAGCTGGT  645

seq1  AGAAAAGTTACCAGTACAAGAAGTTCTTATGAGTGTGTGCAATGAAGAAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAGTTACCAGTACAAGAAGTTCTTATGAGTGTGTGCAATGAAGAAT  695

seq1  ATGTCCTTTTCCCTATTCTGGTCATTACATGTTGTATATGTGCTAAAACA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCTTTTCCCTATTCTGGTCATTACATGTTGTATATGTGCTAAAACA  745

seq1  TTATGCTTTATTCAATAATTTTTGTAATTATTATGTAGAAAAACATACAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCTTTATTCAATAATTTTTGTAATTATTATGTAGAAAAACATACAA  795

seq1  ATATTAAAAATAAATTATTCCAACTTTGATGTTTTTAAAGTGTTAAAATT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTAAAAATAAATTATTCCAACTTTGATGTTTTTAAAGTGTTAAAATT  845

seq1  TACTTTCTATCTTCAGTCAAACTCTAGAAGCTGAAAATGAGAAAGACAGA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTCTATCTTCAGTCAAACTCTAGAAGCTGAAAATGAGAAAGACAGA  895

seq1  TAATGTCAAAGGAGACATGTGAGGAAGATGTATGTAGACAACACAAACAC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTCAAAGGAGACATGTGAGGAAGATGTATGTAGACAACACAAACAC  945

seq1  CTGATTTGAATTGTTGTTTTATAAATGGACTCACTGACTTTGCCTATGTC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTTGAATTGTTGTTTTATAAATGGACTCACTGACTTTGCCTATGTC  995

seq1  ATGGAGGGTATGTTCTGCTTATTCTTGTTGATGTTTTCTCAAAGATATCT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGGGTATGTTCTGCTTATTCTTGTTGATGTTTTCTCAAAGATATCT  1045

seq1  GCCCTGTCTTATCTAATTATTATCCTTTTCACAAGAAGAAACTCTGTCTT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGTCTTATCTAATTATTATCCTTTTCACAAGAAGAAACTCTGTCTT  1095

seq1  GTTATCATTAAAGACCCATTCTTACCTCTTTAAAAGGCCCATTCTCCCAT  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATCATTAAAGACCCATTCTTACCTCTTTAAAAGGCCCATTCTCCCAT  1145

seq1  ACATGCTACATCATAAAGAATTC  1169
      |||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCTACATCATAAAGAATTC  1168

seq1: chr2_88167924_88168645
seq2: B6Ng01-207D15.g_62_783

seq1  GAATTCTCCTAAAGATATACAGATATTAAGACTTAACAAATGTCAAATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTAAAGATATACAGATATTAAGACTTAACAAATGTCAAATTT  50

seq1  TAATGACATGATCCTACTTCTTTTTAAAATTTTACTTATTCAAAAATGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGACATGATCCTACTTCTTTTTAAAATTTTACTTATTCAAAAATGTA  100

seq1  TTTAAATATTTGTGTGTATGAGTATTTTATCTACATATTTATTTGTGCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATATTTGTGTGTATGAGTATTTTATCTACATATTTATTTGTGCAC  150

seq1  CATATGTATGCTGGTAGCCACTAGGATTAAATGAGAGCTAGATATGCTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGTATGCTGGTAGCCACTAGGATTAAATGAGAGCTAGATATGCTTT  200

seq1  GATACTGGAATTGCAAGTGACTGTGAACTGCCACGTGGGCACTGGGAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTGGAATTGCAAGTGACTGTGAACTGCCACGTGGGCACTGGGAATT  250

seq1  GAACCTGAATCCTCAACAGGAGTGACTAGTGATCTTAACCATTAAGCCAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTGAATCCTCAACAGGAGTGACTAGTGATCTTAACCATTAAGCCAC  300

seq1  TCCTCTAGCCTTCCTCCCACTCTTTTCTGCATGTACATATGTGTGTGATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTAGCCTTCCTCCCACTCTTTTCTGCATGTACATATGTGTGTGATG  350

seq1  GGAATATTTGATGCATTTCAGTATTGATGCCCTCAGAGACCATAGTGAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATATTTGATGCATTTCAGTATTGATGCCCTCAGAGACCATAGTGAAC  400

seq1  TAGATAAAATATTTGGTATTCAAATATAAGTGACCAAGCACTGGCATTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAAAATATTTGGTATTCAAATATAAGTGACCAAGCACTGGCATTTG  450

seq1  TTTAGGCTTATATCATGTGATGTTTGGTATTTAGAATATGAGACCAAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGCTTATATCATGTGATGTTTGGTATTTAGAATATGAGACCAAATA  500

seq1  TTGTGCTAGGAATTAAATCAGGGTAACCAATTATGTCAGAAATATATGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGCTAGGAATTAAATCAGGGTAACCAATTATGTCAGAAATATATGTC  550

seq1  TTCAAGACATCAGGGACATAACAACTAGGAAATATCACTGAAAATTACCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGACATCAGGGACATAACAACTAGGAAATATCACTGAAAATTACCA  600

seq1  GGAAGACGAGAGTTTGAACAACTAGGAACAATATCTTCCCATGTGATACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGACGAGAGTTTGAACAACTAGGAACAATATCTTCCCATGTGATACC  650

seq1  TTGACTATATGTTATATTTCTAAAGCCCTGGTGTATTTTCTTCCTTCCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTATATGTTATATTTCTAAAGCCCTGGTGTATTTTCTTCCTTCCTT  700

seq1  CCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC  722
      ||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC  722