BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-216G18
Chromosome2 (Build37)
Map Location 166,397,536 - 166,560,518
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBC067047
Upstream geneEya2, Prkcbp1, LOC546780, Ncoa3, Sulf2, LOC670775, Ppia-ps2_2197.1
Downstream geneTrp53rk, Arfgef2, LOC670802, Cse1l, Stau1, LOC383774, Ddx27, AI481105, 1500012F01Rik, LOC668950, Kcnb1, Ptgis, LOC668951, B4galt5, Slc9a8, Spata2, Zfp313, Snai1, Ube2v1, AI840826, Cebpb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-216G18.bB6Ng01-216G18.g
ACCGA033117GA033118
length928965
definitionB6Ng01-216G18.b B6Ng01-216G18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(166,559,886 - 166,560,518)(166,397,536 - 166,398,476)
sequence
gaattccataccctcctctggcctcatagggcactgcacacatgtggcaa
atggcaaatacacagatggatggacacacacacacacacggacacacaca
agacaaaataaaataagcctttattgaaggcaaacaagcaaggcatggtg
gttcgtgtctgaggccacaacccttgagaggctgaagcaggactgccatg
agttcaagccaaacagagtgcccttgaatgtcttgagatacagagggaga
ctgtctttaaattttaaaaaggaagaaaggaaaataaaaccaagtggcta
agagcactgtgccttccagagcagcggttctcaacctgtgggtctcgacc
cctttaccagacctctatctccaaaagtgtttacattacaattcgtaaca
gtagcaaaattgcagtcatgaagtagcaacaaacataattctatggttag
aggtcggcacagcgtgaggaactgtgttaaagggtcacagcactaggaag
gctgagagccgctgctctacaggattcaagttcagttcccagcaccaaac
agcagctcactgctgcctgtaacttcagttctaggagatcagacattctc
ttctggactctacaggcactgaacacattgcacacgcatgcacacacaaa
taaagtaaaaacaaaaccaaaaaacaggaggaggaggagtgcttggtgtt
agaataataatggtcacaattttcatctcacacataaacacatccacata
tatacacatacacacatatacacatacactcatatacacatacatacata
tagatacatacatatacacacatgtacatatacacacatacacacatgca
caatatacatatatataaacatatatgcacataaacacatatatacactc
aatatactcatacatacacccttacatg
gaattcaggaagaaactgtcttggctgtgtgtgaataaaactttatttat
atataaggggtgagccagagttggaggcccagtcttgacagaataagcat
tcatgaagaacaggactgcttcccgggtcccagggcagtgcagggcccac
agaaagtctccatgagcaagtggaattagcagctaatcagacagacgggg
acagacaaaggacaacaactaagttgtaaattgtgtgcctagtaaatgaa
tggaagcttcgttttccaattcgcaaatggtcagaacagacctgagaaga
gagtgcccctctccatggaaacccaggcccatggtctctccctcttggta
ttgcagggaaagcaatgagacaggacttgagagaggctgtgtctgggagc
ctggtctagggatctggtaaaggtgagactgtgggtgtgttggcgggtgc
ggtcagggtgtggctgcaggcagggctgtaggtagctgtagtaggagtgt
cagaccttagctgttttcctgggtctagctgttttccctctggacagcat
tctgtccactgccctctgcacctctctctggaagttctcctcagagcagg
atccagggctaggagtccaaagatcccagaagcaaccctccctgctcagt
ccttctttgcacagggaggaatgggccaaagagactttgagttcatctgt
ctgtgtaatctggtacaggctgtgtgggcctcagcatactcagctgtaca
atgggtcagcagcgggcctcccattgcacactgctgtatgtgctcccaga
gagtgttcaggctttgcccgtggctcctgaaatgatgtgtccactcccct
gtaggtttgccaccccccaccccagaagccctcatcccgccctttaaccc
ccagcccacgggtagcttacctggagcctttcttatagtaactgctgcac
ctttctccagggaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_166559886_166560518
seq2: B6Ng01-216G18.b_33_665 (reverse)

seq1  GTGCAATGTGTTCAGTGCCTGTAGAGTCCAGAAGAGAATGTCTGATCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAATGTGTTCAGTGCCTGTAGAGTCCAGAAGAGAATGTCTGATCTCC  50

seq1  TAGAACTGAAGTTACAGGCAGCAGTGAGCTGCTGTTTGGTGCTGGGAACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACTGAAGTTACAGGCAGCAGTGAGCTGCTGTTTGGTGCTGGGAACT  100

seq1  GAACTTGAATCCTGTAGAGCAGCGGCTCTCAGCCTTCCTAGTGCTGTGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTGAATCCTGTAGAGCAGCGGCTCTCAGCCTTCCTAGTGCTGTGAC  150

seq1  CCTTTAACACAGTTCCTCACGCTGTGCCGACCTCTAACCATAGAATTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAACACAGTTCCTCACGCTGTGCCGACCTCTAACCATAGAATTATG  200

seq1  TTTGTTGCTACTTCATGACTGCAATTTTGCTACTGTTACGAATTGTAATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTGCTACTTCATGACTGCAATTTTGCTACTGTTACGAATTGTAATG  250

seq1  TAAACACTTTTGGAGATAGAGGTCTGGTAAAGGGGTCGAGACCCACAGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACACTTTTGGAGATAGAGGTCTGGTAAAGGGGTCGAGACCCACAGGT  300

seq1  TGAGAACCGCTGCTCTGGAAGGCACAGTGCTCTTAGCCACTTGGTTTTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAACCGCTGCTCTGGAAGGCACAGTGCTCTTAGCCACTTGGTTTTAT  350

seq1  TTTCCTTTCTTCCTTTTTAAAATTTAAAGACAGTCTCCCTCTGTATCTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTTCTTCCTTTTTAAAATTTAAAGACAGTCTCCCTCTGTATCTCA  400

seq1  AGACATTCAAGGGCACTCTGTTTGGCTTGAACTCATGGCAGTCCTGCTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATTCAAGGGCACTCTGTTTGGCTTGAACTCATGGCAGTCCTGCTTC  450

seq1  AGCCTCTCAAGGGTTGTGGCCTCAGACACGAACCACCATGCCTTGCTTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTCAAGGGTTGTGGCCTCAGACACGAACCACCATGCCTTGCTTGT  500

seq1  TTGCCTTCAATAAAGGCTTATTTTATTTTGTCTTGTGTGTGTCCGTGTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTTCAATAAAGGCTTATTTTATTTTGTCTTGTGTGTGTCCGTGTGT  550

seq1  GTGTGTGTGTCCATCCATCTGTGTATTTGCCATTTGCCACATGTGTGCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTCCATCCATCTGTGTATTTGCCATTTGCCACATGTGTGCAG  600

seq1  TGCCCTATGAGGCCAGAGGAGGGTATGGAATTC  633
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTATGAGGCCAGAGGAGGGTATGGAATTC  633

seq1: chr2_166397536_166398476
seq2: B6Ng01-216G18.g_68_1030

seq1  GAATTCAGGAAGAAACTGTCTTGGCTGTGTGTGAATAAAACTTTATTTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGAAGAAACTGTCTTGGCTGTGTGTGAATAAAACTTTATTTAT  50

seq1  ATATAAGGGGTGAGCCAGAGTTGGAGGCCCAGTCTTGACAGAATAAGCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAGGGGTGAGCCAGAGTTGGAGGCCCAGTCTTGACAGAATAAGCAT  100

seq1  TCATGAAGAACAGGACTGCTTCCCGGGTCCCAGGGCAGTGCAGGGCCCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAAGAACAGGACTGCTTCCCGGGTCCCAGGGCAGTGCAGGGCCCAC  150

seq1  AGAAAGTCTCCATGAGCAAGTGGAATTAGCAGCTAATCAGACAGACGGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTCTCCATGAGCAAGTGGAATTAGCAGCTAATCAGACAGACGGGG  200

seq1  ACAGACAAAGGACAACAACTAAGTTGTAAATTGTGTGCCTAGTAAATGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAAAGGACAACAACTAAGTTGTAAATTGTGTGCCTAGTAAATGAA  250

seq1  TGGAAGCTTCGTTTTCCAATTCGCAAATGGTCAGAACAGACCTGAGAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGCTTCGTTTTCCAATTCGCAAATGGTCAGAACAGACCTGAGAAGA  300

seq1  GAGTGCCCCTCTCCATGGAAACCCAGGCCCATGGTCTCTCCCTCTTGGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGCCCCTCTCCATGGAAACCCAGGCCCATGGTCTCTCCCTCTTGGTA  350

seq1  TTGCAGGGAAAGCAATGAGACAGGACTTGAGAGAGGCTGTGTCTGGGAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGGGAAAGCAATGAGACAGGACTTGAGAGAGGCTGTGTCTGGGAGC  400

seq1  CTGGTCTAGGGATCTGGTAAAGGTGAGACTGTGGGTGTGTTGGCGGGTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCTAGGGATCTGGTAAAGGTGAGACTGTGGGTGTGTTGGCGGGTGC  450

seq1  GGTCAGGGTGTGGCTGCAGGCAGGGCTGTAGGTAGCTGTAGTAGGAGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAGGGTGTGGCTGCAGGCAGGGCTGTAGGTAGCTGTAGTAGGAGTGT  500

seq1  CAGACCTTAGCTGTTTTCCTGGGTCTAGCTGTTTTCCCTCTGGACAGCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCTTAGCTGTTTTCCTGGGTCTAGCTGTTTTCCCTCTGGACAGCAT  550

seq1  TCTGTCCACTGCCCTCTGCACCTCTCTCTGGAAGTTCTCCTCAGAGCAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCCACTGCCCTCTGCACCTCTCTCTGGAAGTTCTCCTCAGAGCAGG  600

seq1  ATCCAGGGCTAGGAGTCCAAAGATCCCAGAAGCAACCCTCCCTGCTCAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGGGCTAGGAGTCCAAAGATCCCAGAAGCAACCCTCCCTGCTCAGT  650

seq1  CCTTCTTTGCACAGGGAGGAATGGGCCAAAGAGAC-TTGAGTTCATCTGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CCTTCTTTGCACAGGGAGGAATGGGCCAAAGAGACTTTGAGTTCATCTGT  700

seq1  CTGTGTAATCTGGTACAGGCTGTGTGGGCCTCAGCATACTCAGCTGTACA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTAATCTGGTACAGGCTGTGTGGGCCTCAGCATACTCAGCTGTACA  750

seq1  ATGGGTCAGCAGC-GGCCTCC--ATGCACACTGCTGTATGTGCT-CCAGA  795
      ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||||
seq2  ATGGGTCAGCAGCGGGCCTCCCATTGCACACTGCTGTATGTGCTCCCAGA  800

seq1  GAGTG-TCAGGC-TTGCCCGTGGCT-CTG-AATGATGTGTCCACT-CCCT  840
      ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||
seq2  GAGTGTTCAGGCTTTGCCCGTGGCTCCTGAAATGATGTGTCCACTCCCCT  850

seq1  GTAGG-TTGCCA-CCCCCACCCCAG-AGCCCTCATCCCGCCCTT--ACCC  885
      ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||
seq2  GTAGGTTTGCCACCCCCCACCCCAGAAGCCCTCATCCCGCCCTTTAACCC  900

seq1  CCAGCCCAC-GGTAGC-TACCT-GAG-CTTTC-TATAGT-ACTGCTGCAC  929
      ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||
seq2  CCAGCCCACGGGTAGCTTACCTGGAGCCTTTCTTATAGTAACTGCTGCAC  950

seq1  C-TTCTCCAGGGA  941
      | |||||||||||
seq2  CTTTCTCCAGGGA  963