BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-251N07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 32,826,542 - 32,985,316
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc2a8, Garnl3
Upstream gene2810003C17Rik, Nup214, A130092J06Rik, LOC100040058, Ppapdc3, 5830434P21Rik, Pomt1, Uck1, LOC622534, 2900010J23Rik, Golga2, Dnm1, Ciz1, 1110008P14Rik, Lcn2, Ptges2, LOC100041671, Slc25a25, 4933440H19Rik, C230093N12Rik, Dpm2, Pip5kl1, St6galnac4, St6galnac6, Ak1, Eng, Fpgs, Cdk9, Sh2d3c, Tor2a, Ttc16, Ptrh1, 1700019L03Rik, Stxbp1, 9130404D14Rik, Lrsam1, Snora65
Downstream geneRalgps1, Angptl2, Zbtb34, Zbtb43, LOC676764, Lmx1b, LOC100041918, 2610528K11Rik, LOC100041931
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-251N07.bB6Ng01-251N07.g
ACCGA058987GA058988
length8291,074
definitionB6Ng01-251N07.b B6Ng01-251N07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,826,542 - 32,827,367)(32,984,248 - 32,985,316)
sequence
gaattcttccttgcggaagaccagaattcttttccagcccctaaatcagg
gcagcttacaaccgcctgtaccgctagaggagcaactgcttctggactcc
gtgggtatctataattcccctccaacccccctctctctctctctctctct
cacacacacacacacacacacacacacacacacacacttaaatcctaaaa
aaaaaaaaaaaggtggagagcaattgggggatacactatatcaacatctg
gtgtccacacacatgcacccacacatacaaatgtatgcattatccccccc
cacacacaaaagtaaaaagcagaaaataaaaatggcagccaatggctggg
ggacacagcgtggtgccgggagtgtttggctagttagcacacgctgggct
ctgagcccagttgccagtgatgggaagaaaaacacagcaggagaccaagc
acatgggagtggcagtaagagaacgcctttcccggctttgcggacagtca
tctccctcacacctggactgagacaccgctacaatcctgaccggtgattg
ttctgtgaagatttcagcaaatttatttatttatttatttatttatttat
ttaatatgcgtacgctgtagctgtcttcagacactcggtttcagcaaatt
aattaattaattagttaattaattattatatgtgcatacgctgtagctgt
cttcagacactccagaagagggcatcagatttttgttacggatggttgtg
agctaccatgtggttgctgggatttgaactcaggcccttcgggaagagca
gttgggtgctcttaaccggctgagctatc
gaattccttgtaacttgaaatgggtcctgcttccaggtggactcattcct
ttcagaatgactccagcaccaccatctgggccagattttcatcagtattc
tgtaataatggccttagggagggtatcctgaagccaacccccttcctcct
agcctactgctgcctgcacccctgagtttttaattgccatagcatgggta
gggacgaggaagagaaaaaagatgtaggactctaacctccactgaggtgg
aaaagagagttcatttgctaaggcacaaagcaaaccagccaagatcctta
aaggaaggtgtgatgcccttaattggcctttctcagactcagtccttgac
acactgctccagcagttctgatgctgtgtggtaaggacagatatcaaggc
tgctctagccgctgccctagcctcttccccatcaccacagctgcctcaag
cctggcccatcacagagcctgaagggcttgggcactcctccctcaggctg
tagaactgctcatcaattctttttgaaagtctttcttgaactctaggctt
agctttgtgtgatcagcacctgggcatctgccaagaaggttctaaatatt
tgtgtggtgacctgagtggaacatttcccttccataggagacccaggcag
ctaacaatctctatggcttgagcatgaagaataggaagaggtataccaag
agactggagcaaagagaatctctcaggtctgaggcagcctgcttaggaca
gtgctgctacagaacttccggacatgaaggaatggttctgtaatgcagcc
catgcagtccgggagccacagacacctgtggctgtggaacacctcgccaa
gacacctgagtgttgagttgtgcttagccttcaatgcaagtaaccacatt
gatcccagcactaccccctcagccagcattaattagcttttcttcaggct
cagtccttgacacatctgctccagcaattctgataggagcccttaggaga
ctggagaaatgcgtacccatagtggaacagtgctggcataaaaatagact
ttcctttccccttgtcttcatgac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_32826542_32827367
seq2: B6Ng01-251N07.b_50_878

seq1  GAATTCTTCCTTGCGGAAGACCAGAATTCTTTTCCAGCCCCTAAATCAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCTTGCGGAAGACCAGAATTCTTTTCCAGCCCCTAAATCAGG  50

seq1  GCAGCTTACAACCGCCTGTACCGCTAGAGGAGCAACTGCTTCTGGACTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTTACAACCGCCTGTACCGCTAGAGGAGCAACTGCTTCTGGACTCC  100

seq1  GTGGGTATCTATAATTCCCCTCCAACCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTATCTATAATTCCCCTCCAACCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  150

seq1  CACACACACACACACACACACACACACACACACACACTTAAATCCTAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACACACACACACTTAAATCCTAAAA  200

seq1  AAAAAAAAAAAGGTGGAGAGCAATTGGGGGATACACTATATCAACATCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAGGTGGAGAGCAATTGGGGGATACACTATATCAACATCTG  250

seq1  GTGTCCACACACATGCACCCACACATACAAATGTATGCATTATCCCCCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCACACACATGCACCCACACATACAAATGTATGCATTATCCCCCCC  300

seq1  CACACACAAAAGTAAAAAGCAGAAAATAAAAATGGCAGCCAATGGCTGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACAAAAGTAAAAAGCAGAAAATAAAAATGGCAGCCAATGGCTGGG  350

seq1  GGACACAGCGTGGTGCCGGGAGTGTTTGGCTAGTTAGCACACGCTGGGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACAGCGTGGTGCCGGGAGTGTTTGGCTAGTTAGCACACGCTGGGCT  400

seq1  CTGAGCCCAGTTGCCAGTGATGGGAAGAAAAACACAGCAGGAGACCAAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCCCAGTTGCCAGTGATGGGAAGAAAAACACAGCAGGAGACCAAGC  450

seq1  ACATGGGAGTGGCAGTAAGAGAACGCCTTTCCCGGCTTTGCGGACAGTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGGAGTGGCAGTAAGAGAACGCCTTTCCCGGCTTTGCGGACAGTCA  500

seq1  TCTCCCTCACACCTGGACTGAGACACCGCTACAATCCTGACCGGTGATTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCTCACACCTGGACTGAGACACCGCTACAATCCTGACCGGTGATTG  550

seq1  TTCTGTGAAGATTTCAGCAAATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTGAAGATTTCAGCAAATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT  600

seq1  TTAATATGCGTACGCTGTAGCTGTCTTCAGACACTCGGTTTCAGCAAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATGCGTACGCTGTAGCTGTCTTCAGACACTCGGTTTCAGCAAATT  650

seq1  AATTAATTAATTAGTTAATTAATTATTATATGTGCATACGCTGTAGCTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAATTAATTAGTTAATTAATTATTATATGTGCATACGCTGTAGCTGT  700

seq1  CTTCAGACACTCCAGAAGAGGGCATCAGATTTTTGTTACGGATGGTTGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGACACTCCAGAAGAGGGCATCAGATTTTTGTTACGGATGGTTGTG  750

seq1  AGCTACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGCCCTT-TGGAAGAGCA  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
seq2  AGCTACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGCCCTTCGGGAAGAGCA  800

seq1  GTT-GGTGCTCTTAACC-GCTGAGCTATC  826
      ||| ||||||||||||| |||||||||||
seq2  GTTGGGTGCTCTTAACCGGCTGAGCTATC  829

seq1: chr2_32984248_32985316
seq2: B6Ng01-251N07.g_66_1139 (reverse)

seq1  GTCATGAAGACAAAGGGGAAGG-AAGTCTAATTTTTATGCCAGCACTG-T  48
      ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |
seq2  GTCATGAAGACAAGGGGAAAGGAAAGTCT-ATTTTTATGCCAGCACTGTT  49

seq1  CCACTAT-GGTACGCATTTCT-CAGTCCTCCTAA-GGCTCTTATCAGAAT  95
      ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||
seq2  CCACTATGGGTACGCATTTCTCCAGT-CTCCTAAGGGCTCCTATCAGAAT  98

seq1  TGCTGGAGCAGATGTGTCAAGGACTGAGCCTGA--GAAAGCTAATTAATG  143
      |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||
seq2  TGCTGGAGCAGATGTGTCAAGGACTGAGCCTGAAGAAAAGCTAATTAATG  148

seq1  CTGGCTGAGGGGGTAGTGCTGGGATCAATGTGGTTACTTGCATTGAAGGC  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGAGGGGGTAGTGCTGGGATCAATGTGGTTACTTGCATTGAAGGC  198

seq1  TAAGCACAACTCAACACTCAGGTGTCTTGGCGAGGTGTTCCACAGCCACA  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCACAACTCAACACTCAGGTGTCTTGGCGAGGTGTTCCACAGCCACA  248

seq1  GGTGTCTGTGGCTCCCGGACTGCATGGGCTGCATTACAGAACCATTCCTT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCTGTGGCTCCCGGACTGCATGGGCTGCATTACAGAACCATTCCTT  298

seq1  CATGTCCGGAAGTTCTGTAGCAGCACTGTCCTAAGCAGGCTGCCTCAGAC  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCCGGAAGTTCTGTAGCAGCACTGTCCTAAGCAGGCTGCCTCAGAC  348

seq1  CTGAGAGATTCTCTTTGCTCCAGTCTCTTGGTATACCTCTTCCTATTCTT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGAGATTCTCTTTGCTCCAGTCTCTTGGTATACCTCTTCCTATTCTT  398

seq1  CATGCTCAAGCCATAGAGATTGTTAGCTGCCTGGGTCTCCTATGGAAGGG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTCAAGCCATAGAGATTGTTAGCTGCCTGGGTCTCCTATGGAAGGG  448

seq1  AAATGTTCCACTCAGGTCACCACACAAATATTTAGAACCTTCTTGGCAGA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTTCCACTCAGGTCACCACACAAATATTTAGAACCTTCTTGGCAGA  498

seq1  TGCCCAGGTGCTGATCACACAAAGCTAAGCCTAGAGTTCAAGAAAGACTT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGGTGCTGATCACACAAAGCTAAGCCTAGAGTTCAAGAAAGACTT  548

seq1  TCAAAAAGAATTGATGAGCAGTTCTACAGCCTGAGGGAGGAGTGCCCAAG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAAGAATTGATGAGCAGTTCTACAGCCTGAGGGAGGAGTGCCCAAG  598

seq1  CCCTTCAGGCTCTGTGATGGGCCAGGCTTGAGGCAGCTGTGGTGATGGGG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCAGGCTCTGTGATGGGCCAGGCTTGAGGCAGCTGTGGTGATGGGG  648

seq1  AAGAGGCTAGGGCAGCGGCTAGAGCAGCCTTGATATCTGTCCTTACCACA  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGCTAGGGCAGCGGCTAGAGCAGCCTTGATATCTGTCCTTACCACA  698

seq1  CAGCATCAGAACTGCTGGAGCAGTGTGTCAAGGACTGAGTCTGAGAAAGG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATCAGAACTGCTGGAGCAGTGTGTCAAGGACTGAGTCTGAGAAAGG  748

seq1  CCAATTAAGGGCATCACACCTTCCTTTAAGGATCTTGGCTGGTTTGCTTT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTAAGGGCATCACACCTTCCTTTAAGGATCTTGGCTGGTTTGCTTT  798

seq1  GTGCCTTAGCAAATGAACTCTCTTTTCCACCTCAGTGGAGGTTAGAGTCC  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTTAGCAAATGAACTCTCTTTTCCACCTCAGTGGAGGTTAGAGTCC  848

seq1  TACATCTTTTTTCTCTTCCTCGTCCCTACCCATGCTATGGCAATTAAAAA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCTTTTTTCTCTTCCTCGTCCCTACCCATGCTATGGCAATTAAAAA  898

seq1  CTCAGGGGTGCAGGCAGCAGTAGGCTAGGAGGAAGGGGGTTGGCTTCAGG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGGGTGCAGGCAGCAGTAGGCTAGGAGGAAGGGGGTTGGCTTCAGG  948

seq1  ATACCCTCCCTAAGGCCATTATTACAGAATACTGATGAAAATCTGGCCCA  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCTCCCTAAGGCCATTATTACAGAATACTGATGAAAATCTGGCCCA  998

seq1  GATGGTGGTGCTGGAGTCATTCTGAAAGGAATGAGTCCACCTGGAAGCAG  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTGGTGCTGGAGTCATTCTGAAAGGAATGAGTCCACCTGGAAGCAG  1048

seq1  GACCCATTTCAAGTTACAAGGAATTC  1069
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCATTTCAAGTTACAAGGAATTC  1074