BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-265O02
Chromosome2 (Build37)
Map Location 82,057,823 - 82,230,008
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp804a, LOC100041308, A130030D18Rik
Upstream geneLOC100040704
Downstream geneEG624362, LOC433550, LOC269292, LOC433440, Fsip2, LOC545429
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-265O02.bB6Ng01-265O02.g
ACCGA069415GA069416
length1,1731,162
definitionB6Ng01-265O02.b B6Ng01-265O02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,057,823 - 82,059,036)(82,228,845 - 82,230,008)
sequence
gaattctcagggtaggatcaatttggcaaacaaacttagatattaactct
ttcaacttcataattttatctgaagtgatagcttatggttactcacttga
aggtcaggtcatttaaatgttaattgagaactgataaataaaaaaaatat
ttgaaaatgtaaagatatctcaaaattctccaactttcatactgtagttt
ttataaactcttatttattgatattaaatatattattctataaaggtata
tgatttggcattatgaattcttgacatagagtattagctgcaactctcta
ttttttttttttttttaggtacgtatttaattctaggcactctttctcct
ttagtccagctaaagttattctgagctatgatctttgttgaaaggcaggt
caatctattcttggctcttccgttttgtgaaacagctgtgagtcagcact
gagttatgctattgaaaatgaaatagacttttcagctgtgtgctaatatt
tgatttgaggaatatacttaatttaaaataaaatttccaagtctgagaga
gtgctactttacatagaactccagttttttatgaatatttttgtaatatg
aacacaatcattttcttcttttatatatgtcattttacctaaatgcactg
aagtagactgaagctgtaagaataatgatacacaactgcttattggcatg
tatagatgcagcaaaaatccattccctggaagtatgtagatatgtacgtt
gatggccataacattatttctagatcaatgtctgtggataaaacttgtgg
tttaaattaagtttagagttttatttctattttatatcatgacttactca
gtgcaagcagaattgcaaagcttgattgttggttaacacaaaaactataa
gactgtatgtgaatactataaacatcatggtaagcaattatcacatgacc
agcacatatcattttaatcatcttagcagatgccaccttattttttgatt
tttatttcactattttttttgttttgctttatctatatttgctcttttaa
tttttgtttaaattaaaatagtacattagtatccagatcatgcttctcga
accttcatgcccatctggcatccgtcaattttctatgtccatagatttac
gtaactgcaccacagatgtgtgt
gaattctctaatttagaccttttttttctccacatttttatctactctca
ctcctttagaaatatcatccagtggcttagtgttaaatgccatctatatg
tgatcatgcccaatttaaatgtccctcccaaacttcgcctggtataatca
gaagactagctgacttgcctttgaatgattgcttcactgtttaaggctgc
actttaatcttctcactgaaaaacactattttatttttaaagtttagctc
ctgcacttgcctcttatgtctacttaactaatgtcttcattttcttcttc
tttgtccaaattgcctaagtctcaacttaatcatggattctagcctgact
actttgtaagtgtagcaatctgtcacatgtatcccttataagcttcctac
tcaaaactgttcatgtcattaagattacatttgttttagatacctatagc
ccttatatcaacaatactatatttagaaaatttccctaaatttggcctat
gagtatgataaacttcttaatttgaggtaaataatttctctatattactg
tgtttattccatttagtggacagacatatcaaaggaattgagagaattta
tgcatataatttgaggattatttatataggaatatgtgataagtctctct
ctcctgtatgtgtgtatctaccattaagtaaatgtgcagagtcagtatag
ttacaacatttcctaaataacactaagttcaatttgcatctttacatttg
atattagcttaatggccaaagaatggtgaattggcatctttaatcaagat
aaagttactaatatctgtcctctcttgcttttttgtgtttctaaagggat
aaagtagatgtgtatataataagctaatatagtgaatgtggagagggaac
tatgaggaagaacttagtgtctagaacagatatgaaaatgagatgaagga
aagagaatttagaagtaaactaaaacacctcctcattgttaagatctgag
aatatccacgtgtataattcactcaattatcatatccacactacaaagtt
ctttgggtgtaagaaagagtcaggttctttcttgggggtgcttcacccta
atcattaaattatttaggattggctataaagcaaattgaacgccatattt
attaaagttgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_82057823_82059036
seq2: B6Ng01-265O02.b_47_1219

seq1  GAATTCTCAGGGTAGGATCAATTTGGCAAACAAACTTAGATATTAACTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGGGTAGGATCAATTTGGCAAACAAACTTAGATATTAACTCT  50

seq1  TTCAACTTCATAATTTTATCTGAAGTGATAGCTTATGGTTACTCACTTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTTCATAATTTTATCTGAAGTGATAGCTTATGGTTACTCACTTGA  100

seq1  AGGTCAGGTCATTTAAATGTTAATTGAGAACTGATAAATAAAAAAAATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAGGTCATTTAAATGTTAATTGAGAACTGATAAATAAAAAAAATAT  150

seq1  TTGAAAATGTAAAGATATCTCAAAATTCTCCAACTTTCATACTGTAGTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAATGTAAAGATATCTCAAAATTCTCCAACTTTCATACTGTAGTTT  200

seq1  TTATAAACTCTTATTTATTGATATTAAATATATTATTCTATAAAGGTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAACTCTTATTTATTGATATTAAATATATTATTCTATAAAGGTATA  250

seq1  TGATTTGGCATTATGAATTCTTGACATAGAGTATTAGCTGCAACTCTCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTGGCATTATGAATTCTTGACATAGAGTATTAGCTGCAACTCTCTA  300

seq1  TTTTTTTTTTTTTTTTAGGTACGTATTTAATTCTAGGCACTCTTTCTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTTTTTTTAGGTACGTATTTAATTCTAGGCACTCTTTCTCCT  350

seq1  TTAGTCCAGCTAAAGTTATTCTGAGCTATGATCTTTGTTGAAAGGCAGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCCAGCTAAAGTTATTCTGAGCTATGATCTTTGTTGAAAGGCAGGT  400

seq1  CAATCTATTCTTGGCTCTTCCGTTTTGTGAAACAGCTGTGAGTCAGCACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTATTCTTGGCTCTTCCGTTTTGTGAAACAGCTGTGAGTCAGCACT  450

seq1  GAGTTATGCTATTGAAAATGAAATAGACTTTTCAGCTGTGTGCTAATATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTATGCTATTGAAAATGAAATAGACTTTTCAGCTGTGTGCTAATATT  500

seq1  TGATTTGAGGAATATACTTAATTTAAAATAAAATTTCCAAGTCTGAGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTGAGGAATATACTTAATTTAAAATAAAATTTCCAAGTCTGAGAGA  550

seq1  GTGCTACTTTACATAGAACTCCAGTTTTTTATGAATATTTTTGTAATATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTACTTTACATAGAACTCCAGTTTTTTATGAATATTTTTGTAATATG  600

seq1  AACACAATCATTTTCTTCTTTTATATATGTCATTTTACCTAAATGCACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAATCATTTTCTTCTTTTATATATGTCATTTTACCTAAATGCACTG  650

seq1  AAGTAGACTGAAGCTGTAAGAATAATGATACACAACTGCTTATTGGCATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGACTGAAGCTGTAAGAATAATGATACACAACTGCTTATTGGCATG  700

seq1  TATAGATGCAGCAAAAATCCATTCCCTGGAAGTATGTAGATATGTACGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGATGCAGCAAAAATCCATTCCCTGGAAGTATGTAGATATGTACGTT  750

seq1  GATGGCCATAACATTATTTCTAGATCAATGTCTGTGGATAAAACTTGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCCATAACATTATTTCTAGATCAATGTCTGTGGATAAAACTTGTGG  800

seq1  TTTAAATTAAGTTTAGAGTTTTATTTCTATTTTATATCATGACTTACTCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATTAAGTTTAGAGTTTTATTTCTATTTTATATCATGACTTACTCA  850

seq1  GTGCAAGCAGAATTGCAAAGCTTGATTGTTGGTTAACACAAAAACTATAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAAGCAGAATTGCAAAGCTTGATTGTTGGTTAACACAAAAACTATAA  900

seq1  GACTGTATGTGAATACTATAAACATCATGGTAAGCAATTATCACATGACC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTATGTGAATACTATAAACATCATGGTAAGCAATTATCACATGACC  950

seq1  AGCACATATCATTTTAATCATCTTAGCAGATGCCACCTTATTTTTTGAAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGCACATATCATTTTAATCATCTTAGCAGATGCCACCTTATTTTTTG-AT  999

seq1  TTTTATTTCACTTAATTTTTTTTGTTTTTGCTTTATCCTAATATTTGCTC  1050
      ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||
seq2  TTTTATTTCACT--ATTTTTTTTG-TTTTGCTTTATC--TATATTTGCTC  1044

seq1  TTTTTAAATTTTTGTTTTAAATTTTAAAATAGGTACATTAGTATCCCAGA  1100
      ||||  ||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| |||||
seq2  TTTT--AATTTTTGTTTAAA---TTAAAATA-GTACATTAGTAT-CCAGA  1087

seq1  TCAATGCCTTCTTCCAGACCCTTCCATGGCCCCATCTTGCCAAATTCGTG  1150
      |||     | ||||  || |||| ||||  ||||||| ||   || |  |
seq2  TCA-----TGCTTCTCGAACCTT-CATG--CCCATCTGGC---ATCC--G  1124

seq1  TCCATTTTTTCTTTAATTGTTACAATTATGAATATACGTAAACATGCAAC  1200
      || ||||| | | |             ||  || |||||||   ||||  
seq2  TCAATTTTCTATGT-----------CCATAGATTTACGTAA--CTGCA--  1159

seq1  ACACAGATGTGTGT  1214
       |||||||||||||
seq2  CCACAGATGTGTGT  1173

seq1: chr2_82228845_82230008
seq2: B6Ng01-265O02.g_65_1226 (reverse)

seq1  TTCAACTTTAAT-AATATGGCCTTTCATTTTCCTTTTATA-CCATCCCTA  48
      |||||||||||| |||||||| ||  |||| |  |||||| |||  ||||
seq2  TTCAACTTTAATAAATATGGCGTTCAATTTGC--TTTATAGCCAATCCTA  48

seq1  AATAATTTTATTGATAAGATTG-AGCA-CCCCAAGAAAGACCCTGATTTC  96
      ||||| |||| |||| ||  || |||| |||||||||||| |||||  ||
seq2  AATAA-TTTAATGATTAGGGTGAAGCACCCCCAAGAAAGAACCTGA-CTC  96

seq1  TTTCTTAACACCAAAGACTTTTGTAGTTGTTGGATATGATAATTTGAGTG  146
      |||||||   |||||||  ||||||||   |||||||||||| |||||||
seq2  TTTCTTACACCCAAAGAACTTTGTAGT--GTGGATATGATAA-TTGAGTG  143

seq1  AATTATACACGTGGATATTCTCAGATCTTAACAATGAGGA-GTGTTTTAG  195
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AATTATACACGTGGATATTCTCAGATCTTAACAATGAGGAGGTGTTTTAG  193

seq1  TTTACTTCTAAATTCTCTTTCCTTCATCTCATTTTCATATCTGTTCTAGA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTCTAAATTCTCTTTCCTTCATCTCATTTTCATATCTGTTCTAGA  243

seq1  CACTAAGTTCTTCCTCATAGTTCCCTCTCCACATTCACTATATTAGCTTA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAAGTTCTTCCTCATAGTTCCCTCTCCACATTCACTATATTAGCTTA  293

seq1  TTATATACACATCTACTTTATCCCCTTAGAAACACAAAAAAGCAAGAGAG  345
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATACACATCTACTTTATCCCTTTAGAAACACAAAAAAGCAAGAGAG  343

seq1  GACAGATATTAGTAACTTTATCTTGATTAAAGATGCCAATTCACCATTCT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGATATTAGTAACTTTATCTTGATTAAAGATGCCAATTCACCATTCT  393

seq1  TTGGCCATTAAGCTAATATCAAATGTAAAGATGCAAATTGAACTTAGTGT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCCATTAAGCTAATATCAAATGTAAAGATGCAAATTGAACTTAGTGT  443

seq1  TATTTAGGAAATGTTGTAACTATACTGACTCTGCACATTTACTTAATGGT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAGGAAATGTTGTAACTATACTGACTCTGCACATTTACTTAATGGT  493

seq1  AGATACACACATACAGGAGAGAGAGACTTATCACATATTCCTATATAAAT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATACACACATACAGGAGAGAGAGACTTATCACATATTCCTATATAAAT  543

seq1  AATCCTCAAATTATATGCATAAATTCTCTCAATTCCTTTGATATGTCTGT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTCAAATTATATGCATAAATTCTCTCAATTCCTTTGATATGTCTGT  593

seq1  CCACTAAATGGAATAAACACAGTAATATAGAGAAATTATTTACCTCAAAT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTAAATGGAATAAACACAGTAATATAGAGAAATTATTTACCTCAAAT  643

seq1  TAAGAAGTTTATCATACTCATAGGCCAAATTTAGGGAAATTTTCTAAATA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAGTTTATCATACTCATAGGCCAAATTTAGGGAAATTTTCTAAATA  693

seq1  TAGTATTGTTGATATAAGGGCTATAGGTATCTAAAACAAATGTAATCTTA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTATTGTTGATATAAGGGCTATAGGTATCTAAAACAAATGTAATCTTA  743

seq1  ATGACATGAACAGTTTTGAGTAGGAAGCTTATAAGGGATACATGTGACAG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACATGAACAGTTTTGAGTAGGAAGCTTATAAGGGATACATGTGACAG  793

seq1  ATTGCTACACTTACAAAGTAGTCAGGCTAGAATCCATGATTAAGTTGAGA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTACACTTACAAAGTAGTCAGGCTAGAATCCATGATTAAGTTGAGA  843

seq1  CTTAGGCAATTTGGACAAAGAAGAAGAAAATGAAGACATTAGTTAAGTAG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGCAATTTGGACAAAGAAGAAGAAAATGAAGACATTAGTTAAGTAG  893

seq1  ACATAAGAGGCAAGTGCAGGAGCTAAACTTTAAAAATAAAATAGTGTTTT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAGAGGCAAGTGCAGGAGCTAAACTTTAAAAATAAAATAGTGTTTT  943

seq1  TCAGTGAGAAGATTAAAGTGCAGCCTTAAACAGTGAAGCAATCATTCAAA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGAGAAGATTAAAGTGCAGCCTTAAACAGTGAAGCAATCATTCAAA  993

seq1  GGCAAGTCAGCTAGTCTTCTGATTATACCAGGCGAAGTTTGGGAGGGACA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGTCAGCTAGTCTTCTGATTATACCAGGCGAAGTTTGGGAGGGACA  1043

seq1  TTTAAATTGGGCATGATCACATATAGATGGCATTTAACACTAAGCCACTG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATTGGGCATGATCACATATAGATGGCATTTAACACTAAGCCACTG  1093

seq1  GATGATATTTCTAAAGGAGTGAGAGTAGATAAAAATGTGGAGAAAAAAAA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATATTTCTAAAGGAGTGAGAGTAGATAAAAATGTGGAGAAAAAAAA  1143

seq1  GGTCTAAATTAGAGAATTC  1164
      |||||||||||||||||||
seq2  GGTCTAAATTAGAGAATTC  1162