BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-283G18
Chromosome2 (Build37)
Map Location 31,431,573 - 31,522,842
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFubp3, LOC100041465, Prdm12
Upstream geneCstad, EG665645, 1700001O22Rik, 2610205E22Rik, Asb6, Prrx2, Ptges, Ppia-ps2_387.1, Tor1b, Tor1a, BC005624, Usp20, Fnbp1, Gpr107, Freq, LOC622345, LOC670182, LOC665700, BC034076, Ass1
Downstream geneExosc2, Abl1, BC094274, Fibcd1, Lamc3, 2810003C17Rik, Nup214, A130092J06Rik, LOC100040058, Ppapdc3, 5830434P21Rik, Pomt1, Uck1, LOC622534, 2900010J23Rik, Golga2, Dnm1, Ciz1, 1110008P14Rik, Lcn2, Ptges2, LOC100041671, Slc25a25, 4933440H19Rik, C230093N12Rik, Dpm2, Pip5kl1, St6galnac4, St6galnac6, Ak1, Eng
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-283G18.bB6Ng01-283G18.g
ACCGA082386GA082387
length1,1201,043
definitionB6Ng01-283G18.b B6Ng01-283G18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,521,714 - 31,522,842)(31,431,573 - 31,432,620)
sequence
gaattcacatagcagcagcagccagcctcatttcatctaacaccaatttt
tcctcagaatcctcaccattaaccaaacatcttccaggtgctctctggcc
ctatcctgagtgcttactgctcccctgtgctgagtgctcactgctcctgt
gctgagtagtgcttactgctcttgtgctgagtgctcactgctcctgtgct
gagtggtgcttactgctctttttttttttttttaagatttacttattatt
attcattagtacactgtagctgtcttcagacacaccagaagagggcatca
gatctcattacggatggttgtgagccaccatgtggtttctgggatttgaa
ctcaggaccttcggaagagcagtcagtgctcttaaccgattgagccatct
cgccagcccctactgctcttgtgctgagtgctcactgctcctgtgctgag
tggtgcttactggtcttgtgctgagtgctcactgctcctgtgctgagtgc
tctctggttctgtgctgagttttccacaagcacgttacttacttgtaaca
gcccatctaggaagaggtcagactgtttccaattactgcctgaggccact
tggtcccccaaacaaacctagaactgtgactagaactcagatttttaccc
agctgctctctctgctccacacttattctttcagcagcaagcagtggaag
aggcacctagaaacagctgcacatctgggattggggcttattaagcatat
ggacttaagctgaagctttgcttcttcttcttcttcttcttcttcttctt
cttcttcttcttcttcttctcttcttcttctcttctttttgcttattttg
catttgataacttgtatttgtgtgtgcttacatacacccaggaccacctg
caagagcaagttcccctccaccgcaggctcctggggatcaagtcaggtgt
gagccaccaagccagcagccctccaccacctcatcagcaagagagtcaga
ggtctgtagttcatggaaatcatgtctgcctctattcgtgtgctttgtta
agttatgcttggaatggtggcgcaatgtgtggtgcagtcatatgtataga
gtcgaggtcagccattaggt
gaattcttaaatacaaagggaatctctgaagatccatataaaacttaaaa
atatttctagagtgggggcccagtggattattgtgtgtcaggaatgaaga
attcacagctgttctgaagggcagtggagataggatctgatttgggacta
ctgataaagtctaagacgctagatagagctctggctgcttagcaaatcaa
gtgttcctttaacttgtttaagagaagactgggtgctgactttcagctca
tcttgttccagaatcatattctgcatctgtgccctgagtgggctacaagc
gggaccagtggacacaagtctgttttactttgaatagtttctgaggatga
ttaaaaatgttcctggcctgagagtgcttgcctactgtgcatggtttata
ggattgggttcagcccccagagccatataaactaagcctggtggcacata
tctatgcaatcccaggacttgagaggtcgaggcgggatgatcaggaagtt
ccaggttgtcctcagccacatagcaagcatagcgagtgaggccagactgg
gatgcctgagaacctgtccaaaaggtaaaaacgttcccagaacagaacag
tgttggccatccgatgaagacggactcgttaatgggttgtgggccatcac
agtgttacagctgccaacagcttcccactagctttcctgaggataggtta
ttttgctaaagtcaatgcttgttaggactttaagctcctgtttgttgtgg
aggtggttttactgaggcagggttctgctgtgtagttcttctgctggcct
caaactcatgctcctcctgccttagtttcctaagaactggaattataggc
ctgcaacagcaacttagctaagtgttttatcttagaccctgttaaaggcc
ctatgcattagccaactcctttagtatgtctttacacagagtgcagtata
aatgcactcttcatggagttgggcaccttgccttggacccaaataaaatg
acagttttatagaatcgagagggctagcagatagctcatggat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_31521714_31522842
seq2: B6Ng01-283G18.b_44_1163 (reverse)

seq1  ACCTAAT-GCTGACCTCTGACCTCTATACATATGAACCTGCA-CACACA-  47
      ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||| 
seq2  ACCTAATGGCTGACCTC-GA-CTCTATACATATGA--CTGCACCACACAT  46

seq1  TGCG-CAC--ATCCAAGCATAAACTAAACAAAAGCACACGAAATAGA-GC  93
      |||| |||   ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||
seq2  TGCGCCACCATTCCAAGCAT-AACTTAAC-AAAGCACACG-AATAGAGGC  93

seq1  AGACATGATTTTCCATTGAAACTACAGACTTCTGAACTTCTCTTTTGCTG  143
      |||||||| |||||||   |||||||||| |||||    |||| ||||||
seq2  AGACATGA-TTTCCAT--GAACTACAGACCTCTGA----CTCTCTTGCTG  136

seq1  ATGAGGTGGTG--AGGCTGCTGGCTTGGTGGCTCACAACCTGACTTTGAT  191
      |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
seq2  ATGAGGTGGTGGAGGGCTGCTGGCTTGGTGGCTCAC-ACCTGAC-TTGAT  184

seq1  -CCCAGGAGCCTGCGGTGGAGGGGAACTTGCTCTTGCAGGTGGTCCTGGG  240
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGGAGCCTGCGGTGGAGGGGAACTTGCTCTTGCAGGTGGTCCTGGG  234

seq1  TGTATGTAAGCACACACAAATACAAGTTATCAAATGCAAAATAAGCAAAA  290
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGTATGTAAGCACACACAAATACAAGTTATCAAATGCAAAATAAGC-AAA  283

seq1  AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA  340
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAG-AGAAGAAGAAG-AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA  331

seq1  GAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAAAGCTTCAGCTTAAGTCCATATGCTTAAT  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAAAGCTTCAGCTTAAGTCCATATGCTTAAT  381

seq1  AAGCCCCAATCCCAGATGTGCAGCTGTTTCTAGGTGCCTCTTCCACTGCT  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCCCAATCCCAGATGTGCAGCTGTTTCTAGGTGCCTCTTCCACTGCT  431

seq1  TGCTGCTGAAAGAATAAGTGTGGAGCAGAGAGAGCAGCTGGGTAAAAATC  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTGAAAGAATAAGTGTGGAGCAGAGAGAGCAGCTGGGTAAAAATC  481

seq1  TGAGTTCTAGTCACAGTTCTAGGTTTGTTTGGGGGACCAAGTGGCCTCAG  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTCTAGTCACAGTTCTAGGTTTGTTTGGGGGACCAAGTGGCCTCAG  531

seq1  GCAGTAATTGGAAACAGTCTGACCTCTTCCTAGATGGGCTGTTACAAGTA  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTAATTGGAAACAGTCTGACCTCTTCCTAGATGGGCTGTTACAAGTA  581

seq1  AGTAACGTGCTTGTGGAAAACTCAGCACAGAACCAGAGAGCACTCAGCAC  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAACGTGCTTGTGGAAAACTCAGCACAGAACCAGAGAGCACTCAGCAC  631

seq1  AGGAGCAGTGAGCACTCAGCACAAGACCAGTAAGCACCACTCAGCACAGG  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCAGTGAGCACTCAGCACAAGACCAGTAAGCACCACTCAGCACAGG  681

seq1  AGCAGTGAGCACTCAGCACAAGAGCAGTAGGGGCTGGCGAGATGGCTCAA  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTGAGCACTCAGCACAAGAGCAGTAGGGGCTGGCGAGATGGCTCAA  731

seq1  TCGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCGAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCA  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCGAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCA  781

seq1  GAAACCACATGGTGGCTCACAACCATCCGTAATGAGATCTGATGCCCTCT  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCACATGGTGGCTCACAACCATCCGTAATGAGATCTGATGCCCTCT  831

seq1  TCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTAATGAATAATAATAAGTA  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTAATGAATAATAATAAGTA  881

seq1  AATCTTAAAAAAAAAAAAAAAGAGCAGTAAGCACCACTCAGCACAGGAGC  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTAAAAAAAAAAAAAAAGAGCAGTAAGCACCACTCAGCACAGGAGC  931

seq1  AGTGAGCACTCAGCACAAGAGCAGTAAGCACTACTCAGCACAGGAGCAGT  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGCACTCAGCACAAGAGCAGTAAGCACTACTCAGCACAGGAGCAGT  981

seq1  GAGCACTCAGCACAGGGGAGCAGTAAGCACTCAGGATAGGGCCAGAGAGC  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACTCAGCACAGGGGAGCAGTAAGCACTCAGGATAGGGCCAGAGAGC  1031

seq1  ACCTGGAAGATGTTTGGTTAATGGTGAGGATTCTGAGGAAAAATTGGTGT  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGGAAGATGTTTGGTTAATGGTGAGGATTCTGAGGAAAAATTGGTGT  1081

seq1  TAGATGAAATGAGGCTGGCTGCTGCTGCTATGTGAATTC  1129
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGAAATGAGGCTGGCTGCTGCTGCTATGTGAATTC  1120

seq1: chr2_31431573_31432620
seq2: B6Ng01-283G18.g_64_1106

seq1  GAATTCTTAAATACAAAGGGAATCTCTGAAGATCCATATAAAACTTAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAAATACAAAGGGAATCTCTGAAGATCCATATAAAACTTAAAA  50

seq1  ATATTTCTAGAGTGGGGGCCCAGTGGATTATTGTGTGTCAGGAATGAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTCTAGAGTGGGGGCCCAGTGGATTATTGTGTGTCAGGAATGAAGA  100

seq1  ATTCACAGCTGTTCTGAAGGGCAGTGGAGATAGGATCTGATTTGGGACTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACAGCTGTTCTGAAGGGCAGTGGAGATAGGATCTGATTTGGGACTA  150

seq1  CTGATAAAGTCTAAGACGCTAGATAGAGCTCTGGCTGCTTAGCAAATCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATAAAGTCTAAGACGCTAGATAGAGCTCTGGCTGCTTAGCAAATCAA  200

seq1  GTGTTCCTTTAACTTGTTTAAGAGAAGACTGGGTGCTGACTTTCAGCTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCCTTTAACTTGTTTAAGAGAAGACTGGGTGCTGACTTTCAGCTCA  250

seq1  TCTTGTTCCAGAATCATATTCTGCATCTGTGCCCTGAGTGGGCTACAAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTCCAGAATCATATTCTGCATCTGTGCCCTGAGTGGGCTACAAGC  300

seq1  GGGACCAGTGGACACAAGTCTGTTTTACTTTGAATAGTTTCTGAGGATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCAGTGGACACAAGTCTGTTTTACTTTGAATAGTTTCTGAGGATGA  350

seq1  TTAAAAATGTTCCTGGCCTGAGAGTGCTTGCCTACTGTGCATGGTTTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAATGTTCCTGGCCTGAGAGTGCTTGCCTACTGTGCATGGTTTATA  400

seq1  GGATTGGGTTCAGCCCCCAGAGCCATATAAACTAAGCCTGGTGGCACATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTGGGTTCAGCCCCCAGAGCCATATAAACTAAGCCTGGTGGCACATA  450

seq1  TCTATGCAATCCCAGGACTTGAGAGGTCGAGGCGGGATGATCAGGAAGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGCAATCCCAGGACTTGAGAGGTCGAGGCGGGATGATCAGGAAGTT  500

seq1  CCAGGTTGTCCTCAGCCACATAGCAAGCATAGCGAGTGAGGCCAGACTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTTGTCCTCAGCCACATAGCAAGCATAGCGAGTGAGGCCAGACTGG  550

seq1  GATGCCTGAGAACCTGTCCAAAAGGTAAAAACGTTCCCAGAACAGAACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCCTGAGAACCTGTCCAAAAGGTAAAAACGTTCCCAGAACAGAACAG  600

seq1  TGTTGGCCATCCGATGAAGACGGACTCGTTAATGGGTTGTGGGCCATCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGCCATCCGATGAAGACGGACTCGTTAATGGGTTGTGGGCCATCAC  650

seq1  AGTGTTACAGCTGCCAACAGCTTCCCACTAGCTTTCCTGAGGATAGGTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTACAGCTGCCAACAGCTTCCCACTAGCTTTCCTGAGGATAGGTTA  700

seq1  TTTTGCTAAAGTCAATGCTTGTTAGGACTTTAAGCTCCTGTTTGTTGTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCTAAAGTCAATGCTTGTTAGGACTTTAAGCTCCTGTTTGTTGTGG  750

seq1  AGGTGGTTTTACTGAGGCAGGGTTCTGCTGTGTAGTTCTTCTGCTGGCCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGTTTTACTGAGGCAGGGTTCTGCTGTGTAGTTCTTCTGCTGGCCT  800

seq1  CAAACTCATGCTCCTCCTGCCTTAGTTTCCTAAGAACTGGAATTATAGGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTCATGCTCCTCCTGCCTTAGTTTCCTAAGAACTGGAATTATAGGC  850

seq1  CTGCAACAGCAACTTAGCTAAGGTGTTTTATCTTAGACCCTGTT-AAGGC  899
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CTGCAACAGCAACTTAGCTAA-GTGTTTTATCTTAGACCCTGTTAAAGGC  899

seq1  CCTATGCATTAGCCAACTCC-TTAGTATGTCTTTACACAGAGTGCAGTAT  948
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATGCATTAGCCAACTCCTTTAGTATGTCTTTACACAGAGTGCAGTAT  949

seq1  AAATGCACTCTTCATGGAGTTGGGCACCTTGCCTTGGACCCAAATAAAAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AAATGCACTCTTCATGGAGTTGGGCACCTTGCCTTGGACCCAAAT-AAAA  998

seq1  TGACCAAGTTTTTATAGAATCGAGAGGGCTAGCAAGATAGCTTCATGGAT  1048
      ||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
seq2  TGAC--AG-TTTTATAGAATCGAGAGGGCTAGC-AGATAGC-TCATGGAT  1043