BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-295O23
Chromosome2 (Build37)
Map Location 112,878,439 - 113,007,533
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneOlfr1312, Olfr1313, Olfr1314, Olfr1315-ps1, Olfr1316, Olfr1317, Olfr1318, GA_x5J8B7W3P0G-705890-705633, LOC100043187, Agpat7, Nut, Nola3, Slc12a6, Tmem85, EG668839, 2410042D21Rik, 2900064A13Rik, Chrm5, Aven, Ryr3
Downstream gene4930563P21Rik, Fmn1, Grem1, LOC100043520, Scg5, Arhgap11a, LOC100043526, Gja9, A530058N18Rik, Actc1, Aqr
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-295O23.bB6Ng01-295O23.g
ACCGA091678GA091679
length7381,109
definitionB6Ng01-295O23.b B6Ng01-295O23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(113,006,796 - 113,007,533)(112,878,439 - 112,879,560)
sequence
gaattcttcatacacagtgattaatgcattaatgacaatagaatggatgt
gagtaccatgtataccagtcagccctaggcaaaggagtgacaggcagcct
ggtggtcagtgctctctcttgttatatctcttcatctttttccaagtcta
taaaatttccatcttagctatttcccatccattgaaaatacctgttgctg
ttggatcattggcttgctaactaacagtcagtgactaattttgtgagtct
gctaaaggttggtaatgccttcaggacctcctctcccagtttaccagcag
tagtcttaaagacattttgcatagggaagtttccttgcagtttatttccc
acacagaagtcccgacttacaggaggagttagttattgtggattttccaa
tccgtgtgtgttaaggagtatgctttcagcagtgtgcgatagcagttacc
aagaaggcattcaaatagtgagtttttcaccaattccatgccgtacagtg
tacactgtaggagagattaggaagatagcagtgtgaacgttagcagagca
ctgggaaagcaggagtcagtccaagttcagggaaaatttcttgaggaaat
ctcaacagtgtggatgcataaacaaggcccaaaaggtgacagcaccagtt
gacatgccagagtggatgggggaaatctctcagggcttcactctggaaga
agagctgcaggcaattgatggtgtgtgtgtgtgtgagt
gaattccacagcaagtcacaacatagactgtgtaacctcagaggtagcaa
aggccaatggcatacagccatggtacacacacatacacacaaagcccctg
gatctaacatttcctgaatgtcattctttaaaaaggtatgactagggcac
tttaactttataggttcacaccataagtgtgtgtctctactttggttctt
ggtaagcactgtgactttgcaggaaggaaagcatctaattctaactatac
tttgtcactagtcagggacactgataggttgtgtaaggacaggtgctttt
gtgtgctattagagctgtttatttcattggtttcctttactgtcatcact
ggctcctcatttgaagcacggtgtctttcttgggcatactggctttttca
tactacccacccactttctatgaaatcttctgacaatgtttatgctacgt
atagggaatgggctgttgtgtatcctgttttacttctgggaaataataca
gtttctgggatttttctgtttatggtgcttcagagtacttgctgatactt
ttctgttattgtttgaaagaaagaggtcaataaaactaaaatctccaatg
tgtgggacactccacatactgtgtgcataatatttatatcactagtctat
tccccgatgtaaaatctgaaagcagaacaaagcctctgtttctatacaca
attaagagtaatggaacactggctttttcaagatggatacttgatgaagt
tagaagattataatgaaatttataggctgacattcagatgggtaaaactt
tgaagataggtttctggcaagcaaaagacttgatttcattatttaatgat
acatcaagtcctaaaaattatcctgtccaggacaagtatctttaaaaatt
atctaatttttccagccacattcagaaatgtcagtatcacaaacccagtg
agaaaagtctgtacagaaggaaaggaccagcaagaaactcaatgagcctt
cttcaagcatcattttcaggtctaaaaagttcctcaagtagtacctgatg
tctatcctatagagaggcactggggcctgagctgaatgtagtgactgcta
gaatctgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_113006796_113007533
seq2: B6Ng01-295O23.b_48_785 (reverse)

seq1  ACTCACACACACACACACCATCAATTGCCTGCAGCTCTTCTTCCAGAGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACACACACACACACCATCAATTGCCTGCAGCTCTTCTTCCAGAGTG  50

seq1  AAGCCCTGAGAGATTTCCCCCATCCACTCTGGCATGTCAACTGGTGCTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCCTGAGAGATTTCCCCCATCCACTCTGGCATGTCAACTGGTGCTGT  100

seq1  CACCTTTTGGGCCTTGTTTATGCATCCACACTGTTGAGATTTCCTCAAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTTTGGGCCTTGTTTATGCATCCACACTGTTGAGATTTCCTCAAGA  150

seq1  AATTTTCCCTGAACTTGGACTGACTCCTGCTTTCCCAGTGCTCTGCTAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTCCCTGAACTTGGACTGACTCCTGCTTTCCCAGTGCTCTGCTAAC  200

seq1  GTTCACACTGCTATCTTCCTAATCTCTCCTACAGTGTACACTGTACGGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCACACTGCTATCTTCCTAATCTCTCCTACAGTGTACACTGTACGGCA  250

seq1  TGGAATTGGTGAAAAACTCACTATTTGAATGCCTTCTTGGTAACTGCTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATTGGTGAAAAACTCACTATTTGAATGCCTTCTTGGTAACTGCTAT  300

seq1  CGCACACTGCTGAAAGCATACTCCTTAACACACACGGATTGGAAAATCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCACACTGCTGAAAGCATACTCCTTAACACACACGGATTGGAAAATCCA  350

seq1  CAATAACTAACTCCTCCTGTAAGTCGGGACTTCTGTGTGGGAAATAAACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAACTAACTCCTCCTGTAAGTCGGGACTTCTGTGTGGGAAATAAACT  400

seq1  GCAAGGAAACTTCCCTATGCAAAATGTCTTTAAGACTACTGCTGGTAAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGAAACTTCCCTATGCAAAATGTCTTTAAGACTACTGCTGGTAAAC  450

seq1  TGGGAGAGGAGGTCCTGAAGGCATTACCAACCTTTAGCAGACTCACAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGAGGAGGTCCTGAAGGCATTACCAACCTTTAGCAGACTCACAAAA  500

seq1  TTAGTCACTGACTGTTAGTTAGCAAGCCAATGATCCAACAGCAACAGGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCACTGACTGTTAGTTAGCAAGCCAATGATCCAACAGCAACAGGTA  550

seq1  TTTTCAATGGATGGGAAATAGCTAAGATGGAAATTTTATAGACTTGGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAATGGATGGGAAATAGCTAAGATGGAAATTTTATAGACTTGGAAA  600

seq1  AAGATGAAGAGATATAACAAGAGAGAGCACTGACCACCAGGCTGCCTGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGAAGAGATATAACAAGAGAGAGCACTGACCACCAGGCTGCCTGTC  650

seq1  ACTCCTTTGCCTAGGGCTGACTGGTATACATGGTACTCACATCCATTCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTTTGCCTAGGGCTGACTGGTATACATGGTACTCACATCCATTCTA  700

seq1  TTGTCATTAATGCATTAATCACTGTGTATGAAGAATTC  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCATTAATGCATTAATCACTGTGTATGAAGAATTC  738

seq1: chr2_112878439_112879560
seq2: B6Ng01-295O23.g_70_1178

seq1  GAATTCCACAGCAAGTCACAACATAGACTGTGTAACCTCAGAGGTAGCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACAGCAAGTCACAACATAGACTGTGTAACCTCAGAGGTAGCAA  50

seq1  AGGCCAATGGCATACAGCCATGGTACACACACATACACACAAAGCCCCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCAATGGCATACAGCCATGGTACACACACATACACACAAAGCCCCTG  100

seq1  GATCTAACATTTCCTGAATGTCATTCTTTAAAAAGGTATGACTAGGGCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTAACATTTCCTGAATGTCATTCTTTAAAAAGGTATGACTAGGGCAC  150

seq1  TTTAACTTTATAGGTTCACACCATAAGTGTGTGTCTCTACTTTGGTTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACTTTATAGGTTCACACCATAAGTGTGTGTCTCTACTTTGGTTCTT  200

seq1  GGTAAGCACTGTGACTTTGCAGGAAGGAAAGCATCTAATTCTAACTATAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAGCACTGTGACTTTGCAGGAAGGAAAGCATCTAATTCTAACTATAC  250

seq1  TTTGTCACTAGTCAGGGACACTGATAGGTTGTGTAAGGACAGGTGCTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCACTAGTCAGGGACACTGATAGGTTGTGTAAGGACAGGTGCTTTT  300

seq1  GTGTGCTATTAGAGCTGTTTATTTCATTGGTTTCCTTTACTGTCATCACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCTATTAGAGCTGTTTATTTCATTGGTTTCCTTTACTGTCATCACT  350

seq1  GGCTCCTCATTTGAAGCACGGTGTCTTTCTTGGGCATACTGGCTTTTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCTCATTTGAAGCACGGTGTCTTTCTTGGGCATACTGGCTTTTTCA  400

seq1  TACTACCCACCCACTTTCTATGAAATCTTCTGACAATGTTTATGCTACGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTACCCACCCACTTTCTATGAAATCTTCTGACAATGTTTATGCTACGT  450

seq1  ATAGGGAATGGGCTGTTGTGTATCCTGTTTTACTTCTGGGAAATAATACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGGAATGGGCTGTTGTGTATCCTGTTTTACTTCTGGGAAATAATACA  500

seq1  GTTTCTGGGATTTTTCTGTTTATGGTGCTTCAGAGTACTTGCTGATACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTGGGATTTTTCTGTTTATGGTGCTTCAGAGTACTTGCTGATACTT  550

seq1  TTCTGTTATTGTTTGAAAGAAAGAGGTCAATAAAACTAAAATCTCCAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTTATTGTTTGAAAGAAAGAGGTCAATAAAACTAAAATCTCCAATG  600

seq1  TGTGGGACACTCCACATACTGTGTGCATAATATTTATATCACTAGTCTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGACACTCCACATACTGTGTGCATAATATTTATATCACTAGTCTAT  650

seq1  TCCCCGATGTAAAATCTGAAAGCAGAACAAAGCCTCTGTTTCTATACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCGATGTAAAATCTGAAAGCAGAACAAAGCCTCTGTTTCTATACACA  700

seq1  ATTAAGAGTAATGGAACACTGGCTTTTTCAAGATGGATACTTGATGAAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGAGTAATGGAACACTGGCTTTTTCAAGATGGATACTTGATGAAGT  750

seq1  TAGAAGATTATAATGAAATTTATAGGCTGACATTCAGATGGGTAAAACTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGATTATAATGAAATTTATAGGCTGACATTCAGATGGGTAAAACTT  800

seq1  TGAAGATAGGTTTCTGGCAAGCAAAAGACTTGATTTCATTATTTAATGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGATAGGTTTCTGGCAAGCAAAAGACTTGATTTCATTATTTAATGAT  850

seq1  ACATCAAGTCCTAAAAATTATCCTGTCCAGGACAAGTATCTTTAAAAATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCAAGTCCTAAAAATTATCCTGTCCAGGACAAGTATCTTTAAAAATT  900

seq1  ATCTAATTTTTCCAGCCACATTCAGAAATGTCAAGTATCACAAA-CCAGT  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
seq2  ATCTAATTTTTCCAGCCACATTCAGAAATGTC-AGTATCACAAACCCAGT  949

seq1  GAGAAAAAGTCTGTACAGAAGGAAAGGACCAGCAAGAAACTCAATGAGCC  999
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAG-AAAAGTCTGTACAGAAGGAAAGGACCAGCAAGAAACTCAATGAGCC  998

seq1  TCTTCCAAGCATCATTTTCAGGTTCTAAAAAGTTCCCTTCAAAGTAGTAA  1049
      |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| 
seq2  TTCTTCAAGCATCATTTTCAGG-TCTAAAAAGTTCC--TC-AAGTAGTA-  1043

seq1  CCCTGATGTCTATCCTATAGAGAAGGGCACTTGGGCCTGAGCTTGGTATG  1099
       ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | |||
seq2  -CCTGATGTCTATCCTATAGAGA--GGCACTGGGGCCTGAGCT--GAATG  1088

seq1  TTAAGTGACTGCCTAG-ATCTGGA  1122
      |  |||||||| |||| |||||||
seq2  T--AGTGACTG-CTAGAATCTGGA  1109