BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-347G07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 117,542,984 - 117,686,304
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneTmco5, LOC100043557, LOC241621, Spred1, LOC624574, 2610510H03Rik, Rasgrp1
Downstream geneThbs1, Fsip1, Gpr176, 1700054M17Rik, Eif2ak4, Srp14, LOC668859, Bmf, LOC640461, Bub1b, Pak6, Gm1337, Plcb2, LOC100043272, A430105I19Rik, Disp2, D2Ertd750e
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-347G07.bB6Ng01-347G07.g
ACCGA129007GA129008
length1,2461,001
definitionB6Ng01-347G07.b B6Ng01-347G07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,542,984 - 117,544,236)(117,685,300 - 117,686,304)
sequence
gaattcatgaaacaagacactcgtggctctctttgcaacagatttccttt
cattcttcccactcagctgccctagaggtgctagacagctgccatttcta
aacacagccctgatccgctgcttactttgatagtgggaagtgaaaagtga
gaaatctctctgggctcttattcacttaaactagtgggaccactaaaggc
aagagaaactccatccccactccactcctcagccctatggttgaggagta
aaacagaaaggaagtcacactaattcacaatcatccaaagcttgaggtag
accagaagtctcacgattttcataggagattgtaaagtagtaacaacaac
gattatttgctaaacatgaaatccaagagcccattcagttcacaccaagg
gagtacaaggaagattcacactggtcttttcctgtataacccagactgga
aattctgaaaacatctctgtgaaagttcattcagggaatgctttagaaga
actgtagtctcaaaaagaaaggaaacacatcatctttcattaaaatattg
tcaaaaaactagcagaacattgactatgaagagatgccaacagacttgag
aattacagtgtctggggtttgcttcagagcatgcagacatttgtgcccag
ggaggcagcatatatatatagtttatgtctctcagcaaatatcttggcac
tgaattgcatcacagctgaagataagcctaaagtagatgatgctgggttg
gaaaaacttctaacaatgtaccaaacgtttctggactccagctccttctt
aagaggaccaggaaagggtttaacacttaggtcacttccacttaacagca
tagtatactgaagttgactagattgcctatgaaatgcatgtttcagcttt
atatgccaagcgtctcatgccccaactcatccagcagttctagtcaacag
ggcatcctatatcatgatgccttcctagcacatgattgtgtaaaacacaa
tagtggtgcacaggttccagcaacgcagctgagtcttaatgatgcaattg
cctcagctttacttcctctaaacggtgactgaaaataacaatagacccat
cggatagggtcatgtcaggactggagagggtaataaatgcaggtgtttgt
atttttaccttgggagaatggtaattagtgaagactttgatgggtattaa
cacatgccgatcagaactgttgatggaattactgtgaagggagaat
gaattctttaaaactacagtattttccttgaatgtgagcagtggacaaac
tgagaaagatctgaaatatcagaggtattcacatgaatgagaatgtagtt
ataaaactatcctattgaacaatgaatatatgctaataagttagaaaata
tagatgttaataaaacagggagattcagaacacatcagtagctggtttaa
aacaagaagaattcagttcaccaatgctagcttgaagatggtagggtcac
atgaaaaactgatgaagaaagtgggtcttctcacagccaggagcttggaa
gcgccatcagctaaaggcccaagtttttaaatgcttcacgtgaggtaata
ctttttatgaaatttaactaactttgcaaataataaaagaacttggtatc
atcaacatgatgaagcctgagtgcatgtgtgtgtgaaggagtaaaacacg
atatggaaacatgtgcaggccattgtggagaaagatcacttaaccctagc
ataacagggcaagattagcttctctttagagagctggataaagtcagttt
tcttggtgctgtggatgaaagaatgcatatataaagtccactatcgtgga
gatgaagtccacaggtgaaattctctttcctttgagaccccaagactcac
tgcgtctcacagaggggcgttcttgtcagtgttctcctgcaaaagcttcc
cctgagagtaaagataaccccagttgctgggggctcaagcaggcttatta
ttgtcactcatctaaacttggaatgtgttaagtttgagttagttcaatgg
agagcaccactagcaccacggggatctgagcaaactttgctctgtgctga
aagcaactaattgcagagccttgaattcaggacctgtcttagtcaggttt
ctattcctgcacaaacatcatgaccagaagcaagttgggggaggaaaggg
tctattcggcttacacttccatactgctgttcatcacaggagtcaggact
g
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_117542984_117544236
seq2: B6Ng01-347G07.b_46_1291

seq1  GAATTCATGAAACAAGACACTCGTGGCTCTCTTTGCAACAGATTTCCTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGAAACAAGACACTCGTGGCTCTCTTTGCAACAGATTTCCTTT  50

seq1  CATTCTTCCCACTCAGCTGCCCTAGAGGTGCTAGACAGCTGCCATTTCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTTCCCACTCAGCTGCCCTAGAGGTGCTAGACAGCTGCCATTTCTA  100

seq1  AACACAGCCCTGATCCGCTGCTTACTTTGATAGTGGGAAGTGAAAAGTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAGCCCTGATCCGCTGCTTACTTTGATAGTGGGAAGTGAAAAGTGA  150

seq1  GAAATCTCTCTGGGCTCTTATTCACTTAAACTAGTGGGACCACTAAAGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCTCTCTGGGCTCTTATTCACTTAAACTAGTGGGACCACTAAAGGC  200

seq1  AAGAGAAACTCCATCCCCACTCCACTCCTCAGCCCTATGGTTGAGGAGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAAACTCCATCCCCACTCCACTCCTCAGCCCTATGGTTGAGGAGTA  250

seq1  AAACAGAAAGGAAGTCACACTAATTCACAATCATCCAAAGCTTGAGGTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGAAAGGAAGTCACACTAATTCACAATCATCCAAAGCTTGAGGTAG  300

seq1  ACCAGAAGTCTCACGATTTTCATAGGAGATTGTAAAGTAGTAACAACAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAAGTCTCACGATTTTCATAGGAGATTGTAAAGTAGTAACAACAAC  350

seq1  GATTATTTGCTAAACATGAAATCCAAGAGCCCATTCAGTTCACACCAAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATTTGCTAAACATGAAATCCAAGAGCCCATTCAGTTCACACCAAGG  400

seq1  GAGTACAAGGAAGATTCACACTGGTCTTTTCCTGTATAACCCAGACTGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTACAAGGAAGATTCACACTGGTCTTTTCCTGTATAACCCAGACTGGA  450

seq1  AATTCTGAAAACATCTCTGTGAAAGTTCATTCAGGGAATGCTTTAGAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTGAAAACATCTCTGTGAAAGTTCATTCAGGGAATGCTTTAGAAGA  500

seq1  ACTGTAGTCTCAAAAAGAAAGGAAACACATCATCTTTCATTAAAATATTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAGTCTCAAAAAGAAAGGAAACACATCATCTTTCATTAAAATATTG  550

seq1  TCAAAAAACTAGCAGAACATTGACTATGAAGAGATGCCAACAGACTTGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAAACTAGCAGAACATTGACTATGAAGAGATGCCAACAGACTTGAG  600

seq1  AATTACAGTGTCTGGGGTTTGCTTCAGAGCATGCAGACATTTGTGCCCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACAGTGTCTGGGGTTTGCTTCAGAGCATGCAGACATTTGTGCCCAG  650

seq1  GGAGGCAGCATATATATATAGTTTATGTCTCTCAGCAAATATCTTGGCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCAGCATATATATATAGTTTATGTCTCTCAGCAAATATCTTGGCAC  700

seq1  TGAATTGCATCACAGCTGAAGATAAGCCTAAAGTAGATGATGCTGGGTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTGCATCACAGCTGAAGATAAGCCTAAAGTAGATGATGCTGGGTTG  750

seq1  GAAAAACTTCTAACAATGTACCAAACGTTTCTGGACTCCAGCTCCTTCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAACTTCTAACAATGTACCAAACGTTTCTGGACTCCAGCTCCTTCTT  800

seq1  AAGAGGACCAGGAAAGGGTTTAACACTTAGGTCACTTCCACTTAACAGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGACCAGGAAAGGGTTTAACACTTAGGTCACTTCCACTTAACAGCA  850

seq1  TAGTATACTGAAGTTGACTAGATTGCCTATGAAATGCATGTTTCAGCTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTATACTGAAGTTGACTAGATTGCCTATGAAATGCATGTTTCAGCTTT  900

seq1  ATATGCCAAGCGTCTCATGCCCCAACTCATCCAGCAGTTCTAGTCAACAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCCAAGCGTCTCATGCCCCAACTCATCCAGCAGTTCTAGTCAACAG  950

seq1  GGCATCCTATATCATGATGCCTTCCTAGCACATGATTGTGTAAAACACAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATCCTATATCATGATGCCTTCCTAGCACATGATTGTGTAAAACACAA  1000

seq1  TAGTGGTGCACAGGTTCCAAGCAAACGCAGCTGAGTC-TAATGATGCAAA  1049
      |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| 
seq2  TAGTGGTGCACAGGTTCC-AGC-AACGCAGCTGAGTCTTAATGATGCAAT  1048

seq1  TTGCTCAGCTTTACTT-CTCTAAAACGTGAACTGAAAATAACAATAGAAC  1098
      |  ||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||
seq2  TGCCTCAGCTTTACTTCCTCTAAACGGTG-ACTGAAAATAACAATAG-AC  1096

seq1  CCATCAGATAGGGTCATGTCAGGGACT-GAGAGGGTAATAAATTGCAGGT  1147
      ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||
seq2  CCATCGGATAGGGTCATGTCA-GGACTGGAGAGGGTAATAAA-TGCAGGT  1144

seq1  GTTTGTATTTTTACCT--GGAAGATGGTAATTAGTGAAAGAATTTTGATG  1195
      ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||   | |||||||
seq2  GTTTGTATTTTTACCTTGGGAGAATGGTAATTAGTGAA--GACTTTGATG  1192

seq1  GTTATTAACACTATGCAGATCAAAGACTGTATGATTGGAATTACTGTGAA  1245
      | ||||||||| |||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||
seq2  GGTATTAACAC-ATGCCGATCAGA-ACTGT-TGA-TGGAATTACTGTGAA  1238

seq1  GTGAGAAT  1253
      | ||||||
seq2  GGGAGAAT  1246

seq1: chr2_117685300_117686304
seq2: B6Ng01-347G07.g_67_1067 (reverse)

seq1  CAGTCCTGACTTCCTTGGTGATGAACAGCAGTATGGAAGTGTAAGCCGAA  50
      |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCTGAC-TCCT--GTGATGAACAGCAGTATGGAAGTGTAAGCCGAA  47

seq1  TAGACCCTTTCCT-CCCCAACTTGCTTCTTGGTCATGATGTTTGTGCAGG  99
      ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TAGACCCTTTCCTCCCCCAACTTGCTTC-TGGTCATGATGTTTGTGCAGG  96

seq1  AATAGAAACCCTGACTAAGACAGGTCCTGAATTCAAGGCTCTGCAATTAG  149
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGAAA-CCTGACTAAGACAGGTCCTGAATTCAAGGCTCTGCAATTAG  145

seq1  TTGCTTTCAGCACAGAGCAAAGTTTGCTCAGATCCCCGTGGTGCTAGTGG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTTCAGCACAGAGCAAAGTTTGCTCAGATCCCCGTGGTGCTAGTGG  195

seq1  TGCTCTCCATTGAACTAACTCAAACTTAACACATTCCAAGTTTAGATGAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTCCATTGAACTAACTCAAACTTAACACATTCCAAGTTTAGATGAG  245

seq1  TGACAATAATAAGCCTGCTTGAGCCCCCAGCAACTGGGGTTATCTTTACT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAATAATAAGCCTGCTTGAGCCCCCAGCAACTGGGGTTATCTTTACT  295

seq1  CTCAGGGGAAGCTTTTGCAGGAGAACACTGACAAGAACGCCCCTCTGTGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGGGAAGCTTTTGCAGGAGAACACTGACAAGAACGCCCCTCTGTGA  345

seq1  GACGCAGTGAGTCTTGGGGTCTCAAAGGAAAGAGAATTTCACCTGTGGAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGCAGTGAGTCTTGGGGTCTCAAAGGAAAGAGAATTTCACCTGTGGAC  395

seq1  TTCATCTCCACGATAGTGGACTTTATATATGCATTCTTTCATCCACAGCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCTCCACGATAGTGGACTTTATATATGCATTCTTTCATCCACAGCA  445

seq1  CCAAGAAAACTGACTTTATCCAGCTCTCTAAAGAGAAGCTAATCTTGCCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAAAACTGACTTTATCCAGCTCTCTAAAGAGAAGCTAATCTTGCCC  495

seq1  TGTTATGCTAGGGTTAAGTGATCTTTCTCCACAATGGCCTGCACATGTTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATGCTAGGGTTAAGTGATCTTTCTCCACAATGGCCTGCACATGTTT  545

seq1  CCATATCGTGTTTTACTCCTTCACACACACATGCACTCAGGCTTCATCAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATCGTGTTTTACTCCTTCACACACACATGCACTCAGGCTTCATCAT  595

seq1  GTTGATGATACCAAGTTCTTTTATTATTTGCAAAGTTAGTTAAATTTCAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGATGATACCAAGTTCTTTTATTATTTGCAAAGTTAGTTAAATTTCAT  645

seq1  AAAAAGTATTACCTCACGTGAAGCATTTAAAAACTTGGGCCTTTAGCTGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGTATTACCTCACGTGAAGCATTTAAAAACTTGGGCCTTTAGCTGA  695

seq1  TGGCGCTTCCAAGCTCCTGGCTGTGAGAAGACCCACTTTCTTCATCAGTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCGCTTCCAAGCTCCTGGCTGTGAGAAGACCCACTTTCTTCATCAGTT  745

seq1  TTTCATGTGACCCTACCATCTTCAAGCTAGCATTGGTGAACTGAATTCTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATGTGACCCTACCATCTTCAAGCTAGCATTGGTGAACTGAATTCTT  795

seq1  CTTGTTTTAAACCAGCTACTGATGTGTTCTGAATCTCCCTGTTTTATTAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTTTAAACCAGCTACTGATGTGTTCTGAATCTCCCTGTTTTATTAA  845

seq1  CATCTATATTTTCTAACTTATTAGCATATATTCATTGTTCAATAGGATAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTATATTTTCTAACTTATTAGCATATATTCATTGTTCAATAGGATAG  895

seq1  TTTTATAACTACATTCTCATTCATGTGAATACCTCTGATATTTCAGATCT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATAACTACATTCTCATTCATGTGAATACCTCTGATATTTCAGATCT  945

seq1  TTCTCAGTTTGTCCACTGCTCACATTCAAGGAAAATACTGTAGTTTTAAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAGTTTGTCCACTGCTCACATTCAAGGAAAATACTGTAGTTTTAAA  995

seq1  GAATTC  1005
      ||||||
seq2  GAATTC  1001