BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-349B05
Chromosome2 (Build37)
Map Location 41,912,907 - 42,054,371
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLrp1b
Upstream geneLOC100042629, LOC625094
Downstream geneLOC100041228
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-349B05.bB6Ng01-349B05.g
ACCGA130168GA130169
length3611,103
definitionB6Ng01-349B05.b B6Ng01-349B05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(41,912,907 - 41,913,267)(42,053,270 - 42,054,371)
sequence
cctttatggtaagttctattatagactgggctacagaggaagaatctgtt
cagttaaaaaaaaaaaaaaaaagactgagaatgggtgaaatgtcaattca
tagctttagttctgcatttatttagctatgcatgaaaggtattttttttt
ttttgctactcaggggtacagtaacattaaatcaataaagaaatataagt
attcagtagggcctgtacataatttgaaggtggaacttaaggctaaaaac
ttcaataattttctccagtcttataatgagcaaaaatttataggccacag
accaactgaagctcatacctaaatgatgttgccataactctctgctcagt
gtgtgtgtgtg
gaattcaatgtgagactgattgtttcctcataatgttaaacagggttggg
acactagttgaatttcactgagggacatccacaaattgtgtctggagagc
tgtaagtgtggagtcaggtgcatggttcaaaattggcagctgtattggta
catgcaacattattattgtgtgttatcacatgcacaatggcttcaaattt
tctctacattttccaaaatgtatattttgtctgatggtggcagaaactct
tttcattccacatctagacacacaatggtaccttgctgaccatttataac
tgaaaaccaccataggaccaaaagactatctgtagaggtaaccacgtaat
agtgctaacatttcgactgtagacatttactagatctgtagttagacttc
tctttgtgatactcagttatttctttggtaagtatggtctttaacaatct
cagttatgatttgaaataaaattcacccaaatatttgttttattaattca
tgtataattcataagtcttagtaaaacataaatcttactatatatttata
atgttgattaaattaatatctcatatgtatttgagatatatgcattttta
ttttgaaatataagtttacatagttggagtttaaatccagatgccaggtg
ttagccttttatgaaaaatacacaactgtagtaaagttcctctcattgac
aatttggagttataacatttatgtgtgaccgtttcattaaacagtaattc
ttcatttttatgtaaattaatgattgtttaatttttttgaatggtaggac
ttgatttgtcacaaaattgaataaatatactgaatgcttttcaatagcta
ccatgtagttgtgcacggaatatgctctgtatgtataaatataattacta
tacatttgtgggtgaaaaaaacatatagcattcattttgcttactgggct
ctacaagcatcggcatggtggtttcaaatggagtctcatagactaatacg
gttctttctctctgacttcttttcttggctttttgccacattgtccaaac
taggatactgacatcacttcaaaccttcttcttaagtttctcctttttat
tct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_41912907_41913267
seq2: B6Ng01-349B05.b_57_417

seq1  CCTTTATGGTAAGTTCTATTATAGACTGGGCTACAGAGGAAGAATCTGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTATGGTAAGTTCTATTATAGACTGGGCTACAGAGGAAGAATCTGTT  50

seq1  CAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTGAGAATGGGTGAAATGTCAATTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTGAGAATGGGTGAAATGTCAATTCA  100

seq1  TAGCTTTAGTTCTGCATTTATTTAGCTATGCATGAAAGGTATTTTTTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTTAGTTCTGCATTTATTTAGCTATGCATGAAAGGTATTTTTTTTT  150

seq1  TTTTGCTACTCAGGGGTACAGTAACATTAAATCAATAAAGAAATATAAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCTACTCAGGGGTACAGTAACATTAAATCAATAAAGAAATATAAGT  200

seq1  ATTCAGTAGGGCCTGTACATAATTTGAAGGTGGAACTTAAGGCTAAAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGTAGGGCCTGTACATAATTTGAAGGTGGAACTTAAGGCTAAAAAC  250

seq1  TTCAATAATTTTCTCCAGTCTTATAATGAGCAAAAATTTATAGGCCACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATAATTTTCTCCAGTCTTATAATGAGCAAAAATTTATAGGCCACAG  300

seq1  ACCAACTGAAGCTCATACCTAAATGATGTTGCCATAACTCTCTGCTCAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAACTGAAGCTCATACCTAAATGATGTTGCCATAACTCTCTGCTCAGT  350

seq1  GTGTGTGTGTG  361
      |||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTG  361

seq1: chr2_42053270_42054371
seq2: B6Ng01-349B05.g_65_1167 (reverse)

seq1  AGAATAAAAAGGAAGAAACTTAAGA--GAGGTTTGAAGTGATGTCAGTAT  48
      |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAAAAAGG-AGAAACTTAAGAAGAAGGTTTGAAGTGATGTCAGTAT  49

seq1  CTTAGTTTGGAACAATGTGGCAAAAAGCCAAGAAAAGAAGTCAGAGAGAA  98
      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTTTGG-ACAATGTGGCAAAAAGCCAAGAAAAGAAGTCAGAGAGAA  98

seq1  AGAACCGTA-TAGTCTATGAGACTCCATTTGAAACCACCATGCCGATGCT  147
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACCGTATTAGTCTATGAGACTCCATTTGAAACCACCATGCCGATGCT  148

seq1  TGTAGAGCCCAGTAAGCAAAATGAATGCTATATGTTTTTTTCACCCACAA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAGCCCAGTAAGCAAAATGAATGCTATATGTTTTTTTCACCCACAA  198

seq1  ATGTATAGTAATTATATTTATACATACAGAGCATATTCCGTGCACAACTA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATAGTAATTATATTTATACATACAGAGCATATTCCGTGCACAACTA  248

seq1  CATGGTAGCTATTGAAAAGCATTCAGTATATTTATTCAATTTTGTGACAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTAGCTATTGAAAAGCATTCAGTATATTTATTCAATTTTGTGACAA  298

seq1  ATCAAGTCCTACCATTCAAAAAAATTAAACAATCATTAATTTACATAAAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGTCCTACCATTCAAAAAAATTAAACAATCATTAATTTACATAAAA  348

seq1  ATGAAGAATTACTGTTTAATGAAACGGTCACACATAAATGTTATAACTCC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGAATTACTGTTTAATGAAACGGTCACACATAAATGTTATAACTCC  398

seq1  AAATTGTCAATGAGAGGAACTTTACTACAGTTGTGTATTTTTCATAAAAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTGTCAATGAGAGGAACTTTACTACAGTTGTGTATTTTTCATAAAAG  448

seq1  GCTAACACCTGGCATCTGGATTTAAACTCCAACTATGTAAACTTATATTT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACACCTGGCATCTGGATTTAAACTCCAACTATGTAAACTTATATTT  498

seq1  CAAAATAAAAATGCATATATCTCAAATACATATGAGATATTAATTTAATC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATAAAAATGCATATATCTCAAATACATATGAGATATTAATTTAATC  548

seq1  AACATTATAAATATATAGTAAGATTTATGTTTTACTAAGACTTATGAATT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTATAAATATATAGTAAGATTTATGTTTTACTAAGACTTATGAATT  598

seq1  ATACATGAATTAATAAAACAAATATTTGGGTGAATTTTATTTCAAATCAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATGAATTAATAAAACAAATATTTGGGTGAATTTTATTTCAAATCAT  648

seq1  AACTGAGATTGTTAAAGACCATACTTACCAAAGAAATAACTGAGTATCAC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAGATTGTTAAAGACCATACTTACCAAAGAAATAACTGAGTATCAC  698

seq1  AAAGAGAAGTCTAACTACAGATCTAGTAAATGTCTACAGTCGAAATGTTA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGAAGTCTAACTACAGATCTAGTAAATGTCTACAGTCGAAATGTTA  748

seq1  GCACTATTACGTGGTTACCTCTACAGATAGTCTTTTGGTCCTATGGTGGT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTATTACGTGGTTACCTCTACAGATAGTCTTTTGGTCCTATGGTGGT  798

seq1  TTTCAGTTATAAATGGTCAGCAAGGTACCATTGTGTGTCTAGATGTGGAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGTTATAAATGGTCAGCAAGGTACCATTGTGTGTCTAGATGTGGAA  848

seq1  TGAAAAGAGTTTCTGCCACCATCAGACAAAATATACATTTTGGAAAATGT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAGAGTTTCTGCCACCATCAGACAAAATATACATTTTGGAAAATGT  898

seq1  AGAGAAAATTTGAAGCCATTGTGCATGTGATAACACACAATAATAATGTT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAATTTGAAGCCATTGTGCATGTGATAACACACAATAATAATGTT  948

seq1  GCATGTACCAATACAGCTGCCAATTTTGAACCATGCACCTGACTCCACAC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTACCAATACAGCTGCCAATTTTGAACCATGCACCTGACTCCACAC  998

seq1  TTACAGCTCTCCAGACACAATTTGTGGATGTCCCTCAGTGAAATTCAACT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGCTCTCCAGACACAATTTGTGGATGTCCCTCAGTGAAATTCAACT  1048

seq1  AGTGTCCCAACCCTGTTTAACATTATGAGGAAACAATCAGTCTCACATTG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCCCAACCCTGTTTAACATTATGAGGAAACAATCAGTCTCACATTG  1098

seq1  AATTC  1102
      |||||
seq2  AATTC  1103