| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-049L23.T7 (MSMg01no049_l23.b1) | MSMg01-049L23.TJ (MSMg01no049_l23.g1) |
|---|
| ACC | AG279083 | AG279084 |
|---|
| length | 1,215 | 1,226 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 681 (52 - 732) | 389 (77 - 465) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_l23.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_l23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:12:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_l23.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_l23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:12:05 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | TTATCTTTNNNNTTACAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCATTATTAAACTCTTAATCGTATTCAATTCAGTGTCACAA
ATAAGAACAATATGAAGAACGTGATTTGCAACCCGGCAGCTAGCCAGATG
CCTGCAGGGTTGTACAGGCAGTCTGACTGGAAGTCATCATTGTCCAGAGC
TAGGAAGGCTCCAATTCATGATCAAAGTGATATCGGCTCTTTAAAAAAAT
TACATTTGAAGTTGAATTAAGTAGAACATTAGCATATTAGGGCCAGCAGA
GACTACACTTGAGAAATGTGTCTCTACGTCATGAGAAACCAGGATCAAAG
TAACAATTTGAAGATTAGAGTTCTGCCTTAGATAAAAAGGGACAGATAGA
ATTTTATTCGAGTTATCGGGACAAATGTCCACAGTGTACTTTACGAAGGC
AAGATGTATGAATGTGAAGAATCTGAGGAGGAATCTGAGGGTTAGGCTGG
TTACTGAAAATGGATGGAGGATGACAGCAGCTTCTGGTATCCTGGCACTA
GATACTGGGTGGTGTACTCCTCAAGATAAGAGAGAGGCTAATGGGAAGGG
CAAGGGGCTGGGCACGAGCATGGCTCTGTAAGCATGACTTAGTCAGATGT
GTATTAAGAGGTGTTTAACACTTTCTCTGTGATGTATGTGTCTAGTAAAT
ACATATAATCTATGTGCCCAAAATTAAAAAAGAAATAGGAGAGAGAGAAA
CTTAGCTTANAAAAATACAATTTGCAAGTCACCAAACTCTTGGAGACAAT
TGAAGTGATAAAATGCAGAGATTTTTATAAACAAAAGAGATACCGGGTGA
TTTTGTGATGCTTTCCACCTGGATGGAAGAGAAAAAAAACCCTTCCATGA
GCCTTAAAAGAAACTGTAGACAAGCTCGATATGAACAGACCTTCCCCTGA
AAACCCCGGGAATTGGGGGTTGAAATTGTGGGGTGGCTGTGCGGCCCCCC
CAAAGCTCCTTGCGTTTGAACACTTGTCTCCCAGGTGTTGGTAACTGGTT
TGTGAAAAATTGGGTTACCTCCTGGAAGTTTAAACCCTAACTTGGGTAAT
TTTAATTTTCTGGGAGGGTGTCTTTTTTAAGCATTACACCCTGTTATATG
TGTCTACTGGCCAATAATCCTTTCTCCTCTTTCTGAGCCCTTTTTGTAAT
AACATAATTTATTCT
| TTTTTAAGAAGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTTTTCATTGAATTCTAGGATCATTTCTTT
CTTTATTTCTGCCTTGACTCAGGCTTCGTCATACAGTCAAGAGTTGTTCA
GTTTCCATGAGTTTGGAGGCTTTCTGTTGTTGAATCTTAGCTTTACTCTG
TGGTGGTCTGATAGCACACAGAGTGTTATTTCAGTTTATTTGTATGCTGG
AGAAAGTTTCATGAGATGCTGAGAATACTTATATTCTTTCTGTGTAGGTG
CAATGTTCTATGCATACCTGTTAGGTCCATTGGGTTCACAATGTCTGTTA
GGACCATTATTTCTCCTCCTAGTTTTTGTCTGGGTGACCTGTCAATCAGT
GAGAGTGAAGTATTCAAGTCTTCAACCATTAGTGTGTGGGGTTCAGCGTA
TGATTTAAGCTTTAGTAATGTTTCCTTTAATATGTGGGTGCACTTTTTGT
GGGCTAGATGTTCAGAATTGAGACATTATCTTGGTGGATTTTTCTTTTGA
TCAGTACAACATGTCCTTTCTCATGTCTTATGATTAATTTTGCTTGCAAG
TCTATTTTGTTGGGCATTTGAATGGCTACACGACCTTGTTTCTTGCGTCC
ATTTGCTTGCAAACTATTTTTTCAACCTTTTACTCTGCAGTATTGTGTAT
TCTGATGTTGAAGTATGTTTCTTGTATGAAACACTCTTGATTATTCTCGG
GCTGGTTACTGCTTTCAACTCTCTTTTTGTTATCCTCCGTCTTTTTTATT
TGAAACATTTGATTCTATTGATATTTGTAACTTTGATCTCCTTCTTGTAT
TTCTATTACTTGTCCTTTTTTTCTATATTTTATTTCTTCCTTTCTTATTT
TCTTTTTTCTTCTTATTTCTTTTTCTTGTTTCATTCTCTCTTGCTATTTT
CCTTATCTCTATTTTTAAGTTCCTTATATTTAATCCTCGTTTTATATCTA
ACTTCCTTTTTTCTTTATCTCCTATTTTTTTTTACATCTTTATTTATTTC
TTTCTCTTTTGCATATCTGTATTTTTTTATATTTTATTTTTTATTTTATT
TTTTTCTTATTATATCTTCTTTTTTTGTCCATCTACTATATCTTCTTATC
TCTTTTTTATTAGATAATATTCTCTTCTCCTTTATTTAATTACTTCTCTC
TTCTTACTCTCTTTCTCTCTCTTTTC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 9 3 0 0 0 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 19 19 9 8 8 10 10 10 22 19 29 28 20 24 24 28 30 33 37
37 37 41 39 39 39 37 32 32 37 37 37 37 37 37 41 41 53 53 53 53 50 48 41 25 22 11 10 9 8 8 8 8 9 12 16 28 27 37 33 28 28 35 35 35 35 38 57 53 43
43 43 43 42 42 57 57 57 47 47 41 44 39 41 37 37 18 11 8 8 8 10 15 34 41 43 46 46 48 48 48 48 59 47 33 33 28 25 22 29 30 33 43 48 57 57 48 48 48 48
48 47 57 48 48 47 57 57 68 68 50 50 54 54 54 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 59 59 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 43 43 39 57 57 57 57 57 43 43 35 43 43 62 62 62 62 39 39 39
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 39
39 39 62 62 62 52 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 44 44 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 39 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 52
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 43 43 62 62 62 43 43 33 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 45 45 52 62 62 62 62 62 62 52 62 62 52 52 52 62
62 62 62 62 62 62 62 35 43 43 43 43 62 62 62 62 62 45 45 45 62 62 68 62 62 62 52 52 62 52 62 62 62 57 57 57 57 43 43 26 26 26 44 44 68 59 59 57 52 52
57 57 57 57 57 57 57 44 44 24 32 20 32 38 44 57 44 44 39 39 39 57 57 57 57 59 59 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 54 54 57 57 57 57 37
43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 37 37 43 59 59 59 59 57 57 44 57 57 57 57 57 57 57 59 59 42 42 44 59 59 59 59 57 54 46 42 39 39 37 37 40 40 37 37
37 47 59 59 44 43 43 43 47 59 43 43 43 40 40 43 43 33 37 33 37 28 43 43 59 59 59 59 48 48 42 43 35 36 36 40 39 42 23 23 11 11 11 15 23 30 48 48 47 42
41 41 37 37 27 21 15 15 13 25 22 36 36 37 39 43 43 48 48 48 48 57 57 57 43 37 24 24 17 26 27 43 43 48 57 59 59 59 43 43 43 59 41 43 25 25 25 36 36 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 41 41 41 36 36 44 43 43 43 43 43 43 34 37 37 37 21 21 19 17 17 15 15 23 21 28 22 22 22 25 31 22 23 9 9 9 23
26 29 27 11 11 11 27 23 3 0 3 16 21 22 23 27 28 37 27 25 22 22 20 23 23 25 26 30 26 22 22 20 24 29 39 39 41 41 41 39 39 26 23 27 25 25 18 15 22 25
30 30 41 41 40 34 34 28 22 15 17 18 19 22 26 24 24 20 15 8 8 8 8 13 11 24 28 12 8 8 8 10 10 10 32 36 35 28 24 16 16 12 10 9 13 9 10 11 11 18
23 37 29 29 20 20 22 22 11 12 12 8 8 8 8 8 13 13 21 21 14 10 8 8 8 9 12 8 8 9 9 9 13 15 19 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9
10 10 10 8 10 14 9 8 9 8 8 8 8 8 8 9 11 16 9 9 15 15 8 8 6 6 8 8 10 10 11 15 23 16 14 14 12 10 10 8 8 9 9 10 12 17 16 18 18 12
10 8 8 8 9 8 9 9 10 10 11 9 12 12 9 9 10 11 9 7 8 15 16 22 17 18 17 11 11 11 11 11 11 11 11 10 10 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11
11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 14 15 13 9 8 8 8 8 10 15 10 10 10 10 7 7 6 9 9 9 9 8 8 10 10 10 9 10 13 10 10 9 9 10 8
8 8 10 10 15 13 10 8 8 8 11 11 12 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 9 10 10 10 10 8 8 8 8 12 10 15 10 8 8 8 8 8 10 10 9 10 9 13 10 10 10
10 12 10 10 12 22 19 18 10 10 10 10 10 10 12 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 6 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 7 9 8 10 10 10 8 10 11 6 6 6 8 9 11 12 12 10 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 9 9 11 12 8 8 6 6 6 8
8 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 7 7 6 6 6 8 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 13 9 7 9 9 12 9 15 15 15 8 9 13 20 23 33 36 36 36 50 36 36 36 36 36 36 37
34 38 38 50 57 50 59 59 59 59 59 47 41 27 23 11 9 9 10 10 11 14 16 15 18 15 15 18 27 31 37 37 48 53 53 53 42 42 43 53 50 50 50 53 53 53 53 53 53 53
68 68 68 68 54 54 42 42 33 33 24 40 32 50 47 47 47 47 46 39 37 26 29 21 21 19 15 32 32 50 50 57 57 50 50 68 68 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 38 38 19 19 17 33 33 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 52 62 52 62 62 62
68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 39 39 11 9 9 39 39 62 62 62 68 68 62 62 68 62 62 62 62 43 43 26
38 26 26 26 43 43 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 35 35 24 38 18 20 43 43 62 62 62 62 62 52 52 62 43 41 34 23 23 20 27 27
44 44 57 57 57 43 43 20 20 20 38 28 32 12 12 12 15 15 20 34 38 13 10 10 10 10 23 28 59 59 59 44 44 33 24 18 38 38 52 57 57 54 54 57 59 59 59 59 57 38
27 12 9 9 12 27 24 35 43 44 50 41 32 17 17 32 36 32 32 32 38 43 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 43 43 23 23 28 44 44 59 59 59 68 68 68 68 68 57 32 32
12 12 11 27 16 24 17 17 17 41 35 25 25 28 44 44 57 68 68 68 68 68 57 68 68 44 44 37 37 35 44 44 25 23 23 35 35 68 68 35 35 15 15 15 32 24 21 23 32 32
57 50 50 50 50 39 32 32 20 18 30 30 13 10 10 8 13 15 19 21 17 30 32 37 37 41 39 41 24 15 15 9 9 12 22 22 32 28 30 25 28 28 21 17 9 8 8 15 10 12
16 32 25 22 11 11 9 21 10 10 10 13 9 9 10 22 30 41 59 59 47 37 23 23 16 12 12 12 19 21 30 39 37 33 22 22 11 10 10 10 10 12 22 29 28 19 23 11 11 13
11 12 12 23 22 36 33 33 33 28 21 19 11 11 12 22 20 18 18 18 23 21 22 11 12 15 19 30 26 17 10 10 10 8 8 8 9 19 16 17 14 12 12 10 8 8 8 8 8 8
8 9 9 9 10 13 15 13 10 8 8 6 8 8 13 8 8 8 8 10 8 8 11 17 12 12 10 10 10 10 9 10 10 10 10 10 11 11 9 9 10 13 13 15 15 24 16 20 15 9
10 10 8 8 8 8 8 11 12 10 10 8 8 8 12 8 10 10 11 12 13 9 10 8 13 7 6 8 8 8 10 12 12 8 11 11 15 13 10 9 12 8 8 6 6 8 6 6 10 8
10 7 7 7 6 6 8 6 6 10 8 10 10 9 8 9 10 10 9 9 8 15 14 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 8 8 10 8 9 9 10
10 7 6 8 8 10 15 11 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 10 15 19 16 10 10 10 10 10 10 8 8 8 7 8 6 8 8 8 8 8 7 6 6 6 8 6 6 8 8 13 8
8 6 7 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 16 12 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 7 7 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 10 10 13 8 8 9 9 11 8 6 6 6
8 8 9 10 8 7 7 7 7 9 13 14 14 19 11 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 12 13 8 8 6 6 8 6 6 7 8 16 16 10 10 11 10 8 8 7
8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 8 8 8 13 12 8 8 8 8 8 11 14 18 13 11 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 6 7 12 8 11 6 6 8 8
10 10 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 9 7 8 8 8 8 8 13 15 15 23 14 15 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 7 6 6 6 8 12 10 8 8 8 8 9 8 8
10 12 12 10 10 13 13 12 12 11 10 11 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 11 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8
8 8 7 7 6 6 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 |
|---|
