| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-124E05.T7 (MSMg01no124_e05.b1) | MSMg01-124E05.TJ (MSMg01no124_e05.g1) |
|---|
| ACC | AG333661 | AG333662 |
|---|
| length | 1,260 | 1,279 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 640 (71 - 710) | 339 (120 - 458) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_e05.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_e05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_e05.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_e05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:08 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | TATGCGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTACCCA
TTTTCTTCCATCCTTTAAAATTATGCTTATATCTAAATCACACAAAGACA
CCCCTTAGAAAGAGAACTTCAGACCAGTTTCCCTTATGAATATTGATGCA
AAAATACTCAATAAAATTCTCATAAACCAAATCCAAGACCACATAAAAAC
AATCATCCAACATGATCAAGTAGGATTCATACAAGTCATGCAAGGATGGT
TCAATATGTTGAAATCCATCAACATAATCCACTATGTAAACAAACTCAAA
GGAAAAAAGGCACATGATCATCTCAGTAGATGTTGAGAAAGCATTTGGTA
AAATTCAACACCCCTTCATGATAAAAGTTTTAGAAATATCAGGAATTCAA
CTCTCATACCTAATCATAGTAAAAGTAATATACACCAAATCAGTAGCCAA
CATCAAACTAAATGGAGAGAAACCTGAAGCAATCCCACTAAAATCAGGGA
CTAGACATGGCTGCCCACTCACTCCCTCCCTATTTAATATAGTACTTGAA
GTCCTAGCTCAACCAATTAGTCAACAAAAGGATTTTAGTGGGATCGCTTC
AGAGGTAACCCAGTACCAAAAGAACACACATGGTATGTACTCACTGATAA
GTGGATCTTTGCCAAAAAGCTTGAAATTCCTATGATGCAACTCACAGAAT
ATAGACCCAAGAAGGAAGACCACAGTGCAGATGCTTCAGTCCTACTCAGA
AGGGGGTGGAAAATAATCTCACGAGGTAGAGGGAGGGAGGATCCGGATGG
AGAGAAGAAGGAAAGTGGAAGGTTCTCCTTTATCCTTCCTTGTCTCCTAT
TATATTTTCTTTCTCCTTCTCTCCTTAATCTCTCCTTCTCTCTCTCTTTT
TTCTTTCTAATTCTCATTCCCCTTTCTTTTTTCTTCTCTCTACTCTTTTC
CTTCTCTCACATTCTTCCTTCTCTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTCCTCATC
CTATTTTCTCTTAATCATTTTCTTCATCTTTTTCCTTTATTCATTTTTTT
CTTACTTTTCCTATAACTATTCCTCTCTTTTTCTCCCTTTATCCTATATT
TTACTCTCATTCTCATTCTCTCCTTATATTTTCTTTCTCTTGTCTCTTAT
CTAAGTCTTCTTCATTTCATCTTGTCCTTTTCTCATTTCTGTTCTCTCAT
CTTTTCCTTTCAATCTATTTCCCTTATATCTCTCTCCTCATCTCTTCTTT
TCTCTCCTTT
| CCTTCTTAAACATTGGTAGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTCTTAGAGTAAGTTTGGAAGAGGTTAGAC
ATTTCAGCCATCCTTTACACACACACACACACAAAAGTAATTAGCGGACT
CACACATCTCTGAATCCCTGAAAGTTTTGTCTTTCTTTCCTTTTCTAACT
ACACATGAACATTTTTCTTTAATATATTAATGTCATTCTGTAAGAAATGG
CATTTTCAATGGATTTTCAAGAATAACTCGAAAGCCTTTTCATTCATCCC
CCAAATCATACCACACTGGTGTCTTTAGCCTAGACAAAGCCTGAACCTTC
ATGGCATGGCAATGCAAATCTTTAATCCCAGTACTAGGGAGTGAGAGGCA
GACTGGTCTCTGTGAATTCAAGGACAGCCTGTTTTACATAAAGAATTCCA
CTAAATTCTTTCACCCCCACTGAGACCTTCTATCACAAAATGAAAAGAAA
TGAAATGAAATGAAATGAAATGAAATGAAATGAAATGAAATGAAATGAAA
TGAAATAATGAAATAACTTTCAGTGTTTACAACATATCATCATCACAGTA
CAGTATGGGCCAATAAACCTGCACATGTTTTTATCACTGATCTCCAAGGA
AAATAACATTCCTTGGGGGATGGCACTTATGCATATCTCTGAGTCTCTGC
TGAATGTAGAAAGTCATTTTCATGATGTTCCTTCTAGAAAACAATGCATG
CATCTGAGAATTAAATACCCCCTTCACACAGGCTTAACATTATGATGAAT
AAATGGGCTCTGATTCAAATGTAAGGAGGACTCTCAGTCTTTCATTTATT
CTCAGAACATTCACTTCACAAGACTGTCCCATCTAAAAATAAAACAGCCT
CTTTCCTGTTACTGAACTGTAGAAAAACAGGTTAGTTTTCTTATTGACCC
AATTCTTGGTTAACGTTACTCTATTCATATCCAAATTTCCTTTGGGCCAG
TGTCTGCTCTTAACATCCATTTCTTTAAAAATCTCCCAACTTCCTTTATT
CCAATTTTCAATTAAAAAAAGAGGCCCTTGATGGTTTTAACTTTAATCTT
TCCACTCAAAAACCCTTTTCTGGGGATTACATACTAAAGGTAATTTCCCT
CCACCTATCTCTCATTTTTCCAATATAAATAAATTCCTCCATCCTTATAT
GAATCCATTCTCATTTATTGGCATAACCTACTTGTCTCTCTAATAGTCTG
GGNGTACCTCCTCTCTTCTCATTCTATTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 9 10 22 29 22 19 12 10 9 9 10 13 10 10 10 21 21 40 40 47 42 48 47 48 48 48 48 42 42 42 48 43 57 57 47 47 47 43 57 57 57 57 53 50 36 36
36 31 50 50 50 59 25 21 15 8 8 7 13 8 9 8 8 8 8 9 12 24 26 36 41 41 41 36 36 36 36 38 38 42 43 42 53 57 57 57 59 59 59 59 42 42 42 39 30 30
14 17 18 17 14 14 12 18 18 34 34 47 39 37 36 37 37 39 47 47 48 57 57 50 50 50 50 50 50 48 48 48 43 43 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54
54 54 57 57 54 54 57 57 57 47 47 47 57 57 68 57 57 57 57 57 47 50 50 51 51 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57
57 57 57 54 54 52 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 54 57
59 59 57 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 47 42 35 42 42 59 59 57 59 59 59 57 59 48 48 48 59 57 57 57 57 59 59 59 48 48 48 59
57 57 59 59 59 48 43 43 43 48 48 57 59 59 59 48 48 48 48 48 48 50 53 57 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 41 34 34 34 23 25 18 12 12 12
15 23 32 37 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 47 43 39 43 43 43 48 59 59 59 59 43 43 43 59 59 54 54 54 57 57 59 59 59 59 59 43 37 37 35 35 27 32 30 37
41 59 42 43 43 57 57 44 47 47 47 47 57 57 57 54 54 54 44 44 54 54 54 57 57 57 46 46 44 47 43 43 43 57 50 48 48 59 50 50 48 48 48 57 59 47 47 35 35 35
43 43 43 43 52 52 57 57 57 54 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 57 68 44 44 37
35 35 59 44 47 43 46 46 44 46 43 57 57 57 59 59 44 44 23 23 23 36 36 39 43 43 43 43 46 46 54 48 48 54 47 47 43 43 48 43 43 36 37 42 39 48 48 43 43 40
35 35 35 37 37 37 37 39 39 37 37 30 33 33 37 37 36 36 36 36 36 33 29 28 32 32 37 37 41 39 39 37 36 43 43 39 39 39 36 39 28 28 14 14 21 34 40 42 48 43
43 43 43 39 37 40 37 42 42 42 36 36 34 34 43 43 43 43 43 46 48 48 48 48 43 43 37 42 32 32 35 39 34 43 48 43 43 32 28 20 20 31 24 24 24 22 18 14 18 18
19 22 24 24 32 32 32 23 23 15 15 12 14 14 18 30 28 17 13 16 10 10 8 10 10 22 23 19 11 11 12 23 28 39 39 25 19 10 10 10 10 19 23 32 28 22 19 11 11 11
14 15 18 20 23 23 28 23 23 20 31 31 30 30 37 37 28 16 16 11 11 10 18 17 17 14 18 11 10 10 16 15 14 14 18 15 15 13 18 11 11 11 9 9 11 12 12 28 15 19
20 19 19 19 14 10 10 11 13 13 11 11 10 12 9 8 8 8 8 8 8 7 7 10 8 8 8 6 6 8 8 10 9 10 10 8 8 8 6 8 6 6 9 12 12 8 8 6 6 8
8 12 11 11 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 8 8 8 9 10 15 10 10 9 9 9 8 11 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9
8 8 6 6 10 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 7 7 8 10 11 10 9 10
10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 9 9 8 8 7 7 8 10 15 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 8 8 6 6 8 8
8 8 10 10 11 10 10 10 10 12 13 10 10 10 11 12 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 6 10 6 6 8 8 10 10 9 9 10
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 7 7 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 10 10 10 10 10 14 12 10 10 10 11 11 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 11
12 12 12 13 10 10 13 10 9 9 9 13 10 13 10 9 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 10 12 13 15 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8
8 8 8 9 9 9 9 8 8 6 9 7 6 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 7 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8
8 10 10 11 10 10 10 8 11 12 10 8 8 8 13 6 7 8 7 11 10 10 8 8 8 8 9 6 10 12 15 15 10 10 8 8 8 8 8 8 12 16 14 16 15 14 12 14 12 10
12 10 8 8 6 7 8 6 6 6 | Open.Hide. 8 8 19 21 15 15 8 8 8 6 6 6 7 7 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 12 14 12 13 7 7 9 3 0 3 8 8 13 8 8 10 19 19 30 29 29 32 21 21 12 12
14 26 21 36 33 33 36 43 43 50 50 50 50 50 47 34 27 17 9 13 12 12 11 8 8 8 6 8 8 12 13 14 14 14 26 27 33 36 36 50 50 50 48 47 47 47 47 47 47 48
48 50 50 42 50 42 47 21 19 10 8 8 8 10 13 12 11 11 11 18 18 28 32 35 39 39 43 44 50 50 57 57 59 59 57 43 43 43 43 43 47 47 42 47 47 43 43 42 48 48
47 47 48 48 48 48 48 48 48 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 44 44 37 35 35 35 35 44 44 57 57 57 57 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 57 57 59 59 59 59 57 57 52 43 43 43 43 52 57 57
57 57 57 44 57 43 39 39 43 43 57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 43 57 52 57 52 52 52 52 59 59 57 57 57 57 54 57 54 54 54 57 59 57
57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 57 44 54 54 57 57 57 57 47 47 39 36 40 28 28 32 40 42 42 42 37 37 37 44 44 54 57 57 57 57 57 43
43 39 42 39 43 43 47 43 37 36 25 25 25 32 42 42 54 54 59 57 57 48 48 48 57 57 57 48 43 43 37 37 28 37 37 37 37 43 41 40 43 43 43 48 39 39 37 31 28 18
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 17 23 39 46 46 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 43 43 43 36 36 43 43 59 59 59 59 59 59 59 39 36 36 43 43 47 47 40 39
39 32 21 15 11 8 6 6 6 8 8 10 10 12 12 18 16 13 10 9 10 10 18 25 39 40 40 41 43 48 48 39 39 28 28 25 28 28 26 24 18 23 21 27 13 14 12 22 18 20
18 15 21 18 28 28 39 47 43 43 41 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 39 39 39 39 39 35 35 35 37 29 28 28 29 31 36 25 25 30 30 28 23 23 23 31 32 23 23
23 23 28 28 36 32 42 37 43 43 57 57 48 48 48 48 44 47 42 42 42 33 42 42 46 46 43 42 42 35 35 35 42 36 42 35 35 35 43 42 43 43 47 43 47 41 41 41 42 41
32 30 17 17 17 32 30 18 16 11 11 11 16 16 28 21 33 33 33 33 30 21 23 13 15 15 23 23 42 43 43 48 34 32 22 22 22 24 28 25 25 18 16 13 11 11 21 23 37 31
28 25 28 15 11 6 6 6 10 15 32 35 28 28 21 20 18 15 12 12 12 15 19 21 32 37 33 39 37 37 32 24 23 20 24 21 30 19 15 13 17 11 11 11 18 21 32 32 20 20
20 32 32 42 30 18 18 15 10 10 20 23 30 28 22 22 22 15 9 9 9 14 19 34 22 18 9 9 9 9 11 18 12 11 11 11 11 11 21 13 10 8 8 8 8 9 10 8 8 7
7 10 10 19 9 10 10 8 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 19 24 24 18 13 13 12 11 11 13 13 13 10 10 8 8 8 9 10 9 14 11 15 8 8 8 10 13 10 11
8 8 6 6 6 8 8 9 10 13 10 10 11 11 11 11 10 10 8 8 8 8 8 10 13 21 16 16 13 11 21 19 14 13 13 13 15 16 21 16 16 11 11 9 9 10 10 8 8 8
6 6 8 8 8 8 12 12 9 8 9 10 10 10 10 10 10 8 8 10 8 16 11 18 18 17 16 10 8 8 8 8 10 10 10 8 9 11 13 11 13 13 9 8 8 8 8 9 9 10
10 8 8 6 6 10 11 10 10 8 8 8 10 12 9 13 15 17 10 10 9 7 6 8 6 6 7 8 10 9 14 13 13 9 9 10 10 8 8 8 8 8 9 8 12 9 9 9 11 8
8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 6 8 7 7 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 10 9 9 8 7 10 10 10 10 11 13 8 8
8 13 8 8 9 9 9 11 14 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 9 8 8 8 8 8 11 11 14 16 14 12 13 8 8 8 9 10 15 8 8 6 6 8
8 9 9 9 9 15 17 18 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 9 10 8 8 15 8 6 6 8 8 12 15 16 24 19 15 12 11 11 18 10 8 8 8 8 8
12 10 10 10 14 15 14 12 12 12 14 10 10 12 12 12 14 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 8 8 8 8 8 8 10 9 12 11 10 10 8
8 6 6 8 8 8 10 6 6 8 6 8 8 8 8 10 19 22 19 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 10 11 11 11 9 9
6 8 8 8 9 9 9 10 8 8 8 8 6 6 8 17 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 9 7 8 6 6 8 6 8 8 8 10 11 13 12 8 8 9 8 8 11 11 10 8 9
9 3 0 3 15 12 9 8 6 10 8 9 10 13 19 10 10 10 6 7 6 6 10 15 8 8 8 13 8 |
|---|
