BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-141C12.T7 (MSMg01no141_c12.b1) | MSMg01-141C12.TJ (MSMg01no141_c12.g1) |
ACC | AG346106 | AG346107 |
length | 1,442 | 1,245 |
length of high quality (start - end) | 241 (78 - 318) | 661 (128 - 788) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_c12.b1 PHD_FILE: MSMg01no141_c12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:59:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_c12.g1 PHD_FILE: MSMg01no141_c12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:59:14 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNTTAACATTGGGCGCTATAGACTACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
AGGGCTTTGCAATGTGCGCTATAAGGTTTATTGTTGAGCTATCTCTGTAA
AATCCATTCCGTATATTGGTGAATCAACCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCC
CTCTCTCCCTCTATCCTCTCTCCCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTC
TCCTCCCCCAGCCCTCCCTGCCCCCAACCCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTATTGTAGTAGGGGCTCTTTTTTTTGCGATAATCGTACTTTTCAC
TATTATATTTTTTTTATATATTATCTTCTTTTCTATTCTATCTTCTTTTT
TTTTTTTTAACTAGACATGATTTACTTATTTTTTTCTTGATAAAATCCCC
CCCTTTATTTAACCCCCCTCCTAATTTAATATATTATTTTGTATTTATAT
AATATTAATTTATCTTTTTTTTTTCTAATTATTTTAGTTATTATTATTTT
CTACTTTTTTTATAAATATACTTTAAACTCTATTTATTAGTAATATATAA
TTCTTTATTATTTTTCTTCTTTTACTTAATTTTAATTATCTCTTAATATA
TATTTAATATTTATTACTCTTTATTTACTCGTTATTATTAATTATAATCA
TTCTTATTATCTATTTTTTATATAATATTTCTATCATATTTATTTCTCTC
TTTAGTATTTTTTCCATCTTTACTTTATAATATATTCTTTAATACTTATT
TCTTTTTTTTAACAAATCTTTTTCTTATTTCACAATTTATTCTATTTTTT
CTAACCCTATATTACTTATTTCTATTTTTATTTTTTTTAAATACACAGTT
TATTGTTAAATTATTATTATTATATAAATACTTTTTATATTTACATTATT
ACTATGTTATTACCTTCATTCCTTAAAATCTATTTCTATTTATCTATATT
TTATTCTTTCTGTTTGGTATAACTCGTATTACTTATATTTTTTTTCGTTT
ATAATTATTATTTTTTATTTTTTATATATTTTATTTATGATTATTATTAA
CTTCTTTCTTAATTTTTTTTTATATTTCTATTATTTTTTATCTATTATCT
CTTTATTTTATCTATATATAACTTAAGACATTATGTTATATCTAGTATTT
TTTTATCTTTTTATTTTGGTTCATTTTTTTTTTCTTCTTTATTTTGTTAA
TATATTTTAATACTCTTATTATATACTATTTGTTACATCCTATATTATTT
AATAACTATATAGACTCTTTATTTTTTCTTTTTTCTTATTTTAATAATTA
TCTATAATCAATTTATAGAACTCTATTTTATCCTATTCTTATATATCTAT
ATATTACTCATTTATATACTCATTCATTGATCATTCTATCCA
| NCCGGATCTTTTTNNACAGCATGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTAAATTACCTACTGACA
CTGTCAGACATCTAAGGAAACCCTTTACATGGCATTTTAAACCGCAATTA
GTCAGTTCTCTGCAACAGTTACTTTAAGGAAGAAGTGAAAGAAGACACAG
AACTTTTCAGAAAAAAAACATTACTGTGGGGCTAAGGAAGTGTCAGGGGT
TGCTATACCTTTTGCGGGGGGTGCCTCCGCTTTCTTAGGTACAGGAGTGG
GAGCTTCGGGTACTGCTTTCTTCACCACTTCAGGTGCTTAAAAGATATTT
TATGGACATGTTGACAAAAGTCACATGCAATGAACAGAACAACACCCCAT
TTACAAACTATAATTTTAGCAACACAAAACACTGATTTAGGAAGATGTTA
GCAACCTAAGTGATAAGAATCGCACCCCCAAAGGAGTGTCACCCCCAAAG
GAGTGTCACAGCAGCTCTGCCAAGATTTCAGTCTTCAGGGATACACGGTT
TAAGAATTATTCTTAAAAGCGAATGCTTTCATCACACACATAGATTGTTC
TCCAGCATTTGAACTGAAATCAAAATTGAGGACTGCAAACTAGGGGGAAG
GATTTAGTAACAGAAAATTGATAGTCAGATTGCAGGGAAGGAGGAAAAAC
TGGGGAGAAAGAAAGGCCCACAAAGCTTCAGCTACCAGGAGTGTGCACTC
TCCAGGCCTCATGGCTGTGCTAGCAGGAAAGTATATGGCTGAAGATTAGG
GCTAGACAGTTCTGAGCACCAAGGTTTTGGTGTGTCCAACTCATCAAAAT
GGCTGTACCTCTAGGTGGNAGAACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCT
CCAATATCTCTTCTTCCTCTATGCTAAGGGGGCTCTTCTGGAATCTCTTC
TGAAGTGGGTTCTTCAGCCCTCTCATAAACTTGAAACAAAATATTTTTGT
AAATTATTTTTTTAAGTCCCCTGAATGTTAGATAGGTTAAAATAAAATTA
CCCCCTTTTGTGAAAAAACCCCCCGCTCTTTAAGGGGTCCGGAACCCTTT
TTATTTCTAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCCGCCCTTTAAAAAATTCCCCA
GGGTTAAACGGGGAAGGGGCCCCCAAAAAAAAAAATTGTGAAATATTATT
TTTTATTAGGAAGTGGGGAAAAATTTTTTTTATCAATATTATTCT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 7 7 7 8 9 13 10 10 15 11 8 8 8 8 8 10 8 9 9 8 8 8 8 8 22 22 30 28 33 33 33 33 36 36 38 38 36 53 53 43 43 43 37 42 37
36 35 35 57 57 36 36 41 41 37 37 33 22 21 10 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 11 13 21 26 36 28 30 39 48 48 53 53 38 38 42 42 42 42 53 53 38 38 36 36 33
44 59 59 46 33 23 15 8 8 8 8 9 9 15 15 28 21 28 28 34 41 46 59 59 59 35 30 24 20 24 22 25 25 29 30 31 31 31 36 36 38 38 42 53 53 53 53 53 50 50
50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 47 47 47 41 41 42 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 32 27 12 11 11 27 24 35 35 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 43 39 39 43 43 57 57 57 54 54 52 57 52 47 47 50 50
50 50 50 48 47 47 47 47 43 43 35 33 33 36 40 37 37 37 39 35 35 35 42 42 43 43 35 32 33 30 30 37 37 40 39 44 44 43 43 30 30 23 19 19 17 17 19 19 28 36
30 24 17 17 17 19 32 32 57 43 39 34 30 25 20 24 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 9 12 18 10 9 9 12 10 8 10 8 8 8 8 8 6 7 8 8 10 8 8 8 8
8 7 7 8 8 8 6 6 6 8 11 10 12 15 11 11 11 15 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 12 10 8 8 8 8 10 9 7 10 6 6 8 8 11 9 10 9 8 9 9
11 18 30 47 30 24 12 10 8 8 6 6 8 8 8 7 7 10 12 8 8 10 8 8 8 8 8 9 9 10 12 12 8 10 8 8 8 8 10 10 10 8 8 9 11 9 11 11 17 21
14 10 9 9 8 8 8 8 10 10 20 18 18 11 12 14 9 9 9 9 9 10 10 13 13 11 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 9 10 11 9 9 9 10 12 11 10 8 8 6 6
8 8 8 10 10 6 6 6 6 8 8 9 9 10 10 10 12 10 9 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 10 10 8 9 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 12 11 11 7
6 8 8 8 10 13 16 28 23 23 10 8 8 8 8 8 7 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 11 16 10 8 7 7 7 7 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 6 6 10 7 6 8 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 10 10 10 12 12 10 8 8 8 10 8
8 6 6 8 8 10 15 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 7 7 8 8 8 9 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 7 8 7 11 8 10 10 15 8 10 6 6 8 8
8 10 10 8 8 8 10 8 10 8 10 12 12 8 8 8 8 8 8 10 10 7 7 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 10 13 13 13 8
8 8 8 8 8 13 19 12 13 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 7 8 8 8 6 8 8 8 10 8 9 9 9 9 9 9 9 12 13 8 8 6 7 8 8 11 11 16 8 10 9
6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 9 9 8 8 8 8 10 10 11 10 10 8 8 8 8 8 13 7 6 8 8 10 12 12 9 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10
10 10 10 9 11 11 18 16 18 8 8 8 8 8 8 8 12 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 10 11 11 9 9 9 9 9 9 10 9 9 8 10 6 6 8
8 9 10 10 9 8 9 10 9 8 8 15 10 8 8 7 7 10 11 10 10 9 10 10 9 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 9 9 9 8 10 8 8 8 8 11 11 11 10 10 8
11 10 8 10 10 12 14 10 8 8 8 6 6 10 6 6 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 12 13 8 10 9 10 10 8 8 8 8 12 9 9 9 10 10 9 9 9 9 9
9 10 13 16 26 14 12 11 13 13 11 11 11 11 11 11 13 15 10 10 9 8 8 8 8 8 8 19 15 15 10 11 8 8 8 8 11 8 6 6 6 8 6 6 8 8 9 8 8 7
7 6 8 8 12 10 8 6 6 8 8 8 10 8 8 16 15 12 16 12 9 10 8 8 8 8 8 8 8 12 13 8 7 7 8 8 8 8 10 12 8 8 10 19 13 10 10 10 10 10
10 10 10 10 10 10 9 11 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 6 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 11 15 12 11 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 12
12 8 12 8 8 8 8 11 12 10 10 8 8 8 8 9 9 9 8 8 7 6 8 8 13 14 23 14 14 14 18 11 12 9 9 9 9 12 12 12 15 11 11 9 8 8 8 8 8 8
8 8 10 12 12 14 14 10 12 8 8 8 8 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 15 12 12 10 8 8
7 11 8 7 7 8 9 12 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 15 12 14 14 15 12 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 8 8 6 6 8 6
6 6 6 6 8 6 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 6 8 10 9 9 8 8 8 12 10 9 9 15 15 19 10 10 10 10 10 10 6 6
8 10 11 10 11 10 8 8 6 7 10 12 10 10 8 10 10 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 6 6 6 11 8 8 8 8 8 7 7 8 8 6 | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 8 8 8 10 19 25 3 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 8 6 6 6 6 8 10 13 8 8 9 8 11 9 16 19 20 22 24 26 29 24 20
21 15 16 21 26 28 35 37 36 36 36 28 28 35 35 36 53 53 50 50 50 50 47 41 27 23 11 9 9 9 14 9 8 8 8 7 8 10 10 14 14 19 22 26 29 29 35 35 36 36
35 35 35 42 35 50 57 57 53 36 36 31 31 31 31 37 37 21 17 11 9 9 9 10 10 13 15 17 19 32 29 36 36 43 39 33 28 25 15 11 11 9 8 8 8 8 22 22 33 33
33 33 50 50 50 53 57 57 57 57 57 57 57 59 59 50 53 47 47 47 47 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57
57 59 59 59 57 57 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 59 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59
59 59 59 59 68 68 59 59 57 68 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 59 54 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 54 50 50 50 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
57 57 57 57 53 48 59 59 59 59 24 20 12 8 8 8 9 9 9 19 21 32 41 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68
68 68 59 57 57 57 57 48 43 43 37 37 43 42 44 48 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 59 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 54 57 57 59 59 68 68 68 57 54 54 68
68 68 68 50 53 57 57 57 57 57 50 50 50 57 53 48 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48 48 47 47 47 47 59 59 44 41 37 44 44 37 37 37 37 37 41 48 48 48 48 48
43 37 43 37 37 37 37 41 41 41 44 37 31 31 37 37 31 37 39 44 44 41 41 44 44 44 47 47 50 50 59 48 48 48 57 50 48 57 43 43 43 43 36 36 36 43 32 37 37 37
39 39 39 41 39 39 41 37 41 39 37 32 29 30 32 37 37 39 41 41 43 43 44 44 37 31 31 37 39 39 47 46 41 41 41 25 19 10 10 10 23 24 22 16 10 8 8 8 8 11
28 35 41 41 41 46 46 40 40 40 39 39 32 32 18 18 20 23 14 17 19 19 17 24 37 43 28 27 24 23 28 20 19 18 18 16 15 15 16 24 22 22 12 11 10 23 19 18 15 10
9 9 10 9 10 9 11 13 17 27 28 25 23 25 18 12 12 3 0 3 10 8 9 10 13 19 28 16 15 14 14 14 14 22 34 34 39 39 37 30 19 13 13 14 13 12 21 21 26 24
14 14 9 9 9 9 13 17 19 25 27 27 15 9 8 8 8 10 8 9 9 10 9 9 9 9 10 12 12 13 12 9 8 8 10 13 13 8 8 8 10 14 15 15 15 17 16 18 19 13
13 8 8 8 6 8 6 10 10 8 10 12 11 11 9 10 9 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 15 28 21 18 21 20 10 9 9 9 9 10 16 16 15 19 9 7 6 6
6 7 10 9 9 10 10 11 11 10 21 13 10 10 8 8 8 8 9 8 10 10 9 10 9 10 10 10 10 10 12 9 11 11 11 11 8 8 8 8 12 8 8 11 11 23 19 23 23 23
20 20 21 12 10 10 9 8 8 6 6 7 6 9 11 21 13 8 8 8 10 8 9 8 6 6 6 6 6 8 12 15 12 12 14 9 10 9 9 7 7 6 8 8 8 10 10 15 24 22
17 8 8 8 12 9 9 9 9 9 21 28 37 39 39 39 39 19 18 11 9 18 15 10 8 8 8 8 13 6 6 6 10 12 8 8 8 8 9 9 20 14 10 9 9 18 15 9 9 9
7 8 6 6 6 6 11 9 10 10 7 7 6 6 6 6 15 10 15 20 25 27 32 20 9 9 9 9 12 12 18 18 12 11 6 6 8 6 7 6 8 11 14 14 6 6 6 6 10 11
30 21 17 7 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 9 7 8 6 6 6 6 10 14 15 15 11 9 8 8 6 10 6 6 8 8 8 8 6 7 6 6 6 6 6 6 |