BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-144O01.T7 (MSMg01no144_o01.b1) | MSMg01-144O01.TJ (MSMg01no144_o01.g1) |
ACC | AG348826 | AG348827 |
length | 763 | 735 |
length of high quality (start - end) | 346 (68 - 413) | 314 (76 - 389) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no144_o01.b1 PHD_FILE: MSMg01no144_o01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:05:49 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no144_o01.g1 PHD_FILE: MSMg01no144_o01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:05:49 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCGAAGAATCCGCGG
AATTCCAGGCCATTCCCCAATGATCTAAAACAGCCAGGATATATATAGTT
AGACCTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAATCAAAAATAAATAAATAATACAAA
CAGGGTTTTACTATGTAGCCCTGTGTGGCTTAAAACTTACTCTGTAGACC
AGGTTGTCCTTGAACTCACATAAATCCACCCACCTTCGCCTCCAGAGCTG
GACTACCGACCTTTATCACATAAAGGTTGACATAACTTTGTCTGCTTTTT
ATTTGAGCCGGGGCTTCAAGTATCTTAAGGTGTCCTTGGCTCTTTGTGTG
GCAAAGGATAAACTACTGATGCCCCTGGCTCTGTCTCAAGTGCTGAGATT
ATAGCTATGTGCCACCACCCCCGGCTTTACTGTCTCTGCCTTGCAACACA
CCTTCGTACACATACATTCTCATTCCTCCTTTTATTTCCCCCTTTCTCTT
ATATACTTCCTCTCCCACATTTGCGCGTTCCAGAGTCACAGGTTTTTATA
TCTCTTCTTGCATCCCGTCCCATTTACTGCATCTACCTCCCAACCCCCTT
TATCATCCTCTAACCCGTTGACATAACGAACCCTTGCCCCTTTTCCAGTC
TTGCTTTCCCGCTTGTCACAAAGGCAATCGCGTCTCGATTTTGCTCTGTT
TCCTCCCCGTTTCCTCCCCCGTGCCCTCCGTGTTGCGATTTTTCCCTCCT
TTTAAACAACTAT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCAGTCTCAAAAAATAAGTTGGGG
GCTAAGAAGATGGCTTGGAGGGTAAAGTGCTTGGGGACAAGCATAAGTCT
CTGAACCTGGGTCTCAGAACCCGTATAAGAACCGGCACAGCCGTACATGC
GCCTGGAATCCCAGCACAAGCTTTCTGTTAGCCAACCTTAATCCGTTATG
CAGAGGTGATTGACAAGAGAGACCACACCCTAAGCAAGATGGAAGGCGAT
GAAACCCGAGGTTTCCCTCTGATTTCCACACACCCTGTGGCATGTGAGGG
CCTGCACTCATACACACAAACACTATGTTCCCTTCCACTATGTATCACGT
TTAAAGCAGTCTAGGACCCATGAGTTTCTGTTCCAAAATATTCAACATAC
TTGACCGCATAGCTAATGGTAGGGTAGTCAGCTAGAGGGAGAGACCTTTG
GGGAATGTTCTAGAAGGGGCAGCCTTACCTTGTATCCCATTAATCTGACC
CTTATTTGTATTGCCTAGTCTTAGGTGCGTCCCTGCCCCCAGACATTCAG
TTTCAAGTTTCCATTGCCTAAGGTAGCGTTCCCCCTCCTTGCGACTTGTT
TTTTTGAAGCTATATGCAGGCTGTATCAGGCGTTAACGTTCAATGGTTGG
TTCTGGTCCCCATCCCTTATTTATTTCCCACGTCC
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 10 10 14 12 28 36 32 29 27 24 22 22 28 39 28 26 23 32 30 30 41 47 33 33 30 30 28 16 20 12 9 7 7 6 6 6 9 7 8 8 8 10 19 18 30 30 33
33 33 33 44 31 31 25 23 13 8 8 8 8 9 9 19 22 22 22 27 27 30 33 33 33 33 43 59 47 36 36 36 36 36 50 42 37 40 40 47 47 57 57 57 57 57 68 57 57 54
57 54 54 57 59 48 48 48 47 42 47 47 47 48 59 59 59 48 48 47 59 47 47 47 47 47 42 37 37 37 35 42 42 48 50 48 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 59 54 54 57 57 59 59 68 68 68 57 57 44 43 35 35 35 47 44 57 57 57 57 59 52 43 43 43 59 59 57 57 57 57 57 68 59 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57
54 57 57 68 68 57 57 59 59 57 68 57 57 57 43 39 35 24 21 9 9 9 19 28 52 57 57 57 57 57 57 52 57 52 43 43 35 43 43 57 62 52 52 62 62 62 59 59 59 57
43 43 35 35 35 57 44 57 57 57 57 59 59 59 57 57 52 52 52 43 43 52 52 52 57 57 43 45 43 57 43 45 45 45 57 52 52 52 57 59 59 59 57 57 57 57 44 44 29 27
27 23 23 38 43 38 44 44 42 33 29 29 29 43 44 44 29 29 29 32 32 20 17 15 21 36 20 22 23 32 44 50 57 59 59 44 43 42 35 33 33 42 44 44 57 46 43 43 42 42
42 43 43 44 59 59 59 44 42 32 30 30 37 37 43 43 44 46 47 48 48 48 57 57 44 44 28 28 28 37 34 32 23 23 28 41 59 48 48 48 43 43 43 33 42 25 24 15 15 15
15 28 28 39 35 37 39 30 30 18 14 14 14 14 12 17 11 10 10 11 15 15 17 17 29 30 39 43 39 37 28 28 28 37 36 36 28 25 25 32 32 24 24 20 28 28 21 21 10 10
10 9 9 9 12 12 12 12 12 12 10 10 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 10 10 10 10 8 6 6 6 6 11 12 18 19 20 21 21 15 15 12 16 12 10 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 11 10 8 11 10 8 8 9 10 9 11 10 13 13 10 9 9 10 10 10 10 13 17 21 10 8 8 8
9 9 14 14 14 13 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 9 10 10 12 9 8 13 8 12 12 21 25 17 11 9 9 9
9 10 11 11 12 12 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 13 8 11 8 9 12 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 9 9 11 16 13 10 11 11 11 9 14 11 9 11 8 8 8
8 12 11 12 8 9 10 10 11 11 10 10 8 11 9 9 10 8 9 11 11 8 6 6 6 8 8 10 9 7 9 9 8 10 8 6 6 8 6 10 14 9 8 8 7 7 9 9 9 9
8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 9 9 17 15 12 16 13 12 10 7 6 6 6 13 18 28 21 21 9 8 8 8 8 6 6 10 6 10 10 12 12 16 12 11 10 10 10 10 10 9
11 10 11 11 11 11 11 12 10 8 6 6 6 | Open.Hide. 6 6 6 14 15 8 8 8 8 12 23 37 37 37 37 37 37 48 48 44 39 39 30 30 32 35 39 41 23 23 10 7 6 6 6 8 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 21 25 33 33
33 33 33 33 41 41 32 23 15 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 9 14 15 24 30 30 37 41 47 47 47 47 47 50 50 50 43 43 43 43 39 32 29 20 20 20 32 32 43 43 43
43 43 40 40 32 37 39 33 31 33 42 33 37 43 41 47 37 37 36 28 22 15 14 14 24 32 40 46 54 48 44 44 41 27 23 36 37 46 48 57 57 57 57 57 57 43 43 43 57 57
57 57 57 43 43 43 46 50 50 44 48 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 50 50 39 43 38 38 18 25 24 27 38 38 50 59 59 59 59 44 35 32 35 35 43 43 52
52 52 52 52 45 57 57 44 43 42 42 35 39 43 57 52 43 43 43 39 41 57 59 59 57 57 45 42 42 43 43 43 43 43 52 52 57 57 57 57 52 52 62 62 62 62 57 57 57 43
39 31 31 31 43 43 45 52 52 57 57 57 57 43 39 39 43 43 57 57 57 26 28 15 15 13 24 38 44 44 38 20 17 18 34 38 42 43 43 43 32 32 33 38 38 38 42 32 28 28
32 32 35 43 44 52 57 52 54 54 43 43 27 27 27 27 27 23 32 16 18 9 9 9 9 16 12 18 38 43 48 57 59 59 59 50 43 41 33 29 44 44 57 47 47 59 42 42 35 43
42 47 57 59 57 57 42 42 32 37 26 26 13 13 13 15 19 28 30 37 32 37 37 44 42 39 37 35 35 37 39 39 46 43 28 26 14 14 14 12 12 12 15 15 23 15 15 14 14 19
26 28 13 13 12 12 12 9 9 10 22 22 12 14 15 14 19 23 12 11 11 12 19 19 21 24 15 15 12 12 8 10 8 8 8 15 19 21 12 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 14
23 17 15 11 18 18 23 19 13 13 12 12 21 24 26 24 20 20 20 32 28 15 11 11 11 11 10 10 11 12 12 13 19 18 18 18 13 13 13 18 18 12 17 16 22 22 28 32 25 21
15 13 12 15 24 22 24 13 13 12 18 12 12 11 15 15 18 10 10 10 9 9 10 22 28 21 24 17 17 13 18 16 17 17 21 20 22 14 10 9 9 9 9 9 10 8 10 6 6 8
8 14 13 12 8 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 16 10 10 13 10 10 10 10 12 13 30 22 28 21 18 12 11 11 15 15 10 10 10 10 10 8 8 8
8 8 11 11 10 10 10 16 13 10 13 8 10 8 9 13 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 10 12 14 17 18 13 19 11 10 10 9 10 9 9 10 11 16 15 10 14 13 13
13 10 10 11 11 15 15 9 9 7 8 8 8 8 10 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 13 15 13 15 14 11 11 14 12 15 8 8
8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 8 10 10 12 11 11 10 7 8 9 8 9 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 |