BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-155N12.T7 (MSMg01no155_n12.b1) | MSMg01-155N12.TJ (MSMg01no155_n12.g1) |
ACC | AG356745 | AG356746 |
length | 693 | 703 |
length of high quality (start - end) | 399 (43 - 441) | 292 (58 - 349) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no155_n12.b1 PHD_FILE: MSMg01no155_n12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:20:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no155_n12.g1 PHD_FILE: MSMg01no155_n12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:20:50 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (28,445,317 - 28,445,715) | (28,252,525 - 28,252,816) |
---|
sequence | CTCACTCGGAGCGAGGATCCGCGGAATTCTTTTACCCGATAGAAACGCTC
TATATCGGCTGGAGATGCAGCTCAGTGGTTAAGGACCCAGGTTCAATTCC
AAGCACCTACATGGTGGCTCACAACCATTTGTACCTCCAGTCCCAGGGGA
TTTGATGACCTCTTCATTTTTACAGTATTTGTCTTTAATGGAGCAAAGAT
TCATATTATGACTTATAAGTAGTCACTAAAAATGCATATATTAGAGGAAA
CATAGAACATAAAATGTAAATAGTATAGGGGGGCTGGATAGATGGTTCTG
CTGTTAATAACACTTGCTGCTCTTGCAAAGGACCTGGGTTTGGTCCCAGA
AGCCACATGGCAGCTCACAACCACCTGTAACTCCTTTCAAGGGAGATCTG
ACTTTTTGGATCTTCTGGGCACCTTCACTTACACACACACACACACACAC
ACACACACACACACACACACACACACACACACACTCATGCGCGTGCGCCT
ATAATTAAAAACTAGAACAGATCTAACTATATAAAATCCGTATAAAGAAG
GAAGTAAAGGGCATTTACATATACTCAATTTGGTTGATAGAATAAAAAAA
TTATGAAAGAGTTGAACCTACTTATATTACGGATTGTATTAAATGCCAAC
GTATTATATATTTCACCTAACACACCATGGACATCCGACACCG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXACTCTGACAGCATCCCAGCCAGCAAGAAGCAGGGCTCCACTGG
CCATAAAGCCATCACTCATCTCATGACTAAAGGAGACAGGCTTGCCAAGG
GGTGGCACTAGTGAACACAGCACAGACCTGGCTTAAGGCTGTGGACAACA
GGCCTCCACCAAGGGGAGCCCATGAAAATTTAAAGACATCCTGCTGTCTG
CCAAAGAGCATCATTTTAAGGCAGGCAAGCAGGGGCTGCTGTTCCTCTAA
CTTCCTTCCTCTCATGACTGGGAATGCCTGTCACTACCCTCCAAGGTGAC
AAGATGTCAGGGGGTGGCTCCCAAACCTGGATTTCTCAAGCCTCCTTTAC
CTGTATCCAGCCTTCAGTCTCCCACTGTGGCCTTCCCCAGGGTCAAAAAG
AGGGTACTGCCCCTCATCCCAGGACTTCTCCCTGGAGGCCTTCAAGGCAA
ACCGCTTAGCCCTTGGTCTAGTGACCCAGTGCCCTCCACAAAAGGCTGCC
TCACACCTCCATGCCCTTCCAAGTTGCTTTCCACAATCAATTTCCCCGCC
ATGACACCACAGGAAAACCTCATTATTTCAGACACTGCTAATCTACGCCT
TTGTGACCACCCTGCCTAAATCAGCACAACCCCGCCTTTGCTTTCTCTCC
GAG
|
quality values | Open.Hide. 7 15 7 7 6 6 7 7 7 9 10 11 12 16 17 19 20 14 15 26 32 37 37 33 33 33 30 33 19 21 7 7 6 6 6 6 11 10 10 10 10 10 13 16 28 28 40 40 48 48
48 53 57 48 48 43 43 37 43 43 57 57 53 53 50 50 43 43 43 43 43 42 42 34 34 34 39 46 48 54 57 57 57 48 47 47 41 46 39 41 41 47 47 47 47 47 50 48 47 47
47 48 47 42 43 43 43 42 42 42 47 47 48 43 43 43 46 46 40 57 46 57 57 57 54 54 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 52 57 57 52 52 57 57 54 57 50 46 46 46
46 46 48 50 50 50 68 68 57 57 57 57 57 57 52 57 57 59 59 68 59 59 52 52 45 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 52 57
57 52 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 59 62 62 52 52 45 62 62 43 43 39 43 43 44 44 35 35 35 43 43 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 39 41 47 44 44 57 57 57
52 43 43 35 35 35 47 59 59 59 57 57 52 52 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 43 38 24 12 11 12 12 12 12 15 24 27 24 44 44 43 43 43
44 44 57 57 57 57 50 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 57 44 32 18 15 14 14 14 10 10 15 19 23 23 43 43 43 43 43 39 39 30 30 25 36 30 30 28 28
30 30 16 21 21 40 40 43 43 43 39 39 35 35 35 42 42 48 48 43 37 37 28 28 29 33 43 37 42 39 43 34 34 37 39 23 27 27 33 28 17 13 12 9 9 17 22 59 47 47
47 59 59 59 59 59 48 48 48 39 39 39 39 35 39 34 37 28 27 26 16 21 21 31 28 23 25 37 40 43 42 32 28 28 25 24 22 22 21 24 17 14 14 19 26 18 15 15 10 10
12 13 12 15 13 18 11 11 12 24 12 13 13 13 13 15 16 15 15 15 15 9 9 9 9 9 10 14 21 19 13 12 12 11 11 11 12 12 13 24 27 25 21 21 14 13 13 15 15 10
15 11 11 14 11 12 11 15 13 13 13 10 10 10 15 15 23 23 22 19 23 15 15 10 14 14 15 19 24 21 22 16 12 12 15 22 16 15 10 10 9 9 17 17 16 12 16 11 11 11
13 15 15 12 12 11 11 19 18 16 11 9 9 11 11 16 11 11 11 11 17 9 9 8 8 8 8 12 13 14 13 10 13 12 9 8 8 8 8 8 8 10 8 12 13 12 11 11 11 8
8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 10 10 10 10 11 15 15 12 11 11 11 17 11 12 12 13 12 19 15 18 18 18 18 18 17 10 9 9 9 17 11 10 12 13 9 9 9 10 13 8
8 8 15 10 14 14 10 12 9 14 14 12 12 14 14 14 17 16 16 8 11 8 8 8 8 10 15 19 13 9 10 9 9 11 7 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide.22 27 20 20 25 24 19 11 15 15 14 9 9 11 11 12 12 14 12 10 15 10 11 11 19 25 34 39 50 46 27 29 21 21 19 25 23 21 9 9 9 10 9 9 9 9 13 12 12 12
11 10 12 22 26 33 33 31 31 35 43 48 36 36 36 36 50 36 43 37 33 34 30 28 28 37 37 40 40 40 47 54 43 59 35 35 35 39 44 37 39 37 28 32 23 28 25 36 44 36
38 22 28 28 40 44 44 29 29 14 16 16 32 32 36 42 37 47 47 41 41 41 41 41 47 57 57 57 47 43 41 39 50 59 50 35 43 43 38 32 20 20 41 32 35 32 32 35 44 59
52 52 52 52 52 52 52 57 59 43 44 31 28 43 44 44 54 52 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 59 59 52 52 52 57 57 59 59 57 44 44 33 33 35 44 43
52 52 52 52 57 57 45 45 45 57 57 57 57 57 38 36 17 24 24 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 57 57 57 52 52 57 52 57 52 57 52 52 52 52 57 57
57 54 52 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 50 50 46 44 46 48 48 48 43 43 33 33 29 22 22 34 32 44 43 43 43 47 46 44 42 28 28 23 28 32 36 43 43 37 37
42 42 48 59 59 48 54 54 59 59 40 40 25 30 30 44 44 59 59 43 39 37 36 43 43 54 54 47 47 32 32 32 29 28 28 28 32 30 30 24 24 18 28 27 34 43 28 26 13 12
12 15 12 14 21 21 21 23 20 20 17 17 20 18 18 17 24 19 31 34 37 32 37 37 43 43 39 39 37 30 30 37 33 43 43 33 29 31 31 42 42 42 48 48 57 46 48 48 48 48
37 41 30 33 37 30 30 20 17 17 30 30 37 37 28 28 25 30 22 24 19 28 22 21 23 30 26 37 37 24 18 13 18 18 32 34 32 28 24 23 15 14 14 21 22 25 15 18 13 21
21 21 14 13 9 9 13 18 28 40 37 47 39 47 37 36 36 32 29 21 14 14 14 17 19 19 20 18 27 20 20 13 15 11 11 11 11 17 16 22 27 37 35 31 32 28 24 18 12 12
12 12 14 30 24 22 22 12 12 12 16 16 24 30 19 20 20 18 21 12 12 12 22 18 21 18 11 10 10 10 10 12 15 25 30 34 23 23 23 22 20 24 16 16 15 19 19 22 20 17
24 11 15 15 19 18 11 12 12 14 16 23 28 28 25 25 19 17 14 12 10 10 19 15 17 24 26 21 17 10 9 8 10 6 6 7 6 8 8 10 15 12 12 11 19 13 10 10 10 10
12 9 10 10 11 8 8 8 13 10 19 20 28 24 13 13 12 9 7 10 8 10 17 21 21 22 22 19 13 11 11 11 11 11 10 12 9 13 10 10 10 14 14 20 13 13 10 8 8 10
10 19 19 19 13 10 10 11 11 12 11 11 11 16 19 11 11 10 10 10 11 10 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9 8 17 8 10 10 12 11 11 10 10 10 10 9 9 10 8 8
8 6 6 |