BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-163J07.T7 (MSMg01no163_j07.b1) | MSMg01-163J07.TJ (MSMg01no163_j07.g1) |
ACC | AG362338 | AG362339 |
length | 732 | 732 |
length of high quality (start - end) | 583 (51 - 633) | 347 (386 - 732) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no163_j07.b1 PHD_FILE: MSMg01no163_j07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:31:12 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no163_j07.g1 PHD_FILE: MSMg01no163_j07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:31:12 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (119,609,513 - 119,610,047) | (119,427,081 - 119,427,427) |
---|
sequence | NCCATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCACTAGGTACACCAGGCTGGCCTTGAATTCACAGAGATCTA
CCTGCCTTTGCCTCCCAAGTGCTGGGATCAAAGGTGTGCGCCACCATGCC
CCACTCTTGTTTGTTTTTTGACACAGGGTTTTATGTACTTCAGGCTGGCT
TTTAAACTTACCATATAGCCAAGGGTAACCTGGAACTTTCTACCCTCTTG
CTTTTTACCCCAAGTGCTGGGGGTTATAGACAGGTGCAGCCGCCCTCGCG
TTGGCTGTAAATAAGTTTACTAGACTGATGGCCAGAGAGGGCTGATAGAG
AAAGAAATGCCTTTGAGCTCACCTCCCTGCATGGAAAAGATAAAGACCAC
CAGGGTTCGGTTGTAACCGCTGCTGTTTTGATGCTTTAGGGGTGGATGAG
AGGGAGTACTGGAAGGAGTCGTACAAAGGGCACAGCTCCAGGGCCATGAT
GCTGTCCAGACCGAAGCCTGGAGAGTCAGAGGTGGACCTGCTGCGCTTCC
AGAGCCAGTTCCTTGAGGCTGGTGCAGCCCCGGCGGTGCAGCTGGTGAAG
GGGAGTAGGAGGCATGGTGATGCTCCTCCAGACCGGCTCCCACCGCAGGA
CCATCGGGATGTGGTGATGCTGGACAGTGAGTGCTTTCTAACATGGTCGT
GAGGAGAGAGGGCTCATCCTCAGAGTCCCTGG
| CAACGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTCCAGTGAGAGGTGATACG
TGCTCTTTCTCCCTTTAGTAGTTATGTTATAAGGAACTATTGTGGAAATA
TCTCTTCCTTCTCAATCAATGGAAGTTTATTATATGGGATGCCAGGCTTT
TACATGAGAGGGTACCATTGTTTGCAACGGTTGCCAGTAGAGAAGGAGTT
TTAAGCTTGTTAGATGAGAGAGAAACAGATGCTGTTAGAGCTGACTTCTG
GAACGGGCTCTCAGTGCTGCAGGTGCTGTGAATTTGAATCATAAAAATGT
TCAAAATTATATTTTGTTGACCCTCCCCGCCTAGTCAGATTGGGCAACAA
AATTGAATTTATGCTAAAAGCTTTTTTCATGAATATTTATTATAAATAAC
CTATTAATGAGAGCAAATAATAATAAAATACTAGAGAAATAACATGTTTA
AGGTAACCTAAATTTCTGGGCTTGGTTGCTCAACCTATAACCACATTTTG
ACGACTGAGGCAGGAGGATAGGCCACAAAGATCAAGGCCAGCCTGAATGA
CAGACACTGTCTCAAAATGAAACAAAAATATAACCCACGTTTTTCAAGTG
CCCCAGCCACTTATATTTTTATTTAGAAGACAAAGCCAGCTGGTGGTTGA
GAGCACCTCCTAGATGCTGAGCTGTCCTGCAC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 7 10 12 9 11 11 17 19 28 34 32 37 37 37 31 31 37 37 37 37 37 37 37 37 37 43 31 28 28 28 28 35 43 43 39 40 40 43 44 53 48 32 32 20 22 22
37 34 57 48 47 47 42 42 50 50 50 50 50 57 57 57 50 48 48 48 47 50 47 57 57 47 47 47 59 47 48 57 57 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 54 57 54 57 57 57 59 59 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 54 52 50 43 38 24 24 28 36 50 50 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 52 59 57 57 52 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 57 59 57 59 57 59 59 59 57 52 62 62 52 52 52 62 62 62
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 41 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62
62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 43 43 39 39 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 59 59 59
59 68 68 59 57 44 38 27 15 13 12 12 12 12 27 18 41 22 34 21 13 10 10 10 8 8 8 8 12 11 38 38 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57
57 52 59 59 59 59 52 57 52 59 59 68 59 59 52 57 57 57 57 52 52 42 32 27 20 20 28 32 35 43 43 43 48 57 59 59 59 68 68 59 59 59 68 68 68 68 59 59 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 48 48 48 57 48 54 54 57 57 68 68 57 57 54 57 57 57 57 48 48 43 48 43 57 59 46 46 48 43 48 48 48
48 43 43 47 40 40 43 43 48 48 48 48 39 39 39 37 33 34 34 24 29 34 41 37 47 39 39 39 59 47 48 48 59 47 47 47 47 47 47 57 48 48 48 57 59 59 59 43 42 39
39 42 43 48 48 48 48 43 46 43 43 43 57 44 57 43 43 43 57 59 57 54 54 48 59 39 39 30 34 37 39 33 42 40 57 43 43 32 37 30 32 32 43 43 43 48 43 43 32 32
28 28 28 35 32 32 37 33 36 39 39 39 37 32 30 19 19 24 37 37 37 46 46 46 47 43 46 39 37 28 30 16 16 16 23 32 25 24 17 16 17 18 18 18 22 23 23 13 17 12
14 14 21 27 21 13 11 11 10 15 13 24 24 22 22 29 30 26 32 29 25 17 9 12 8 8 8 11 17 15 15 12 12 16 18 21 15 8 8 8 8 8 16 23 17 14 14 15 19 15
15 14 12 12 11 11 10 13 10 10 10 12 12 12 12 10 10 10 10 13 12 10 9 9 9 9 10 10 11 11 10 10 | Open.Hide. 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 9 18 30 26 32 35 31 34 41 37 37 37 37 37 37 48 48 43 47 46 39 39 30 30 30 37 39 40 43 34 34 36 36 48 48 57 57 57
57 54 50 48 48 42 42 42 48 48 54 68 59 59 48 50 41 50 50 43 57 57 48 50 50 50 48 50 47 47 47 41 41 41 41 38 38 43 44 44 44 57 37 37 37 44 57 42 42 37
37 43 43 43 50 50 57 57 54 54 57 54 54 54 44 44 37 37 37 37 50 43 43 43 52 52 52 52 54 59 57 57 52 52 52 52 52 43 50 43 43 23 28 28 35 28 57 57 57 57
42 43 52 52 52 57 52 52 52 57 52 43 57 57 52 52 43 44 29 29 29 43 43 57 57 57 52 52 52 52 52 52 57 52 43 43 33 33 31 43 43 57 57 43 43 35 35 35 44 44
57 52 45 45 34 43 26 26 26 44 44 52 52 52 57 43 57 52 52 45 59 43 52 52 57 57 52 52 42 59 35 42 43 57 44 57 38 38 20 20 20 32 32 50 43 52 52 57 57 57
57 57 43 43 35 35 38 43 39 38 41 42 42 37 43 43 32 43 42 43 43 48 48 57 43 43 32 32 32 42 42 43 43 43 44 44 37 32 32 32 32 35 42 42 43 43 44 42 42 42
42 43 46 44 42 39 30 30 32 39 39 44 44 30 28 28 40 40 48 46 46 43 39 39 35 33 33 32 37 39 57 57 57 48 23 23 9 9 9 23 27 47 57 59 59 59 35 35 39 47
47 48 59 59 59 59 39 23 20 11 11 12 12 13 15 18 12 19 18 12 10 10 10 10 10 12 7 6 6 6 6 8 13 13 18 20 24 24 30 37 34 32 37 37 48 59 57 57 57 57
43 48 48 48 48 48 57 57 59 57 48 48 48 43 43 47 47 42 35 35 35 44 40 41 41 37 30 30 25 23 19 20 24 24 30 44 44 68 57 57 57 57 57 48 48 48 48 46 57 48
48 48 57 44 59 47 35 33 42 44 42 47 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 52 43 43 44 44 54 59 57 57 57 57 52 43 43 37 37 43 59 59 59 68
59 59 59 59 43 44 43 52 52 52 57 57 57 59 52 52 43 43 43 41 41 42 43 35 50 42 43 44 44 44 50 57 57 47 47 47 48 57 59 59 57 48 48 48 48 48 57 59 57 57
47 43 43 39 43 42 42 35 42 42 48 57 48 48 48 44 46 43 43 43 48 48 54 54 54 54 59 47 43 43 43 43 43 48 48 48 57 48 48 42 40 43 43 43 39 39 42 39 39 39
39 35 36 36 37 37 35 39 35 35 35 37 35 31 31 37 41 43 47 59 47 47 47 59 59 59 47 43 43 43 43 43 43 48 48 48 48 48 48 59 59 59 57 48 48 43 43 37 43 39
39 39 59 43 41 33 29 24 28 30 37 34 36 36 36 39 44 59 47 41 39 37 25 25 14 12 12 12 12 13 19 15 28 30 41 41 32 32 25 28 23 32 24 32 28 31 37 22 28 13
13 13 18 18 23 26 25 32 21 14 14 11 11 11 19 19 34 26 34 25 25 25 34 32 35 35 39 30 22 16 11 11 |