BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-172N04.T7 (MSMg01no172_n04.b1) | MSMg01-172N04.TJ (MSMg01no172_n04.g1) |
ACC | AG368615 | AG368616 |
length | 768 | 703 |
length of high quality (start - end) | 257 (64 - 320) | 285 (76 - 360) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no172_n04.b1 PHD_FILE: MSMg01no172_n04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:22 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no172_n04.g1 PHD_FILE: MSMg01no172_n04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:22 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | TXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CTCTGGTTTACTTTTTATGGTCACTTAAGTATACTATCATATCATCAGCA
AATAGTGATATTTTGACTTCCACCTTTCCAATTTGTATCTGATTGACCAC
CTTTTGTTGTTTCATTGCTCTAGCCAGGACTTCAAGTACTACATTGAATA
GGTAGGTAGAGAGTGGGGAGCCTTGTCTAGTACCTGATTTTAGTGGGATT
GCTGCAAGTTTCTCTACATGTAGTTTGATGTTGGCTACTGATTTGCTGTA
GATTGCTTTTATTATGTTTATGTGCGGGTCTTGAATTCCTGAACTTTCTA
AGGTTTTTATCCCGCCCCCCCGCCGAACTTTGTCAGACGCTTTTTCTGTC
TCTATTGTACCCCCCTTGTGAATTTTGTCCCTGAGCTTTTTTATACTATT
CTATCACTTTTCAGCACTATTTTCCATTTTTTTTATTCCTTCTTTCCCCT
CCTTTGCTTCCGCTAATTTCTTCACTTATTATTCTATTTTCTACTCCCTT
TCACTTCCTCTTACCTCTCTACCTTTCCTTTTAAAACTTTTCAATCTCTT
TTCGTCGATTTTGCTTACTTCTACTTTTTCCTCCTTTTCCCCCCTTTTCT
CCACCCTTTTTCCCCCTTCTCTTTTCCCTCTTCTCCACCCCTCTTTACAC
CACCCCTTATATTTTTTTTTTTAAATCCCCTATCCCCCGCTTCCACATTT
TTCATTTTTTCACCTCTT
| CACGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGAGCCCCTACCTCCAGCTCTGTAG
AGGAGGGGCAGGTTGGAAGAGTAAAACATAGGAAGATTGTCAATGGTACC
TGCTGGGAGGTGGTATAGGAGCCTCCCCTCAGAAACACTCAAGATAGCCC
CCAGATCCTAGAACCCTCAGATGTAGAAGAGCCTTCTGGAACTCTGCTGT
CCTCAGTTAATGAGCAGGAAATACCTGCTAGAATACAACTGTGTCAGGAC
TCCCCAGAGAGCCCTAGGCTTCAAGACATTCTGCTCTCTGCTAGCCACTC
CCCAGACCACTTTGTGGTGAAGTCAGAGTTTGGGTCCAGTCCAAACCTTG
TGAGGCTGAGCAATATTGAATCACAAGTGCCGCAGCTACCAGTGAACTGG
AAGAGATTTTGGATTTTATGCTATGTGACTCAGATGTTGAGCCACCAGTA
GGTTCTTTGGAGAGTCCTGGGGCTGAAGGCTGCAGAACCCCCAAGTTATC
ACCTGGCAGAAACAGGAAAGAATTGGATTGAAGGGAAAGAATGGTGTTTG
CCAGACATGGAACTCTGGCCCAGAAACCTCACAGGATTGGAACAGGAATC
AGTTAGTGAGAACAAAGAGCCTGTTGAGCCCTTTAGTCCCCTTGTCATGG
CCT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 7 10 21 29 28 39 39 39 37 19 17 9 9 9 19 19 41 47 50 30 28 25 22 19 10 11 10 11 9 10 10 10 12 12 20 20 30 24 24 28 41 47 48 36 36 31 31 33
33 59 34 36 15 10 7 8 6 8 6 8 8 23 30 30 24 25 24 30 30 37 47 47 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53 50 50 50 53 53 68 47 47 47 47 43 43 50 53
53 68 57 57 57 54 54 54 54 68 68 68 68 68 34 34 15 13 12 12 23 23 57 57 59 57 50 50 50 50 51 51 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 50 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 52 57 59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 52 52 43
42 47 35 24 27 11 11 11 26 26 44 44 57 57 52 52 43 43 33 38 38 38 50 50 57 57 57 57 57 48 50 50 59 50 50 50 57 57 57 44 47 35 33 28 27 20 32 32 40 38
47 48 43 44 42 35 35 42 42 57 59 59 57 57 44 44 30 30 23 26 13 13 13 18 34 44 57 57 43 43 36 33 28 28 28 31 31 30 30 30 37 37 43 43 43 33 29 16 12 11
11 15 25 28 36 37 43 43 43 48 32 32 23 23 23 24 28 24 17 8 8 8 10 8 8 8 8 10 25 25 34 43 43 39 37 43 43 37 37 28 28 28 28 37 34 34 23 23 20 19
15 15 13 13 14 30 30 39 19 13 10 8 8 8 9 11 21 33 15 15 9 9 7 10 10 9 9 9 10 21 14 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 17 23 28 13 12 8 8 8 8
8 10 8 8 10 8 8 6 6 8 8 11 10 10 15 12 12 13 10 10 10 10 14 13 18 13 10 10 10 10 10 11 18 11 11 11 8 8 8 8 14 10 11 8 8 8 6 6 6 6
10 8 8 8 8 8 8 12 13 12 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 15 15 15 8 8 9 19 13 8 8 8 9 9 9 11 12 18 18 20 13 11 11 18 13 13 12 8 8 8
11 11 13 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 11 12 13 13 11 16 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 11 9 9 9 6 8 6 7 10 8 9 9 9 11 9
9 9 9 9 9 17 17 13 14 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 10 15 10 7 7 7 8 10 6 6 8 6 8 8 9 9 10 10 7 6 8 7
8 8 8 10 8 8 8 10 13 11 11 8 9 8 8 8 8 8 15 18 17 10 10 11 20 14 10 10 9 8 8 8 8 6 6 8 8 10 16 22 15 13 8 8 8 15 15 14 10 10
8 9 8 8 8 8 14 22 12 12 9 9 10 7 8 12 10 10 10 9 9 9 11 10 9 9 9 9 9 10 10 10 11 10 11 8 8 8 8 8 10 10 10 8 15 6 6 6 6 6
8 6 6 8 8 9 10 8 8 8 8 8 14 17 20 19 19 17 11 13 10 9 11 11 11 12 12 15 12 11 11 10 15 15 19 12 12 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 20 15
17 14 14 9 9 9 14 19 16 13 8 8 6 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 6 8 8 10 12 11 9 9 22 12 19 10 10 13 23 30 42 41 48 48 53 50 50 48 42 47 47 41 39 39 35 31 31 41 39 37 30 33 33 33 33 33 37 37 39 23 23 12
11 11 21 21 48 48 48 48 48 57 33 36 36 36 36 42 59 57 57 41 41 47 47 50 50 47 47 50 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 47 43 43 43 32 24 20 20 20 20 32 44 57 57 57 57 57 68 68 68 48 48 46 46 46 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 52 52 52 57
57 57 57 68 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 68 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59
59 59 59 57 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 54 54 50 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 57
57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 44 37 35 32 30 36 25 28 34 40 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
50 48 41 39 30 21 18 12 12 11 11 12 12 16 16 19 19 15 15 21 12 12 12 12 13 13 15 14 15 18 28 30 37 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 48 57 57 57 59 59
59 59 59 68 68 68 59 59 43 43 43 43 59 59 47 43 48 48 48 48 48 48 48 48 48 57 48 54 54 54 57 57 57 46 43 40 44 57 48 48 48 48 48 48 48 48 47 57 57 59
59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 57 57 48 43 43 43 43 43 54 48 48 48
48 59 59 48 59 59 59 59 57 57 47 47 36 39 39 40 43 43 59 47 47 36 36 36 43 36 37 39 39 39 41 41 40 41 48 37 39 39 48 48 43 43 43 43 43 43 43 43 43 41
40 43 39 36 36 30 30 30 37 27 29 32 37 37 37 46 41 41 59 37 47 47 47 27 27 14 14 23 30 32 48 47 59 48 48 46 47 47 30 23 21 19 16 16 35 41 41 41 37 37
28 28 23 30 25 28 28 37 28 28 32 21 21 11 18 17 16 12 24 28 28 30 22 9 8 8 8 12 15 18 18 20 32 32 39 37 30 30 17 8 8 6 6 6 13 18 17 12 12 12
12 13 14 15 15 20 19 28 19 15 11 11 11 13 14 15 15 20 12 11 9 11 11 16 27 39 37 32 25 25 27 31 31 20 15 14 14 11 11 27 34 25 22 11 11 18 25 23 16 7
7 7 7 |