BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176E18.T7 (MSMg01no176_e18.b1) | MSMg01-176E18.TJ (MSMg01no176_e18.g1) |
ACC | AG371033 | AG371034 |
length | 1,258 | 1,265 |
length of high quality (start - end) | 641 (144 - 784) | 274 (135 - 408) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_e18.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_e18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:47:52 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_e18.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_e18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:47:52 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCATTTTTNNNNNNATCACTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCTTATCAGGAACTAAAACGCATTAAATGTGAATTTGATA
TTATATCATTATTTCTGATTCCTCTATATCAATCAGCTAGAGCAAATGGA
TTCAAAGAATGAGGCATCTTTTGTTTACCCAGAATTAGTTTTAAAATATT
GACCCTGGCTTTGTAGATCTTATAACTTCTTCCTTGAATTGAGCAAGATG
TTTTTATAATCTGGAAATTCTCTGAAATGTATTTCAGGTTCATTTTATTC
AGTAAAAACAAACTGTTTTCTAGTATTTTTCCTATGTTTAAATTTTTCTT
CTGTTTTAATTCATCTGTGCATTCTAATCCCTTTGGAGAAATATTAACTT
TCATTCAATAATATCTACTTATAGGTGATGTGCTTTGATTTTTTATCTTC
TTGCTTGTGTTTGGTTCTTTTAATCTCTAAAGTAATTATATAGTGGAAAG
AATCCATTTTTTAAAATACAAATATTTTATTTTAGAATTAAGATGTGACT
TTAGGTTTTTGTTTTGCTTTCTTCTTGTTTTCCTACATATTTATTTTAAA
TTGTTTACATGTATGTGTCTTGTGTCCATGCATGTGTACATAAGAGTATG
TAAATACCCAAGGAATCCAGAAGAAGGAGTCTGATACCCTAGACATGCAG
TTATAGGCAGATGTGAGCTGCCCAACATGGGCAGTGGATAATGAACCCCA
GTACCCCTGGAGAAGAGGAAACAGTTGTAATCTCTGGTGTGTCTATGGGA
CTTTCACAGGTCTATTTTTTTTTTGCATAAGCTTGCATTTTTCTGCCTGT
CCCATCAGTTTACCTAATATTGGATTCCACTACTTTTAATCCATCCTTCC
TCTACCTATCCAAGTATCTTTCCACCCATCCCATGATCCAACATATAATA
TATTTTTTTTACCTTTTTGAATAATTTAATTTATTTTGCCCCCCCCTGGT
TCCATTTTCCCAGTTTGTTCTCCAATTTCTCCCTCACTTTTATCTCCAAA
AGTAGTTCTCCCCTACAAATCCCTTCTTTTTTCTGGGGGATTACTTTTTT
TTAGGGCGTTTATAATTTTTTCTTCCTCCGTCTCAAATTATGCTTAACCT
TCTTTTAACTTTACAACACTTTTCTCTGTGTCCAATAATCCTTCTTCTAA
TTGTTTTTCTCTTGATCTCTTCCTTTCCTTTATTCTTTTTATTTTTTTAT
CTTATATT
| CAGTTTTNNNNNATTCATGGNAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTTTTTTCTAATGGTTTAGAG
CTTTATTTTAGAAAGCCCTAGAGAAAGGAGAGAAGGTTGAAAGAGAGAGG
CTGGCCATGGCCACGTGGAGAGAGGGGGGAAGGGAACGAGAAAAAGAGAG
CTACCAAGTAAGAAAGGTGAGAGCTTAAGCAATAAAGTGAATTCTATCTT
TGTGCCAAAATAGAATGTTTTCAATTTAATTCATTTATATCCACATTTCA
TAATTTCCAAAAAAATCCTAAGTATTACACCTCCCAAACACTTCCACATC
TATGGCTCAGAGAACATTCAGGAAAAAGAGGCAGAAAGATTATAGGAGCC
TGAAGAGCATTTTGTTGGGTGTGAGACTGTGTCTCCTAGTAATACCAGAA
GCTAAACCCATAACTGTCTCAATATAATAGCCACATAACCATCCATCTGT
ACATATAATATTTTACTAATTATTACATATTTATAATTAGATTTTTAAGA
GTATATTTTTAACAATTATTTCTATGCATTTTAATGCAAATGTTTAGCGG
ACTTCAAACTTTATAGATTTTGACCCGTTTAATTAAAATGTCTAATAATA
ACACGACTAATTGAATTTCAGTGTGCTGAAACATTTACCTTTAAAATAGT
ATAGTATTCTCTGCTTCAAAACATAATTTTATATACTTTGTATGATTTAG
CTACCATTTTTAATTTTTCTGATGTAATTTTTAATTATTTTATGACAGTG
CACCTGAAGTATGTTTGCTAGATGTCAACTCTGACGGGTATTTTTTATAT
TATAACGTCATCATATTTCCATTTTATCTATATCCTCTGTTCCATAGACA
AGACAACCATACCTTGTCCCTTGAACACTCATTTCCTTACCCATGTTCCC
TTTTTTATCAATGTGGCCGCTTTTTCCACTGTTTCATTTTCTTGTGCCTA
TCTTGTTTCTCGGGAATTCTTTTTTCTTTTTCTTTCGTCTTCTTGCTCCC
TTTTTGCCTCTTTTATCTTCCTTTTTTTTCTTCTTCCTACTTGCTTTTTT
CCCTTCCTTTATTATTCTTCTCTTATTTTCTCCTGCTCTCACTTATTTTT
TCTTTTTCTCTTCTTTTCCTTTTCTCCTTCCCTTAATCTCCACTACTTCT
CTTTTTCCTCTCTTTCCTTTATCTTTACATCTCTTCCTCTTATTTAATTC
TGCTCCTAACCTTCT
|
quality values | Open.Hide.12 12 14 12 12 11 9 3 0 0 0 0 0 0 3 8 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 15 20 14 18 16 17 17 18 18 24 24 33 28 29 33 29 33 34 37
48 50 48 48 42 37 37 47 47 42 50 37 36 36 36 36 36 36 36 31 33 31 31 37 37 37 23 27 9 9 9 11 11 14 14 12 11 11 13 13 14 14 19 29 34 44 53 48 48 48
53 53 53 53 53 50 50 36 36 36 36 33 31 33 33 33 33 25 22 8 6 6 7 6 10 8 19 19 34 28 24 24 20 24 24 18 25 24 19 10 15 12 12 12 27 27 41 42 50 50
41 48 48 50 57 57 59 59 59 59 57 57 48 47 47 50 50 53 57 53 53 68 48 43 42 43 54 54 48 57 54 54 57 51 50 50 47 50 50 50 51 50 50 47 47 48 57 57 68 57
68 68 68 68 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 59 59 68 59 59 59 59 57 59 59 57 57 57 59 59 68
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62
62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 68 68 68 68 62 62 39 39 13 26 13 14 14 27 27 39 44 43 62 52 52 52 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 62 43 43 35 43 43 62 43 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 43 45 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 52 62 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 47 59 43 52 57 57 57 57 57 52 59 57 59 59 68 68 68 68 68
59 59 57 57 52 52 52 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 43 43 59 59 59 68 59 59 48 48 48 59 57 57 59 59 59 59 59 59 48 54 54
59 59 59 59 57 57 57 48 47 47 47 57 57 59 57 46 43 43 57 57 57 48 48 48 57 57 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 43
43 43 59 39 43 39 37 37 28 28 37 37 37 37 37 37 32 24 20 15 21 18 35 28 31 35 41 41 47 59 47 47 48 37 47 47 47 47 37 39 32 43 30 39 36 59 43 43 36 34
23 10 8 8 8 8 19 21 47 47 39 43 43 39 39 39 32 32 24 24 24 30 34 41 41 41 41 39 31 31 26 22 10 10 10 11 16 22 34 30 39 31 32 23 18 16 11 10 10 16
16 22 28 30 39 37 28 28 22 24 27 28 28 22 22 14 11 8 12 11 11 18 23 37 39 40 37 37 32 32 19 23 28 29 23 15 10 10 10 15 19 18 23 28 28 22 23 13 13 13
20 19 20 22 19 14 14 15 10 16 12 15 21 31 43 43 47 47 57 57 57 47 41 26 18 14 26 22 23 13 9 9 9 9 9 9 15 17 25 21 27 16 14 14 25 27 18 17 10 10
9 9 8 8 10 10 10 10 7 8 8 10 15 25 18 9 11 11 9 8 9 11 9 9 12 13 10 9 9 9 23 12 10 10 9 9 8 8 8 12 18 32 16 12 10 10 10 15 14 11
8 8 8 10 9 12 16 16 16 14 18 18 18 15 18 8 8 8 13 12 10 10 11 11 10 15 8 10 9 7 13 8 11 11 13 10 11 11 11 10 10 11 12 19 12 14 8 8 8 8
10 11 15 11 9 9 9 17 14 14 10 8 8 8 8 7 7 6 6 8 8 8 8 8 14 10 10 9 9 8 13 8 8 8 8 10 18 19 22 18 9 11 9 8 9 9 10 9 8 8
6 6 8 8 7 8 9 6 8 8 6 6 8 8 8 8 10 12 8 10 10 10 10 10 10 10 12 9 9 9 9 8 8 8 8 10 8 9 9 10 10 8 8 6 6 8 8 9 10 10
9 7 7 7 7 8 8 8 8 10 12 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 9 9 9 9 10 7 9 10 6 6 10 8 8 9 10 11 12 12 17 16 16
15 10 9 9 9 9 9 9 8 10 6 6 6 6 11 11 12 18 14 14 16 8 8 8 11 18 10 9 9 9 9 10 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 6 6
8 8 10 13 10 6 6 6 6 8 11 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 8 10 8 6 6 6 6 8 8 11 8 9 8 8 7 7 6 6 8 10 11 10 8 8 8 10
10 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 10 8 8 6 6 6 8 10 7 7 9 10 6 8 9 11 11 8 8 6 6 8 12 10 15 8 8 8 8 8 8 10 10 19 10 12 8 8 8
12 17 10 10 10 10 10 10 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 3 0 0 0 0 0 3 9 9 9 9 8 6 3 0 3 10 7 6 6 6 6 6 8 10 13 8 8 9 8 11 9 15 15 11 8 9 9 21 19 20 17 17 24
28 32 35 35 37 37 37 35 32 32 36 36 36 36 44 44 39 37 42 37 39 27 18 9 9 9 12 12 19 16 12 14 14 18 18 10 10 10 9 15 19 33 37 33 33 33 47 47 38 57
57 42 38 38 36 36 31 31 33 33 33 27 27 20 11 12 14 16 15 10 11 12 22 26 23 20 20 28 28 24 22 15 12 12 12 15 25 41 44 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 68
68 68 68 57 57 50 50 50 50 53 54 54 47 43 43 43 43 43 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 43 50 43 43 44 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57
57 68 59 68 68 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 44 33 33 33 35 43 59 59 57 59 59 59 59 68
68 68 59 59 59 59 59 59 57 54 54 54 54 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 48 47 43 43 48 57 48 43 43 43 43 57 57 59 57 57 57 57 57 50 50
48 48 46 46 34 30 22 15 13 11 8 8 8 8 9 13 15 13 21 26 36 41 48 48 48 48 48 57 57 57 57 48 48 57 57 59 59 48 47 48 48 48 48 59 59 57 57 57 57 57
57 59 59 59 54 54 34 41 22 23 23 31 32 43 47 59 43 43 30 32 14 13 13 19 18 17 20 20 33 37 43 48 48 48 48 54 59 59 37 37 37 59 59 48 48 48 59 59 59 59
59 54 54 54 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 59 59 59 59 59 59 57 59 59
57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 48 48 54 54 54 57 59 59 59 57 43 47 47 48 57 47 59 43 39 42 42 42 32 39 39 32 35 59 59 48 48 48 39 39
35 39 36 36 30 39 39 40 43 43 47 46 46 41 20 17 9 9 9 19 28 47 47 47 19 15 6 6 8 19 16 37 32 28 20 20 23 26 24 18 23 28 23 14 11 9 9 12 14 17
19 18 18 18 27 34 34 34 23 23 23 27 27 17 13 13 13 21 12 22 21 28 34 23 23 31 34 41 43 35 28 29 29 22 25 19 30 25 31 34 37 33 30 30 33 30 43 34 34 28
28 28 28 28 17 17 28 28 28 22 18 16 14 15 11 13 15 22 28 32 34 37 37 32 17 13 10 10 10 17 18 34 34 36 39 39 37 32 31 20 20 20 20 19 24 20 17 18 15 10
10 10 15 17 16 16 16 16 15 18 13 13 12 19 22 28 12 12 12 18 18 19 11 8 10 8 10 9 10 10 15 18 14 16 13 20 11 12 12 23 12 12 12 10 10 10 10 10 15 10
10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 6 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 13 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8 15 15 10 10 11
11 11 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 9 9 9 9 13 14 10 12 15 15 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 6 8 8 13 10 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8
8 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 12 15 15 10 10 8 8 8 8 9 9 9 9 12 11 11 9 9 9 9 8 8 13 9 9 7 8 8 8 8 6 7 8 8 11 12 15 13 15
14 16 16 8 10 6 6 8 6 6 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 14 18 15 10 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 9 10 10
11 13 10 8 8 8 8 8 9 9 9 10 11 9 9 8 10 7 6 8 10 9 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 8 8 9 9 9 9 10 8 8 6 6 8 10 13 16 8 8 8
8 8 10 10 12 12 10 10 10 10 9 9 12 11 8 8 8 11 8 8 9 9 9 11 11 12 9 10 9 10 11 11 11 11 11 9 9 12 16 8 10 8 8 8 8 9 11 11 16 18
12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 10 10 12 14 14 13 10 12 8 8 8 7 7 8 8 10 8 8 8 9 10 11 11 11 12 15 16 16
11 11 12 12 12 12 8 8 6 6 8 7 7 12 10 16 10 10 11 11 10 10 10 10 9 9 10 7 8 8 8 15 8 8 8 10 8 10 8 6 6 7 6 8 6 6 6 8 8 8
10 10 12 10 13 10 10 9 13 10 11 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 10 8 6 6 6 6 6 6 6 7 6 7 10 8 8 8 6 6 6 8 10 10 8 8 6 6
6 6 8 9 12 10 10 10 7 7 10 8 8 8 8 |