BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-304E13.T7 (MSMg01no304_e13.b1) | MSMg01-304E13.TJ (MSMg01no304_e13.g1) |
ACC | AG429618 | AG429619 |
length | 1,305 | 1,347 |
length of high quality (start - end) | 304 (491 - 794) | 749 (82 - 830) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_e13.b1 PHD_FILE: MSMg01no304_e13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:42:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_e13.g1 PHD_FILE: MSMg01no304_e13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:42:43 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCAGGCCTTTNNNNNNNCCAATGGGCGCTNXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXCGCGGAATTCCATCCAAAATATACAATCATCTAAGATAANANNNAA
NAAAANANAANCAAAAANCAAACCTTTAAAAAGGGNAAAGGACTNAAANA
TTCCNTCAAAGAAGATTTTTAAATTGTCAATAAACACATGTGAACCCGCA
CCTACCACCATTAGCTATTAAAGAAATACAAATTAAAATTATACTAAAAT
GCCACTCACTTCATATCCTCACAGATGGCTAAAATTGAAACAGAAACAAC
ACTATGTGTTTACAAGATGTAAGCTGGAATTCTCATGCACTCCCTTTGGG
AACATAAAATATTTAACAATGCTTTTTTTTTTTTTTGTAGGTCTGATGAC
ATACCAGAGACAATTTTTTTTATTAANNGGAACAAAAAACACAAAGGAGT
TNCACAGCAACACCCTTCCAAATAACCAAAACACAGAGAAAAACCAAGNA
NCAACTGAAGNGNGGATTGTGGTATATTTTTTGTCATTAAAAGGAAAAAT
AATCCCTTTTATCAAATCAAATGATCTCTAGAAAATTACAAGCATGTAGG
TAACTCTACTAAAGACACACAGAGAGAAAATAGGGGATGCTTACAAGCTG
AGACTTTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTAAATAATTCTGTCTATTTTTACT
AGCTATTTTCTTTATTTACATTTCAAATGTTATCCCCTTTCCTAGTTTCC
CCTCCAAAAATCCCCTATCATCTACCCCCTCCCCCTGCTCCCCAATTTTT
TTACTCCTGCTTCCTGGCCCTGGCATTCCCCTATACTAGGGCATAAAGCC
TTCACAGGACCAAGGGCCTCTCCTCCCATTGATGACTGACTAGGCCATCC
TTTGCTACATATGTAGCTGGAGCCCTGAGTCCCCACATGTGTTTTCTTTG
ATGGGGGTTTTAATCCAGGGAACTTCCGGGGGACTGGGTGGGCCCCACTG
TTGGTCCCCCCAAAGGGGTGGAAAACCCTCTGCTCCTTGGGGGCCTTTTC
TAAGCCCCCCCAAGGGGGAACCTGGGGCCGGCCCACGGGGGGGGGGGGGA
AACCCCCTCCTGGAATTGTGAAAACAAATAAAAAACGCCCCGCGTAGAAC
ATTATATAAGTGCCCCGCGAGAGGGAAATTCTAAGTAACATCGCTCGCCT
CTCCCTAGAGAGTGCACGAGAAAGACCCCTTTCTGAATATAATGGGGTGA
ACCCAGGTCTTCNTAACCACACTACCTATCTTATATGTAGCACACACAAT
AACAT
| NNNCCCTTTTTTTTNNNNATCAAGTGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTAAATCCACTTCCCCC
TCTATCTAGTTTGAACTTGGGCACTGTTATGTGTGTGTTGACACGGTCCC
TGCCACAGTGAATTTGCATTTGCATCACTCCTGTTGTGTCTGGAAGGCAC
TGTTTCTATGAAGTTATCCATCTCCTCTGGCTCTTGCACTCTTTCTGCCT
CTTCTTTCACACAAATCCCTGAGACTTTGGGGGAGGGGTTTGACGAACAC
TCCATTTAGAGCTGAATATTCTAAAGTCTCTCACTCTCTGCACATTTCCC
AGTGATTGGTCCCATCTACTGAAAGAAGAAGTGTCTTTGAAATTCGCTAA
GTGAGGTTCTGATCAGCATGCATAACAACATGCAGTTAGGAGTTATTTTA
TTGCTAAATTCTTTTGGCAGACTGATGGTTTTAGGCTTTTTCCTAGGCCT
AAAACTTATCTAGACTTGTCTACTCTCAGGTTCTTGGGAACTTTAGCAGA
ATCAGGTATGAGTACCCTTTCACAAAGTGACCTTAAATCCAAGCAGAAAG
TGGTTGGTTGCACACATAGCATTTGTGCCATTATTGCATCAGTATATTTT
GGAGGGCAGGTGACTGCTTTATTGTTGCAGAATTTGTAGCTGGGTAATAT
TGATGACTACCTTTCTCTTCTAGTAGTATGCAGAGTACTCTACAGATACT
AGTAATAGTGTGAATCTTTGTTGATGGACATATAAACTGTTTCCAGTCTC
TCTGTAGTATGATGTAAAGTCCTTTGAGTATATGCTGAAAAGGATCTTGA
GGTANATGAATTCTCAGCTTCCTCAAAAAACTCCACACTGATTTTCATCA
TGGCTGTACCAGTTTGTACTCCCATCAAATGAATAAAAGGTCCAGTTTTC
CCGCATCCTCCTAAAAAGGGCTATCACTTGTTTTGTTGATCTTTGCATTC
TTTTCCGAAAAAAAAAAAATTTCTCAAGAAATTTTATATTCTTTTCCTCA
TAGGCAAAAAGTAGTCATAACGAAGGTTTCATTATTTAAAAATCTCTTCT
TTTTCTGCCCCAACTTAAATTGGATAATTTTTGTAGGTATTTTTTAAAAT
AAATATTACTTTTATATTATCGTCCAATACTATAAATTATTTTATTTCAC
ATCTATCTATTAATTAATCTCCGAAATATCATATCTTAAATAATATACAA
TTATNATTATTAATTGTATTATTAAACTTAAGCCATATCATATTTTTCCA
TATNTCATTTGCACCATAATTATATATTTCTTTCAGTCAATAAGTCA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 7 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 7 10 8 8 3 0 3 8 10 12 15 8 10 10 10 12 10 15 15 33 34 24 26 19 22
22 29 33 33 37 33 30 30 25 24 15 19 11 12 10 22 21 31 31 44 44 39 37 37 37 29 23 10 6 6 6 7 6 6 11 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 0 0 0 3 3
0 3 27 27 3 0 3 0 3 3 0 3 17 14 7 7 3 0 3 6 6 6 6 7 11 17 14 24 23 23 20 14 18 18 3 0 3 27 27 39 37 23 23 3 0 3 27 3 0 3
7 7 7 3 0 3 21 21 44 47 59 59 59 59 48 59 59 36 36 36 36 36 42 57 57 57 57 48 47 48 50 50 48 57 48 48 48 44 33 33 33 33 33 22 19 10 8 8 9 15
37 37 37 37 37 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 53 53 53 50 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 59 59 41 29 22 16 12 12 11 12 12 23 23 41
41 42 42 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 43 43 43 59 47 48 43 59 47 48 48 39 39 48
48 48 59 59 50 48 46 46 46 30 27 12 11 12 9 11 12 13 11 11 9 9 9 23 9 3 0 0 3 9 9 27 27 59 59 59 50 43 48 43 43 36 43 43 34 34 17 15 7 7
3 0 3 23 27 47 43 46 47 23 23 9 9 9 12 12 15 9 12 12 13 24 21 25 20 28 29 34 37 30 18 11 8 8 8 15 17 9 9 9 9 19 23 59 59 27 27 3 0 3
0 3 27 27 39 27 21 9 9 3 0 3 0 3 9 9 27 27 40 37 37 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 68 68 68 68
59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 48 48 48 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 47 47 47 59 59 59 59 43 43 35 44 44
68 57 59 59 59 57 57 57 59 59 57 59 59 59 57 57 57 54 54 54 57 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 44 44
33 33 33 44 44 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 47 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 43 43 43 46 46 59 59 68 57 57 57 47 42
35 35 35 43 43 59 59 59 59 48 48 48 59 48 48 48 59 59 46 46 46 59 43 39 38 34 31 39 35 35 35 39 39 41 48 59 59 50 57 57 57 39 34 28 25 25 34 34 59 59
59 59 41 41 41 37 37 39 37 37 41 44 44 47 43 59 39 39 39 59 59 44 44 44 37 37 44 59 59 59 59 59 59 59 39 39 36 36 36 37 27 21 14 11 12 11 12 17 22 21
14 11 10 10 10 13 13 19 25 29 24 24 24 30 25 31 36 31 31 37 32 24 26 32 30 30 30 31 32 34 34 23 23 23 32 30 37 37 35 31 31 39 39 41 41 41 41 41 37 32
32 20 22 22 22 28 28 23 19 17 17 17 22 31 32 36 36 24 17 12 12 10 9 10 13 21 17 30 26 18 20 12 12 10 13 11 11 12 20 20 35 23 23 10 10 10 10 10 9 10
10 9 17 9 11 11 10 10 11 11 16 17 11 11 11 10 10 10 11 14 12 10 8 8 10 12 13 10 10 8 8 11 15 8 8 9 10 11 9 9 9 17 12 12 10 9 9 9 11 13
12 9 11 9 12 9 9 13 8 8 8 7 7 9 9 9 9 10 12 12 9 9 8 8 6 6 6 6 8 9 9 8 8 8 9 12 11 8 8 8 8 8 15 7 7 8 8 8 9 9
10 10 10 10 10 9 9 14 9 9 7 10 9 11 12 21 10 9 9 9 9 9 12 12 10 10 11 10 10 10 9 10 10 10 10 11 13 18 12 17 15 11 14 17 15 11 11 12 12 12
8 6 6 6 8 6 8 9 9 10 10 11 11 12 23 27 10 9 9 9 10 9 8 8 8 11 11 11 9 9 11 8 7 6 8 8 6 8 8 9 9 9 12 12 10 10 10 10 19 8
10 6 6 6 7 10 9 9 8 10 10 9 8 9 9 9 17 11 14 14 17 18 18 11 10 8 8 8 8 8 8 18 17 6 6 6 6 8 6 9 9 9 9 9 10 11 11 8 6 6
6 8 8 6 6 6 8 10 8 8 8 17 8 11 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 13 6 6 8 6 6 11 8 9 6 10 8 10 8 10 8 7 7 7 7 6 8 6 6
6 6 9 9 9 8 8 7 7 10 6 6 8 6 7 7 7 6 8 8 15 15 8 6 6 8 8 8 6 8 8 8 8 6 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 10
13 8 8 8 8 8 8 7 8 8 10 3 0 3 6 8 8 8 8 8 8 8 10 7 9 13 10 15 8 6 6 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 13 9
10 11 11 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 3 8 8 8 9 9 9 9 10 12 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 7 7 13 10 8 8 9 6 6 6 6 8 7 9 15 15 12 8 9 9
21 19 19 8 8 19 23 35 35 35 37 37 37 29 28 29 36 38 38 36 53 41 50 50 50 47 36 27 18 9 10 9 8 8 8 6 6 8 8 10 19 25 31 31 33 33 50 36 35 36
36 36 35 35 42 42 35 36 36 35 35 35 53 31 31 31 31 31 30 23 21 9 9 8 8 8 19 27 31 31 31 33 33 36 36 50 53 57 50 50 57 57 57 40 47 47 47 47 47 50
50 50 51 68 68 51 51 51 47 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 51 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 51 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 68 68
68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 30 30 12 12 9 9 9 9 12 20 37 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50 53 53 53 57 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 43 43 43 46 47 54 57 57 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 59 68 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 54 50 50 43 43 52
57 57 57 54 54 59 59 57 50 50 35 35 35 50 50 68 68 59 59 57 48 48 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 59 48 57 48 47 47 39 39 39 59 59 57
57 57 59 57 54 57 57 57 57 57 54 54 54 57 54 59 59 48 43 43 47 59 59 59 48 48 48 59 48 48 48 57 48 48 48 48 48 48 47 39 35 32 34 28 34 43 47 47 43 43
30 30 17 19 17 30 30 36 36 36 32 32 33 33 33 39 43 48 48 48 48 48 48 46 46 46 36 34 31 24 19 25 27 37 37 32 34 28 28 28 34 32 37 43 36 36 34 40 41 41
48 48 48 43 43 41 41 41 43 43 48 48 57 48 48 48 48 47 48 32 37 33 28 34 23 23 23 37 37 42 40 23 27 11 15 15 32 32 43 48 47 47 43 34 34 25 33 34 31 31
37 37 36 39 32 41 41 37 39 39 39 41 43 41 41 41 47 47 40 41 32 31 39 37 37 36 41 36 39 43 43 46 47 47 59 59 59 43 41 29 29 31 26 25 29 30 27 25 21 24
30 28 28 30 30 30 22 24 21 28 37 37 37 18 18 10 10 9 9 10 15 24 27 28 30 30 24 25 18 19 26 19 19 10 10 10 13 17 33 32 26 26 14 15 21 26 25 20 23 11
11 11 19 3 0 3 18 8 7 6 6 6 11 14 13 10 10 10 13 13 15 16 11 8 10 10 12 12 14 16 11 11 11 12 12 13 18 18 26 21 13 10 9 9 9 9 11 19 21 18
17 12 13 15 13 14 14 14 11 11 9 10 17 13 12 10 10 11 15 19 22 28 12 12 10 8 8 8 12 13 13 11 9 9 9 12 10 9 8 9 8 11 8 8 9 9 10 12 12 10
10 12 11 11 10 15 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 21 14 10 12 12 8 8 10 10 12 8 8 8 8 8 8 10 10 10
9 11 8 8 7 8 8 8 12 13 12 19 22 25 25 24 27 18 18 12 14 11 9 9 6 6 7 7 9 9 14 14 13 17 13 10 8 6 6 8 8 8 8 8 7 10 6 6 6 6
6 8 6 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 13 7 6 6 6 9 9 11 11 8 8 8 8 12 12 8 8 6 6 10 12 15 13 8 9 8 8 8 6 9 9 10 12 10
9 9 8 8 8 6 6 8 6 8 7 8 9 10 9 11 10 15 13 14 9 8 8 8 7 7 8 8 8 11 10 8 6 6 8 8 6 6 8 12 8 8 8 8 8 10 8 10 6 6
8 8 10 11 9 8 10 8 6 6 8 8 13 11 10 10 10 8 7 7 8 13 6 6 6 6 13 6 7 8 8 8 9 9 10 8 8 10 12 17 10 10 8 7 6 10 8 8 10 11
8 8 10 8 8 8 8 9 9 10 11 13 8 8 8 8 9 8 8 9 9 8 8 8 10 13 19 19 13 12 8 7 6 8 12 15 9 11 8 6 7 7 8 8 8 8 8 7 8 7
7 8 8 3 0 3 8 8 9 13 15 30 18 22 9 8 8 7 7 8 8 16 22 19 15 13 8 8 8 8 6 6 7 8 8 8 8 7 6 8 8 7 6 6 7 9 6 10 12 14
7 7 3 0 3 6 6 7 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 8 10 6 6 6 6 8 8 6 |