BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-330E02.T7 (MSMg01no330_e02.b1) | MSMg01-330E02.TJ (MSMg01no330_e02.g1) |
ACC | AG446861 | AG446862 |
length | 711 | 718 |
length of high quality (start - end) | 316 (37 - 352) | 239 (109 - 347) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no330_e02.b1 PHD_FILE: MSMg01no330_e02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:15:56 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no330_e02.g1 PHD_FILE: MSMg01no330_e02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:15:56 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (33,441,253 - 33,441,560) | (33,617,151 - 33,617,387) |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCCTGC
AGGAGCATGGTAGGGAGCCTATGCCCAGAGGCTGCTCTGGCCCCCAGTCT
GCCTCCTCAGCCGCCCCAAACTCATGAGCGTGTGCATGTCTGTGACCACA
CATGTCTGACAAGCCCTTTGCCTAGCGTGGTCAGTCGGTGCACACAACAT
CTCATTTCTCTGGCTTACACCCATTCCCACACCATGGGAGTGTTCCCAAT
GCCGACACTGCTACTGGAACACCAGTACAATGTGTGTACATATATGTAGT
CTCTGTGCCCTCTCCTCCTGCATACATCTGCTTGCCAAAGCACACATGTT
TANCTTATTACCNTNACGTNCCCCTATAGCTTTTCAGCTTCTGGTATGTA
GCCACTGTTTAGAAAAAAAAAAAATCTACACATGCCTGCGGATCTCATGG
TGCCCCACCCTATGCACACATGCTGTACACATGGATCCCCACACATTGTC
ACAGGCCACTGATACTAGAAGTGCTTGTATGTGTGAACAGCCTGTGATTT
AACAGCTCCCAGTATGTTTTCACCCTCCTATACAGTGTCCGCACATATAT
GTGCTAATGTGTGGTCATCCCTCTCCGGCAGGTTTCCCGAGCATTTTCGT
ACCCAAAACCCATATGTGGCTTTAAACATACATTTGAGTATCTAATTTTG
TCAAATACCTT
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXATTTGAGGTAGGGAATATCTCTAGTTCTTGTCTTCTTGAATGA
AACCCCCCCAGTCAAAACACAGATATTTTAAGCAGAAGTTCATTTAGCAG
AGCAAAGCCAACAGTCAGACACAGTGTGAACTGCCCCCAACATGGAATAT
AGCCTAGTGCATTCTATGATATGGATTTAAGGTTTTAGAAATATTTATGA
GGTGGCATATTCATGAGGTGATAGTGACCCTTTTCCTTCACAACTCATGA
TGGACCAGATTTTTCTTTCATGGCATTTCTTCCCATGATCCTCTATTTTT
AGCCCCTCCCACCCCACTTGAGGTCTAAACCACAATGCACATGGTATTTT
AATGGTGCCATGTCTCTCGAGCATACTGACCCTTCATTAGCGCCTGTGGA
GGACATAGCACAATCCTAGCTACAGCTTTGAAAATATTCCACCACCCCTG
CGTTTTTGCTGCCCGGTAGACTCACCCTTGTTCCTCTTCAGTCCCCCCTT
TTCCTAACTCTTTCACCTTCCATGGTCCTCATACTGTCATATGTAACCTC
ATTTCCTGACCTGGTTTTTCTTCTGACACTCTTCACAGCCACCGATGCCC
TTTAAGCTCCACTGCCCGTCTACTTCTGTTGAGCCTTCTTCCTTACATAC
GCCCCCTGTTATTCCTCG
|
quality values | Open.Hide.11 11 19 22 30 30 25 22 22 18 18 21 28 25 28 40 28 28 26 31 36 29 26 14 13 10 10 11 13 18 18 12 9 9 13 13 26 25 43 59 26 26 23 23 34 42 43 43 31 28
17 17 9 11 8 8 8 15 20 36 57 48 48 48 48 48 57 57 59 59 59 59 59 48 42 42 41 42 42 57 57 57 57 57 57 57 57 48 43 43 43 36 39 39 39 39 47 50 59 59
43 43 37 43 37 33 23 18 11 9 9 11 12 12 23 23 37 37 37 37 41 41 47 36 38 38 57 57 57 59 59 59 48 48 57 59 59 59 48 48 57 59 57 57 48 48 48 54 54 54
54 54 57 57 57 57 50 50 54 54 54 57 59 57 54 59 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 57 57 43 43 39 43 36 47 35 35 35 42 47 43 43 43 44 44 50 50 54 59 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 57 57 54 54 57 59 59 68 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 52 52 52 57 57 57
52 52 52 43 43 50 43 43 57 57 57 57 57 57 57 48 44 44 46 46 54 44 44 32 32 32 44 37 42 43 47 47 47 44 44 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 48 48 48 59
59 59 59 68 68 59 59 47 31 37 28 39 37 35 32 43 42 57 57 48 48 48 48 48 57 48 48 48 48 57 57 57 59 34 33 28 28 36 36 48 59 47 47 47 30 25 11 15 8 8
7 3 0 3 6 6 6 6 18 18 13 3 0 3 0 3 9 9 3 0 3 12 12 16 16 15 24 19 28 28 34 34 48 43 43 43 48 48 57 59 59 43 33 29 35 35 35 36 57 37
32 23 28 25 28 34 23 28 12 12 10 12 9 9 9 12 22 24 23 12 14 14 14 11 11 11 11 12 16 16 19 19 22 21 21 19 22 9 8 8 8 8 13 22 26 19 14 12 12 10
19 16 17 23 28 28 25 22 22 22 31 31 34 37 28 23 23 23 28 28 35 42 31 28 20 20 18 18 18 13 12 11 12 8 8 13 13 15 15 10 12 10 11 15 19 28 19 17 13 10
10 10 10 14 15 22 12 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 12 12 10 13 13 11 10 15 9 9 10 15 16 12 12 12 18 15 16 14 12 10 19 12 12 11 12 12 11 16 10
12 10 9 9 9 11 15 19 12 12 11 10 11 11 12 12 13 13 11 11 11 11 13 14 18 14 16 17 19 14 13 12 11 15 16 15 19 19 15 10 10 10 9 9 10 10 8 8 10 10
16 17 17 10 9 9 9 9 9 8 8 9 9 9 7 7 9 10 10 10 15 19 14 14 15 10 8 8 8 8 8 8 8 12 13 13 10 10 6 6 6 6 10 13 8 12 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 8 13 12 10 10 9 9 10 9 9 9 12 16 10 10 9 9 9 9 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 9 8 10 10 13 17 10
9 9 9 8 10 8 8 8 10 8 8 | Open.Hide.26 30 30 33 37 37 37 37 40 39 34 25 16 6 6 7 7 6 8 8 10 19 24 26 24 34 23 34 34 47 36 36 36 33 33 33 41 41 28 23 12 10 6 6 6 8 8 14 18 23
14 14 14 28 27 37 33 33 36 36 59 59 48 48 43 57 43 37 37 33 33 39 43 48 53 50 50 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 25 16 9 9 9 9
13 12 12 12 13 11 11 11 11 25 25 37 37 41 41 37 39 47 37 31 22 28 28 37 43 48 50 48 43 47 43 33 33 32 32 29 29 29 32 43 39 42 42 43 43 32 32 32 28 28
25 30 30 42 44 48 43 43 48 48 48 57 57 59 54 54 54 57 57 48 48 47 47 47 47 57 44 44 48 57 57 59 48 48 48 47 57 47 57 57 57 57 57 57 57 47 50 50 57 57
48 48 48 57 57 52 52 52 52 52 44 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52
52 50 57 50 50 37 42 42 44 44 44 43 33 33 43 42 42 41 35 35 42 42 43 43 37 43 43 57 57 57 59 59 59 43 43 43 34 34 30 30 30 44 44 59 47 48 48 44 44 35
35 35 39 37 36 28 23 23 23 37 37 35 35 35 42 42 43 43 33 33 23 28 20 32 32 32 26 33 37 43 43 43 43 43 43 43 43 43 48 32 32 18 19 13 14 13 10 8 10 8
11 11 12 15 18 11 10 10 10 13 10 16 13 10 10 10 16 13 19 28 21 28 24 20 18 18 18 28 28 18 14 14 15 21 23 28 28 25 25 24 30 22 21 15 24 19 28 27 42 42
32 30 18 18 10 10 8 10 12 13 13 12 12 12 11 11 11 11 16 18 32 18 18 15 20 13 10 10 17 21 42 42 36 36 23 23 18 24 11 11 10 10 12 21 22 24 28 20 21 20
32 14 8 8 8 8 8 8 8 15 24 30 39 37 41 32 26 24 17 17 21 25 19 28 28 24 26 25 16 16 14 10 10 10 10 10 14 18 21 12 12 12 10 10 10 10 9 9 12 10
10 9 9 9 14 14 15 16 12 12 12 15 16 16 15 11 13 11 10 10 8 8 8 8 8 8 17 14 11 8 8 8 8 9 9 10 10 10 8 8 9 10 10 10 14 12 9 9 12 11
12 12 8 8 7 7 10 12 10 12 12 13 9 10 10 15 15 15 11 10 10 10 10 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 18 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8
8 8 9 13 24 16 9 9 9 8 8 8 8 8 9 11 14 17 20 13 13 8 8 8 8 10 9 9 9 15 12 11 12 10 10 10 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 10 12
14 14 13 16 10 8 8 8 8 6 6 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 12 11 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11
10 10 10 10 16 12 11 11 11 15 15 12 8 8 6 6 8 6 |