BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-334F04.T7 (MSMg01no334_f04.b1) | MSMg01-334F04.TJ (MSMg01no334_f04.g1) |
ACC | AG449848 | AG449849 |
length | 702 | 699 |
length of high quality (start - end) | 658 (45 - 702) | 532 (81 - 612) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no334_f04.b1 PHD_FILE: MSMg01no334_f04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:21:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no334_f04.g1 PHD_FILE: MSMg01no334_f04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:21:43 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCAAGGTCCATACCTAAACATAGTAAAAGCAATATACAGCAAACCAAT
AGCCAACATCAAACTAAATGGGGAGAAGCTGGAAGCAATCCCACTAAAAT
CAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTCTCTCTCTACATATTCAATATAGTA
CTTGAAGTCCTATTTGGAGCAATTAAACAACCAAAGGAGGTCAAAGGGAT
ACAAACTAGAAAGGGAGAAGTCAAAATATCACTATTTGCAGATGATATGA
TAGTATAATTAAGTGACCCCAAAAATTCCACCATAGAACTCCTAAACCTG
ATAAACAACTTCAGCAAAGTTACTGGATATAAAATTAACTCAAACAAATC
AGTAACATTCTTCTATTCAAAGGATAAACAGACTGAGAAAGATAGGGAAA
CAACACCCTTCACAATAGTCACAAATAAAATAAAATACCTTGGTGTAACT
CTAACCAAGCAAATGAAAAATCAGTGTGACAAGAATTTCAAGTCTCTGAA
GAAAGAAATCAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCGTGCTCAT
GGATTGGCAGGATTAATAATAGTAAAAATTGCCATCATGCCAAAAGCAAT
CTACAGATTCAGTGCACGCTCCACCAAAATTCCAGCTCAATTCTTCATAG
AG
| TCGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAACCTCACAGAGACAAAGA
GGATCCTAGTAAAAAGATAGCCTGAGCATCCAGAGAGGCCATTTGGAATC
TGTAGCATGATATAAGCTTACCTATATAGACTAAAATTTCATGATACCGA
GGAACGACTAAGAAACCGAAAAGATTTTTGAGACTGGAAGAAGTAGAAAT
TTCAGTTGCCCAGACCTAAAGACCCCCTGTGAACACCCAGAGCACTTAAT
ATTAATTTCGGAAGGGTCACATCGTAAAAATAGGATCAAACGTTCACTGG
AATCAGGATCTTCATCACCTCTGTATAAGCTAATCTCAAGGAATCAAATC
TATGAACTAGCAGTTCATTATATCCCAGATCAAAGTCCACCAATTTTTAA
ATATTGCAATTAAAAAATAATATTGAATGTCTAACATCTTGTTATGTTAT
GTATAAATAGTTCAAATCTATTAAATAATCATAAAAATTCTTTCAGAAAA
ATATCATTGCTATGATAATAAATTAAAAAGAAATATAAATATTGTAAGTA
TGCCCTCATGGTTAAGCGAAATTATTAGTTTTACCAGGTAGAGAGTTAAC
TTAGGAGCAATTAAATAACATTTATGTGCATGCAAGATTAAGGAGTGAA
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 8 10 19 34 34 33 32 30 25 25 37 22 23 22 24 26 28 48 43 28 24 24 20 22 17 21 11 11 11 16 11 9 9 11 10 10 10 10 10 19 23 47 39 31 31
30 30 33 28 28 33 27 28 16 11 12 12 12 16 12 12 12 12 21 26 33 33 33 33 50 50 50 57 44 44 43 48 48 57 57 59 57 40 39 39 42 42 39 43 37 33 33 43 44 46
59 42 28 28 28 36 42 42 39 39 37 48 43 47 47 48 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 54 54 42 48 37 39 44 43 43 43 42 59 48 50 50 37
37 37 50 50 50 47 50 50 57 57 43 52 52 57 57 57 57 57 59 52 52 52 52 57 52 52 52 52 52 52 52 52 43 57 52 54 57 57 57 57 52 52 57 57 68 68 68 57 59 45
57 57 57 57 68 57 57 45 45 57 57 59 59 68 68 68 59 59 52 52 52 57 57 68 57 57 52 52 43 43 52 45 45 59 57 68 68 68 44 44 35 35 43 59 62 62 62 62 62 44
43 35 35 59 43 43 43 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 45 45 52 62 62 68 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 43 43 39 39 43 35 35 43 44 62 62 62 43 43 43 43 43 52 43 44 44 62 62 44 44 45 52 43 43 59 62 52 45 52 52 62
62 68 62 62 62 54 54 62 62 62 43 39 39 62 62 62 62 62 68 62 62 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 43 43 31 44 43 62 62 62 62 52 43
43 44 44 62 52 52 43 44 43 52 52 52 52 52 62 44 43 31 31 44 44 62 62 62 62 62 62 52 52 52 59 52 52 43 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 52
52 52 52 52 43 45 52 52 52 52 45 45 57 57 57 57 59 59 45 43 52 52 52 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 52 44 44 54 57 57 50 59 43 43 43
52 43 44 43 35 35 42 44 43 48 48 59 59 59 59 59 59 68 50 48 43 37 37 44 44 54 44 44 43 37 37 44 48 57 68 57 43 37 30 30 42 44 41 41 41 41 43 44 44 57
57 59 59 59 59 57 47 47 37 36 28 37 33 47 47 57 57 57 42 42 34 31 25 34 43 57 57 48 48 48 57 59 59 43 44 39 39 39 36 39 28 28 21 34 34 34 28 35 35 39
36 41 44 44 43 59 47 47 47 41 41 41 41 41 39 37 41 37 37 39 39 39 41 42 50 37 37 37 37 37 30 25 25 37 37 41 41 59 37 31 31 31 31 39 43 43 37 29 29 23
23 28 31 28 36 43 43 43 43 37 37 43 43 43 43 39 43 37 37 30 37 30 33 33 36 36 40 40 39 31 31 35 35 35 39 37 36 32 22 18 18 15 21 24 34 31 31 31 27 27
27 24 | Open.Hide. 6 6 6 6 10 10 10 9 10 17 12 26 27 28 37 37 37 31 29 32 37 37 37 37 33 33 30 33 33 19 19 11 7 7 6 8 8 6 7 7 7 10 13 11 16 20 21 39 37 33
36 33 28 28 33 37 37 42 30 21 16 8 8 8 8 8 8 11 11 20 14 22 29 29 33 29 28 24 29 29 39 35 28 32 32 39 32 32 39 39 43 42 42 28 22 22 36 42 59 57
42 42 42 42 33 33 36 44 44 68 68 68 68 68 51 51 50 48 42 37 30 30 36 38 38 47 39 43 43 46 37 39 57 57 68 57 57 46 43 43 44 57 57 68 68 50 40 42 32 37
37 44 44 57 48 48 50 50 50 50 50 50 50 57 57 52 52 52 57 52 52 52 52 59 59 68 68 59 59 54 57 57 59 57 68 68 44 44 52 37 37 57 57 57 57 52 52 57 57 57
57 57 57 57 57 57 52 52 43 44 43 57 44 44 43 52 52 43 44 44 57 57 57 57 68 57 57 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62
62 62 43 43 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 43 43 43 44 44 62 62 62 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 52 52 62 62 62 62 52 52 43 62 62 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 39 39 43 43 43 39 43 29 39 39 43 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 43 43 41 43 43 43 44 43 43 43 43 43 62 62 62 62 39 39 43 44 59 35 35 43 35 23 44 44 62 52 52 62 52 52 52 62 62 52
52 62 62 62 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 43 43 35 43 44 59 57 57 59 59 35 35 35 43 43 52 52 52 52 57 59 59 59 59 57 43
43 52 57 57 59 57 52 52 52 52 43 37 50 50 52 52 52 57 54 54 54 57 59 59 59 59 59 57 52 52 52 50 50 50 50 47 47 43 43 42 29 29 43 43 43 35 42 42 42 43
35 35 35 43 43 57 57 47 47 35 30 28 37 33 39 37 43 43 57 46 46 46 59 44 35 39 39 39 39 39 39 39 39 37 37 39 27 27 22 24 28 37 30 37 30 30 30 39 37 47
48 48 42 34 30 30 30 39 39 43 43 48 48 43 43 43 43 39 37 28 28 28 32 32 34 31 19 19 28 28 24 26 30 37 37 37 35 35 35 35 37 32 26 15 15 14 15 15 32 20
28 24 28 28 24 24 20 31 25 26 16 12 12 18 16 15 12 12 15 19 24 30 30 37 37 32 24 20 18 17 27 30 27 27 16 12 12 15 11 11 11 15 23 31 22 22 16 20 12 11
11 16 12 13 13 26 19 17 17 17 13 28 24 22 16 11 8 8 8 10 11 29 29 19 14 10 12 8 12 10 10 8 10 10 13 18 20 20 20 23 20 23 26 26 23 28 28 34 30 |