BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-378D09.T7 (MSMg01no378_d09.b1) | MSMg01-378D09.TJ (MSMg01no378_d09.g1) |
ACC | AG483112 | AG483113 |
length | 764 | 765 |
length of high quality (start - end) | 529 (49 - 577) | 537 (77 - 613) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no378_d09.b1 PHD_FILE: MSMg01no378_d09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:18:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no378_d09.g1 PHD_FILE: MSMg01no378_d09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:18:39 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNTTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCTCAACTGATCAATCTTGAATGGCGAGAAGCACCTAAAGAAAC
ATTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAATCAGAATGACATTGCTAT
TCCACCTCACAGTAGTAAGAATGGCTAAGATCAAAAACTCAGATGACAGC
AGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCACTGCTGGTGGGATTACAAGCT
GGTACAATCACTCTGAAAATCAGCCTGCCTATTCCTCAGAAAACTGAAAA
TAGTTTTCTTGAGGACCAAGCCATACCACTCCTCGACATATACCCAAAGA
TTCTCCAACATATAATAAGAACACATGATCTACGATGTTTATAGCAACCT
TATTTATAATAGCCAGAAGCTGTAAAGAACCCAGATGTCCTTCAACAGAG
GAACAGATCAAGAAAATGTGGTACATTTACACACTGGACTACTATTCAGA
TATTAAAAACAATGACATCAAAAAATTCTCAGGAAGATGATGGAACTTGA
AAATATCATCCTGAGTGTCATAACCTGTTGTGTCCGGCCAGCAGCTCACA
TGTCTGGGTTCTAGTCTGGAAAGGCATCTTGGAAACCTGGAAGAGAAGAG
GGAGCTAGGTGGATGAGAGAAGATGTAGCTTAGACAANTTCTGATCAAAG
CTCAATTTACTAATTCCGACACTCCCTTTTGAAGGAGGGAAGGGGCCCGA
ATTCCACCAACCAT
| CGATTGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAGGCCTAAACTTCACAAAAAGCA
CCCAGTATTTTCCTAGATTTGAGATTCAAAAAGAATTTTCCATTCTATTT
CTGAGTAACATTCTGACTTCATCCTTGAAATTCTTTCCCACCCAGACTTT
CCCTGGTTTTCTCATGATCTTCTTACTTCATTAACAGTCTTTTCCTACAA
AGTGTGTTTTTCACTGCTCACTCTTTCTTCGCCGGGGTTCACTAACATCA
TAGTAATGTTCTATGACTCCCTATAACTTTAACATTATGAACTGGGATAT
TTTTGTGGATTTTAAATGTAGTCTGAATCTTCTTCCTCCTACAACTCCTT
TTTTCTTTTTATATATTTTTGGGGCTGATATACCTAAATCTATTATTTTC
ACCCATTATCTAATAGGCATGTTCTTAATCTCCATGACGGCCACTGATAT
AGTCTCCAAGACAGAGCTATAACCATCTTATATTCATCCTAGTTCTTTAT
TTTATGTCCAGGGCTCAAATCAACATGTAATTTGCTCATTGAGCTAGTGA
ACTAATCTATGTGTTTTTTCCCCTCTGCAACATCATAATAGGTGGGAACC
TATTTTAAATATTTACCACCTAGTCCCTAAAATAACACATTACACCTTAT
TTTTAATCCTTTCCTTATTAAATGCTCTTAAAAGTTGCTGTCGGAAAAAG
AATCATTCTCTTAAG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 16 11 35 28 23 23 14 14 14 27 27 30 26 23 37 28 29 37 37 27 26 25 24 20 21 21 8 8 8 8 8 8 13 28 19 19 21 18 18 30 41
53 57 36 36 35 35 37 42 47 47 47 40 30 28 28 15 15 15 19 19 23 34 43 59 47 47 47 47 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50
50 50 51 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 57 48 48 43 46 57 57 59 57 57 57 57 57 57 47 47 43 43 43 57 57 57 57 57 57 59 59 57 50 44 39 39 35 30 39
39 39 39 39 34 37 43 41 41 41 41 40 41 46 46 43 39 39 35 35 35 59 39 48 41 41 47 41 34 34 25 20 30 32 24 32 20 24 24 37 33 31 36 36 37 41 41 41 41 31
31 39 31 37 37 47 35 36 39 59 47 34 28 18 14 14 14 14 14 25 25 31 31 32 22 30 17 14 14 15 15 20 23 19 24 24 14 14 14 19 21 30 25 28 24 24 18 20 25 31
32 30 30 30 37 30 34 32 32 28 33 32 23 20 20 20 28 24 31 31 34 34 29 24 28 25 28 31 22 24 12 12 14 16 16 17 26 18 15 12 16 9 7 9 9 9 7 6 6 8
8 9 9 17 17 24 24 22 22 28 25 29 36 23 18 10 8 8 8 9 9 9 11 12 12 20 10 10 8 8 8 7 9 9 10 10 3 0 3 10 13 15 16 15 10 8 8 8 8 8
11 13 10 8 8 8 15 8 8 9 8 6 6 6 8 6 11 12 8 8 9 9 9 8 8 8 8 11 15 8 8 10 12 8 8 10 9 8 8 8 10 10 10 11 16 16 16 10 10 10
9 9 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 | Open.Hide. 7 7 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 15 16 29 29 41 37 37 41 41 39 39 37 32 32 37 35 25 25 10 9 9 9 9 9 13 22 14 19 20 29 27 39 53 57 57 47 42
50 43 43 37 47 53 53 53 53 44 35 19 14 21 21 26 32 41 48 59 42 47 42 50 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 54 54 54 54 57 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 47 47 39 37 37 31 31 37 37 37 41 42 50 42 48
48 48 48 57 47 47 47 47 47 47 48 48 46 47 43 41 41 41 41 39 39 39 36 32 41 41 43 43 41 40 40 48 43 43 36 36 36 43 37 37 37 30 25 32 37 29 31 39 35 31
31 39 37 31 31 25 25 25 34 34 25 26 34 34 28 28 28 26 27 34 28 24 24 34 30 30 28 27 23 24 27 25 34 23 23 23 28 28 25 30 34 30 30 34 25 28 15 15 12 21
18 35 31 27 26 32 23 28 20 23 11 11 11 11 11 21 21 19 18 12 12 12 16 22 15 15 12 11 11 13 15 18 28 28 31 25 22 17 17 12 16 11 8 6 8 8 9 9 10 11
14 15 25 23 19 8 8 8 8 8 9 24 23 25 19 15 14 12 10 11 13 10 9 9 9 15 8 10 10 11 11 8 8 11 12 12 13 15 13 12 9 9 9 8 8 8 9 9 10 19
22 27 32 11 10 8 8 8 8 12 12 18 13 12 12 12 12 12 12 12 14 11 11 10 8 8 8 8 8 9 9 9 8 9 11 11 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 |