BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-384B04.T7 (MSMg01no384_b04.b1) | MSMg01-384B04.TJ (MSMg01no384_b04.g1) |
ACC | AG487595 | AG487596 |
length | 754 | 748 |
length of high quality (start - end) | 221 (34 - 254) | 489 (64 - 552) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no384_b04.b1 PHD_FILE: MSMg01no384_b04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:26:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no384_b04.g1 PHD_FILE: MSMg01no384_b04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:26:17 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCTTACTCC
TATAATTTTCTTATGTCTTCCCATGACCCACATGTACCTCCCAGGACTCC
CCACATACATATTCCCTACCTTCTTAGTTCCTGACTCGTGTCCAAGCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACACACACA
CACAAACACACACACACACACACATCTTTACTTTTTCCTCCCTAGCACCA
TCCCCATCCCTTTCTGGAAACAGGGTGAAAAAGGGCCCAGAGTTTGACCC
AGAGAAGAAAGTTTTGCCTGGGACAGGGAAAGAGAAGACTGAAGTCAGGA
CAGCTCCCTGATCTTAGAGTAGAGGTATCAGGCCTCGGGAAACCCAGGGC
TATTCAAAGGTGGGCTATCTAAGGAGTGGGCTTCTTGCATTGTGGGGATG
ACTCTCCTGGGAAGACGCTCTGTGCTCCTGCTCTGAGGAAAGGAGACACT
TGAAAAGAGCAGATTGCAAGCGTCACATGGCCAGACTGCTTTACAAATTT
GGTGTCCGTGCTATAACTATGGCCAAAAAATTTGTTCAAAGCCCATCCTT
TAAAATTGGATTTAGTAAAGAAGAGAGTGTTCCCAGTCTTTTTTGGGGTG
GAGAAAAGGGGCCCCCATGGGGGAGGTTTGAGAAAGTACCACTGGTGTAG
AGGG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXTATATCTGGATCAGCAGGCAGCAGGAAGATAAAGTCA
CACTAGGTCTTGCTTGAGTATTTTGGACCTCAAAGCCTACGACCAGGGAC
ACACTTCCTGTAACAAGGCCACTCCTACTCCAACAAGGTCACACCTTCTA
ACAGGGCCACTCCTATGGTCTATGCGGCCATTTTCTTTCAAACCACCTCA
TCTGGGAAGAATGAACCATTGTTTGGAAGAACAGTGATTAAAGAGAAGTG
AATGAATGAAGGGCTGGAGAACTGGCTCATCAGTTAGGAGCATTTGCTGC
TTTGCAGAGGACCCAGGTTTGATTCCTAGCACCCACATGGTGGCCAATAA
CTGCCTGTAACTCTAGAGTCAGAGTATTTGATGTCCCCCAAGGGCTGCTG
CTTGCCATGGTGCATGTGAATTCACAAAAATAATTTTTAAAAACTTAAAA
ATAAATGAATGAATTGACATATGCATATATTTATGTTCATCAGGAAATCA
GAAGTGTGTGGTTTAGTCATGACATACTAGAGCTCTATTAGGCTTTTGTA
GGAGTGTGATTGTGGCTCCTGGCTCCCTGATGAAACAGAGTAATCTGACT
TGGGTCCCATTGGGTCCCGAAGAATCAAAGGTGCACCGTGAATGGCCCCC
CACCAAATAAAATGGCTCTGAGCAACATCACCCTAGTCCTTTAACTTG
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 15 19 10 10 8 8 8 23 23 59 30 30 30 30 31 36 48 53 50 50 50 50 47 47 59 28 25 12 12 12 23 31 59 47 33 33 33 33 36 36 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 59 48 48 48 50 50 50 68 50 50 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 51 51 51 51 51 50 68 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57
52 52 52 52 45 62 62 52 62 52 62 52 43 43 41 41 41 35 35 18 17 16 16 23 23 23 23 23 31 31 35 35 35 35 24 24 13 13 13 15 16 23 26 31 35 35 35 35 27 18
16 16 12 12 16 12 12 14 15 26 27 20 20 18 28 28 43 43 43 35 35 31 27 27 35 35 35 43 43 35 35 35 43 41 41 35 35 35 28 16 14 14 13 15 15 12 12 12 12 18
18 20 18 13 13 13 13 13 13 13 18 24 23 18 23 23 44 38 38 20 20 20 38 28 35 35 43 43 52 52 52 52 41 41 21 21 20 32 32 43 43 42 38 38 43 43 43 32 32 35
43 43 29 27 27 28 28 23 43 43 32 32 37 43 32 32 20 20 27 41 36 37 28 28 28 40 44 57 54 54 48 59 48 44 44 34 32 14 14 14 27 25 27 22 22 30 37 44 44 37
37 37 39 40 39 37 35 35 37 39 39 30 30 30 42 34 25 19 11 11 21 25 30 40 28 25 28 34 32 28 28 20 17 17 25 26 32 37 37 31 34 23 23 23 28 31 24 17 12 11
11 11 22 22 28 23 20 29 19 19 16 24 20 24 28 32 32 28 28 28 25 25 23 23 23 23 25 34 32 39 39 39 47 47 30 25 12 12 12 15 15 12 12 14 26 18 20 11 11 11
12 12 12 12 13 24 24 30 22 22 25 25 18 19 18 19 20 28 28 39 47 32 28 15 14 14 14 14 24 13 13 13 24 19 18 10 10 10 10 11 17 23 20 11 11 11 11 10 10 9
8 15 9 11 11 9 15 11 11 11 20 23 11 10 8 8 8 8 8 10 18 11 13 10 9 9 9 9 7 7 6 6 8 8 9 9 14 14 21 13 12 13 11 11 12 24 9 8 8 8
8 8 8 6 8 6 10 6 6 6 11 10 10 10 10 8 8 10 21 21 11 9 8 8 10 10 9 9 12 15 14 9 9 11 11 11 16 12 13 20 11 10 10 11 10 10 10 10 8 8
8 8 9 8 10 10 10 7 7 6 8 6 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 9 9 9 10 8 8 9 17 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
10 6 7 7 8 17 10 9 9 11 9 9 10 10 13 8 8 8 9 9 12 16 9 9 9 11 11 10 8 8 8 8 8 13 10 8 6 6 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 10 7 | Open.Hide. 7 7 8 9 26 37 44 39 37 33 32 32 28 28 37 44 37 41 41 40 40 48 48 47 32 29 21 28 28 36 29 48 53 53 50 44 37 36 36 47 48 48 57 57 68 68 68 68 42 48
41 41 47 47 57 57 57 42 48 41 41 43 50 59 68 68 68 68 68 68 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 50 50 47 48 48 50 57 57 57 57 57
57 57 57 57 68 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 59 59 57 59 57 57 57 57 57 57 57 50 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 68 68 68 68 68 59 59 68 68 59 59 54 54 59 59 59 68 68
68 68 68 68 59 59 59 59 68 59 59 54 48 48 59 59 59 59 57 57 59 59 57 54 54 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 50 50 47 59 59 59 43 41 41 44 59 59 59 59 47 47 48 48 43 43 43 37 37 39 43 43 57 57 57 48 48 48 48 48 57 57 57 48 48 59 59 48 48 48 48 48 48 59 48
47 41 41 41 39 39 35 34 32 39 37 34 32 41 41 41 41 41 41 41 59 43 48 48 43 43 43 43 48 48 48 48 41 41 25 25 25 31 31 37 37 32 31 31 39 37 37 26 24 15
16 24 24 23 26 13 16 14 15 12 14 11 14 18 14 13 19 12 12 14 28 15 20 20 29 26 23 23 16 16 13 21 21 20 19 16 19 13 16 10 14 14 30 18 21 26 16 10 10 19
15 15 18 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 10 10 13 15 11 11 15 10 12 9 9 8 8 8 8 10 12 11 9 9 9 9 9 7 8 7 9 10 12 22 22 11 8 8
11 9 11 17 15 9 8 8 10 10 15 14 8 8 8 8 8 8 11 8 9 9 8 8 10 10 9 9 11 14 6 6 6 6 6 7 10 9 9 8 9 8 8 8 8 12 12 22 16 9
8 9 8 8 8 9 9 9 9 16 13 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 14 9 8 8 8 8 8 9 10 13 13 11 8 8 8 8 |