BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-428A24.T7 (MSMg01no428_a24.b1) | MSMg01-428A24.TJ (MSMg01no428_a24.g1) |
ACC | AG521115 | AG521116 |
length | 766 | 770 |
length of high quality (start - end) | 235 (329 - 563) | 534 (70 - 603) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no428_a24.b1 PHD_FILE: MSMg01no428_a24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:50:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no428_a24.g1 PHD_FILE: MSMg01no428_a24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:50:07 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | plural | unique |
---|
Map location. | (90,992,339 - 90,992,573) | (91,164,579 - 91,165,112) |
---|
sequence | TXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCCAAGACAGTTCCCGCTACACAGAGAAACCCTGTTTCANAAGAAAAAAA
GAAAAAGGAAAAGGAAAAAGAAAAAGAAAAAGGAGGCATTTAAGTGTTGT
GATGAGAACAGATTTCATCTCAGATCCGCAGAGGTGTGCAGACCTCACAT
GGAAACTGCTGTACTCTAACAGCTGGAGGACTGAGAGTCCCCACACTGAA
CAGAAGGACCAACACCTCACCTGGACTACTGCCCCAGTCTCTAAGCTACT
AACTATAACTACCCACCTCTAATTTACTAACTCTAACTACCCATTCTCTA
AACTCCTAACTCTAACTGCCCATTCTCTAAACTACTAACTACCCATTCTC
TAAACTACTAACTCTAACTACCCATTCTCTAAACTACTAACTATAGCTAC
CCATCTCTAAACTACTAACTGTAACTACCGATTCTCCTCTAAACTAGGCA
TTAACTGGGCTGCATAGCAGCATGGCAGACACGTTTAGTGTGAAAGCGCT
GTATAGGCAGGGGGACACGCAGGATAAAAGGGACGGTCCGATGTGTTCAC
CAGGCTGTTCAGCCTGATCGAGCACCTCATTGACTTGCTGGCTGCACACC
TGCCCACTGTGTTACTTTCCCATTAGGCGCCGTACTTTCTTCCTGAAGTC
CTTCCTGTTCTCCTGCTAAGCCAAGAACGGATTCTCTATTAATGGCTCTG
TTTCTCTTTCCCAGCG
| TGCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTCTGCTTCGCTGCTGGCTGCTGCCAGACA
CAGAGTGCTAAATCCTGTCAGTCGGAGACTTCAAATGCTGATGTGTGAAA
CAGTGCTGCGAACTGGCGAGTTGGCGCCCGAAGCTCATTCAGGCTGACTG
CTTTGCCAATTAACCATGGCAGTGGAAGGTGACAGCACAGAGGAGAAGTG
TACTTCCACTGCCCATGCCATATCATCACTGTGGGAACAGTGTACCTGGC
CATGTCCCCATCTTTCCCTTTGTCAGTAGGCCACTCTAGTCACTGGTAAG
CTTCAATTCTGTTTCCTTCAACATCGTTCCTTTCCCAAGCCTAATAGAGC
AATTTCTTTAACAGCTTGCAACACACCAGGGATAGAACTAGCATTAATGT
GCAGAATGGAAAAGCAGAGAGCAAAACACTTTTGCAGCTGGCTCCTAGCA
TCTTACATGCACCCCACCCCACTTCCACCAGTGTGTGGCTGCCTCCTCTT
CTGGCTCAGTGACATCTCCAGCAGGCCAGCCTCCACTCCCCTGTTTCATG
TGCTCCTGCATGCTTCTACCAAATGCCACACCTCTCTCTACATCTCACCT
CACTTCCCCTTCTTAAAATATTTTTTTGTCTTTGCTGCCTGCATCCCCAC
ACCCCGGAATATAAGCACTCCCAAAAGGGGATCTTTATCCCCCTGGGGTG
TTACACCCATTTTCTTCCCG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 13 10 14 17 23 13 6 6 6 10 19 19 25 24 22 32 32 39 39 41 32 30 22 22 22 21 19 6 6 6 6 6 6 9 11 11 12 14 14 12 12 18 23 18 14 13 12 19
16 14 8 8 8 21 23 11 9 9 9 12 12 15 10 11 12 21 25 20 19 22 22 22 30 34 23 19 19 19 23 28 44 47 41 33 21 19 3 0 3 23 23 44 47 39 39 44 39 37
39 31 32 32 31 37 28 37 37 31 31 31 37 30 30 24 20 22 28 31 24 27 27 25 27 32 32 30 31 31 31 31 34 38 39 39 39 42 42 41 41 37 33 25 22 18 15 15 19 22
27 28 28 29 29 33 32 37 32 33 28 19 23 19 19 11 27 12 16 16 23 23 42 39 43 43 48 43 57 46 43 41 48 48 48 68 68 57 57 57 59 59 57 34 44 23 23 23 32 32
48 57 57 68 57 50 50 50 54 41 41 20 20 28 35 35 48 42 42 42 48 48 43 57 54 54 48 43 23 23 12 12 16 15 11 11 12 12 28 30 39 37 28 28 13 12 19 27 24 28
24 22 15 15 14 14 17 25 39 44 47 47 50 28 28 21 21 13 30 30 57 43 43 40 40 43 43 57 59 59 59 57 57 59 57 40 43 25 25 31 43 41 59 59 59 59 59 43 43 43
43 43 50 57 59 59 59 57 57 48 50 48 48 59 47 47 43 25 25 10 10 9 9 9 9 11 11 11 16 16 32 36 59 59 59 50 50 50 53 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
48 48 48 57 48 53 68 68 54 57 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 57 47 52 52 57 57 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 59 59
59 54 54 54 57 57 57 50 43 32 38 29 43 43 43 50 48 57 50 43 43 43 43 50 35 43 43 50 50 57 57 57 57 57 48 54 48 57 47 46 59 59 57 57 57 46 43 43 44 57
59 44 43 37 37 42 42 47 47 36 37 23 26 21 41 41 37 36 26 26 26 44 40 43 32 32 32 32 35 39 39 43 42 40 32 26 15 14 14 28 23 24 32 33 36 37 42 39 39 33
33 28 28 28 23 23 28 31 28 22 15 12 12 11 11 11 12 12 19 15 13 13 14 22 22 24 25 25 20 31 28 25 21 16 12 9 10 19 16 16 28 30 17 9 8 8 8 13 23 25
28 17 15 18 25 25 20 20 23 28 23 20 30 29 29 32 23 23 12 9 8 10 8 13 15 17 16 12 12 12 23 23 25 25 20 21 22 24 19 15 18 18 15 14 10 10 10 10 12 11
10 10 13 18 12 10 10 10 18 19 13 11 10 15 20 12 16 13 10 10 14 14 11 16 11 14 13 17 11 13 16 11 11 11 18 15 23 18 10 10 9 9 9 10 15 8 8 8 10 10
13 9 12 9 9 9 8 8 12 8 8 8 7 10 6 6 8 8 10 10 9 12 12 11 12 12 12 12 11 11 11 11 11 8 8 8 8 10 10 12 11 11 10 10 10 13 14 15 9 9
9 8 13 9 8 8 8 9 11 10 13 10 8 8 8 8 | Open.Hide. 9 9 9 9 8 8 8 11 9 13 14 19 14 32 37 32 32 32 32 37 32 32 37 37 32 23 21 10 9 9 9 8 8 8 8 10 13 14 21 15 18 18 25 19 13 13 17 28 21 37
37 37 34 27 14 6 8 6 6 6 6 9 12 12 10 11 13 16 22 34 46 47 50 50 50 53 53 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 50 48 42 42 42 42 42 42
42 42 42 51 57 68 68 68 68 68 48 48 43 46 48 48 44 57 39 39 36 42 47 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 57 54 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 50 50 54 59 59 68 68 68 68 68 57 57 54 54 57 57 42 44
42 43 44 59 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41 30 21 14 13 13 12 15 11 11 12 12 18 25 36 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59
59 57 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 59 59 59 57 57 47 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 57 59 57 52 52 52 43 57 52 52 52 57 57 68 59 59 59 59 52 52 59 59 59 57 48 48 57 57 57
57 59 57 59 59 59 59 59 57 57 57 54 54 48 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48 54 54 57 59 59 57 57 54 57 54 54 54 54 57 57 57 57 46 46 43 43 43 59
46 57 57 48 48 43 43 43 48 43 43 48 44 44 48 48 48 48 48 48 48 43 43 43 43 36 47 37 37 39 37 37 28 31 28 28 22 29 34 37 34 34 40 40 40 41 41 46 41 41
41 34 26 26 32 32 34 25 28 33 37 37 32 35 37 47 47 47 47 47 34 34 25 22 22 25 19 21 18 20 20 26 37 40 43 48 40 40 41 41 39 39 31 25 25 32 30 21 21 11
11 11 17 17 24 24 28 25 18 18 18 22 24 24 34 34 28 21 21 16 15 30 26 34 23 23 23 28 28 24 20 22 37 37 37 47 41 30 30 15 15 15 16 24 24 34 28 24 24 25
17 10 10 10 16 8 12 10 10 15 10 14 14 26 26 31 24 10 10 12 12 12 16 19 13 9 7 6 6 6 10 8 15 19 10 11 10 10 8 13 9 9 10 12 9 14 21 10 10 9
9 9 9 9 9 13 17 18 14 15 13 12 10 8 8 10 8 8 11 13 15 13 19 12 12 12 10 9 9 9 8 6 6 6 13 10 8 6 6 6 7 10 10 10 10 11 17 11 11 9
9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 13 11 |