BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-441C12.T7 (MSMg01no441_c12.b1) | MSMg01-441C12.TJ (MSMg01no441_c12.g1) |
ACC | AG531104 | AG531105 |
length | 1,116 | 742 |
length of high quality (start - end) | --- | 498 (79 - 576) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no441_c12.b1 PHD_FILE: MSMg01no441_c12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:07:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no441_c12.g1 PHD_FILE: MSMg01no441_c12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:07:50 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TGTTCTTTAATTCTTTGCGCCTTGNTAAGAAGGAANAATACTACAAAAAA
AAGGGGAGGGGGGGGGAAANNNNGTTTTTTCCCCCAAAAAGAAAAAGCNG
NAGAAAAAGGAAACTGGCCGGCAAATGATTAATATCCACCCCATTCTTTT
ATATTGCACCCCTCCCTATAAAATATCCAAATGGGATCATTTCATAATAC
TTTTAATCTTGGCACCCGCCTGCCCCCTATCTTTTCTTTCCCCCTCGCTT
ATATTGTACGTAACGGAGCTTTAGTGGCTCGCTCCGGGTATTTCTCGTGT
ATTGGCTGGTTTATTCCTTGGAAAACCCCGGGAGCCTTAGTATTTTATTA
AACAATTGGCTTGGGAGCCGAACCGCAGATACCCTGCCTCCCTATTATGT
GCGGCTGCTCTTTGACGACCAGGAGAAAATGTTGTTTTTTTTTTGAAAAC
CGCAACCGCGCGCCTGGATATTTATTGTTTTCCCAAACCTAATTTATTAT
ATTACTCGCGCCCTCCAACTCTTCCGTCGTATAACTATATAAGAACTCGA
GTTTTTTACCGCACGCTGCATTATTGTTTTTGGGATATGATTAACGCAGG
ATATTTATAGTGTCCGGGGACAAATATGTATTAACAGCGATTTTACTATA
ATCTCGACTCACCCACTCACGACTGCTATTGTGCGCCACCGTCTTAAATA
CACCGTGCGTTTTTGTTATTTAATATGTACGGTATCTCCAACTCTATTCA
CCCGACATATTTCTGATTCTCGCACTCCGCCCGCCTTATTATATAGTTTA
TCTCAATCCACCCTATATATCCCAACTGCCGTTATTTTTCTTGTGACCCG
TCGAGCAGTTACTATGTATAACAGCGCTCATTTGTGCCGTTTAGAGCCGA
ATTGTTATTTTACCTGGGCAATACCAGTGAGGCGGTGAGTGCTGTAGCTA
TCTACATCCCTATTCCTTAGCTGTAATAACTTTCGGCTNCGCACGGTAAT
AACGCGCGGCGCGGGGAATGNTATTAAACATAATTAGATGGTAGTTTACT
GGTTGTGTTGGTCGTGAAAGAGAAAATTGGGGCCGTTGTATGTTAGAACT
GGTTGCTATATGCTGG
| NCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAATAACTTTCCTAGGAGAAAA
AATGATTATTGATACTGTACAGTGGAGAAAATATGGCCTTTCAATAGGGA
GAAAACTTTTTTGAACCCCTCCTTATTTGTTACTAAATTCAAGATGTACT
ACTTAAACTTTTTGACGTTCACACATAAAATAAAAATAAAAGTATAAGTG
AAAGCTGATGTGATATAAAGATGCAGGAATATGTTTAATATATTATTAAC
TATTTTATAAATGTTATTTTTCTTGAAAGAGGACCTCTCTTGAGTTTACT
TTGCTAGGAAGGTGGACTGATTGTTTTACCTTGAGAATGCTGTGAGATCA
AATGAATGTGTGTTTAGCACAGAACCTAAAAGGGGGCGTAACCTGCGTTT
TGTTGTTAATTCCTCAACAAGGATTGCTTCTACAGTTCTGCTCTTCCTTC
TTTTACTCTCCTCCCCCTTAAAACAGTCTGTTTTTCTCAGACCTAACACG
AGAGTTCAGAAAGCTGCCCCTGATGCTAACCTTGTGTCACCATTTGTCAC
CTGCAGAGTTCTGTGTCTTGGTAAAGGTTAATCTAGTTCTGTGAAGCCTT
CCCCCCCACCTCCCACTCACAAAACACTTGCAGTGGTGTAATGTCCGTGC
CCCGTTTGCTTACCTTACTATCCAAAGTAATCTATGCGCACC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 8 8 9 9 10 10 10 8 8 8 8 10 8 10 10 10 10 16 10 10 3 0 3 15 10 10 11 12 9 10 13 3 0 3 10 10 9 9 7 7 7 7 7 8 12 18 10
10 9 9 8 8 8 7 7 15 15 17 24 21 12 9 9 6 6 3 0 0 0 0 3 12 12 12 15 15 14 14 11 16 12 13 16 18 11 8 8 8 8 11 8 8 8 8 3 0 3
0 3 6 8 6 7 6 7 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 10 11 9 7 8 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 10 9 9 11 11 10 8 8 8 8 10 10 10 9 9 10 10 10 10 10 11 8 9 9 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8
8 8 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 6 6 6 8 11 10 11 11 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 11 11 14 8 10 10 11 10 10 12
11 11 8 8 10 10 8 8 9 9 10 10 12 12 12 12 11 11 11 15 11 8 6 6 6 10 13 8 8 8 8 10 15 11 9 9 9 9 11 11 12 9 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 12 12 9 7 8 10 10 10 10 15 10 8 8 8 8 8 10 15 11 12 12 16 17 11 13 9 11 8
8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 12 12 11 11 11 11 11 11 11 11 11 17 12 9 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 6 10 10 12 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8
6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 12 7 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 12 8 9 11 13 13 14 26 16 7 6 6 6 8 8 10 8 8
8 8 8 10 8 7 8 8 8 8 8 10 8 13 11 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 12 12 13 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 11 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6
8 8 12 12 12 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 7 8 8 9 6 8 6 6 6 10 11 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 10 8 8 11 11
9 10 11 10 9 7 7 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 7 6 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 9 8 8 8 8
8 8 10 10 10 10 16 17 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 7 7 8 8 8 8 7 6 8 8 14 18 12 8 6 6 6 8 8 8 8 11 6 6 9 10 9 9 6 8 8 6 8 8 8 8 6 6 10 10 10 8
8 8 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 10 8 10 9 8 8 8 8 8 10 11 12 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 11 8 8 6 6 8 10 10
10 8 8 8 8 8 6 6 7 6 10 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 12 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 9 9 8 7 6 6 6 12 10 11 13 16 11 10 10 10 10 10 8 6 6 6 6 8 8 12
8 8 10 10 9 9 13 13 10 10 10 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 12
12 11 9 9 9 9 9 10 12 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 6 6 6 6 8 6 8 8 9 9 9 3 0 3 9 10 11 9 9 9 9 9 8 10
8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 3 0 3 9 9 10 10 11 11 10 11 10 10 11 12 11 9 8 8 10 10 8 6 8 6 6 8 6 6 6 6
7 8 7 6 7 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 7 9 8 8 6 6 6 6 10 8 9 8 9 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 11 11 9 9 7
7 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 8 10 10 8 8 15 15 16 11 14 25 30 31 43 39 39 37 37 37 37 39 37 19 19 9 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 9 9 11 11 15 22 20 28 37
53 33 33 33 33 33 33 25 25 9 9 9 16 9 9 9 11 11 21 23 43 43 33 33 33 33 33 33 28 32 36 36 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 68
47 47 47 51 51 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 54 57 48 44 43 39 43 44 57 57 57 57 57 51 50 68 50 50 50 57 54 54 54 59 48 47 47 47 48 48 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 52 52 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 52 43 43 57 57 57 57 57 57 68 59 59
68 68 59 59 59 59 52 52 57 59 57 68 57 57 57 57 57 57 52 57 57 52 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52
52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 43 41 41 38 38 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 57 57 57
59 59 68 68 68 59 59 52 52 52 52 52 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 43 43 52 52 52 57 47 59 52 52 52 57 57 57 43 43 37 43 57 57 57 52 52 52 52
52 52 52 59 59 59 59 57 57 57 52 52 42 42 32 32 35 37 43 43 35 37 32 44 32 32 32 32 32 42 37 43 42 43 44 43 43 43 44 43 43 44 44 37 35 35 42 42 57 42
42 31 33 33 31 32 37 39 42 46 47 42 42 33 28 23 32 36 44 46 46 48 43 46 37 43 43 47 47 43 39 44 44 47 47 47 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 59 59 59
48 48 48 48 59 59 59 48 48 48 59 41 39 37 37 37 37 39 34 25 19 24 17 17 16 19 19 19 32 32 48 48 34 34 37 39 26 26 14 24 24 31 31 37 31 31 25 25 21 28
14 14 14 18 15 15 22 17 18 30 32 34 41 41 43 32 22 22 23 22 28 30 22 22 12 13 12 19 16 15 15 13 21 9 10 9 14 15 15 18 24 31 36 34 34 33 27 27 15 15
11 22 12 12 14 14 22 13 20 19 24 23 19 18 12 10 10 12 12 15 13 28 21 25 15 13 12 11 8 6 6 6 6 10 8 18 18 30 25 20 17 11 11 9 10 10 9 8 8 7
8 6 6 10 13 21 23 28 28 28 28 25 22 22 25 28 16 12 12 16 14 12 15 12 11 11 11 15 12 10 9 9 9 9 9 11 11 11 11 12 11 10 10 10 11 10 13 11 11 11
14 12 11 12 10 8 8 8 6 8 11 9 9 10 9 9 11 8 8 9 16 11 15 15 18 15 18 19 17 11 11 10 17 9 10 10 10 8 8 8 8 6 |