BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-446D15.T7 (MSMg01no446_d15.b1) | MSMg01-446D15.TJ (MSMg01no446_d15.g1) |
ACC | AG534972 | AG534973 |
length | 735 | 744 |
length of high quality (start - end) | 661 (63 - 723) | 330 (319 - 648) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no446_d15.b1 PHD_FILE: MSMg01no446_d15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:14:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no446_d15.g1 PHD_FILE: MSMg01no446_d15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:14:41 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGCCGCGGAATTCTTTATTT
TTGCAAGAGACCCATTTTTAATGGGGTTATTTGATTTTCTGGAGTCCACC
TTCTTGAGTTCTTCACATGATATGTACTCACTGATAAATGGATATTAGCC
CAGAAACTATGAATACCCAAGATAGAAGATACAATTTGCAAAACACAGGA
AACTCAAGAAGAATGAAGACCAAAGTGTGGACACTTTGCCCCTTCTTAGA
ATTGGGATTAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGC
TGTGTCAAAAGGTTGTACTACATAGAGCCTGCCATATCCAGGGATCCATC
CCATAATCAGCCTCCAAACGCTGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTT
TGCTGAAAGGACCGAGATATAGCTGTCTCTTGTCAGAATATGCCAGGGCC
TAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGGTCACAC
GGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGGATCT
GCAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTATCCCCCAGAG
CTCGTGTCTCTAGCTGCATATGTATCATAAGATGGCCTAGTAGTCCATCA
TTGTGAAGAGAGACCCCTTGGTCTTGCAAACTTTATATGCCTCAGTACAG
GGGAACTCCAGGGCCAAGAAGTGGGAGTGGGTGGT
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCAGAAATTCTACACTTCTTAATTATTTGCATATTGGCTCTCTAAGAG
TTTCAAAAATAAGGTCTACCTATACGAGACAAATTACACAAACTCTTTGG
ATTTTATTTTAAATTTGACTCTGTTGAAACAAAAGACATTTAATATTCAA
ATGTTTAAAATTATATTTAGGTCATTTTGTTCTCTGTTTATTATTTATTT
TGCTTTTATATATGTTCATATATTACCTGTGTGCCTAGTGCTCATGGAGA
TCAGAAGATATGGTTGTTATCAAATAGATTTGAAATTGCAGATGGTGATG
TACTACCATTTGAATTTAGTGAAACAGACCCTCAGTTCTATGCAAGAACT
ATAGCATCTCTCAATAACTCAGCAATCTCTCAGGCTTCAGACATTTATTA
ATTTAAAGTACATGTCTTTCTAAAACAATACTTTCATTTCCTTAACATTT
TATAATTAATCTTGACAGTAGAATGAGGTTAATATCTAACATGTTTGTCA
TTGAGAGAACTGCCAGAGAATCATTCTGTAATTATTTATTTTGTCATTGA
GTTTTGTGGTTAAGTTTTGTTTTGATAGACTAAATGAAACTGATAACATG
TTTCTAACTGAATCCTTTTTTGCAACCACATTCCGCTAAGTATAGATCAG
NTTTATCTCTTCTTCCATTAAGGTTGTGTGTGTTCAGTATGTAT
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 15 15 14 10 10 12 28 28 59 29 29 30 30 25 21 21 9 9 9 11 9 9 9 9 11 10 10 10 10 12 9 23 23 31 31 31 33 33 33 47 47 44 30 21 19 8
8 7 7 6 6 6 8 8 8 11 11 15 18 21 28 33 39 44 44 36 36 38 38 42 53 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 57 57 59 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50
57 68 46 46 37 39 35 35 32 44 32 32 32 22 32 32 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 51 51 50 50 50 51 68 68 68 51 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 44 43 43
43 35 43 50 57 57 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 48 48 47 57 47 47 32 34 34 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 57 53 53 59
59 59 59 59 31 22 12 9 9 6 6 6 6 6 6 7 13 13 21 29 41 59 50 50 50 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 53 53 53 68 68 57 59 43 47
43 43 39 47 47 48 59 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
44 44 41 41 44 44 59 59 59 44 41 41 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 48 59 59 50 50 48 41 41 41
47 41 41 44 37 37 39 44 44 44 44 37 41 44 59 44 41 47 47 41 43 43 43 43 43 46 59 59 59 59 59 59 44 44 39 37 44 41 44 59 59 59 59 50 48 48 48 57 48 48
48 59 59 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 59 47 47 47 59 47 44 41 41 37 43 43 41 37 35 35 31 39 30 37 39 37 37 34 24 19 23 18 14 13
12 20 11 11 11 15 22 32 28 31 31 39 35 32 32 37 37 37 32 29 29 32 39 59 40 41 41 37 37 37 41 37 31 31 37 37 39 40 37 31 31 34 34 36 36 41 37 37 37 20
21 21 19 15 15 25 28 26 29 32 23 22 22 22 20 22 24 34 29 29 16 9 9 9 9 14 17 32 17 11 9 8 8 6 6 | Open.Hide. 9 9 10 17 27 32 37 39 39 39 39 44 41 41 44 59 33 27 12 9 6 6 7 7 6 6 6 8 6 6 6 8 10 17 30 28 28 28 33 31 31 50 50 47 47 27 27 9 9 7
7 6 6 6 6 6 6 12 10 10 15 16 17 19 22 33 30 31 48 53 53 38 53 50 47 47 47 47 47 47 47 47 43 48 48 57 57 48 48 57 57 57 53 53 57 57 57 57 48 57
57 36 32 32 19 19 17 24 24 25 22 12 11 11 12 19 25 34 59 59 59 59 48 48 48 57 57 43 43 48 47 47 53 53 50 50 57 57 57 57 57 53 48 48 48 48 57 57 41 41
41 41 41 50 54 68 68 68 54 59 54 54 54 50 50 50 68 68 68 68 57 59 54 54 54 59 59 57 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 54
54 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 50 48 48 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 44 44 32 32 28 20 20 27 32 44 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 53 50 57 50 53 50
50 50 50 41 30 15 12 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 12 18 25 34 59 59 59 50 50 53 53 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 54 54 32 43
43 43 43 47 46 54 54 54 54 54 54 54 54 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 54 57 59 59 59 68 68 68 68 57 57 59 59 59 57 57 43 52 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 47 47 39 44 59 68 68 57 57 54 54 54 54 54 54 57 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 57 57 57 57 59
59 59 59 43 47 41 39 39 41 41 41 41 34 34 39 43 37 39 40 41 41 48 42 46 47 37 37 30 30 25 27 30 37 37 41 47 59 59 59 59 59 59 28 28 25 32 30 37 28 27
22 18 20 23 34 23 17 17 27 27 31 29 20 24 22 22 22 28 32 31 29 35 37 37 37 37 37 37 36 37 32 29 29 29 37 32 31 29 37 37 37 37 30 28 19 19 15 15 11 10
10 10 10 10 9 11 9 11 11 23 18 30 34 37 37 37 37 39 39 39 34 24 22 18 16 19 11 12 11 19 19 30 30 32 27 28 15 12 10 10 10 10 12 10 10 9 10 10 12 3
0 3 15 15 24 24 16 14 11 11 11 23 15 15 12 11 11 18 13 11 11 12 8 8 8 11 9 9 9 9 9 9 10 10 13 16 11 12 11 13 12 10 10 10 |