BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-470P20.T7 (MSMg01no470_p20.b1) | MSMg01-470P20.TJ (MSMg01no470_p20.g1) |
ACC | AG553862 | AG553863 |
length | 772 | 770 |
length of high quality (start - end) | 248 (67 - 314) | 442 (71 - 512) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no470_p20.b1 PHD_FILE: MSMg01no470_p20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:48:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no470_p20.g1 PHD_FILE: MSMg01no470_p20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:48:05 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (45,224,680 - 45,224,927) | (45,039,197 - 45,039,638) |
---|
sequence | AATTTGCGGCGCTAAACGACTCCTATTTTCACAACACCGCGGAATTCACC
TCTTATTCCAAAAACACATTGGGAAATTAATTCCCAGTGCTAAGACAAAT
CTGGCAGGAGAACAGACACATTGCAATTTTCCAAGTTACCTGGCAATCGT
TTCGAAATGTTATCTTGTGTAAAATGGCACTCTTGTGTCTTCCCCCACAG
ACATAGGCTGTTTGATTTCTGGTCTTTATTTTTTACTAAGTTAGAGAATG
TATATCCATTTTGATGCTGTCATAAAAGCATACCAGTTATCTGTCAGAAA
CATTTATATAGATGTACATACATAATTTCACATAACAATACTAATTTTAA
TTATGATTAAGTAAAATGCAATTAAAATTAAACCTTAGAAATAAATACAT
TAGAGATAAAGCTTGTTGTTATTGTACGATTATTATTGTATCTTATAATG
GAAAATAGCTACAAAATAATAATCACAAACAGGACTACAATGAACTAATG
TACTTTAAAACACAAATTTCTAGATTTATATATCAGAACCTAGGAGTGTC
CACTTAAACCACATCCAAATTTAAGTCTTTGTCAGGCCACTTACTGAGCA
TGTGTTAGCTCTGCGCTAAAACTGTAACTCTACTCAGCCACGCAAGCTAA
CCTCCCTACCTTTGTTTACTTTGCACACCTTGACTCCACTCCCAATATGC
CCCATTATGTCCCCCACCTTTTTAATGCTCGAACACTGCACCCACAAGCA
CTCCCCCGTTTCCTCCCCCCTN
| ACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTGTGAGTGAATTAATTTCCACTCTAGCT
TCCCCTAAGAAACAAAGTACCTAGTTTCTTTAAAAGAGGATGTCCGGCAT
TATTTGGAAAAGGATGCTTTTGACTGTTAGCCTGTCCTTATTTTTACTGC
AAGTGTGAAAACATTTCATATAGCAGGGTTGCTATGTGCCTGATGGTCCC
AGCTTCTGAACACTTTGACCTCATTCATTTGGTTCTTTAAAATGAAATGT
TTCTTTGCCCATTTTTTTTCTGTCTCAGCTCTCTCTCTTATTTTTGAATC
TACGTACGCTTTAGGATTTGCTAGAAGAACAAAATAAATTTTGAACAAAG
GGGAGGGAGGATGAAACCGAAGGAAGTTGTGAAAAATAGCCCCTTCTTTC
CAAACTGATTTAGAAGGGCTGTGATTAGTCCTGTTCTGCTGGAGGCGACT
TCGGTTTTCATTCAGTGGCTCCAGTTCGTTTGTACCTGATGTCACTGGTG
CTGAGGTCAAGGGCTTGACTTCCCAGTCGCTGCTGCCCCTTTTCCCAGAG
CATATGGAGCGCTAATACGATCACTGCAGAGCAATGCCGGTCCTCCCAGG
TACCATGTTCACTCCCGCTCCAAACCGCACATCCCTACCCTACTCTCCCC
CCTCCCTTACCCTAGTATCGCAAAGTGCCCTCTTTTAATCTGCCAGCTTC
CCCCACTCCGTGGCTCCTTT
|
quality values | Open.Hide.15 15 15 15 15 12 15 17 15 17 12 9 9 9 9 9 19 19 27 19 9 10 10 13 13 11 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 14 16 16 12 17 25 29 29 33 33 26 26 25
43 25 25 9 9 9 9 9 9 9 11 13 21 14 14 15 16 24 21 28 36 43 48 33 36 36 50 50 50 50 53 53 47 53 47 47 42 47 59 59 59 59 43 33 33 33 33 37 42 57
57 42 39 44 44 54 54 54 48 44 37 37 37 31 37 42 44 44 48 48 47 57 57 68 68 68 68 68 68 42 42 28 28 35 42 59 59 59 57 57 57 48 57 48 57 57 57 57 57 57
57 57 43 43 37 50 50 50 41 42 36 36 36 41 36 43 23 23 23 32 32 43 42 57 43 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 54 57 57 57 54
54 54 47 47 48 57 57 54 54 54 59 59 54 68 68 68 54 53 57 57 54 43 43 43 47 43 57 57 57 57 57 59 59 57 57 43 39 39 37 37 47 47 41 29 17 10 9 9 9 9
9 19 28 34 37 37 37 37 37 41 59 53 57 57 57 57 57 59 59 59 35 37 37 59 59 59 57 57 48 48 48 48 48 43 43 40 43 43 57 59 59 57 48 39 40 35 43 43 43 43
48 57 57 59 59 48 48 41 43 40 23 23 18 18 9 9 9 9 6 6 6 6 8 13 41 41 39 39 35 35 35 37 37 32 32 20 20 21 32 41 59 59 48 48 48 48 48 48 59 59
59 34 34 15 10 10 10 15 10 11 12 12 28 24 35 35 37 36 30 30 30 37 41 41 35 35 35 39 39 39 43 43 43 43 32 32 24 12 12 32 32 47 48 48 47 44 57 37 37 36
35 26 15 13 26 26 32 32 15 11 11 11 16 18 12 13 38 32 43 43 43 43 43 35 44 44 43 35 35 35 43 44 35 35 35 38 38 18 18 18 41 41 57 57 57 57 57 50 50 41
41 41 43 43 50 57 32 32 22 21 21 12 12 12 18 20 32 33 42 42 43 43 48 42 37 35 35 42 42 42 37 37 37 42 32 30 27 17 17 30 34 34 30 30 25 33 28 28 28 25
25 40 40 32 32 31 20 19 10 18 12 12 10 9 14 15 21 15 10 10 10 14 19 19 29 22 25 22 22 18 20 18 23 18 11 11 10 12 12 18 20 11 11 11 18 10 10 9 6 8
8 8 8 8 15 12 20 20 19 28 24 13 13 13 15 13 15 26 19 18 21 18 12 12 12 11 11 18 18 27 26 15 15 11 10 9 10 10 13 21 30 34 34 23 13 13 10 17 10 13
15 23 15 12 12 11 10 9 9 9 10 14 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 11 12 12 16 11 11 9 8 6 6 6 8 8 10 8 8 8 10 10 12 8 8 9 8 8 8
8 6 6 9 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 7 7 9 7 11 8 8 6 6 6 7 6 8 6 10 13 8 10 10 12 18 11 10 10 10 15 16 16 12 11 10 10 10 10 10
10 10 8 8 8 8 8 8 9 15 15 20 17 14 15 9 9 10 9 9 13 12 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 9 11 9 10 10 15 9 9 8 10 6 6 8 6 9 11 11 13
10 10 10 15 19 10 6 6 6 13 8 8 10 8 8 8 15 19 12 16 3 0 | Open.Hide. 9 9 9 9 13 9 10 9 13 18 28 29 37 34 39 41 43 39 39 39 39 39 34 34 37 25 18 9 9 9 9 17 9 9 9 16 17 16 22 21 25 39 37 41 47 39 39 37 44 41
50 42 41 39 27 10 3 0 3 6 6 9 9 13 13 15 19 19 28 28 37 37 37 48 53 53 53 53 53 36 42 37 50 50 50 57 57 57 48 48 47 47 47 48 57 57 54 59 57 59
59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 48 46 48 47 47 47 48 48 57 57 42 42 41 42 47 57 57 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 47 47 57 57 50 48 57 57 68
68 68 68 57 57 54 54 57 57 68 68 50 48 46 46 46 46 57 57 57 57 57 54 52 52 52 44 59 52 52 43 59 59 52 52 52 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59
59 57 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 68 68 57 57 57 54 54 59 44 44
44 43 43 43 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 46 59 43 43 47 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 57 57 48 48 48 57 48
48 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 50 50 59 59 59 59 59 28 30 21 21 14 14 12 20 11 18 25 34 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 48
48 47 48 43 43 25 31 31 43 47 41 37 23 23 19 30 30 39 48 48 44 59 54 59 47 43 43 39 44 37 43 43 37 42 42 37 42 43 47 59 44 44 44 43 42 42 43 43 42 42
41 35 42 42 43 43 43 43 50 50 50 57 38 43 23 20 20 32 27 38 38 32 37 50 43 47 44 50 50 54 54 57 59 57 57 57 57 46 46 43 44 59 57 57 57 59 57 57 42 42
35 42 42 43 59 57 68 68 57 44 44 28 28 30 44 44 34 34 14 24 18 36 36 43 32 32 14 14 14 28 28 29 27 33 33 43 43 54 43 43 59 59 57 50 50 48 40 39 39 39
37 34 34 48 57 30 30 26 22 21 22 22 20 16 21 12 12 13 12 18 21 25 20 29 26 23 24 37 37 31 37 30 33 37 37 37 39 39 28 31 19 25 12 12 12 24 16 34 33 32
34 22 29 17 17 17 17 19 22 19 21 21 11 11 15 23 31 22 15 19 15 9 9 10 13 16 16 10 8 8 10 11 10 12 11 11 10 9 12 12 15 11 25 24 17 12 11 11 11 11
11 15 21 30 28 14 12 10 10 10 10 10 15 15 12 12 12 11 10 11 13 8 8 8 10 10 14 10 10 11 12 12 12 10 10 8 10 8 8 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10
10 10 12 12 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 11 11 10 10 10 7 8 8 8 8 8 10 9 9 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 12 10
8 8 10 10 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 9 9 8 8 8 8 8 9 10 8 8 7 7 8 8 8 8 8 10 19 23
21 17 13 8 8 6 7 11 8 7 8 8 8 8 9 9 12 20 21 16 |