BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-486E10.T7 (MSMg01no486_e10.b1) | MSMg01-486E10.TJ (MSMg01no486_e10.g1) |
ACC | AG565517 | AG565518 |
length | 731 | 766 |
length of high quality (start - end) | 567 (77 - 643) | 169 (76 - 244) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no486_e10.b1 PHD_FILE: MSMg01no486_e10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:08:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no486_e10.g1 PHD_FILE: MSMg01no486_e10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:08:32 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NGGGACCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAGAAAATG
GGCGGAATTCCTAAAGTTCCCCTATAAAATGAAACCCACTCACTTGTTAA
CTGGTTTGAAAAAAAATATGGCTTTCTTCTCTTTCTATCTCCCTTTCTCA
CCCCTGCTGTATCCTAGAACCACTTCTAAAGTCATCTGTTTTCACTGTAA
TCTTTGTTTGGGGTTGTCTTATTATGTATATGTAATACTAAATAGGTTAG
TGTAGATGTGTCTTGAATCAGCATGATAAACCTATAAGAATACCTATTCT
TTCATTAAGAGCCACTACTTTATTTTTGGGCTGGTTTCCCTGAAACAGAA
CTAATTTATATAGTCATGGCAGATGTGCCTGCCTTCGGGTTCAGTGTCTG
ATGTCTTATGTTTAATAAGTCACCTCAGGTCTTAGATGACTATCTGTCTC
TGCCCTGCTTTGTTCATCTGTAAAAAAGCATTGCTAAGTTAGGATAAGGA
TGAAGGTTCACTGTAAACAATAACATCATGCCTACTTCTTTGTGAACACC
CAGTCCTTTGTGGTGACTTTTGTTATAAACAATCTCTGACTACCCAGTTG
TTCCTAATGCATTGTTAGGGGCCATAAATGTGCGGCTTTGAAAGCCAAGT
TGACATTTATGTACGTTTGCATTTTTATTCCCGNTTTTCTTCTTGCTAAA
AGTGACCTGCTTTCTATTCAGGATTATTGTG
| TCCAATACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXTGACTCAAGGAATTCAAAGCAGTGCTGGGAGCTGACA
GCGCTCAGTGGGGTAGAGGCCCTGGCCTTATAAACCTGAAACATGAGTTC
GATCCCATGTAAATGAAGAAGAAAGGAAAAAACTAATTAGACAAGTTTGT
ACTCTGACCCACCCTATCCCATCACACACACACACACACACACTCATACA
CACTTACTCACACTCACACTCACACATATTTTTAAAATTGTCAATAGAAT
TGGAACAAAGAAACAGAAATTTTTTTTATAATATGGAAGACTCAGACCTC
ATAACATACTACAGGGAAAATACCTGATTGAGGATGTAAATGTAATACAA
AAAGAAATATGTTCCATGTTGTATGCGGCTTTTAAGGCCACCTCTATATA
GCCCCAGACATCATGACAGTGAGAATCTCCCTTTACATATTGGGGATGAC
CTTATTCTATCCTCACTATTGCCACCTCCAGTATAAACTTATGGCCCCCA
TTTGAGGCATGTGACCATCTGTCCCTCTCCAAAATTTTTTGCGCTCCTAT
ATGTTCCTGTCCAATAGTTAATGCTGGTGACCAAACAGGCAAGGATATTT
CGAATGACAGGTCTCTTTCCAACATTAGATTTACTTTATATTCTCCTTCC
CTCCTAGCGTGTTTTAAGACCCCGTAGTACAATAACTGACCGTTTCGGTA
GCTACTTTTACCACAN
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 6 8 12 15 10 10 10 12 12 14 25 30 39 39 41 37 34 37 23 19 11 9 9 21 19 39 24 28 28 25 23 23 25 12 10 10 10 6 6 6 9 12 12 14 9 8
8 10 17 18 29 29 31 31 39 37 59 59 29 23 9 6 6 7 6 6 6 14 14 12 12 12 25 24 32 30 30 32 34 43 43 48 53 53 53 53 53 53 53 53 57 59 59 59 57 53
53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 43 43 43 50 50 68 68 57 48 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 47 47 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 53 53 53 53 53 53 57 57 57 57 59 57 57 57 57 53 53 50 50 50 50 59
36 31 26 13 13 13 28 28 39 59 59 59 59 59 50 53 53 53 53 53 53 53 57 53 53 53 53 53 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 53 59 59 59 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 25 25 11 12 11 14 12 13 11 10 11 12 21 30 59 59 59 59 59 59 59 53 57 57 53 53 53 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 57 44 43 43 43 43 47 40 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 41 37 37 43 43 59 59 41 41 41 48 48 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 44 41 37 37 41 59 59 59 41 41 41 41 39 39 29 29 32
37 32 30 29 29 26 29 31 39 39 39 41 43 44 43 39 37 39 37 37 39 39 39 39 40 41 41 47 43 44 41 41 44 44 44 41 41 44 41 41 43 43 43 39 31 31 37 41 31 32
34 30 30 37 32 36 39 39 39 39 38 34 37 39 39 41 41 39 39 37 37 39 31 31 35 35 31 31 41 41 32 32 41 43 43 43 39 39 36 36 16 20 9 9 9 13 22 31 31 30
31 25 28 25 37 31 31 39 37 37 32 29 29 32 28 31 36 31 31 36 31 29 25 15 11 11 11 11 16 28 30 31 34 22 20 22 25 31 30 22 18 18 12 18 18 28 23 19 24 12
10 10 13 12 24 21 24 17 13 13 11 11 12 20 22 29 27 27 32 22 15 10 10 9 16 11 17 14 14 19 16 12 3 0 3 16 16 18 18 15 15 21 19 19 24 15 15 16 19 19
15 13 9 10 8 8 8 11 19 14 14 13 11 14 14 15 18 16 17 10 10 10 11 11 13 23 18 18 12 12 12 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 10 9 9 9 10 10 8 9 12 15 11 12 19 26 23 29 19 16 16 17 13 18 25 15 15 11 8 9 8 6 6 6 6 8 7 14 12 14 19 19 24 16 23 25
32 37 37 37 37 37 37 27 21 13 9 9 9 9 9 9 9 9 11 11 11 11 9 9 16 18 23 23 30 33 37 41 48 48 43 43 43 43 46 59 44 50 50 50 50 57 43 39 39 37
42 42 43 42 31 31 22 22 22 41 36 57 43 59 35 35 32 40 36 37 37 39 36 28 28 38 42 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 41 41 39 42 42 43 43 59 46
47 47 57 57 57 48 54 54 57 57 57 50 50 50 43 43 31 31 31 35 35 35 43 43 48 57 50 47 47 47 47 48 50 57 47 48 43 50 43 48 44 44 42 39 37 37 39 43 46 57
57 59 59 57 57 57 57 47 46 43 43 37 37 43 44 57 57 48 48 48 43 46 48 42 42 32 32 35 36 36 39 39 42 42 32 35 32 31 33 30 18 17 10 10 10 11 11 12 12 18
16 18 13 14 10 10 9 9 9 15 20 22 14 14 12 21 10 8 8 8 8 10 8 11 11 16 11 11 11 22 23 21 19 11 12 12 19 21 34 28 28 20 15 15 18 11 11 21 23 25
31 28 15 15 11 11 11 16 12 14 12 17 10 10 10 13 11 12 12 12 17 12 14 13 9 8 8 8 8 10 19 15 19 12 9 9 9 12 14 19 15 15 22 13 14 14 21 19 24 19
17 16 15 11 11 11 21 22 17 15 15 12 12 12 13 12 13 18 15 10 10 10 15 23 37 39 32 32 15 19 12 12 12 22 22 24 15 19 15 21 15 20 12 13 10 8 8 8 9 18
18 15 11 11 12 20 18 14 13 13 16 11 11 12 13 14 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 12 11 11 12 11 9 9 13 13 11 9 15 15 16 16 13 11 11 11 11 11
10 10 15 21 14 12 10 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 14 19 26 18 13 10 10 11 11 11 11 16 19 24 26 19 16 11 11 11 11 14 11
11 8 8 8 8 8 8 11 13 13 17 11 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 10 11 11 18 18 18 11 8 8 8 8 8 10 8 8 11 8 8 8 10 13 11 10 10 10 13 10 12
13 15 19 23 22 22 17 17 18 18 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 9 8 9 10 8 8 8 10 8 9 11 11 17 17 24 30 18 21 12 12 7 7 8 8 9 10 8 8 8
8 8 10 8 8 8 8 8 12 10 10 10 8 8 8 8 6 6 10 10 10 12 11 11 11 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9 9 8 10
7 9 10 8 6 6 8 8 10 10 10 11 13 11 10 10 15 12 11 8 8 6 6 6 8 8 6 6 7 8 10 9 10 10 13 11 10 10 10 8 6 8 6 6 8 8 10 10 10 8
8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 10 12 10 10 8 9 9 12 11 8 8 8 8 6 8 8 10 8 9 10 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6
6 6 8 11 10 10 9 10 8 8 8 8 8 10 3 0 |