BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-009L23
ChromosomeX (Build37)
Map Location 22,718,651 - 22,859,089
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKlhl13
Upstream geneLOC100043182, LOC100043956, EG436197, Ppia-psx_207.1, 1700023I07Rik
Downstream geneEG635719, Wdr44, EG236749, EG214450, EG245376, LOC546271, LOC100043957, LOC100043206
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-009L23.bB6Ng01-009L23.g
ACCDH845607DH845608
length1,0731,080
definitionDH845607|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009L23, 5' end.DH845608|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009L23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,718,651 - 22,719,726)(22,857,993 - 22,859,089)
sequence
gaattcctcactattgcttctacatgaaaacgactgccccagtaaacgaa
gttaataattcaaatcattgtgtctcaagtattgttctaaatcaaagaat
tcttgttaacttatcttttaacccccagaacagagggtaaagttgaatga
agttggagagtcacatgcaaagacaaaagaaaacagagggaaaaagaggg
ccagaacaataagtacaatgaacccctgatcaagtatgtcatctgtagct
tctctttcggtcactccaaaattatacaaatcatgctccactggggtctt
ctttgttcattctggtgtttccctctattatagtgagggtgatggtgagc
cagatgtagtaggacatgcttgtaatccaggcagttagggaggaggagga
ggaggctcagggttccaggtcatcatctggtatttagcaagttgaaagct
agctgagaccccgctgatacttttgagactttaattcagttgtgtgccat
ttagttattggttccttgcagaaggttcatggccgttatggcttactgat
acttttttcctgcttaaaaagcactgactactcaaagacaaagattttct
tttttttttttccattttttattaggtatttacctcatttacatttccaa
tgctataccaaaagtcgccatatccacccaccccccactcccctgcccac
ccactccccctttttggccctggtgttcccctgtactggggcatataaag
tttgcaagtccaatgggcctctctttccagtgatggccaactaggccatc
ttttgatatatatgcagctagagtcaagagctccggggtactggttagtt
cataatgttgtccacctatagggttgcagatcccttttagctccttggct
atttccttagctcctccattgggagccctatgatccatccattagctgac
tggtgagcatccacttctgtgtttgctaggccccggcatagttctacaga
gacagctacatctgggtcttttcaataaaatcttgtagtgtatgcaatgg
tgtcagcgttgggagctgattat
gaattcattttcaacatcaaacaaatatgttgtgtttgctcctttgggat
ttatagctcgagtttgttttctctttttagatagttgaaatgtctcaata
ttttcaagagtggtgacaatagtgactatggcacctttaaggaaagctgt
tttatgtagcatacatttcaattatgatgtaatgcattagggaagataga
agaattagggtaattttggccctgtttactgagtagacatagtcttcatc
cagtttcaggtttgaacacgtgcagagtggtatgccatccatctggattt
cggaagggattctcttaatagaaacagagtccttggtgacatgtttgtgc
taccgtctgttcaacactaggttgaagttcagccttagcctcagggaggt
tttcctggtcagtgaaaactgcattagtagagactctgctcttgacaggt
ggaaaccatataaattcccctgtcatttggcttaaattaataaagctgaa
agggcaaccgcattgaagtgctttgccagtgttttggtattcgttgtttt
aaaacagcaaatggctcattcagaccaatgttataggattaatgcattgt
tacattctgaacacacactggaacagtgttagtactagagaggttttctt
cttttcttcacaaacacaaagttttatcagtaatagaagtgtggaaagaa
ggtggaaaataactaggttaagaattgtatggtgcatcataacagtgaat
tttagcaagatgggctaagagatgactgatattagtgaactaatttgaac
cagaatgagtctcatcctcctttagcccctacgattgtaattagttagct
ttctgtttaaatttgttgtatatgtaaactatattttatagttaatgcca
acagtatcatattcatagcattttttaatcaataaaattcagtccttaga
tttcacagaaaaacattttgcatgctatgctaattttcccatttttggat
gattcgatcgatataaatatcgcatattttttattcttttgatattttct
tcctttgtttcttagaaattctctactaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_22718651_22719726
seq2: B6Ng01-009L23.b_48_1120

seq1  GAATTCCTCACTATTGCTTCTACATGAAAACGACTGCCCCAGTAAACGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCACTATTGCTTCTACATGAAAACGACTGCCCCAGTAAACGAA  50

seq1  GTTAATAATTCAAATCATTGTGTCTCAAGTATTGTTCTAAATCAAAGAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATAATTCAAATCATTGTGTCTCAAGTATTGTTCTAAATCAAAGAAT  100

seq1  TCTTGTTAACTTATCTTTTAACCCCCAGAACAGAGGGTAAAGTTGAATGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTAACTTATCTTTTAACCCCCAGAACAGAGGGTAAAGTTGAATGA  150

seq1  AGTTGGAGAGTCACATGCAAAGACAAAAGAAAACAGAGGGAAAAAGAGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGAGAGTCACATGCAAAGACAAAAGAAAACAGAGGGAAAAAGAGGG  200

seq1  CCAGAACAATAAGTACAATGAACCCCTGATCAAGTATGTCATCTGTAGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAACAATAAGTACAATGAACCCCTGATCAAGTATGTCATCTGTAGCT  250

seq1  TCTCTTTCGGTCACTCCAAAATTATACAAATCATGCTCCACTGGGGTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTCGGTCACTCCAAAATTATACAAATCATGCTCCACTGGGGTCTT  300

seq1  CTTTGTTCATTCTGGTGTTTCCCTCTATTATAGTGAGGGTGATGGTGAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTTCATTCTGGTGTTTCCCTCTATTATAGTGAGGGTGATGGTGAGC  350

seq1  CAGATGTAGTAGGACATGCTTGTAATCCAGGCAGTTAGGGAGGAGGAGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGTAGTAGGACATGCTTGTAATCCAGGCAGTTAGGGAGGAGGAGGA  400

seq1  GGAGGCTCAGGGTTCCAGGTCATCATCTGGTATTTAGCAAGTTGAAAGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCTCAGGGTTCCAGGTCATCATCTGGTATTTAGCAAGTTGAAAGCT  450

seq1  AGCTGAGACCCCGCTGATACTTTTGAGACTTTAATTCAGTTGTGTGCCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAGACCCCGCTGATACTTTTGAGACTTTAATTCAGTTGTGTGCCAT  500

seq1  TTAGTTATTGGTTCCTTGCAGAAGGTTCATGGCCGTTATGGCTTACTGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTATTGGTTCCTTGCAGAAGGTTCATGGCCGTTATGGCTTACTGAT  550

seq1  ACTTTTTTCCTGCTTAAAAAGCACTGACTACTCAAAGACAAAGATTTTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTTTCCTGCTTAAAAAGCACTGACTACTCAAAGACAAAGATTTTCT  600

seq1  TTTTTTTTTTTCCATTTTTTATTAGGTATTTACCTCATTTACATTTCCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTTCCATTTTTTATTAGGTATTTACCTCATTTACATTTCCAA  650

seq1  TGCTATACCAAAAGTCGCCATATCCACCCACCCCCCACTCCCCTGCCCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATACCAAAAGTCGCCATATCCACCCACCCCCCACTCCCCTGCCCAC  700

seq1  CCACTCCCCCTTTTTGGCCCTGGTGTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCCCCCTTTTTGGCCCTGGTGTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAG  750

seq1  TTTGCAAGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCCAACTAGGCCATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAAGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCCAACTAGGCCATC  800

seq1  TTTTGATATATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGTTAGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGATATATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGTTAGTT  850

seq1  CATAATGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGATCCC-TTTAGCTCCTTGGC  899
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CATAATGTTG-TCCACCTATAGGGTTGCAGATCCCTTTTAGCTCCTTGGC  899

seq1  TACTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGAGCCCTATGATCCATCCATTAGCTG  949
      || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TA-TTTCCTTAGCTCCTCCATTGGGAGCCCTATGATCCATCCATTAGCTG  948

seq1  ACT-GTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCGGCATAGTCTCACA  998
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   
seq2  ACTGGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCGGCATAGT-TCTAC  997

seq1  AGAGACAGCTACATCTGGGTCCTTTCAATAAAATCTTGCTAGTGTATGCA  1048
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGAGACAGCTACATCTGGGTCTTTTCAATAAAATCTTG-TAGTGTATGCA  1046

seq1  ATGGTGTCAGCGTTTGGATGCTGATTAT  1076
      |||||||||||||| ||| |||||||||
seq2  ATGGTGTCAGCGTTGGGA-GCTGATTAT  1073

seq1: chrX_22857993_22859089
seq2: B6Ng01-009L23.g_66_1145 (reverse)

seq1  ATTAGTAGAGGATATTCTTAGGGAAACAAAGGGAAAGAAAATATCAAAAA  50
      |||||||||| || |||| |  ||||||||||  ||||||||||| ||||
seq2  ATTAGTAGAGAAT-TTCTAA--GAAACAAAGG--AAGAAAATATC-AAAA  44

seq1  GGAT-AAAAATATGCGTTTTGTTTTATATCTGTATTTTGAATCATCCAGA  99
      | || ||||||||||| |    ||||||||      | |||||||||| |
seq2  GAATAAAAAATATGCGAT---ATTTATATC----GATCGAATCATCCAAA  87

seq1  AATGGGGAAAATTAGCATAGCATGCAAAATGTTTTTCTGTGGAAATCTAA  149
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AAT-GGGAAAATTAGCATAGCATGCAAAATGTTTTTCTGT-GAAATCTAA  135

seq1  GGACTGAATTTTATTGATTAAAAAATTGCTATGAAATATGATACTGTTGG  199
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
seq2  GGACTGAATTTTATTGATTAAAAAA-TGCTATG-AATATGATACTGTTGG  183

seq1  CATTAACTATAAAATATAGTTTACATATACAACAAATTTTAAACAGAAAG  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CATTAACTATAAAATATAGTTTACATATACAACAAA-TTTAAACAGAAAG  232

seq1  CTAACTAATTACAATCGTAGGGGCTAAAGGAGGATGAGACTCATTCTGGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTAATTACAATCGTAGGGGCTAAAGGAGGATGAGACTCATTCTGGT  282

seq1  TCAAATTAGTTCACTAATATCAGTCATCTCTTAGCCCATCTTGCTAAAAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATTAGTTCACTAATATCAGTCATCTCTTAGCCCATCTTGCTAAAAT  332

seq1  TCACTGTTATGATGCACCATACAATTCTTAACCTAGTTATTTTCCACCTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGTTATGATGCACCATACAATTCTTAACCTAGTTATTTTCCACCTT  382

seq1  CTTTCCACACTTCTATTACTGATAAAACTTTGTGTTTGTGAAGAAAAGAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCACACTTCTATTACTGATAAAACTTTGTGTTTGTGAAGAAAAGAA  432

seq1  GAAAACCTCTCTAGTACTAACACTGTTCCAGTGTGTGTTCAGAATGTAAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACCTCTCTAGTACTAACACTGTTCCAGTGTGTGTTCAGAATGTAAC  482

seq1  AATGCATTAATCCTATAACATTGGTCTGAATGAGCCATTTGCTGTTTTAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCATTAATCCTATAACATTGGTCTGAATGAGCCATTTGCTGTTTTAA  532

seq1  AACAACGAATACCAAAACACTGGCAAAGCACTTCAATGCGGTTGCCCTTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACGAATACCAAAACACTGGCAAAGCACTTCAATGCGGTTGCCCTTT  582

seq1  CAGCTTTATTAATTTAAGCCAAATGACAGGGGAATTTATATGGTTTCCAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTATTAATTTAAGCCAAATGACAGGGGAATTTATATGGTTTCCAC  632

seq1  CTGTCAAGAGCAGAGTCTCTACTAATGCAGTTTTCACTGACCAGGAAAAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCAAGAGCAGAGTCTCTACTAATGCAGTTTTCACTGACCAGGAAAAC  682

seq1  CTCCCTGAGGCTAAGGCTGAACTTCAACCTAGTGTTGAACAGACGGTAGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTGAGGCTAAGGCTGAACTTCAACCTAGTGTTGAACAGACGGTAGC  732

seq1  ACAAACATGTCACCAAGGACTCTGTTTCTATTAAGAGAATCCCTTCCGAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACATGTCACCAAGGACTCTGTTTCTATTAAGAGAATCCCTTCCGAA  782

seq1  ATCCAGATGGATGGCATACCACTCTGCACGTGTTCAAACCTGAAACTGGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGATGGATGGCATACCACTCTGCACGTGTTCAAACCTGAAACTGGA  832

seq1  TGAAGACTATGTCTACTCAGTAAACAGGGCCAAAATTACCCTAATTCTTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGACTATGTCTACTCAGTAAACAGGGCCAAAATTACCCTAATTCTTC  882

seq1  TATCTTCCCTAATGCATTACATCATAATTGAAATGTATGCTACATAAAAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTCCCTAATGCATTACATCATAATTGAAATGTATGCTACATAAAAC  932

seq1  AGCTTTCCTTAAAGGTGCCATAGTCACTATTGTCACCACTCTTGAAAATA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTCCTTAAAGGTGCCATAGTCACTATTGTCACCACTCTTGAAAATA  982

seq1  TTGAGACATTTCAACTATCTAAAAAGAGAAAACAAACTCGAGCTATAAAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGACATTTCAACTATCTAAAAAGAGAAAACAAACTCGAGCTATAAAT  1032

seq1  CCCAAAGGAGCAAACACAACATATTTGTTTGATGTTGAAAATGAATTC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAAGGAGCAAACACAACATATTTGTTTGATGTTGAAAATGAATTC  1080